• 제목/요약/키워드: BLAST Analysis

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PC-Cluster 기반 병렬형 유전자 서열 검색 시스템의 개발 및 성능 평가 (Development and Performance Evaluation of Parallel Sequence Analysis System on PC-Cluster)

  • 신용원;박정선
    • 대한의용생체공학회:의공학회지
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    • 제25권6호
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    • pp.617-621
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    • 2004
  • 최근 들어 유전자 서열의 생산량 증가에 비례하여 유전자 발현 마이크로 칩과 같은 새로운 분석방법과 기술들이 도입되면서 연구자들이 매일 수천개의 서열을 효율적으로 분석해야 할 필요성이 증대되고 있다. 이러한 생명공학분야의 급속한 발전은 대용량 유전자 서열에 대한 빠른 분석이 가능한 컴퓨팅 자원을 요구하고 있으나 IT 인프라에 대한 막대한 투자비용으로 인해 관련 연구기관에서 쉽게 이들 컴퓨팅 자원을 도입하지 못하고 있는 실정이다. 본 연구에서는 저가의 PC서버를 고속의 네트워크로 연결한 PC 클러스터를 활용하여 시스템의 안정성과 신뢰성을 보장함과 동시에 범용성을 지닌 병렬형 유전자 서열 검색 시스템을 구축하였다. 이러한 효율적인 시스템 구축을 통해 생물정보 데이터베이스 및 서열 검색 시스템을 제공하고, 대용량 서열 데이터베이스의 검색 시간을 단축하였다.

수치해석 기법을 이용한 발파전색재료 및 플러그 장치의 폭발압 저항 효과에 관한 연구 (The Study on Pressure Confine Effect of Blast Stemming Material and Plug Device Using Numerical Analysis Technique)

  • 고영훈;곽기석;서승환;정영준;김식;정문경
    • 화약ㆍ발파
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    • 제40권2호
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    • pp.1-14
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    • 2022
  • 본 연구에서는 발파전색재료와 밀폐용 플러그 장치의 압력 구속 효과를 평가하기 위하여 충격챔버 모델을 구성하여 발파 수치해석을 수행하였다. 현재 개발 중인 전단농화유체 기반의 전색물질과 일반적으로 사용되고 있는 전색재료인 모래의 전색효과를 서로 비교하였다. 또한 발파공 내부압력의 구속효과 강화를 위한 세 가지 형태의 플러그 장치를 시뮬레이션에 적용하였다. 그 결과로서 전단농화유체 기반의 전색재료가 모래전색보다 전색효과가 더 우수한 것으로 나타났다. 또한 전단농화유체 기반의 전색물질과 플러그 장치를 복합적으로 사용하였을 때 발파공 내의 폭발가스의 작용 시간과 영향범위를 효과적으로 향상할 수 있을 것으로 분석되었다.

정적변위를 고려한 플랜트 구조물의 단자유도 폭발 해석 (Blast Analysis of Single Degree of Freedom Plant Structures Considering Static Displacement)

  • 이재균;이승훈;김한수
    • 한국전산구조공학회논문집
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    • 제35권5호
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    • pp.317-324
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    • 2022
  • 본 논문에서는 등가 단자유도를 이용하여 구조부재의 정적변위를 고려하는 해석기법을 제시하였다. 기존의 단자유도 비선형 동적 해석 알고리듬을 구조부재의 초기정적변위의 영향을 고려할 수 있도록 개선하였다. 가정된 폭발하중 지속시간과 부재의 고유주기 비에 따라 정적변위가 최대응답에 미치는 영향의 차이와 폭발하중의 방향과 초기변위의 방향에 따른 차이를 확인하였다. 이에 따라 기존의 응답 차트를 정적변위를 고려할 수 있도록 폭발하중의 형태에 따라 각각 제시하였다. 설계 예제를 정적변위가 고려된 응답 차트에 적용하여 부재의 최대 변위를 비교 및 분석하였다. 본 연구의 결과를 통해 초기 정적변위를 고려한 구조부재의 최대응답을 쉽게 산정할 수 있으며 본 연구에서 제시한 응답 차트는 플랜트 또는 군사시설물의 내폭 설계에 활용될 수 있다.

산업시설 근접발파 시 발파진동 영향 분석 및 평가 (Analysis and Evaluation of the Effect of Blast-induced Vibration Adjacent to Industrial Facilities)

  • 곽창원;박인준;김영준
    • 대한토목학회논문집
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    • 제43권4호
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    • pp.459-468
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    • 2023
  • 발전소와 같은 산업시설은 국가 기간산업으로서 재해 발생 시 막대한 물적, 인적 피해가 발생하며 사회경제적 파급효과가 지대하다. 본 연구에서는 상업운전 중인 ○○발전소 부지 하부로 철도터널이 발파굴착될 때 발파진동의 특성과 영향을 평가하였다. 이를 위하여 진동 예민 구조물과 근접하여 발파한 기존 사례를 검토하고 발전소 근접 발파 시 합리적인 발파진동 허용 기준을 결정하였다. 발전소 내 주요 시설물들에 대한 발파진동 영향은 3차원 유한요소해석법에 의한 동적수치해석을 이용하여 발파하중 재하 시의 입자진동속도를 분석하고, 탁월주파수 산정을 통한 공진검토를 수행하였다. 해석결과 발파원과 가장 인접한 펌프기초에서 진동속도가 허용기준치에 근접하여 일부 발파패턴을 수정 후 계측하여 허용치 이내임을 확인함으로서 산업시설 근접발파 시 안정성을 확보할 수 있는 진동영향평가의 합리적인 의사결정과정을 확립하였다.

바닥발파에서 암질지수(RQD)와 발파진동상수 K, n의 관계 (Relationship between Rock Quality Designation and Blasting Vibration Constant "K" & Decay Constant "n" by Bottom Blasting Pattern)

  • 천병식;오민열
    • 한국지반공학회지:지반
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    • 제11권3호
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    • pp.55-68
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    • 1995
  • 본 연구는 수직구의 바닥굴착을 위한 바닥발파시 삼승근환산식과 자승근환산식의 발파진동상수 및 감쇠지수와 암질지수(RQD)와의 관계를 시험발파계측을 통하여 정리분석한 것이다. 각종 발파시 발파진동의 크기는 장약량, 발파원과 발파진동 측정지점과의 거리, 지반의 특성에 따라 크게 좌우되며 본 논문에서는 지반의 특성이 발파진동에 미치는 영향을 규명하기 위하여 암반의 절리특성을 대표하는 RQD와 발파진동 크기와의 관계를 연구한 것이다. 시험결과 RQD의 증가에 따라 발파진동상수 K와 감치지수 n의 절대치는 상대적으로 증가하는 것으로 나타났으며 본 연구결과에 의하여 향후 암질지수에 따른 바닥발파의 발파진동속도를 예측할 수 있다.

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고로 슬래그 시멘트 페이스트 내 자유염화물량과 물가용성 염화물량 평가에 관한 연구 (A Study on the Evaluation of the Water-soluble Chloride Content and Free-chloride Content in Blast Furnace Slag Cement Pastes)

  • 조영국;소승영
    • 한국건축시공학회지
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    • 제4권4호
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    • pp.95-101
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    • 2004
  • The purpose of this paper is to compare free-chloride content with water-soluble chloride in blast furnace cement(BSC) paste. The content of free-chloride in cement paste measured by pore solution analysis and water-soluble chloride measured by ASTM. The result of this study are as follows: 1. The concentration of chloride ion in pore solution of BSC-solidified matrix is almost as low as 43-71% compared to that of OPC-solidified matrix containing the same chloride content in cement paste. 2. The binding capacity of specimens, OPC Pl-P5, are 93.5-77%, but the binding capacity of specimens, BSC Pl-P5 are 97.1-86.1%, which is to be as high as 2-9.1% compared to OPC containing the same chloride content. 3. In terms of water-soluble chloride content in BSC paste are 15-31.7 percent of chloride addition but free-chloride content in pore solution are 2.9-13.9 percent of chloride addition. The free-chloride content in pore solution is 19.3-43.8 percent lower for the water-soluble chloride content in cement paste.

Study of Thiazoline Derivatives for the Design of Optimal Fungicidal Compounds Using Multiple Linear Regression (MLR)

  • Han, Won-Seok;Lee, Jin-Kak;Lee, Jun-Seok;Hahn, Hoh-Gyu;Yoon, Chang-No
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제33권5호
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    • pp.1703-1706
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    • 2012
  • Rice blast is the most serious disease of rice due to its harmfulness and its world wide distribution. $Magnaporthe$ $grisea$ is the cause of rice blast disease and destroys rice enough to feed several tens of millions of people each year. Fungicides are commonly used to control rice blast. But $M.$ $grisea$ acquires resistance to chemical treatments by genetic mutations. 2-Phenylimino-1,3-thiazolines were proposed as a novel class of fungicides against $M.$ $grisea$ in the previous study. To develop compounds with a higher biological activity, a new series of 2-phenylimino-1,3-thiazolines was synthesized and its fungicidal activity was determined against $M.$ $grisea$. The QSAR analysis was carried out on a series of 2-phenylimino-1,3-thiazolines. The QSAR results showed the dependence of fungicidal activity on the structural and physicochemical features of 2-phenylimino-1,3-thiazolines. Our results could be used as guidelines for the study of the mode of action and further design of optimal fungicides.

Characterizing of Rice Blast Lesion Mimic

  • Lee, Joo-Hee;Jaw, Nam-Soo
    • 한국식물병리학회:학술대회논문집
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    • 한국식물병리학회 2003년도 정기총회 및 추계학술발표회
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    • pp.68.1-68
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    • 2003
  • When plants are infected by plant pathogens, typical disease symptom termed lesion, appears in compatible interaction. Whereas, in incompatible interactions, only small speck of lesions are visible on the leaf surfaces. Hypersensitive response (HR) of plant which is the result of infection by incompatible pathogens, is a well known defense response inducing rapid cell death resulting in complete resistance. However, some rice mutants show spontaneous disease symptoms during the growth stages without interaction with pathogens. We investigated the spontaneous cell death mutant called Blast Lesion Mimic(BLM) generated by EMS mutation, on the relationship with the hypersensitive response as well as resistant characteristics. Accumulation of phenolic compounds were detected around the lesions as lesions develop on leaf surface. Activation of PR gene was detected before the lesion appeared, and that result indicates the defense-related response are started earlier than lesion formation. The BLM mutant showed resistant response to inoculation of Magnaporthe grisea KJ201 with which the wild type Hwacheong is totally susceptible. Informations on the formation of spontaneous lesions and detail analysis of lesion mimic mutants and related genes are very limited to date. It is really important to understand the phenomenon of the defense-related lesion formation for developing resistant cultivar for rice blast pathogens

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발파원 모델링을 위한 수치해석적 고찰 (A Study on the Numerical Modelling of Blast Source)

  • 백승규;류창하
    • 화약ㆍ발파
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    • 제21권4호
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    • pp.37-42
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    • 2003
  • 화약발파에 의한 암반의 파괴는 폭약의 열화학적 반응에 의해 생성되는 에너지가 주위 암반으로 전달되면서 발생한다. 폭약의 반응은 매우 짧은 시간에 격렬하게 이루어지므로 실험적 관찰이 용이하지 않을 뿐만 아니라, 암반을 대상으로 발파할 경우 암반의 불균질성, 이방성으로 인해 동일한 조건으로 실험을 하더라도 특성상 정량적 정성적으로 똑같은 상황을 반복적으로 재현하여 실험하는 것도 불가능하다. 따라서 폭약으로부터 발생하는 에너지와 암반으로의 전달과정은 암반 파괴의 에너지원으로서 매우 중요하면서도 명확히 파악되지 않은 부분이다. 본 논문에서는 수치해석적 방법으로 발파원과 암반의 거동을 모델링하여 발파원의 특성이 암반 거동에 미치는 영향을 고찰하였다. 주요 결과로는 발파원과 관련된 입력 자료로서 감쇠상수와 발파공벽에 가해지는 압력의 증가시간에 따라 암반의 동적거동이 상이하게 나타났으며, 동적 거동을 결정짓는 두 입력 변수의 상호관계를 유도할 수 있었다.

Evaluation of Sequential Planting Method for Screening of Durable Resistance against Rice Blast in Rice Breeding Program

  • Goh, Jaeduk;Kim, Byoung-Ryun;Shin, Dong Bum;Kang, In Jeong;Lee, Bong Choon;Kang, Hang-Won;Han, Seong-Sook
    • 식물병연구
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    • 제21권1호
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    • pp.20-23
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    • 2015
  • A sequential planting method was developed to screen rice plants with durable resistance against rice blast in a short time, and applied for several years in Korean rice breeding program. In this study, we showed the advantages of a sequential planting method compared to other pathogenicity tests. The correlation analysis among three pathogenicity tests and other factors demonstrated that durable resistance depended on the average of diseased leaf area and the number of compatible pathogens. Significant correlations were found in the nursery test but not in the field test result. In addition, we traced changes in the pathogen population during sequential planting stages through re-isolation of the pathogen. The portion of compatible pathogens was increased during sequential planting. Through this study, we provide an effective sequential planting method and direction of durable resistance in a breeding program.