• 한국광학회지
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• 제17권6호
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• pp.507-513
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• 2006

본 논문에서는 출력평면에 나타나는 원 영상을 재생시키기 위하여 위상 랩핑 방법을 이용하여 암호화 수준을 향상시키고 주파수 영역에서 위상 부호화하여 암호화함으로써 잡음에 강한 복호화 방법을 제안하였다. 암호화된 영상은 원 영상이 아닌 위상 변조된 가상 영상과 무작위 위상 영상을 곱하고 제로 패딩(ze.o-padding)하여 푸리에 변환한 후 이 변환된 복소 영상을 데이터 전송 및 매핑을 용이하게 하기 위하여 실수 값으로 변환하여 위상 부호화하여 만든다. 복호화 과정은 제안한 선형적인 영상을 비선형적인 영상으로 변환시키는 위상 랩핑 방법에 의해 각각 만들어진 암호화된 영상과 복호화 키를 곱하여 푸리에 역변환하여 공간필터를 가진 출력 평면에서 원 영상을 복원함으로써 광축 정렬 문제와 픽셀 대 픽셀 대응이 용이하여 복원영상의 해상도를 향상시킬 수 있다. 제안한 방법은 허가되지 않은 사용자가 암호화된 영상을 분석함으로써 있을 수 있는 복제 가능성을 원 영상의 어떤 정보도 포함하지 않은 가상 영상을 사용함으로써 배제할 수 있고 또한 실수 값을 위상 부호화함으로써 현재에 사용되는 공간 광 변조기로 표현이 가능하다. 컴퓨터 모의 실험을 통하여 제안한 암호화 방법의 적합성과 암호화된 영상과 복호화 키 영상에 잡음이 발생하더라도 원 영상의 복원이 가능함을 확인하였다.

• 한국콘텐츠학회논문지
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• 제14권4호
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• pp.407-417
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• 2014

우리 민족의 대표적인 민요이면서 동시에 유네스코 인류무형문화유산인 아리랑을 정보알고리즘 기법을 도입하여 후렴구를 중심으로 계통도를 분석하고 아리랑들 사이의 상관관계는 본문 단어중심으로 분석하였다. 아리랑의 계통도 분석은 생명체의 진화관계를 분석하는 알고리즘인 다중서열정렬 기법을 사용하였다. 분석한 아리랑 106개 중에서 38개 아리랑이 빠른 템포를 가지고 있었으며, 나머지 68개 아리랑이 느린 템포를 가지고 있었다. 이를 바탕으로 후렴구 기반 아리랑 계통도를 완성하였다. 아리랑 본문 단어는 아리랑에 있는 단어와 아리랑 제목을 노드로 하는 bipartate네트워크를 구축하고 이들로부터 73개 아리랑 및 104개의 핵심 단어를 추출하였다. 먼저, 이 데이터를 바탕으로 쌍대비교분석 기법을 사용하여 아리랑들 사이의 상관관계를 분석하였다. 또한, 네트워크 연결계수가 1인 노드를 단계적으로 제거하여 핵심네트워크를 구축한 다음 네트워크 기반으로 아리랑들 사이의 상관관계를 분석하였다. 그동안 아리랑을 어원 중심의 인문과학이나 음률적인 접근을 통하여 아리랑의 어원, 계통도, 상관관계를 분석하려는 연구가 있었다. 본 연구에서는 이러한 시도를 벗어나 과학적 접근방법인 정보알고리즘을 사용하여 아리랑을 분석함으로써 세계적인 문화유산의 위상을 한층 더 높이고 객관적인 결과를 통해서 아리랑의 대중화 및 세계화의 기틀을 마련함에 있어 그 방법론을 제시하였다.

• Korean Chemical Engineering Research
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• 제47권1호
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• pp.1-10
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• 2009

작은 크기의 고기능성 휴대용 전자기기 수요의 급증에 따라 기존에 사용되던 수평구조의 2차원 칩의 크기를 줄이는 것은, 전기 배선의 신호지연 증가로 한계에 도달했다. 이러한 문제를 해결하기 위해 칩들을 수직으로 적층한 뒤, 수평 구조의 긴 신호배선을 짧은 수직 배선으로 만들어 신호지연을 최소화하는 3차원 칩 적층기술이 새롭게 제안되었다. 3차원 칩의 개발을 위해서는 기존에 사용되던 반도체 공정들뿐 아니라 실리콘 관통 전극 기술, 웨이퍼 박화 기술, 웨이퍼 정렬 및 본딩 기술 등의 새로운 공정들이 개발되어야 하며 위 기술들의 표준 공정을 개발하기 위한 노력이 현재 활발히 진행되고 있다. 현재까지 4~8개의 단일칩을 수직으로 적층한 DRAM/NAND 칩, 및 메모리 칩과 CPU 칩을 한꺼번에 적층한 구조의 성공적인 개발 결과가 보고되었다. 본 총설에서는 이러한 3차원 칩 적층의 기본 원리와 구조, 적층에 필요한 중요 기술들에 대한 소개, 개발 현황 및 앞으로 나아갈 방향에 대해 논의하고자 한다.

• Journal of Ginseng Research
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• 제41권3호
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• pp.326-329
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• 2017

Background: Cultivated ginseng is often introduced as a substitute and adulterant of Russian wild ginseng due to its lower cost or misidentification caused by similarity in appearance with wild ginseng. The aim of this study is to develop a simple and reliable method to differentiate Russian wild ginseng from cultivated ginseng. Methods: The mitochondrial NADH dehydrogenase subunit 7 (nad7) intron 3 regions of Russian wild ginseng and Chinese cultivated ginseng were analyzed. Based on the multiple sequence alignment result, a specific primer for Russian wild ginseng was designed by introducing additional mismatch and allele-specific polymerase chain reaction (PCR) was performed for identification of wild ginseng. Real-time allele-specific PCR with endpoint analysis was used for validation of the developed Russian wild ginseng single nucleotide polymorphism (SNP) marker. Results: An SNP site specific to Russian wild ginseng was exploited by multiple alignments of mitochondrial nad7 intron 3 regions of different ginseng samples. With the SNP-based specific primer, Russian wild ginseng was successfully discriminated from Chinese and Korean cultivated ginseng samples by allele-specific PCR. The reliability and specificity of the SNP marker was validated by checking 20 individuals of Russian wild ginseng samples with real-time allele-specific PCR assay. Conclusion: An effective DNA method for molecular discrimination of Russian wild ginseng from Chinese and Korean cultivated ginseng was developed. The established real-time allele-specific PCR was simple and reliable, and the present method should be a crucial complement of chemical analysis for authentication of Russian wild ginseng.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제18권7호
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• pp.1235-1244
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• 2008

Indole-3-acetic acid (IAA) is produced commonly by plants and many bacteria, however, little is known about the genetic basis involving the key enzymes of IAA biosynthetic pathways from Bacillus spp. IAA intermediates from the Gram-positive spore-forming bacterium Paenibacillus polymyxa E681 were investigated, which showed the existence of only an indole-3-pyruvic acid (IPA) pathway for IAA biosynthesis from the bacterium. Four open reading frames (ORFs) encoding indole-3-pyruvate decarboxylase-like proteins and putative indole-3-pyruvate decarboxylase (IPDC), a key enzyme in the IPA synthetic pathway, were found on the genome sequence database of P. polymyxa and cloned in Escherichia coli DH5$\alpha$. One of the ORFs, PP2_01257, was assigned as probable indole-3-pyruvate decarboxylase. The ORF consisted of 1,743 nucleotides encoding 581 amino acids with a deduced molecular mass of 63,380 Da. Alignment studies of the deduced amino acid sequence of the ORF with known IPDC sequences revealed conservation of several amino acids in PP2_01257, essential for substrate and cofactor binding. Recombinant protein, gene product of the ORF PP2_01257 from P. polymyxa E681, was expressed in E. coli BL21 (DE3) as a glutathione S-transferase (GST)-fusion protein and purified to homogeneity using affinity chromatography. The molecular mass of the purified enzyme showed about 63 kDa, corresponding closely to the expected molecular mass of IPDC. The indole-3-pyruvate decarboxylase activity of the recombinant protein, detected by HPLC, using IPA substrate in the enzyme reaction confirmed the identity and functionality of the enzyme IPDC from the E681 strain.

• 대한치과교정학회지
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• 제49권2호
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• pp.124-136
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• 2019

Orthodontic treatment is more complicated when both soft and hard tissues must be considered because an impacted maxillary canine has important effects on function and esthetics. Compared with extraction of impacted maxillary canines, exposure followed by orthodontic traction can improve esthetics and better protect the patient's teeth and alveolar bone. Therefore, in order to achieve desirable tooth movement with minimal unexpected complications, a precise diagnosis is indispensable to establish an effective and efficient force system. In this report, we describe the case of a 31-year-old patient who had a labio-palatal horizontally impacted maxillary left canine with a severe occlusal alveolar bone defect and a missing maxillary left first premolar. Herein, with the aid of three-dimensional imaging, sequential traction was performed with a three-directional force device that finally achieved acceptable occlusion by bringing the horizontally impacted maxillary left canine into alignment. The maxillary left canine had normal gingival contours and was surrounded by a substantial amount of regenerated alveolar bone. The 1-year follow-up stability assessment demonstrated that the esthetic and functional outcomes were successful.

• 한국광학회지
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• 제17권3호
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• pp.248-255
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• 2006

본 논문에서는 결합 변환 상관 평면에 이동 변위에 따른 위상 성분의 영향을 또 다른 암호화 매개변수로 이용하여 무작위 위상 영상과 매개 변수 값을 암호화요소로 사용하는 광 암호화방법을 제안하였다. 암호화과정 시 사용자만이 알고 있는 이동 변위 수치를 원 영상에 더하여 위상 변조한 후, 위상 변조한 무작위 위상과 공간 영역에서 곱한다. 곱해진 영상을 푸리에 변환을 하여 최종 암호화 영상을 생성하며, 이 때 키 영상은 무작위 위상 영상을 푸리에 변환하여 얻는다. 생성된 암호화 영상은 원 영상을 재생 시키 영상과 이동 변위 수치 정보가 동시에 필요로 하며, 키 영상은 복소함수로 세기 검출기로 쉽게 복제가 힘들뿐만 아니라 설사 키 영상이 복제하거나 도난 또는 분실된 경우에도 불법 사용자는 이동 변위 정보를 획득해야만 원 영상 정보를 재생할 수 있으므로, 좀 더 높은 암호화 수준으로 원 영상 정보를 보호할 수 있다. 복호화 과정은 결합 변환 상관 평면에 암호화 영상과 키 영상을 암호화 시 사용한 이동 변위 값에 따라 위치시켜 간단히 구현할 수 있으며, 간섭계 구조나 4-f 상관기 구조를 이용하지 않으므로 광축 정렬이나 외부 환경 변화에 영향을 받지 않고 원 영상을 재생할 수 있다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제8권5호
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• pp.471-477
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• 1998

Taq DNA polymerase from Thermus aquaticus is very useful in the polymerase chain reaction. Taq DNA polymerase is classified in the pol I family, represented by E. coli DNA polymerase I. The three-dimensional structural alignment of 3'-5'exonuclease domains from the pol I family DNA polymerases explains why Taq DNA polymerase does not carry out proofreading in polymerase chain reactions. Three sequence motifs, Exo I, II, and III, must exist to carry out 3'-5'exonuclease activity for proof- reading by a 3'-5'exonuclease reaction, but these are abolished in Taq DNA polymerase. The key catalytic module in 3'-5'exonuclease is two metal ions chelated by four active-site carboxylic amino acids. Taq DNA polymerase was mutagenized to construct the catalytic module in the active site. The circular dichroism technique supported the formation of the catalytic module, and the radioactive assay showed that the 3'-5'exonuclease activity doubled in the mutant Taq DNA polymerase.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제29권8호
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• pp.1499-1504
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• 2008

Pyrazine derivatives bind to b-RAF receptor which is important in cancer therapy. The ligand-receptor interactions have been studied by comparative molecular field analysis (CoMFA) and molecular docking methods. Applying conventional ligand-based alignment schemes for the whole set was not successful. However, QM and DFT results suggested that some ligands have electrostatic interaction while others have steric interactions. On the basis of these results, we divided the dataset into two subsets. Electrostatic effect was found to be important in one set while steric effect for the other. Best docking modes were obtained for each subset based on the available crystal structure. These receptor-guided CoMFA models propose an interesting possibility which is difficult to obtain otherwise. i.e., in one binding mode the electrostatic interaction plays a key role for one subset ($q^2$ = 0.46, $r^2$ = 0.98), while in another binding mode steric effect is important with another subset ($q^2$ = 0.43, $r^2$ = 0.74).

• 환경생물
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• 제23권4호
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• pp.335-342
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• 2005

We cloned seven genes encoding chitin synthases (CHSs) by PCR amplification from genomic DNAs of four strains of the genus Sporobolomyces and of Bensingtonia subrosea using degenerated primers based on conserved regions of the CHS genes. Though amino acid sequences of these genes were shown similar as 176 to 189 amino acids except SgCHS2, DNA sequences were different in size, which was due to various introns present in seven fragments. Alignment and phylogenetic analysis of their deduced amino acid sequences together with the reported CHS genes of basidiomycetes separated the sequences into classes I, II and III. This analysis also permitted the classification of isolated CHSs; SgCHS1 belongs to class I, BsCHS1, SaCHS1, SgCHS2, SpgCHS1, and SsCHS1 belong to class II, and BsCHS2 belongs to class III. The deduced amino acid sequences involving in class II that were discovered from five strains were also compared with those of other basidiomycetes by CLUSTAL X program. The bootstrap analysis and phylogenetic tree by neighbor-joining method revealed the taxonomic and evolutionary position for four strains of the genus Sporobolomyces and for Bensingtonia subrosea which agreed with the previous classification. The results clearly showed that CHS fragments could be used as a valuable key for the molecular taxonomic and phylogenetic studies of basidiomycetes.