Communications for Statistical Applications and Methods
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제16권2호
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pp.325-334
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2009
In this research, we propose a nonparametric test procedure for the right censored and grouped data under the additive hazards model. For deriving the test statistics, we use the likelihood principle. Then we illustrate proposed test with an example and compare the performance with other procedure by obtaining empirical powers. Finally we discuss some interesting features concerning the proposed test.
In contrast to the multiplicative risk model, the additive risk model specifies that the hazard function with covariates is the sum of, rather than product of, the baseline hazard function and the regression function of covariates. We, in this paper, propose a method for checking the adequacy of the additive risk model based on partial-sum of matingale residuals. Under the assumed model, the asymptotic properties of the proposed test statistic and approximation method to find the critical values of the limiting distribution are studied. Several real examples are illustrated.
In this article, we propose a class of weighted estimators for the excess risk in additive risk model with a binary covariate. The proposed estimator is consistent and asymptotically normal. When the assumed model is inappropriate, however, the estimators with different weights converge to nonidentical constants. This fact enables us to develop a goodness-of-fit test for the excess assumption by comparing estimators with diffrent weights. It is shown that the proposed test converges in distribution to normal with mean zero and is consistent under the model misspecifications. Furthermore, the finite-sample properties of the proposed test procedure are investigated and two examples using real data are presented.
본 논문에서는 하나의 이진공변량(binary covariate)을 갖는 가산위험모형(additive risk model)의 적합도를 검정하기 위한 검정법을 제안하였다. 제안된 검정법은 마팅게일잔차(martingale residual)에 기초한 Wei(1984)의 비례위험모형(proportional hazards model)의 적합도검정법을 가산위험모형으로 확장한 형태이다. 제안된 검정통계량의 점근성질을 유도하였고 실제자료에 적용하여 보았다.
본 논문에서는 사망과 같은 종말사건의 발생 유무는 알고 있지만 치매 발병과 같은 중간사건이 구간중도절단 되었거나 연구 기간 도중에 추적이 끊겨 결측된 준경쟁적위험 자료에 대해 다중상태모형을 적용하여 모수를 추정하는 방법을 제안하였다. 이를 위해 본 논문에서는 상태 간의 전이강도는 로그정규 프레일티를 랜덤효과로 가진 Lin과 Ying(1994)의 가산위험모형을 따른다고 가정하였다. 다섯 가지 상태를 가진 다중상태모형에서 가능한 여섯 가지 경로별로 조건부우도를 정의하였고, 주변우도를 구하기 위해 조정중요표본추출법을 적용하였으며 반복유사뉴튼 방법으로 최적해를 구하였다. 소표본 모의실험을 통해 모수의 95% 신뢰구간 포함률이 명목값에 얼마나 가까운지 살펴보았으며, 제안한 모형을 Persones $Ag{\acute{e}}es$ Quid (PAQUID) 자료 (Helmer 등, 2001)에 적용하고 그 결과를 해석하였다.
Communications for Statistical Applications and Methods
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제22권4호
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pp.313-320
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2015
In this research, we compare the efficiency of two test procedures proposed by Prentice and Gloeckler (1978) and Park and Hong (2009) for grouped data with possible right censored observations. Both test statistics were derived using the likelihood ratio principle, but under different semi-parametric models. We review the two statistics with asymptotic normality and consider obtaining empirical powers through a simulation study. The simulation study considers two types of models the location translation model and the scale model. We discuss some interesting features related to the grouped data and obtain null distribution functions with a re-sampling method. Finally we indicate topics for future research.
Kim, Min Kyeong;Yoo, Kyong-Ah;Park, Eun Young;Joo, Jungnam;Lee, Eun Young;Eom, Hyeon-Seok;Kong, Sun-Young
Genomics & Informatics
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제14권4호
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pp.205-210
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2016
Interleukin-10 (IL10) plays an important role in initiating and maintaining an appropriate immune response to non-Hodgkin lymphoma (NHL). Previous studies have revealed that the transcription of IL10 mRNA and its protein expression may be infl uenced by several single-nucleotide polymorphisms in the promoter and intron regions, including rs1800896, rs1800871, and rs1800872. However, the impact of polymorphisms of the IL10 gene on NHL prognosis has not been fully elucidated. Here, we investigated the association between IL10 polymorphisms and NHL prognosis. This study involved 112 NHL patients treated at the National Cancer Center, Korea. The median age was 57 years, and 70 patients (62.5%) were men. Clinical characteristics, including age, performance status, stage, and extra-nodal involvement, as well as cell lineage and International Prognostic Index (IPI), were evaluated. A total of four polymorphisms in IL10 with heterozygous alleles were analyzed for hazard ratios of overall survival (OS) and progression-free survival (PFS) using Cox proportional hazards regression analysis. Diffuse large B-cell lymphoma was the most common histologic type (n = 83), followed by T-cell lymphoma (n = 18), mantle cell lymphoma (n = 6), and others (n = 5). Cell lineage, IPI, and extra-nodal involvement were predictors of prognosis. In the additive genetic model results for each IL10 polymorphism, the rs1800871 and rs1800872 polymorphisms represented a marginal association with OS (p = 0.09 and p = 0.06) and PFS (p = 0.05 and p = 0.08) in B-cell lymphoma patients treated with rituximab plus cyclophosphamide, doxorubicin, vincristine, and prednisone (R-CHOP). These findings suggest that IL10 polymorphisms might be prognostic indicators for patients with B-cell NHL treated with R-CHOP.
Over-expression of de novo lipogenesis (DNL) genes is associated with the prognosis of various types of cancers. However, the effects of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in these genes on recurrence and survival of non-small cell lung cancer (NSCLC) patients after surgery are still unknown. In this study, a total of 500 NSCLC patients who underwent surgery treatment were included. Eight SNPs in 3 genes (ACACA, FASN and ACLY) of the DNL pathway were examined using the Sequenom iPLEX genotyping system. Multivariate Cox proportional hazards regression and Kaplan-Meier curves were used to analyze the association of SNPs with patient survival and tumour recurrence. We found that two SNPs in the FASN gene were significantly associated with the recurrence of NSCLC. SNP rs4246444 had a significant association with lung cancer recurrence under additive model (hazard ratio [HR], 0.82; 95% confidence interval [95%CI], 0.67-1.00; p=0.05). Under the dominant model, rs4485435 exhibited a significant association with recurrence (HR, 0.75; 95%CI, 0.56-1.01; p=0.05). Additionally, SNP rs9912300 in ACLY gene was significantly associated with overall survival in lung cancer patients (HR, 1.41; 95%CI, 1.02-1.94, p=0.04) under the dominant model. Further cumulative effect analysis showed moderate dose-dependent effects of unfavorable SNPs on both survival and recurrence. Our data suggest that the SNPs in DNL genes may serve as independent prognostic markers for NSCLC patients after surgery.
감자 6품종인 수미(SP), 대서(AT), 하령(HR), 고운(GU), 홍영(HY), 자영(JY)을 대상으로, 해발고도별로 재배환경이 다른 강릉(E1), 진부(E2), 대관령(E3) 지역에서 2012년과 2013년 재배하여 괴경 수량성과 글리코알카로이드(PGA) 함량을 평가하였다. 품종이 가지고 있는 유전적 특성은 품종 고유의 유전형(G)과 재배환경(E)과의 상호작용($G{\times}E$)을 거쳐 발현되므로 본 연구에서는 AMMI 모델과 GGE biplot 분석을 통해 지역별 수량성과 PGA 함량 변화 양상을 검토하였다. 1. 감자 수량은 재배환경과 상호작용이 차지하는 비율이 높고, PGA 함량은 유전형(품종)의 효과가 차지하는 비율이 높은 것으로 나타났다. 2. 지역별로 높은 수량을 나타내는데 적합한 품종으로 강릉에서 '수미', 진부에서 '고운', 대관령 에서 '하령'이었으며, 수량이 높으면서 생산 안정성을 보인 품종은 수미였다. 3. 지역별로 높은 PGA 함량을 보이는 품종으로 강릉에서 '하령', 진부에서 '대서', 대관령에서 '수미'이었으며, PGA 함량이 낮으면서 재배환경에 영향을 덜 받는 안정성이 뛰어난 품종은 '고운'이었다. 4. 감자 품종의 양적 농업 형질인 수량은 재배환경에 따라 차이를 보였으며, PGA 함량은 품종 고유의 형질 차이에 의해 다르게 나타났다. 5. 감자의 수량성을 확보하기 위해서는 재배 적지의 선정이 중요하고, PGA 함량을 낮추기 위해서는 저함유 품종 개발이 선행되어야 한다고 판단되었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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