• 제목/요약/키워드: 96-well plate

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A Neutravidin-based Assay for Reverse Transcriptase Suitable for High Throughput Screening of Retroviral Activity

  • Brennan, Lyndall E.;Sune, Carlos;Klimkait, Thomas
    • BMB Reports
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    • 제35권3호
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    • pp.262-266
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    • 2002
  • A non-isotopic neutravidin-based reverse transcriptase (RT) assay adapted for high throughput screening of HIV activity is described. Using a 96-well microtitre plate, HIV particles are lysed and the RT enzyme released into a reaction mixture containing poly(A) RNA, biotinylated oligo d(T) and fluorescein-labelled dUTP (FI-dUTP). With poly(A) as a template and oligo d(T) as primer, the viron RT incorporates FI-dUTP into an elongating DNA strand. The resulting product is captured on a neutravidin-coated 96-well plate and the unincorporated nucleotides removed by a series of washing steps. A simple ELISA is subsequently performed using a monoclonal antifluorescein antibody conjugated to alkaline phosphatase. Quantification of RT activity is facilitated by a colorimetric readout. The assay was validated in the context of a diagnostic HIV-1 phenotyping assay. Using supernatants from HIV-1 infected lymphocyte cultures the assay was shown to be as sensitive as a radioactive assay and the RT activity correlated well with levels of cell-asociated HIV-p24. Importantly, even minor reductions of RT activity by virus variants with reduced fitness could be distinguished.

High throughput automated 96-well solid-phase extraction and liquid chromatography-tandem mass spectrometric analysis of beraprost in human plasma

  • Chang, Kyu-Young;Kim, Ho-Hyun;Lee, Hee-Joo;Lee, Kyung-Ryul
    • 대한약학회:학술대회논문집
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    • 대한약학회 2003년도 Proceedings of the Convention of the Pharmaceutical Society of Korea Vol.2-2
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    • pp.224.1-224.1
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    • 2003
  • A sensitive and selective liquid chromatographic method coupled with tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) was developed for the determination of beraprost in human plasma. Plasma samples were transferred into 96-well OASIS HLB extraction plate using an automated sample handling system and the drugs were eluted with methanol. The eluents were then evaporated and reconstituted with water. All sample transfer and solid-phase extraction (SPE) was automated through the application of both the PerkinElmer MultiPROBE II HT and TOMTEC Quadra 96 workstation. (omitted)

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투영면 컨벌루션과 결정트리를 이용한 상태 적응적 차량번호판 인식 시스템 (Adaptive Vehicle License Plate Recognition System Using Projected Plane Convolution and Decision Tree Classifier)

  • 이응주;이수현;김성진
    • 한국멀티미디어학회논문지
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    • 제8권11호
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    • pp.1496-1509
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    • 2005
  • 본 논문에서는 투영면 컨벌루션과 결정트리 분류기법을 사용하여 주변 환경이 복잡한 차량영상으로부터 실시간으로 번호판을 추출하고 인식하는 적응적 차량번호판 인식 시스템을 제안하였다. 일반적으로 고속도로 톨게이트와 주차장 출입구에서의 차량영상은 설치 카메라와 도로 환경에 따라 차량번호판의 크기, 각도변화, 주변잡음 등으로 매우 다양하므로 번호판 추출과 분할이 어렵다. 따라서 본 논문에서는 차량 영상을 획득한 후 번호판 후보영역을 검출하고 진입 위치 변화에 따라 번호판의 기울기와 크기를 자동으로 보정하여 인식하는 알고리즘을 제안하였다. 제안한 인식 방법은 차량의 에지누적 분포와 번호판의 일정한 명암값 변화 빈도수를 누적한 투영면 컨벌루션과 체인코드를 사용하여 크기와 기울기가 일정하지 않은 번호판으로부터 번호판영역을 정확히 추출하고, 적응적 이진화 기법을 이용하여 문자를 분할하였다. 본 논문에서 제안한 방법으로써 실험한 결과 복잡한 영상에서 전방 및 후방 차량영상으로부터 번호판 인식이 가능하였으며 각각 $98.8\%$$95.5\%$의 추출률과 분할된 문자영역에서 $97.3\%$$96\%$의 인식률 개선 결과를 나타내었다.

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PIV 기법을 이용한 초음속 평판 경계층의 속도 분포 측정 (Velocity profile measurement of supersonic boundary layer over a flat plate using the PIV technique)

  • 이혁;김영주;변영환;박수형
    • 한국항공우주학회지
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    • 제44권6호
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    • pp.477-483
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    • 2016
  • 본 연구는 Particle Image Velocimetry(PIV) 기법을 이용하여 마하수 2.96의 평판에 대해 층류, 천이, 난류 경계층의 속도 분포를 측정하였다. Schlieren 가시화 기법과 PIV 기법을 이용하여 앞전에서 발생한 경사 충격파가 평판 위의 유동장에 영향을 주는지 확인하였다. 층류 경계층의 경우, 실험에서 측정한 속도 분포가 압축성 Blasius 속도 분포를 만족하였다. 천이 경계층의 속도 분포는 벽면 부근부터 이론적인 난류 속도 분포로 변했으며, Re = $1.41{\times}10^6$에서 천이가 시작되었다. 난류 경계층 영역에서는 압축성 효과를 고려한 Van Driest 변환 속도가 비압축성 로그 법칙을 만족하였다. 또한 로그 구간이 끝나는 위치($y/{\delta}{\approx}0.28$)가 비압축성 난류 경계층($y/{\delta}{\approx}0.2$)에 비해 벽면에서 더 멀어진 것을 확인하였다.

Adenosine Deaminase 표지유전자로 형질전환된 연초의 신속한 Assay 방법 (Visible and Fast Assay System for Tobacco Transformant Introduced with Adenosine Deaminase Marker Gene)

  • 양덕춘;김용환;임학태;방극수;배창휴
    • 식물조직배양학회지
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    • 제28권3호
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    • pp.165-171
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    • 2001
  • Adenosine deaminase 유전자를 연초의 형질전환용 표지유전자로 활용할 때 형질전환체 여부를 매우 빠르고 눈으로 직접 색깔을 확인할 수 있는 새로운 방법이 개발되었다. ADA 효소는 독성인 adenosine 유도체를 비독성인 inosine 유도체와 암모니아로 변환시키는데, 이때 형성된 암모니아를 phenol-nitoprusside와 alkaline-hypochlorite 용액을 이용하여 청색으로 변환시켜 96 well plate상에서 1시간 내에 형질전환체 여부를 쉽게 확인할 수 있게 되었다. ADA효소의 substrate로서 9-D-arabinofuranosyl adenine, cordycepin, 2'-deoxyadenosine, adenosine and xylofuranosyl adenine이 모두 가능하였으며, substrate 용액의 최적조건은 adenosine 10 mM과 pH 7.5이었다. 특히 형질전환체는 ADA효소의 inhibitor인 deoxycoformycin이 함유되어 있는 용액 속에서는 adenosine을 inosine과 암모니아로 변환시키지 못해 색깔의 변화가 없었는데, 이는 형질전환체에서 색깔의 변화는 ADA효소의 작용 때문에 일어나는 것을 의미한다. 따라서 본 연구결과는 ADA 표지유전자가 도입된 형질전환체의 확인에 있어서 GUS gene system과 같이 눈으로 직접 확인할 수 있을 뿐만 아니라 매우 작은 크기의 형질전환체 절편으로 쉽고, 빠르면, 값싸게 확인할 수 있게 되었다.

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치과용 유니트 수관에서 분리한 세균의 부착 및 바이오필름 형성 능력 (Adhesion and Biofilm Formation Abilities of Bacteria Isolated from Dental Unit Waterlines)

  • 윤혜영;이시영
    • 치위생과학회지
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    • 제18권2호
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    • pp.69-75
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    • 2018
  • 우리 연구의 목적은 DUWL에서 배출되는 물에서 분리한 균주의 부착 능력과 바이오필름 형성 능력을 확인하고 두 능력 사이 관계를 확인하는 것이다. DUWL로부터 분리한 12균주를 실험에 사용하였다. 각 균주의 부착 능력을 확인하기 위해, 12-well plates의 각 well에 멸균된 glass coverslip, R2A 액체 배지, 그리고 $1{\times}10^8CFU/ml$의 농도로 조정된 세균 현탁액을 넣고 $26^{\circ}C$ 배양기에서 7일 동안 배양하였다. 배양 후, glass coverslip에 부착한 정도에 따라 1~3점으로 점수를 부여하였다. 분리 균주의 바이오필름 형성 능력을 확인하기 위해, 96-well polystyrene flat-bottom microtiter plate에 R2A 액체 배지와 세균 현탁액을 넣고 $26^{\circ}C$에서 7일 동안 배양하였다. 배양 후, plate에 형성된 바이오필름은 R2A 액체 배지에 현탁했고, 현탁액을 R2A 고체 배지에 도말하였다. $26^{\circ}C$에서 7일 배양한 후 세균의 집락을 계수하고 CFU/ml를 계산하였다. DUWL로부터 총 56균주가 분리되었으며, 12속과 31종을 포함하였다. 실험에는 속당 1균주씩 선택하여 총 12균주가 사용되었다. 12균주 중에 S. echinoides, M. aquaticum, C. pauculus의 부착 능력 점수는 +3으로 가장 높았다. 바이오필름 축적량은 C. pauculus가 가장 많았고, M. testaceum이 가장 적었다. 대부분의 부착 능력이 높은 균주는 바이오필름 형성 능력 또한 높았다. 본 연구의 결과는 DUWL 바이오필름의 형성 기전을 파악하는데 도움을 주며 나아가 바이오필름 형성을 억제하는 방법의 개발에 기본적인 정보를 제공할 수 있을 것이다.

선인장 추출물이 인체 장내미생물에 미치는 영향 (Effects of Cactus Extracts on Human Intestinal Microflora)

  • 라보현;이운종;조윤원;김광엽
    • 농업생명과학연구
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    • 제43권3호
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    • pp.45-54
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    • 2009
  • 본 연구에서는 인체 내 장내 세균 및 병원성 식중독 세균에 선인장 추출물이 미치는 영향과 항산화, 항고혈압 활성에 대하여 분석하였다. 항균활성은 96well-plate법과 paper disc법을 이용하여 실험하였으며 줄기 추출물의 경우 96well-plate 및 paper disc법의 결과, 장내유해균인 Eubacterium limosum 및 Clostridium perfringens, C. butyricum, C. difficile과 Staphylococcus aureus에 대하여 높은 억제율을 보였으나 Bacteroides fragilis, Bifidobacterium bifidum, Lactobacillus acidophilis, Streptococcus thermophilus의 경우 억제율을 나타내지 않았다. 열매 추출물의 경우 장내유해균 및 장내유익균에 Bacteroides fragilis, Bifidobacterium bifidum, Lactobacillus acidophilis, and Streptococcus thermophilis에 대하여 억제율을 나타내지 않았다. 또한 줄기 추출물의 경우 열 및 pH에서도 장내미생물에 대한 항균활성에 안정함을 나타내었다. 선인장 추출물의 폴리페놀과 플라보노이드 함량 및 DPPH 전자공여능을 측정한 결과 열처리하지 않은 열매와 줄기 추출물의 폴리페놀은 3.02 mg/g, 5.85 mg/g, 플라보노이드는 1.04 mg/g, 2.1 mg/g, 전자공여능은 87, 88%로 높은 수율을 나타내었다. 선인장 추출물의 항고혈압활성은 줄기 추출물의 경우 88.8% 열매 추출물의 경우 69.2%의 항고혈압활성을 보였으며 상기 결과를 종합할 때, 선인장 줄기추출물은 장내 유해균의 억제 및 유익균의 증진을 통한 장내 균총 개선을 위한 기능성 식품소재로 활용할 수 있다고 판단된다.

중금속 상호간의 작용 및 착화제에 의한 세포독성의 억제효과 (Decreased Effectiveness on Cytotoxicity of Metal-Metal and Metal-Chelator Combinations)

  • 김재민
    • 한국안광학회지
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    • 제1권1호
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    • pp.115-118
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    • 1996
  • 생쥐 섬유모세포주 L929 세포에 미치는 중금속류와 중금속 착화제의 세포독성 정도를 측정하기 위해 96 well microtiter plate를 이용한 간편한 비색검정 방법, 즉 neutral red(NR)와 tetrazolium MTT 정량을 실시하였다. NR과 MTT정량으로 측정한 결과 세포독성은 카드뮴 > 아연 > 니켈 > 3가크롬의 순서로 나타났다. 또한 두개의 중금속을 동시에 처리한 결과 아연에 의해 카드뮴의 독성이 감소되었으며 니켈과 크롬을 동시에 처리한 결과 니켈의 독성이 감소하였다. 그리고 착화제로 EDTA와 Chitosan을 처리한 결과 세포독성이 현저하게 감소되는 것으로 나타났다.

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재조합 박테리아 바이오센서의 고정화: 페놀계 화합물의 현장 검출을 위한 간단한 접근 방법 (Immobilization of Recombinant Bacterial Biosensors: a Simple Approach for the On-Site Detection of Phenolic Compounds)

  • 신혜자
    • 생명과학회지
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    • 제21권9호
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    • pp.1323-1328
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    • 2011
  • 본 연구에서는 페놀 화합물들을 현장에서 검출하기 위해 간단하고 간편한 일회용 재조합 박테리아 바이오센서 시스템을 개발하였다. 플라즈미드 pLZCapR을 함유하는 E. coli 세포를 ${\beta}$-galactosidase 기질인 CPRG와 함께 96-well plate의 wells에 agarose로 고정하였다. 이 바이오센서는 현장에서 발색을 위한 별도의 기질을 추가하거나 불편한 기기 사용 또는 시료의 전 처리를 필요로 하지 않는다. 시료의 측정은 간단히 적은 부피(<100 ${\mu}l$)의 현장 시료를 바이오센서를 포함하는 wells에 넣고 발색을 관찰하여 측정하였다. 또한 6% DMF, 0.1% SDS 그리고 10 mM $CaCl_2$를 첨가하여 agarose 고정에 의한 화합물의 세포내 확산 제한을 감소시켜 보다 더 나은 발색을 얻을 수 있었다. 따라서 이 고정된 미생물 유래 재조합 바이오센서 시스템은 현장에서 환경오염물질들을 간단하게 확인하고 정량 하는 유용한 접근 방법이 될 것으로 사료된다.

Simultaneous Characterization of Sofalcone and Its Metabolite in Human Plasma by Liquid Chromatography -Tandem Mass Spectrometry

  • Han, Sang-Beom;Jang, Moon-Sun;Lee, Hee-Joo;Lee, Ye-Rie;Yu, Chong-Woo;Lee, Kyung-Ryul;Kim, Ho-Hyun
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제26권5호
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    • pp.729-734
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    • 2005
  • A sensitive and selective method for quantitation of sofalcone and its active metabolite in human plasma has been established using liquid chromatography-electrospray ionization tandem mass spectrometry (LC-ESI/MS/MS). Plasma samples were transferred into 96-well plate using an automated sample handling system and spiked with 10 $\mu$L of 2 $\mu$g/mL $d_3$-sofalcone and $d_3$-sofalcone metabolite solutions (internal standard), respectively. After adding 0.5 mL of acetonitrile to the 96-well plate, the plasma samples were then vortexed for 30 sec. After centrifugation, the supernatant was transferred into another 96-well plate and completely evaporated at 40 ${^{\circ}C}$ under a stream of nitrogen. Dry residues were reconstituted with mobile phase and were injected into a $C_{18}$ reversed-phase column. The limit of quantitation of sofalcone and its metabolite was 2 ng/mL, using a sample volume of 0.2 mL for analysis. The reproducibility of the method was evaluated by analyzing 10 replicates over the concentration range of 2 ng/mL to 1000 ng/mL. The validation experiments of the method have shown that the assay has good precision and accuracy. Sofalcone and its metabolite produced a protonated precursor ion ([M+H]$^+$) of m/z 451 and 453, and a corresponding product ion of m/z 315 and 317, respectively. Internal standard ($d_3$-sofalcone and $d_3$-sofalcone metabolite) produced a protonated precursor ion ([M+H]$^+$) of m/z 454 and 456 and a corresponding product ion of m/z 315 and 317, respectively. The method has been successfully applied to a pharmacokinetic study of sofalcone and its active metabolite in human plasma.