• 대한임상검사과학회지
• /
• 제50권4호
• /
• pp.414-421
• /
• 2018

본 연구에서는 일개 대학병원에서 2년간 분리된 혈액배양 양성배지에서 MALDI-TOF MS system을 이용하여 Gram-positive bacilli를 동정한 결과를 균종별, 분기별로 분석하였다. Corynebacterium striatum은 총 89균주 중 66균주 (74.2%), Bacillus cereus는 60균주 중 44 균주 (73.3%), Listeria monocytogenes는 25균주 중 25균주 (100%)로 2.0이상의 높은 스코어에서 동정되었다. 미 동정 된 균주는 303균주 중 293균주는 혈액배양에서 1회 분리 균주로 감염균으로서의 의의가 없는 오염 균주로 간주되었다. 감염균으로서 의의가 있는 동일 환자 2회 이상 분리 균주 대상 16S-rRNA sequencing 비교결과 총 50균주 중 43균주가 일치해 86.0% 동정이 가능하였다. 일치하지 않은 7균주 중 5균주는 MALDI-TOF MS로도 동정이 되지 않았다. 결론적으로 혈액배양에서 Gram-positive bacilli가 동정되는 경우, 일차적으로 MALDI-TOF MS를 이용하여 동정해보고 이를 활용한다면 어렵고 비용이 많이 들던 Gram-positive bacilli 동정이 저비용으로 더욱 간편하고 정확해지며, Gram-positive bacilli에 의한 감염 진단에도 도움이 될 것으로 판단된다.

• BMB Reports
• /
• 제32권1호
• /
• pp.12-19
• /
• 1999

Gaegurin 4 (GGN4), a broad-spectrum antibiotic, is a 37-amino acid peptide isolated from the Korean frog, Rana rugosa. In this study, we have chemically synthesized and purified GGN4 analogues where the C-terminal portion is truncated and/or substituted with tryptophan. These peptides show significantly different biological activities depending on the location of tryptophan and the number of amino acids truncated from the C-terminal end. While deletion of 9 amino acids from the C-terminal seems to be marginally tolerable in maintaining the antimicrobial activity, further deletion of up to 14 amino acid residues decreases the potency by more than 60-fold towards Gram-positive, and 10-fold towards Gram-negative, bacteria. Surprisingly, the reduced activity of the shorter peptide can be completely restored by a single substitution of aspartic acid 16 to tryptophan 16 (D16W). Also, the truncation seems to decrease the specificity of antibiotic activity more towards Gram-positive than towards Gram-negative bacteria studied. These data suggest a partial role of the C-terminal region in determining the binding specificity and the activity of peptides upon binding to their target cell membranes.

• 대한산업공학회지
• /
• 제41권4호
• /
• pp.381-388
• /
• 2015

The rapid growth of the World Wide Web and online information services has generated and made accessible a huge number of text documents. To analyze texts, selecting important keywords is an essential step. In this paper, we propose a feature selection method that combines a term frequency-inverse document frequency technique and symmetrical conditional probability. The proposed method can identify features with N-gram, the sequential multiword. The effectiveness of the proposed method is demonstrated through a real text data from the machine learning repository, University of California, Irvine.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
• /
• 제30권3호
• /
• pp.687-690
• /
• 2009

A series of novel 1,3-diallyltrisulfane analogues were synthesized and assayed in vitro for antimicrobial activity against Gram positive, Gram negative bacteria and fungi. The antimicrobial activity of the 1,3-diallyltrisulfane derivatives showed, on the whole, very potent towards all the tested Gram positive, Gram negative and fungi (MIC ranging from 4 to 256 μg/mL). 1,3-Di(pent-4-enyl)trisulfane 3b and 1,3-bis(3-methylbut-2-enyl)trisulfane 3e exhibited the strongest antibacterial activity among all the compounds, and both of them were more active than 1,3-diallyltrisulfane (DATS). Results indicated the relationship of either carbon number or lipophilicity with antimicrobial activity presented “V” shape. These observations provided some predictions in order to further design 1,3-diallyltrisulfane derivatives with antimicrobial activity.

• Journal of Microbiology
• /
• 제40권4호
• /
• pp.267-273
• /
• 2002

Urinary tract infection (UTI) is one of the most common domiciliary and nosocomial bacterial infections prevalent in both males and females. UTI is diagnosed on the basis of clinical symptoms, microscopy and culture of urine. In order to evaluate the efficacy of microscopic detection for presumptive diagnosis of UTI we analyzed urine samples of Nepalese patients. We have conducted Gram staining and counting of pus cells, red blood cells (RBC) and epithelial cells. We observed that RBC and epithelial cell counts were not sensitive enough to be used for presumptive diagnosis of UTI. However, pus cell counts as well as Gram stain are sensitive and significant enough to presume UTI. When the Gram stain result was compared with the culture result, it was statistically significant. From this, we suggest that Gram stain of centrifuged urine is a very sensitive screening method to detect bacteriuria. In addition, we found that E. coli was the most predominant microorganism causing UTI and nitrofurantoin was the most effective antibiotic against the isolated urinary pathogens.

• 한국정보과학회 언어공학연구회:학술대회논문집(한글 및 한국어 정보처리)
• /
• 한국정보과학회언어공학연구회 2012년도 제24회 한글 및 한국어 정보처리 학술대회
• /
• pp.185-190
• /
• 2012

본 논문은 동아, 조선, 중앙, 한겨레 신문의 2009년 신문 사설의 제목과 본문에서 나타나는 n-gram에 대한 논의이다. 구체적으로 자주 출현하는 단어들의 연속 단위 3~6개의 형태소를 추출하여 신문 사설에서 나타난 고빈도 형태소 연속체를 살펴본다. 또한 이들을 기사문에서 추출한 패턴과 로그공산비로 비교하여 신문 사설에서 더 특징적인 의미로 사용되는 어휘들을 살펴본다. 그 결과, 사설 본문에서는 3-gram은 '아야 한다'. 4-gram은 'ㄹ 것이다', 5-gram은 'ㄹ 수밖에 없다', 6-gram은 '아야 할 것이다' 등이, 사설 제목은 '것인가, 안 된다'가 하나의 용어처럼 사용되고 있었다. 이러한 형태소 연속체를 살펴봄으로써, 신문사설의 텍스트 특징과 정형적인 표현에 대해서 살펴볼 수 있다.

• Applied Biological Chemistry
• /
• 제17권2호
• /
• pp.117-124
• /
• 1974

23종(種)의 대표적(代表約)인 세균(細菌)에 대(對)하여 glucosamine 함량(含量)을 측정(測定)하여 당지질(糖脂質)의 분포(分布)를 조사(調査)하고 당지질(糖脂質)의 함량(含量)과 Gram염색(染色)과의 상관관계(相關關係)를 규명(究明)한바 다음과 같은 결과(結果)를 얻었다. 1. Gram음성균(陰性菌) 및 varieable균(菌)은 그 균체(菌體) 당지질중(糖脂質中) glucosamine함량(含量)이 최소(最少) Proteus vulgaris의 $0.04{\mu}g$에서 부터 최고(最高) Aerobacter aerogenes 의 $2.48{\mu}g$의 범위(範圍)로 분포(分布)되여 있었다. Gram positive균(菌) 및 Bacillus속중(屬中)의 Gram양성균(陽性菌)은 전부(全部) $0.02{\mu}g$ 이하(以下)의 함량(含量)을 갖고 있었다. Gram양성(湯性)인 Corynebacterium sepedonicum 및 Staphylococcus aureaus는 특(特)히 glucosamine함량(含量)이 최소(最少)였다. 이들보다 Gram음성균(陰性菌)은 양성균(湯性菌)과 명확(明確)히 구별(區別)할 수 있을만큼 glucosamine함량(含量)이 많았다. 2. Gram염색(染色)은 당지질(糖脂質) 추출전(抽出前)보다 추출후(抽出後)가 염색(染色)이 더 잘되는 경향(傾向)이였다. 3. Aerobacter aerogenes, Bacillus circulans, Pseudomonas fluorescens 및 Salmonella typhirurium의 4균주(菌株)에서 얻은 당지질(糖脂質)의 적외선(赤外線) spectra는 대체(大體)로 같았으며 다 OH-group C-O, C-O-C, $CH_2+CH_3$, amide 결합(結合), 지방산(脂肪酸) ester 결합(結合), ester carbonyl 결합(結合)의 존재(存在)를 확인(確認)하였다.

• 한국축산식품학회지
• /
• 제37권4호
• /
• pp.502-510
• /
• 2017

This study investigated bacterial growth-inhibitory effect of 69 therapeutic herbal plants extracts on 9 bacterial strains using a disc diffusion assay. Especially, the antimicrobial activity of Psoraleae semen, which showed different activity on pathogenic Gram-positive and Gram-negative bacteria, was evaluated by MIC (minimal inhibition concentration) and biofilm formation assay. The effect of Psoraleae semen extract on bacterial cell membranes was examined by measurement of protein leakage (optical density at 280 nm) and scanning electron microscope (SEM). No clear zone was formed on discs containing Gram-negative bacteria, but Gram-positive bacteria exhibited clear zones. The MICs of Psoraleae semen extract were $8{\mu}g/mL$ for Streptococcus mutans, and $16{\mu}g/mL$ for Enterococci and Staphylococcus aureus. In addition, biofilm formation was inhibited at concentration $8-16{\mu}g/mL$. Protein leakage values and SEM images revealed that cell membranes of Gram-positive bacteria were impaired following exposure to the extract. Further, the extract inhibited the growth of Listeria monocytogenes in sausages. These results indicate that Psoraleae semen extract could be utilized as a natural antimicrobial agent against Gram-positive bacteria.

• 한국지능시스템학회논문지
• /
• 제25권4호
• /
• pp.386-391
• /
• 2015

본 논문에서는 한국어와 중국어의 언어학적인 특징을 고려하여 문서 자동분류 시스템의 성능을 높일 수 있는 최적의 자질어 단위를 제안한다. 언어 종속적 단위인 형태소 자질어와 언어 독립적 단위인 n-gram 자질어 그리고 이들을 조합한 복합 자질어 집합을 대상으로 각 언어의 인터넷 신문기사를 SVM으로 분류하는 실험을 수행하였다. 실험 결과, 한국어 문서분류에서는 bi-gram이 F1-measure 87.07%로 가장 좋은 분류 성능을 보였고, 중국어 문서분류에서는 'uni-gram 명사 동사 형용사 사자성어'의 복합 자질어 집합이 F1-measure 82.79%로 가장 좋은 성능을 보였다.

• 정보처리학회논문지:컴퓨터 및 통신 시스템
• /
• 제2권4호
• /
• pp.177-180
• /
• 2013

소프트웨어 버스마크는 프로그램을 인식하는데 사용될 수 있는 고유한 특징을 의미한다. 소프트웨어 버스마크는 단순한 프로그램 변환에 의해서 삭제되지 않기 때문에 코드 도용을 탐지하는데 사용된다. 본 논문에서는 안드로이드 앱에 대한 API k-gram 기반의 버스마크 기법을 제안한다. 안드로이드 SDK는 프로그래머가 쉽게 앱을 개발할 수 있도록 다양한 라이브러리를 제공한다. 그리고 안드로이드 SDK를 사용하기 위해서는 반드시 API 메소드 호출을 이용해야만 한다. API 메소드 호출 명령어는 다른 명령어로 바꾸거나 삭제하기 어렵기 때문에 애플리케이션의 고유한 특징으로서 사용될 수 있다. 본 논문에서 제안하는 버스마크의 효용성을 보여주기 위해서 기존의 버스마크 기법과 비교하였고 오픈소스 앱을 대상으로 평가하였다. 실험으로부터 API k-gram 버스마크가 기존 버스마크보다 신뢰도와 강인도가 높은 것을 확인하였다.