• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제26권4호
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• pp.537-542
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• 2005

It was proposed that Ru(II)[(1,10-phenanthroline)$_2$dipyrido[3,2-a:2',3'-c]phenazine ([Ru(phen)$_2$DPPZ]$^{2+}$)complexes and 4',6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) simultaneously bind to poly[d(A-T)$_2$] (Biophysics. J. 2003, 85, 3865). Förster type resonance energy transfer from excited DAPI to [Ru(phen)2DPPZ]$^{2+}$ complexes was observed. In this study, we synthesized $\Delta$- and $\wedge$-[Ru(phenanthroline)$_2$dipyrido[3,2-a:2’3’c]6-azaphenazine] ([Ru(phen)$_2$DPAPZ]$^{2+}$) at which the DNA intercalating ligand DPPZ was replaced and we studied its binding properties to poly[d(A-T)$_2$] in the presence and absence of DAPI using polarized spectroscopy and fluorescence techniques. All the spectroscopic properties of the [Ru(phen)$_2$DPAPZ]$^{2+}$-poly[d(A-T)$_2$] complex were the same in the presence and absence of DAPI that blocks the minor groove of polynucleotide, suggesting both $\Delta$- and $\wedge$-[Ru(phen)$_2$DPAPZ]$^{2+}$ complexes are located at the major groove of poly[d(A-T)2]. On the other hand, in contrast with [Ru(phen)$_2$DPPZ]$^{2+}$, both $\Delta$- and $\wedge$-[Ru(phen)$_2$DPAPZ]$^{2+}$ exhibited almost twice the efficiency in the fluorescence quenching of DAPI that binds at the minor groove of poly[d(A-T)$_2$]. This observation indicates that the efficiency of the Förster type resonance energy transfer can be controlled by a small change in the chemical structure of the intercalated ligand.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제18권5호
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• pp.510-514
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• 1997

We studied the interaction of 4',6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) with single stranded poly(dA) using optical spectroscopic methods, including absorption, circular dichroism (CD), and fluorescence spectroscopy. The temperature-dependent conformation of poly(dA) was also investigated. The conformation of poly(dA) varied with temperature, which is explained by the stacking-destacking process of the adenine bases, resulting from the sugar conformation. The hypochromicity and red-shift in the absorption spectroscopy, the lack of CD change in the drag absorption region, and the fluorescence behavior, especially a great accessibility of the I2 quencher to the poly(dA)-bound DAPI, suggest that DAPI binds to the outside of poly(dA). The Job plot for the DAPI-poly(dA) mixture demonstrated that a stoichiometry of one DAPI molecule binds to the one phosphate of poly(dA).

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제33권2호
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• pp.529-534
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• 2012

The fluorescence of 4',6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) bound to DNA at a [DAPI]/[DNA base] ratio of 0.005 was quenched by meso-tetrakis(N-methylpyridinium-4-yl)porphyrin (TMPyP) or cis-bis(N-methylpyridinium-4-yl)porphyrin (BMPyP) when both DAPI and either porphyrin spontaneously bound to the same DNA strand. The quenching was investigated using the "one-dimensional inner sphere" and the "F$\ddot{o}$rster resonance energy transfer" (FRET) models. Total quenching occurred when DAPI and TMPyP were up to 19.3 base pairs or $66\AA$ apart. BMPyP could quench the fluorescence up to 13.9 base pairs or $47\AA$. TMPyP, which intercalated between the DNA base-pairs, appeared to be a better acceptor than BMPyP, which stacked along the DNA stem. The higher quenching and higher resonance energy transfer efficiency of TMPyP was due to the larger overlap integral between its absorption spectrum and the emission spectrum of DNA-bound DAPI.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제34권10호
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• pp.2895-2899
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• 2013

Direction of intercalation to DNA of the planar dipyrido[3,2-a:2',3'-c]phenazine ligands (dppz) of a bis-Ru(II) complex namely, $[Ru(1,10-phenanthroline)_2dipyrido[3,2-a:2^{\prime},3^{\prime}-c]phenazine]^{2+}$ linkered by a 1,3-bis(4-pyridyl)propane, was investigated by probing the behavior of 4',6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) that bound deep in the minor groove. Bis-intercalation of DPPZ resulted in a little blue shift and hyperchromism in DAPI absorption band, and a large decrease in DAPI fluorescence intensity which accompined by an increase in the dppz emission intensity. Diminishing the intenisty of the positive induced circular dichroism (CD) and linear dichroism (LD) were also observed. These spectral changes indicated that insertion of dppz ligand caused the change of the binding mode of DAPI, which probably moved to the exterior of DNA from the minor groove and interacted with the phospghate groups of DNA by electrostatic interaction. At the surface of DNA, DAPI binds at the phosphate groups of DNA by electrostatic attraction. Consequently, this observation indicated that the dppz ligand intercalated from the minor groove.

• 한국산림과학회지
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• 제67권1호
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• pp.28-30
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• 1984

형광색소(蛍光色素) DAPI(4'-6-diamidino-2-phenylindole, 2HCI)와 형광원미경(蛍光願微鏡)을 이용(利用)한 조직화학적(組織化學的) 기법(技法)으로 빗자루병(病)에 걸린 대추나무 조직내(組織內)의 마이코플라스마 분포(分布)를 조사(調査)한 결과(結果), 빗자루병징(病徵)이 나타나 있는 가지에서는 외관상(外觀上) 건전엽(健全葉)을 포함(包含)하여 모든 잎과 줄기에서 마이코 플라스마가 검출(檢出)되었으나 병징(病徵)이 나타나 있지 않은 가지의 잎과 줄기에서는 마이코플라스마가 검출(檢出)되지 않았다. 또한 감염(感染)된 나무의 뿌리조직(組織)에서도 뚜렷한 형광반응(蛍光反應)이 나타남으로써 마이코플라스마가 뿌리조직(組織)에도 많이 존재하고 있음을 알 수 있다.

• 미생물학회지
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• 제37권1호
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• pp.61-65
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• 2001

식물잎권의 잎표면세균에 대한 직접관찰과 이들을 분리시킨 용액 내 세균에 대한 간접관찰을 위하여 형광염료인 4', 6-diamidino-2-phenylindole(DAPI)와 acridine orange(AO)로 염색한 후 형광현미경을 사용하였다. AO로 염색한 잎표면은 배경형광이 진한 주홍색 이나 적색을 띠어 잎표면세균의 관잘 및 계수가 극히 힘들었으나 DAPI로 염색된 잎권세균은 뚜렷한 형광 영상을 나타내었다. 반면 잎표면세균 분리용액의 여과지에 대한 형광염색 결과는 DAPI와 AO 모두가 관찰이 가능하였다. 다만 DAPI가 AO에 비하여 형광 영상이 좀 더 뚜렷하였고 AO 염색과정에서는 염색된 여과지에 대한 세척과정이 필수적이었다. 최적의 DAPI 염색법은 잎과 여과지 모두가 5 $\mu$g/ml의 농도에서 5분 동안 염색하는 것이었다. 잎권의 형광현미경 관찰에 있어서 핵심적인 요소는 잎에서 나오는 수분을 최소화하는 것으로서 염색된 잎 시료를 거름종이 위에 올려놓고 공기 중에서 말리는 대신 $70^{\circ}C$를 유지한 건조기에서 2분 동안 말린 다음 바로 현미경으로 관찰하는 것이 가장 종은 방법인 것으로 확인되었다. 이렇게 확립된 형광현미경 관찰법을 떡갈나무의 잎권세균을 성공적으로 관찰하고 계수할 수 있었다.

• 한국식물병리학회지
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• 제1권1호
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• pp.12-16
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• 1985

마이코플라스마에 감염된 대추나무, 뽕나무 및 일일초의 조직절편을 형광염색소인 DAPI(4'-6-diamidino-2-phenylindole$\cdot$2HCl), aniline blue 그리고 quinacrine(quinacrine mustard dihydrochloride)으로 염색하여 형광현미경하에서 관찰함으로서 이들 형광염색소의 마이코프라스마 감염진단에의 효용가치를 비교 조사하였다. 이병식물의 줄기절편의 절부에서 특이형광반응이 나타났으나 건전식물의 조직절편에서는 특이형광반응이 관찰되지 않음으로써, DAPI, anilinc blue 및 quinacrine 등의 형광염색소에 의한 조직염색법은 대추나무, 뽕나무 및 일일초의 마이코플라스마 감염을 식속 정확하게 진단하는 데 매우 유용한 방법임을 보여주었다. 한펀, 이들 형광염색소 중에서는 DAPI가 가장 효과적이었다.

• Journal of Plant Biology
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• 제36권2호
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• pp.183-192
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• 1993

Efficient plant regeneration system was established through the culture of rice (Oryza sativa L.) microspores. Microspores released by anther shedding culture developed into proembryos and calluses in B5 medium within two weeks of culture. The optimal hormone and carbon sources were dependent on the genotypes used. Microspore's viability decreased rapidly in culture time, therefore less than 3% of the total microspores were viable at the 9th day when the first microspore division was observed. Of two types of microspores (pollen dimorphism) observed in culture, only the P-grain, larger microspores than normal one was able to divide. Using 4',6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) fluorescence staining, it was confirmed that the symmetrical division of uninucleate microspore was the first step leading to continuous microspore development. Microspore-derived proembryos and calluses were regenerated to plants in N6 medium containing 1 mg/L NAA and 5 mg/L kinetin, and 78.3% of the regenerated plants were haploids.

• Journal of Plant Biology
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• 제36권4호
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• pp.399-406
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• 1993

유채(Brassica napus L. cv. Topas) 소포자 배양에 의한 기내 배발생 과정을 관찰하고 발생과정에 따른 총단백질의 변화 양상을 이차원 전기영동을 통하여 분석하였다. 배양에 적합한 소포자의 발달 단계는 4,6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) 형광염색으로 핵상관찰을 통하여 결정하였다. 최초의 소포자 생존율은 63.9%였으며 이러한 생존율의 차이로 배양초기에 소포자의 이형성이 나타났다. 배 발달 경로에 따른 최초의 세포분열은 화분벽 안에서 균등분열로 시작되어 배병의 발달이 선행된 후 배 발생이 일어났으며, 구형, 심장형, 어뢰형으로의 배 발달은 여러 조직의 분화와 더불어 빠르게 진행되었다. 소포자배 발달과정을 치상단계의 소포자, 배양 3일째의 초기 분열세포, 구형 및 심장형배, 어뢰형배, 성숙한 자엽단계의 배 등의 5단계로 나누어 각각 2차원 전기영동을 수행한 결과, 최초 소포자 단계에서 나타났던 23개의 단백질들은 배 달달 경로로 진행됨에 따라 사라지고, 배양 3일째에는 8개의 단백질이 특이적 또는 지속적으로 발현되었다. 배의 발달과 더불어 20∼50 kD 사이에서 총 42개의 단백질이 급격히 나타나거나 또는 후기 배로 진행하면서 점차적으로 발현되었다.

• 한국산림과학회지
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• 제82권1호
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• pp.12-16
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• 1993

대추를 수확(收穫)한 직후(直後)에 oxytetracycline-HCl(OTC)용액(溶液)를 수간주입(樹幹注入)하여 대추나무 빗자루병(病)에 대(對)한 방제효과(防除效果)를 조사(調査)하였다. 빗자루병(病)에 결린 대추나무(흉고직경(胸高直徑) 9-16cm)에 크기에 따라 약량(藥量)을 늘리면서 주당(株當) OTC 2g 내지 6g을 물 0.51 및 1.01에 녹여 9월(月)에서 10월(月) 사이에 중력식(重力式) 수간주입(樹幹注入)을 실시(實施)한 결과(結果), 2년간(年間) 병징(病徵)이 억제(抑制)되고 건전(健全)한 모습으로 회복(回復)되었다. 0.51와 1.01수용액간(水溶液間)에 방제효과(防除效果)의 차이(差異)가 없었으며, 이와 같이 비교적(比較的) 고농도(高濃度)의 OTC를 주입(注入)하였을 경우(境遇) 우려(憂慮)되는 약해(藥害)가 이듬해 새로 나온 잎에서 관찰(觀察)되지 않았다. 한편 회복(回復)된 나무의 사부조직(篩部組織)을 DAPI(4'-6-diamidino-2-phenylindole.2HCl)로 염색(染色)하여 형광현미경(螢光顯微鏡)으로 검경(檢鏡)하여 보았던 바 마이코플라스마-특이(特異) 형광반응(螢光反應)이 나타나지 않음으로써 조직내(組織內)의 마이코플라스마가 소멸(消滅)되었음을 알 수 있었다.