• Journal of Plant Biotechnology
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• 제39권1호
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• pp.81-92
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• 2012

단백질체학에서 이차원 전기영동 (2-DGE)은 고해상도 단백질 분리가 가능한 중요 기술 중 하나이다. 본 논문에서는 2-DGE 이미지 분석 일치도를 향상시킴으로써 작물 단백질 검출과 정량분석이 가능하도록 하는 전반적인 주요 장비, 시약 등을 자세히 기술한 프로토콜을 제시하고 있다. 이 프로토콜은 식물의 발달, 생물학적, 비생물학적 스트레스 반응 등과 관련된 작물 단백질 바이오마커를 개발하기 위한 목적에서 2-DGE를 처음 시도하는 연구자들에게 유용할 것으로 기대한다.

• 한국학교수학회논문집
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• 제17권2호
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• pp.139-166
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• 2014

수학 교육에서 교사의 SMK와 PCK에 대한 역량은 대단히 중요하다. 그들의 SMK와 PCK에 대한 현황 파악과 그에 따른 강화방안이 있다면 더 없이 좋을 것이다. 그러나 교사를 대상으로 교수 역량 강화에 대한 연구를 수행하는 것은 현실적으로 많은 어려움이 있다. 이에 본 연구에서는 23명의 예비 초등교사를 대상으로, 이들의 SMK와 PCK에 대한 현황 파악과 그에 따른 강화방안으로 DGE 탐구활동을 활용하였다. 그 결과 3명의 예비 초등교사가 초기 SMK에서 오류를 나타내었으며, 초기 PCK에서는 설명 및 시각적 확인 위주의 교수 방법으로 문제해결에 필요한 성질을 지도하는 것에 중점을 두었다. 또한 DGE 탐구활동의 실제는 역동성 개념 이해 및 구현의 어려움, $75^{\circ}$ 작도에 집착 및 결과의 일반화, '접는 활동'의 수학적 해석의 어려움, 무난한 GSP 구현의 네 가지로 분류되었다. 이후 초기 SMK에서 나타난 하나의 오류가 수정되었으며 PCK의 방법적 측면에서 GSP를 활용한 시각적 확인이 추가되었다. 이러한 결과로부터 DGE가 예비교사의 SMK와 PCK 강화 도구로 활용될 수 있도록 돕는 몇 가지 교수학적 시사점을 추출할 수 있었다.

• 한방재활의학과학회지
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• 제28권2호
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• pp.21-35
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• 2018

Objectives The objective of this study is to determine the antimicrobial effect of Daehwanggyeonu-san(Dahwangqianniu-san,DGE) and synergistic effects with antibiotics oxacillin, ampicillin, and gentamicin against Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus(MRSA). Methods The antibacterial activity of DGE extract was evaluated againest MRSA strains by using the Disc diffusion method, broth microdilution method(minimal inhibitory concentration; MIC), checkerboard dilution test. The checkerboard dilution test was used to examined synergetic effect of oxacillin, ampicillin, gentamicin, ciprofloxacin with DGE extract. Results DGE showed antimicrobial activity against MRSA with an MIC value of $125{\sim}250{\mu}g/mL$. In the checkerboard test, the interation of DGE with all tested antibiotics produced almost synergy or partial synergy against MRSA. Conclusions This study shows that DGE reduced the MICs of several antibiotics tested, and a remarkable antibacterial effect of DGE, with membrane permeability enhancers and ATP synthase inhibitors. This study can be a valuable source for the development of a new drug with low MRSA resistance.

• 대한의용생체공학회:의공학회지
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• 제28권5호
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• pp.601-608
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• 2007

2 Dimensional Gel Electrophoresis(2DGE) is an essentialmethodology for analysis on the expression of various proteins. For example, information for the location, mass, expression, size and shape of the proteins obtained by 2DGE can be used for diagnosis, prognosis and biological progress by comparison of patients with the normal persons. Protein spot matching for this purpose is comparative analysis of protein expression pattern for the 2DGE images generated under different conditions. However, visual analysis of protein spots which are more than several hundreds included in a 2DGE image requires long time and heavy effort. Furthermore, geometrical distortion makes the spot matching for the same protein harder. In this paper, an iterative algorithm is introduced for more efficient spot matching. Proposed method is first performing global matching step, which reduces the geometrical difference between the landmarks and the spot to be matched. Thus, movement for a spot is defined by a weighted sum of the movement of the landmark spots. Weight for the summation is defined by the inverse of the distance from the spots to the landmarks. This movement is iteratively performed until the total sum of the difference between the corresponding landmarks is larger than a pre-selected value. Due to local distortion generally occurred in 2DGE images, there are many regions in whichmany spot pairs are miss-matched. In the second stage, the same spot matching algorithm is applied to such local regions with the additional landmarks for those regions. In other words, the same method is applied with the expanded landmark set to which additional landmarks are added. Our proposed algorithm for spot matching empirically proved reliable analysis of protein separation image by producing higher accuracy.

• Journal of the Korean Data and Information Science Society
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• 제18권2호
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• pp.375-384
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• 2007

As teachings that use the ICT are more popular, many studies on the dynamic geometry environment(DGE) are under way. An important factor emphasized in the studies is to practical use learning activities of learners. In this study, we first define the learning history data in DGE. Second we develop a prototype of the DGE that is able to collect and analyze the learning history data automatically. The environment enables not only to grasp leaning history but also to create and manage new learning objects.

• 정보처리학회논문지B
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• 제12B권3호
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• pp.239-246
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• 2005

생물학자가 단백질을 검색하고 분석하기 위해서는 2차원 젤 전기영동(2DGE : Two Dimensional Gel Electrophoresis) 실험을 해야 한다. 실험 결과는 2차원 영상이 생성된다. 2차원 영상에서 단백질 반점의 패턴 분석을 위해 2차원 젤 영상에 펼쳐진 단백질 반점들을 영상처리를 통해 분할하고, 대조 그룹의 단백질 패턴과 비교분석을 통해 밝히고자하는 단백질 반점을 찾아내야 한다. 단백질 반점을 분할하는 알고리즘에 있어서 기존에는 가우시안 함수를 적용하였지만, 최근 들어 형태학 분리개념에 의한 Watersheds 영역기반 분할(Watersheds region-based segmentation) 알고리즘을 활용하고 있다. 그러나 Watersheds 영역기반 분할 알고리즘은 크기가 큰 영상에서 원하는 영역을 신속하게 분할한다는 장점이 있지만, 영상 화소의 그레이 값이 연속적인 경우 실제 반점의 개수 에 비해 과다분할(over-segmentation)되거나 과소분할(under-segmentation)의 문제점을 안고 있다. 이는 마커(marker) 포인트의 설정에 의해 어느 정도 해결할 수 있지만 병합(merge)과 분할(split) 과정을 반복해야 한다. 본 논문은 Watersheds 기반 계층적 이진화 기법을 적용하여 마커 드리븐 Watersheds 영상분할의 문제점을 해결하고자 한다.

• 한국자원식물학회지
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• 제30권2호
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• pp.125-132
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• 2017

BPA는 내분비교란물질로 널리 알려져 있다. BPA를 세포와 실험동물에 처리하여 독성을 유도하고 이를 인삼 추출물들이 BPA로 유도된 독성에 어떠한 영향을 미칠 것인지 살펴보았다. WGE, DGE, RGE에 대한 항산화능을 DPPH 분석법으로 측정하였다. DGE 및 RGE는 DPPH 소거 항산화 활성을 증가시켰다. 간암세포주 HepG2에 BPA 처리하여 세포독성을 유도하고, 이를 인삼추출물에 의해 세포생존이 증가되는지 MTT법으로 측정하였다. BPA $200{\mu}M$ 처리하여 유도된 세포독성에 DGE 및 RGE는 세포 생존 능력을 증가시켰다. 실험동물에 BPA를 처리하여 독성을 유도하고 이를 인삼추출물들이 방어하는지 살펴보았다. 혈청에서 간 손상 생화학적 마커인 AST와 ALT가 RGE 투여군에서 증가했다. 또한, 손상된 간세포 재생및 증식이 RGE 투여군에서 현저하게 증가하였다. 또한, RGE 주변 영역 및 간 미세 구조의 중심 정맥의 문맥에서 간 섬유화를 억제하였다. 이상의 결과를 종합하면 RGE가 간 세포주에서 BPA로 유도된 세포독성을 유의적으로 저해하였으며, 동물실험을 통하여 BPA에 의해 손상된 간에서 RGE가 간의 보호와 간 조직 재생이 발생하는 것을 확인하였다. 이 결과는 RGE가 외부에서 유입된 화학물질에 대한 간 손상 개선제로 사용될 수 있음을 보여준다. 그러므로, RGE는환경독성 물질로 인한 질환치료약물에 대한 잠재적인 후보가 될 수 있을 것이라 사료된다.

• 한국초전도학회:학술대회논문집
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• 한국초전도학회 2004년도 High Temperature Superconductivity Vol.XIV
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• pp.97-97
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• 2004

• Composites Research
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• 제37권3호
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• pp.215-218
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• 2024

Diglycidyl ether of 4,4'-dihydroxy-α-methylstilbene (DGE-DHMS)에 aniline을 2:1의 비율로 첨가한 액정에폭시올리고머인 DD-A를 합성하고 촉매성 경화제인 1-Methyl Imidazole을 이용하여 경화시키며 겔화 및 유리화 시간을 측정하여 액정 변화가 포함된 Time-Temperature-Transition Diagram을 작성하였다. 경화제의 농도가 높아질수록 겔화 및 유리화 시간이 감소함을 확인할 수 있었고 유리화 곡선은 전형적인 S-형태를 보였다.

• 한국환경농학회지
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• 제30권4호
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• pp.395-401
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• 2011

BACKGROUND: Potassium (K) is one of the macronutrients which are essential for plant growth and development. Its deficiency in paddy soils is becoming one of the limiting factors for increasing rice yield in Asia. METHODS AND RESULTS: To investigate physiological symptoms under K-starvation (NP) compared with complete media (NPK) condition, we measured shoot/root length, weight, nutrients, and patterns of protein expression. The shoot growth was significantly reduced, but root growth was not affected by K-starvation. However, biomasses were decreased in both shoot and root. Uptake of K was reduced up to 85%, while total concentrations of P, Ca, Mg, Na were increased in root and shoot. To better understand the starved K mechanism of rice, comparative proteome analysis for proteins isolated from rice leaves was conducted using 2-DGE. Five spots of differentially expressed proteins were analyzed by MALDI-TOF MS. Analysis of these K-starvation response proteins suggested that they were involved in metabolism and defense. CONCLUSION(s): Physiological and 2-DGE based proteomics approach used in our study results in observation of morphology or nutrients change and identification of K-starvation responsive proteins in rice root. These results have important roles in maintaining nutrient homeostasis and would also be useful for further characterization of protein function in plant K nutrition.