• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제35권8호
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• pp.2335-2341
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• 2014

Chemical investigation on the methanol extract of the starfish Ctenodiscus crispatus resulted in the isolation of five steroids, (22E,$24{\zeta}$)-26,27-bisnor-24-methyl-$5{\alpha}$-cholest-22-en-$3{\beta}$,5,$6{\beta}$,$15{\alpha}$,25-pentol 25-O-sulfate (1), (22E,24R,25R)-24-methyl-$5{\alpha}$-cholest-22-en-$3{\beta}$,5,$6{\beta}$,$15{\alpha}$,25,26-hexol 26-O-sulfate (2), (28R)-24-ethyl-$5{\alpha}$-cholesta-$3{\beta}$,5,$6{\beta}$,8,$15{\alpha}$,28,29-heptaol-24-sulfate (3), (25S)-$5{\alpha}$-cholestane-$3{\beta}$,5,$6{\beta}$,$15{\alpha}$,$16{\beta}$,26-hexaol (4), and ${\Delta}7$-sitosterol (5). Their structures were identified by extensive spectroscopic analyses, including 1D, 2D NMR and MS and chemical methods. Compound 4 showed cytotoxicity against human hepatoma HepG2 and glioblastoma U87MG cells via inhibition of cell growth and induction of apoptosis. Induction of apoptosis by 4 was demonstrated by cell death, DNA fragmentation, increased Bax/Bcl-2 protein ratio and the activation of caspase-3, caspase-9 and poly (ADP-ribose) polymerase (PARP).

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제25권1호
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• pp.98-108
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• 2015

Staphylococcus aureus is an important foodborne pathogen that causes diverse diseases ranging from minor infections to life-threatening conditions in humans and animals. To further understand its pathogenesis, the genome of the strain S. aureus FORC_001 was isolated from a contaminated food. Its genome consists of 2,886,017 bp double-stranded DNA with a GC content of 32.8%. It is predicted to contain 2,728 open reading frames, 57 tRNAs, and 6 rRNA operons, including 1 additional 5S rRNA gene. Comparative phylogenetic tree analysis of 40 complete S. aureus genome sequences using average nucleotide identity (ANI) revealed that strain FORC_001 belonged to Group I. The closest phylogenetic match was S. aureus MRSA252, according to a whole-genome ANI (99.87%), suggesting that they might share a common ancestor. Comparative genome analysis of FORC_001 and MRSA252 revealed two non-homologous regions: Regions I and II. The presence of various antibiotic resistance genes, including the SCCmec cluster in Region I of MRSA252, suggests that this strain might have acquired the SCCmec cluster to adapt to specific environments containing methicillin. Region II of both genomes contains prophage regions but their DNA sequence identity is very low, suggesting that the prophages might differ. This is the first report of the complete genome sequence of S. aureus isolated from a real foodborne outbreak in South Korea. This report would be helpful to extend our understanding about the genome, general characteristics, and virulence factors of S. aureus for further studies of pathogenesis, rapid detection, and epidemiological investigation in foodborne outbreak.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제29권8호
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• pp.1266-1272
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• 2019

A bacterial strain, labeled $UR11^T$, was isolated from green alga Ulva pertusa collected from Jeju Island, Korea. $UR11^T$ was identified as a gram-negative, rod-shaped, motile by gliding and aerobic bacterial strain with yellow colonies on R2A plates. The strain $UR11^T$ grew over at a temperature range of $10^{\circ}C$ to $30^{\circ}C$ (optimally at $25^{\circ}C$), a pH range of 6.0-11 (optimally at pH 7.0) and a Nacl range of 0.5-5% Nacl (w/v). Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequences revealed that strain $UR11^T$ was a member of the genus Flavobacterium. Strain $UR11^T$ shared close similarity with F. jejuensis $EC11^T$ (98.0%) F. jumunjinense $HME7102^T$ (96.1%), F. haoranii $LQY-7^T$ (95.3%), F. dongtanense $LW30^T$ (95.1%), and F. ahnfeltiae 10Alg $130^T$(94.9%). The major fatty acids (>5%) were $iso-C_{15:0}$ (33.9%), $iso-C_{15:1}$ G (12.4%), $iso-C_{17:0}$ 3-OH (9.0%), $isoC_{16:0}$ (7.0%) and $iso-C_{15:0}$ 3-OH (6.3%). The major polar lipids were phosphatidylethanolamine, seven unknown aminolipids, two unknown aminopolarlipids and two unknown lipids. DNA-DNA hybridization value was 58% at strain $UR11^T$ with F. jejuensis $EC11^T$. Based on phenotypic, chemotaxonomic and phylogenetic evidence, strain $UR11^T$ represents a novel species of the genus Flavobacterium, for which the name Flavobacterium jocheonensis sp. nov. is proposed. The type strain is Flavobacterium jocheonensis is $UR11^T$ (=KCTC $52377^T$ =JCM $31512^T$).

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제25권5호
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• pp.733-737
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• 2012

Determination of sex origin of cattle meat by fast and reliable molecular methods is an important measure to ensure correct allocation of export refunds particularly in European countries and also female cattle (cow) slaughter is legally banned in India because of religious beliefs. Based on the DEAD box protein gene located on the X and Y chromosomes, 2 pair of primers were designed and the system of PCR was optimized. Upon PCR amplification, male tissue showed 2 bands, while female tissue resulted in only one band. The accuracy and specificity of the primers was assessed using DNA template extracted from cattle meat of known sex. The protocol was subjected to a blind test and showed 100% concordance, proving its accuracy and reliability.

• 한국균학회지
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• 제42권1호
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• pp.21-27
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• 2014

충청남도 예산군 신암면 일대 과수원들의 과일과 꽃에서 효모들을 분리한 후 이들의 26S rDNA의 D1/D2 부위의 염기서열을 결정한 다음 NCBI의 BLAST 데이터베이스에 등록되어 있는 효모들과의 분자생물학적 유연관계를 비교, 분석하여 동정하였다. 2013년 4월부터 10월 사이의 과일 19점으로부터 모두 25종의 효모들을 48균주 분리하였고 Pichia kluyveri, Hanseniaspora uvarum, Rhodotorula mucilaginosa, Torulaspora delbrueckii 등 4종의 효모 등이 많이 분포하고 있었다. 과수원 주위의 꽃 39점에서 48종의 효모 등을 108균주 분리하였고 이 중 Microstroma juglandis와 Pseudozyma aphidis가 가장 많이 분리되었다.

• 한국환경보건학회:학술대회논문집
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• 한국환경보건학회 2004년도 International Conference Global Environmental Problems and their Health Consequences
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• pp.165-168
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• 2004

An anti-fungal material producing actinomycete was isolated from domestic soil. This strain was identified as Streptomyces albogriseus by 16S rDNA sequence. YEME (yeast extract 4g, malt extract 10g, glucose 4g, D.W 1l , pH $7.0{\pm}0.2$) medium was used for production of anti-fungal materials. S. albogriseus was cultured in a shaking incubator for 2 weeks at 150 rpm and $25{\pm}1^{\circ}C$. An anti-fungal material produced by S. albogriseus was identified at 340nm by uv/vis- spectrometer and it showed powerful anti-fungal activity. This is the first report that secondary metabolite produced by S. albogriseus showed an activity against phytopathogenic fungi such as Collectrichum coccodes, Botrytis cinerea, Cladosporium cucumerinum, Didymella bryoniae.

• 한국식품저장유통학회지
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• 제15권3호
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• pp.483-490
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• 2008

주석산은 포도에 상당량 함유되어 있어 포도 주스 또는 포도주의 저장 및 유통 기간 중에 침전물을 형성하여 품질을 저하시킨다. 본 연구에서는 주석산의 분해에 사용될 수 있는 효소 자원의 개발을 목적으로 주석산 분해 세균을 분리하고 그 특성을 조사하였다. 주석산의 함량이 높은 것으로 알려진 국산 캠벨얼리 포도주의 주박으로부터 주석산 분해세균을 집식배양한 후 주석산을 탄소원으로 함유하는 배지를 사용하여 주석산을 분해할 수 있는 세균을 분리하였다. 분리 균주 중에서 KMBL 5777과 KMBL 5778 두 균주가 주석산 함유 배지에서 생육도와 주석산 분해능이 가장 우수하였다. 이 두 균주의 형태학적, 생리학적 특성 및 165 rDNA를 분석하여 Acetobacter tropicalis로 동정하였다. 16S rDNA 염기서열의 상동성은 KMBL 5777 균주와 A. tropicalis LMG 1663 균주 사이에는 99.3%, KMBL 5778 균주와 A. tropicalis A77 균주 사이에는 99.8%로 나타났다. 두 균주에 의한 주석산 분해 조건을 조사한 결과 두 균주 모두 $25^{\circ}C$, 배지의 초기 pH 6.0에서 가장 우수한 생육도와 주석산 분해능을 나타내었다. 주석산 0.2%를 함유하는 배지에서 8일간의 배양 후에는 600 nm에서의 생육도가 약 2.3에 도달하였으며 주석산 분해율은 약 90%를 나타내었다. 온도에 의한 영향은 $25^{\circ}C$에 비하여 20, $30^{\circ}C$의 순으로 활성이 감소하였으며 37'E에서는 생육과 주석산 분해가 전혀 불가능하였다. pH 6에 비하여 pH 7, 5, 4, 3의 순으로 주석산의 분해속도가 감소하였으나 pH7, 5, 4의 경우에는 배양 8일 후 pH 6의 경우와 유사한 주석산 분해능을 나타내었다.

• 미생물학회지
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• 제41권1호
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• pp.74-80
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• 2005

제주도 연안의 해수로부터 항산화물질을 생산하는 세균을 분리하였으며 항산화물질의 특성을 조사하였다. 분리된 항산화 생성 균주는 그람양성의 통성혐기성균으로 운동성을 가진 단간균이었으며 생육시 NaCl를 필요로 하였다. 분리균주는 형태학적, 배양적, 생화학적 특성 및 165 rDNA 염기서열 분식결과 Exiguobacterium 속으로 동정되어 Ekiguobaoteriurn sp. SC2-1로 명명하였다. 항산화물질 생산균주 배양액의 radical 소거활성은 DPPH (1,1-diphenyl-2-picrylhydrazyl) 법을 사용하였으며, 항산화물질 생성 최적조건은 $25^{\circ}C,\;NaCl\;4\%,\;pH\;6\~8$ 이었으며, 최적 탄소원은 $1\%$ maltose였다. 배양액의 hydroxyl radical 소거활성은 $73\%$였으며 superoxide radical 소거활성은 $35\%$를 나타내었다.

• 미생물학회지
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• 제40권1호
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• pp.1-6
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• 2004

대구지역에서 수집한 50점의 김치 중에서 10점의 김치로부터 tetracycline내성 세균을 분리하였다. 이 균주들의 tetracycline에 대한 MIC는 25-100 mg/l 이상의 범위로 분포하였으며 다른 항생제에 대한 내성도 다양하였다. tet(M), tet(O)특이적 primer를 이용한 PCR에서 HJ9 한 균주에서만 tet(M)유전자가 검출되었으며, tet(M)은 플라스미드상에 존재하는 것으로 나타났다. HJ9 균주의 tet(M)부분 염기서열을 분석한 결과 기존에 보고된 Gram양성균의 tet(M)의 DNA 염기서열 및 아미노산 서열과 각각 90-99%, 94-100%의 높은 상동성을 보였다. 165 rRNA 염기서열을 분석한 결과 HJ9 균주는 Lactobacillus sakei로 동정되었다. 김치를 통하여서도 항생제 내성 유전자의 전파 확산이 가능할 것으로 생각된다.

• 미생물학회지
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• 제43권3호
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• pp.217-221
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• 2007

거봉 포도로부터 분리하여 동정한 야생효모 Saccharomyces cerevisiae IJ850을 이용, 국내산 캠벨얼리와 거봉포도를 발효시켜 적포도주를 제조하고, 이의 발효특성을 분석함으로서 포도주제조용 발효균주로서의 가능성을 알아보고자 하였다. 야생발효균주의 분리를 위하여 안성지역 거봉포도와 캠벨얼리 포도즙을 실온에서 6일 동안 스타터의 첨가없이 자연발효시켜 우세균주를 분리하였다. 거봉에서 분리된 효모의 발효능이 캠벨얼리에서 분리된 효모보다 1.8배정도 높았다. 거봉에서 분리한 발효균주를 분자 생물학적 인 방법 인 26S rDNA 염기서열에 근거하여 동정한 결과, Saccharomyces cerevisiae와 99.7%의 유사성을 나타내어 Saccharomyces cerevisiae IJ850으로 동정되었다. 분리균주를 이용한 포도주의 제조에서는 캠벨얼리와 거봉포도즙의 최종 당도를 $25^{\circ}Brix$로 포도당을 이용하여 보당하고, 이산화탄소를 발효조에 채우고, 실온에서 10일간 발효시켰다. 포도주의 수율은 캠벨얼리가 75%, 거봉이 85%였고 최종 알코올 도수는 캠벨얼리가 11.0%, 거봉이 13.0%이었다. 산업용발효균주인 S. cerevisiae EC-1118과 비교한 결과 총산도는 캠벨얼리와 거봉포도주 모두에서 산업용 발효균주인 EC-1118에 비하여 분리한 S. cerevisiae IJ850에서 낮은 수치를 보였다. 포도주의 pH와 색도 분석에서는 S. cerevisiae IJ850과 S. cerevisiae EC-1118로 제조한 포도주모두에서 비슷한 수치를 보여주었으나, 페놀 성분분석에서는 S. cerevisiae EC-1118로 제조한 캠벨얼리 포도주에서 125 mg/L의 함량을, S. cerevisiae IJ850으로 제조한 거봉포도주에서 75 mg/L의 함량을 나타내었다. 따라서 국내 거봉포도로부터 분리한 S. cerevesiae IJ850는 포도주 생산에 사용될 수 있는 균주로써 그 가능성을 보여주었다.