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Rhizobium japonicum의 생리적(生理的) 특성(特性) 및 Plasmid DNA의 분리(分離) (Isolation of Plasmid DNA and Physiological Characteristics of Rhizobium japonicum)

  • 오세헌;강상재;박우철
    • Current Research on Agriculture and Life Sciences
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    • 제12권
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    • pp.69-82
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    • 1994
  • 6개(個) 품종(品種)의 대두(大豆)로 부터 분리(分離)된 대두(大豆) 근류균(根瘤菌)의 생리적(生理的) 특성(特性) 및 plasmid DNA의 분리(分離)를 조사(調査)한 결과(結果)는 다음과 같다. YEM 배지(培地)에서 S117, S118, 011, DY-1균주(菌株)는 생육속도(生育速度)가 느리고 alkaline 반응(反應)을 나타내었으며, S110, S111, S114, S115, S116, S120, 010균주(菌株)들은 생육속도(生育速度)가 빠르고 산반응(酸反應)을 나타내었다. fast-growing형(型)과 slow-growing형(型) R. japonicum은 모두 극모성 또는 주모성 편모(鞭毛)를 가진 그람 음성(陰性) 간균(桿菌)이며, 한천 평판에서 점액성(粘液性)이 있는 유백색(乳白色) colony를 형성(形成) 하였다. 접종(接種) 7일후(後), fast-growing형(型)의 colony는 직경(直徑)이 2.0-4.0mm였고, slow-growing 형(型)의 colony는 대체로 0.5-1.5였다. fast-growing형(型)은 pH4.5에서 한결같이 감수성(感受性)이 있고, pH9.5에 내성(耐性)이 있는 반면 slow-growing형(型)은 정반대로 나타났다. 조사(調査)된 균주(菌株)들은 모두 생육(生育)을 위한 탄소원(炭素源)으로써 glucose를 이용(利用)하였으며, 010과 321을 제외하고 모든 균주는 starch는 전혀 이용(利用)하지 못하였으며 fast-growing형(型) 만이 sucrose를 이용(利用)하였다. 조사(調査)된 slow-growing R. japonicum은 일반적으로 15-250kb 정도(程度)의 1-3개(個)의 plasmid DNA를 함유하는 반면, fast-growing R. japonicum은 20-250kb정도(程度)의 1-3개(個)의 plamid DNA를 함유(含有)하고 있었다.

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지리산 동부 지역에 분포하는 차노카이트의 변성작용과 성인에 관한 연구 (Petrogenesis and Metamorphism of Charnockite of Eastern Jirisan Area)

  • 김동연;송용선;박계헌
    • 암석학회지
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    • 제11권3_4호
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    • pp.138-156
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    • 2002
  • 소백산 육괴 중 남동부 지역의 선캠브리아 변성암류는 화강암질 편마암, 반상변정질 편마암과 석영장석질 편마암 등으로 이루어져 있으며, 하동-산청 회장암 복합체 서편에 남북방향의 대상으로 사방휘석을 함유한 차노카이트가 폭 3km, 길이 12km의 규모로 분포한다. 차노카이트는 조직에 따라 괴상 차노카이트와 엽리상 차노카이트로 분류된다. 성분상 차노카이트의 원암은 화강섬록암에서 석영 몬조나이트에 대비되고 비알카리질이며. 이들의 주원소 및 미량원소의 함량 변화양상은 전형적인 마그마 분화 경향을 보여준다. 한편, 조구조 판별도에 도시된 지구화학적 자료는 이들 차노카이트가 활동적인 조구조 환경에서 형성되었음을 보여준다. 괴상 및 엽리상 차노카이트에서 관찰되는 주구성 광물은 사장석, 사방휘석, 미사장석 석류석 석영 등이며, 석류석은 산점상으로 산출한다. 석류석은 대체로 성분 누대구조가 잘 나타나고, $X_{alm}$ / (0.74~0.83)와 $X_{py}$ (0.07~0.12), $X_{Mg}$ (0.12-0.08) 성분은 주변부로 가면서 감소하고, $X_{grs}$ /(0.03~0.15)는 중심부에서는 낮고 주변 부로 가면서 크게 증가하는 특징적인 변화를 보인다. 사방휘석-석류석-사장석-석영 공생광물군을 이용하여 계산된 차노카이트의 변성조건은 시료에 따라 2.5-7.5kb, $600-900^{\circ}C$의 큰 범위로 변화하지만, 석류석의 중심부 성분을 사용하였을 경우 약 $800^{\circ}C$의 정점온도를 보인다. 그리고 석류석의 누대구조 특성이 뚜렷한 시료 MS2-1에서는 3.5kb, $800^{\circ}C$에서 6kb, $600^{\circ}C$로 후퇴한 반시계 방향의 진화경로가 인지된다.

Bacillus cellulyticus K-12 Crystalline Cellulose-Degrading Avicelase Gene and Expression in Eschterichia coli

  • Cheorl-Ho Kim;Woo
    • 한국식품영양학회지
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    • 제6권4호
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    • pp.314-321
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    • 1993
  • We have cloned the Bacillus cellulyticus K-12 avicelase (Avi, E.C.3.2.1.4) gene (ace A) In E. coli. This was accompanied by using the vector PT7T3U 19 and Hind W -Hind m libraries of Bacillus cellulyticus K-12 chromosomal inserts created in 5.cofi. The Libraries were screened for the expression of avicelase by monitoring the immunoreaction of the anti-avicelase (immunoscreening). Positive clones (Ac-3, Ac-5, and Ac-7) contained the identical 3.5kb Hind III fragment as determined by restriction mapping and Southern hybridization, and expressed avicelase efficiently and constituvely using its own promoter in the heterologous host. From the immunoblotting analysis, a polypeptide which showed a CMCase activity with an Mr of 54000 was detected.

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표고균사 갈변과 관련된 BCR (Brown Color Repressor) 유전자 분리 (BCR (Brown Color Repressor) gene isolation related to mycelial browning of Lentinus edodes)

  • 김영호;박수철;전창성;유창현;성재모;공원식
    • 한국버섯학회지
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    • 제10권3호
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    • pp.120-128
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    • 2012
  • 표고균사에서 갈변시기를 조절하고 확인할 수 있는 유전공학적 시스템을 개발하여 톱밥재배용 표고균주를 조기에 선별할 수 있도록 표고균사가 갈변되는 동안 균사상태에서 특이적으로 발현되는 유전자를 분리하기 위하여 갈변되지 않은 균사와 갈변이 완전히 이루어진 균사에서 differential display를 실시하였다. 그 결과 이들 균사로부터 특이적으로 발현되는 두 개의 1.6kb와 1.2kb의 cDNA clone을 선발하여 염기서열을 분석하였다. 이 중 1.6kb의 cDNA단편은 Dugenia polichroa로부터 분리된 microsatellites 유전자와 100%의 상동성을 나타냈다. 그러나 1.2kb의 cDNA 단편은 3'부위에 poly A tail과 5 부위에 partial open reading frame를 가지고 있어 이를 primer로 제작한 후 갈변되지 않은 균사와 갈변이 이루어진 균사에서 RT-PCR을 실시하여 본 결과 갈변이 되지 않은 백색의 균사에서 발현이 확인되었다. 1.2kb의 cDNA 단편의 5' 부위의 염기서열 분석은 110개의 아미노산으로 구성된 partial open reading frame으로 나타났다. 이 유전자를 DNASIS database에서 상동성을 비교해 본 결과 Arabidopsis thaliata에서 분리된 dTDP-glucose 4,6-dehydratases 유전자와 DNA 수준에서는 66.7%, 아미노산 수준에서는 69.2%의 높은 상동성을 나타내었다. 갈변에 관련된 특이 유전자(BCR gene)를 확인하였다. 이 유전자는 산화 stress에 대해 저항성을 나타내는 기능을 가진 것으로 알려져 있어 표고 균사가 갈변될 때 repressor로서 작용할 것으로 생각된다. 따라서 이 유전자를 BCR (Brown Color Repressor) 유전자라고 명명하였다.

Bacillus thuringiensis subsp. kurstaki HD-1 CryIIA의 내독소 단백질 유전자의 클로닝 및 발현 (Cloning and Expression of an Insecticidal Crystal Protein CryIIA Gene from Bacillus thuringiensis subsp. kurstaki HD-1)

  • 김호산;김상현;제연호;유용만;서숙재;강석권;조용섭
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제32권3호
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    • pp.300-306
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    • 1993
  • Bacillus thuringiensis subsp. kurstaki HD-1으로부터 생산된 살충성 내독소 단백질을 coding하는 CryIIA 유전자를 클로닝하고 염기서열을 조사하였다. HD-1 균주의 12개 plasmid 중 225kb plasmid를 분리하여 CryIIA 유전자를 포함하는 5kb HindIII 절편을 hybridization하여 찾아냈다. 이 절편을 plasmid pUC19에 ligation하여 E. coli에 형질 전환하였다. 이 독소 유전자를 포함하는 4kb BamHI-HindIII 절편은 vector pT7-5에 ligation하여 pSKIIA라하였다. pSKIIA는 3개의 open reading frames(orf1, orf2, orf3)로 구성되어 있으며 염기서열은 3,952base로 되어 있었다. 이러한 3개의 orf 각각의 발현 여부를 확인하기 위하여 생물검정을 하였다. 그러나 orf1 또는 orf2에 의한 형질 전환체는 독성이 없는 것으로 나타났다. orf3를 포함하는 형질 전환체는 3종의 나비목 곤충(배추점나방, 담배거세미나방, 담배나방) 및 1종의 파리목 곤충(집모기) 유충에 대하여 독성을 나타내었다.

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각종 작물로부터 분리한 Rhizoctonia solani 균주의 RFLP 및 PCR-RFLP를 이용한 분자계통한 특성 구명 (Molecular Systematics of Rhizoctonia solani Isolates from Various Crops with RFLP and PCR-RFLP)

  • 최혜선;신환성;김희종;김경수;우수진
    • 미생물학회지
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    • 제35권3호
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    • pp.173-179
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    • 1999
  • Rhizoctonia solani 분류를 위해 균사의 anastomosis group과 grouprks의 유전적 차이의 분석을 위해 rDNA 의 PCR-RFLP 와 RFLP를 실시하였다. rDNA 의 PCR-RFLP 결과 R. solani 는 크게 5 group 으로 나뉘어졌다. 균주 번호 1번과 3번은 AG-5 그룹과 0.976의 높은 상동성을 보였고, 12번, 13번은 AG-2-2와 0.976의 상동성을 보였다. 균주번호 7,8,11,13,15 는 AG-1에 속하였다. 제한효소 HaeIII로 절단하였을 때 균주번호 4,5,7,8은 700 bp에서 하나의 밴드가 나타나 AG-1에 속하였고, 균주번호 9는 AG-2-1과 517 bp에서 하나의 밴드가 나타났다. 도한 제한효소 Msp I을 사용하여 southern blotting을 한 결과 더 다양한 절단양상을 보이며 AG 간의 차이가 나타났다. AG-2-1과 균주번호 9는 200 bp에서 하나의 밴드가 나타났다. 균주 3,4,5,10,11,13은 AG-1과 1kb에서 하나의 밴드로 나타났다.

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Cytotoxic and Antimicrobial Activities of Bioactive Monoterpenophenols

  • Oh In Kio;Lee Hyun Ok;Ahn Jong Woong;Kim Hyung Min;Shin Ji Hee;Lim Jin A;Chun Hyun Ja;Baek Seung Hwa
    • 동의생리병리학회지
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    • 제16권6호
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    • pp.1270-1276
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    • 2002
  • Compounds 1 - 12 were tested for their growth inhibitory effects against tumor cell lines using two different 3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyl-2H-tetrazolium bromide (MTT) and sulforhodamine B protein (SRB) assays and antimicrobial activity. The cytotoxic activity of methyl-4-[{(2E)-3,7-dimethyl-2,6-octadienyl}oxy]-3-methoxy benzoate (1) exhibit more active than that of 5-fluorouracil (11) on human oral epithelioid carcinoma (KB, ATCC No. OCL 17) cell lines. But this compound (1) on human skin melanoma (SK-MEL-3, HBT 69) cell lines shows less active than that of adriamycin (12). However, compound 9 showed the antimicrobial activity against S. epidermidis (MIC, 15.625 ㎍/㎖), S. aureus, C. albicans (MIC, 31.25 ㎍/㎖), S. mutans, S. typhimurium, P. putida (MIC. 125 ㎍/㎖) and P. aeruginosa (MIC, 500 ㎍/㎖).

Saccharomyces cerevisiae에서 Bacillus CGTase의 표층발현 (Surface Display of Bacillus CGTase on the Cell of Saccharomyces cerevisiae)

  • 김현철;임채권;김병우;전숭종;남수완
    • 생명과학회지
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    • 제15권1호
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    • pp.118-123
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    • 2005
  • B. stearothermophilus 유래의 CGTase 유전자(cgtS)를 보유하고 있는 재조합 plasmid pCGTS (4.8 kb)을 효모 표면 발현용 vector인 pYDl (GAL1 promoter)에 subcloning 하였다. 구축된 재조합 plasmid, pYDCGT (7.2 kb)는 S. cerevisiae EBY100에 형질전환하였고, tryptophan이 결여된 SD 배지에서 1차 선별된 형질전환체들을 YPGS배지에서 배양 후 활성 염색을 통하여 CD가 생 성 됨을 확인하였다. 배양시간과 효소반응시간에 따른 반응 산물을 TLC로 분석 한 결과, 배양 12시간째부터 효소활성이 나타났고, 반응 10분 이후부터 CD가 생성되어 시간이 지남에 따라 CD 생성양이 증가하는 것을 확인하였다. 회분 배양한 결과 $25^{\circ}C$$30^{\circ}C$에서 CGTase의 최대 활성이 각각 21.3 unit/1 와 16.5 unit/1로 나타났고, plasmid 안정성은 각각 $86\%$$82\%$로 나타나 배양온도에 상관없이 plasmid는 비교적 안정하게 유지되었다.

Schizosaccharomyces pombe에서 SNF2에 속하는 hrp2+ 유전자의 특성 연구 (Characterization of hrp2 + Gene Related to SNF2 Family in Schizosaccharomyces pombe)

  • Park, In-Soon
    • 한국환경성돌연변이발암원학회지
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    • 제22권3호
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    • pp.137-141
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    • 2002
  • 본 연구는 분열형 효모 Schizosaccharomyces pombe에서 여러 가지 DNA 절제회복 및 유전자 발현에 관여하는 SNF2/SW12유전자의 기능을 연구하기 위하여 이에 관련되는 유전자를 분리하고 그 특성을 연구하였다. SNF2 motif 의 conserved sequence를 primer로 하여 중합효소 연쇄반응(PCR) 방법으로 480 bp 크기의 DNA fragment를 분리하여, 이를 probe로 하여 효모에서 hrp2+ 유전자를 분리하였다. 분리한 hrp2+ 유전자의 sequence homology를 비교한 결과 3개의 SNF2 motif를 포함하고 있었다. hrp2+유전자의 전사체 크기는 4.7 kb임을 Northern hybridization으로 확인하였다. hrp2+유전자의 전사 개시 부위를 알기 위하여 primer extension분석을 한 결과, 첫 번째 ATG에서 약47 base pair 위쪽에 위치함을 확인하였다. 또한 특성 연구를 위하여 Northern hybridization으로 hrp2+ 유전자의 UV와 MMS에 대한 유도성을 조사한 결과 자외선에 대해서만 유전자의 발현이 유도되었다. 이 결과 분리한 hrp2+는 UV-inducible 유전자임을 확인하였다.

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Inhibition of Interleukin-12 Production in Mouse Macrophages via Decreased Nuclear $Factor-\kappaB$ DNA Binding Activity by Myricetin, a Naturally Occurring Flavonoid

  • Kang Bok Yun;Kim Seung Hyun;Cho Dae Ho;Kim Tae Sung
    • Archives of Pharmacal Research
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    • 제28권3호
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    • pp.274-279
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    • 2005
  • Pharmacological inhibition of interleukin-12 (IL-12) production may be a therapeutic strategy for preventing the development and progression of disease in experimental models of autoimmunity. In this study, the effects of myricetin, a naturally occurring flavonoid present in fruits, vegetables and medicinal herbs, on the production of IL-12 were investigated in mouse macrophages stimulated with lipopolysaccharide (LPS). Myricetin significantly inhibited the LPS­induced IL-12 production from both primary macrophages and the RAW264.7 monocytic cell-line in a dose-dependent manner. The effect of myricetin on IL-12 gene promoter activation was analyzed by transfecting RAW264.7 cells with IL-12 gene promoter/luciferase constructs. The repressive effect was mapped to a region in the IL-12 gene promoter containing a binding site for NF-${\kappa}B$. Furthermore, activation of macrophages by LPS resulted in markedly enhanced binding activity to the NF-${\kappa}B$ site, which significantly decreased upon addition of myricetin, indicating that myricetin inhibited IL-12 production in LPS-activated macrophages via the down­regulation of NF-KB binding activity.