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Southern hybridization에 의한 질편모충의 유전학적 다양성 (Genetic variance of Tuchomonns uaginclis isolates by Southern hybridization)

  • 류재숙;민득영
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제36권3호
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    • pp.207-212
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    • 1998
  • 질편모충 7개 분리주 (국내분리주 UT8, KT6, UT-Kim 및 fr-Lee, 외국 분리주 CDC85, IR78 및 NYH286주)의 유전학적 차이점을 관찰하고자 Southemhybridization을 하였다. 탐침 (probe) 은 질편모충 DNA에 있는 반복적인 염기서열을 기초로 하여 337 bp의 탐침을 제작하였다. 질편모충 각 분리주를 클로닝하고 각각의 원충을 따로 배양하여 DNA를 분리하여 제한효소를 처리한 후 전기영동하고 Southemhybridization을 하였다. 질편모충 분리주에 관계엄이 11개 내외의 븐회이 관찰되었다. 콜로니가 2개 형성된 KT8, IR78 및 KT-Lee 분리주에서는 클로닝하기 전의 분리주와 클로닝하여 형성된 콜로니를 배양한 질편모충에서 같은 bandpattem이 관찰되었다. 사용된 모든 질편모충을 bandpattem에 따라 3군으로 나눌 수 있었는데, KT8 분리주는 국내 분리주인 KT6, KT-Kim 분리주와 같은 band pattern을 보여 1 kb, 1,2 kb, 1.6 kb, 1.9 kb, 2.3 kb, 2.7 kb, 3.2 kb, 3.4 kb, 3.8 kb, 4.9 kb 및 6.0 kb의 11개의 공통 분획을 보였다. 외국분리주로 metronidazole에 내성인 IR78 분리주는 국내 분리주인 fr-Lee 분리주와 같은 분획을 보여 1 kb, 1.2 kb, 1.6 kb, 1.8 kb, 2.1 kb, 2.5 kb, 2.7 kb, 2.9 kb, 3.4 kb, 5.0 kb 및 6.0 kb의 분획을 보였으며 IR78과 같이 약제 내성이 있다고 알려진 CDC85의 경우 IR78, KT-Lee 분리주와 비슷한 분획을 보였으나 2.9 kb가 없고 3.2 kb의 분획이 관찰되었다. 세번째 군에 해당되는 NYH286주는 12개의 분획을 보였는데 IR78, KT-Lee 분리주와 유사한 분획을 보였으나 그 차이점 은 6.0 kb 대신 6.2 kb를, 2. 1 kb 대신 2.0 kb와 2.2 kb를 나타냈다. 이상의 결과로 질편모충 여러 분리주의 유전학적 다양성이 관찰되었다.

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Frankia sp. strain SNU 014201의 nif-H, D, K, 유전자 클로닝

  • 권석윤;강명수;안정선
    • 미생물학회지
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    • 제30권1호
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    • pp.30-36
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    • 1992
  • 물오리나무의 뿌리혹에서 분기한 Frankia sp. SNU 014201 공생균주의 게놈내에 13.5 kb의 EcoRI, 18.0 kb 의 BamHI, 10.5 kb의 Bg/II, 4.5 kb의 KpnI 절편에 nif-H, D 유전자가 존재함을 확인하였다. 람다 파아지 EMBI3-BamHI arm을 사용하여 제조한 genomic library 에서 nif유전자를 포함하고 있는 14개의 재조합 파아지 클론을 선별하였다. 이들 중 Ahnif-12번 클론은 nif 유전자를 포함하고 있는 18kb 의 삽입 DNA 를 가지고 있었으며, 이중 7.9 kb 의 BamHI 절편내에 nif-H. D. K가 3.6kb 의 HindIII/KpnI 절편내에 nif D 의 일부와 H 가 위치하고 있었다. 따라서 이등 절편을 각각 subcloning 하고 제한효소 지도를 작성한 결과, Frankia sp. SNU 01420의 nif-H. D. K 유전자는 6.5 kb 의 Hind III/Bam HI 절편과 5.2 kb Sal/IBamHI 절편내에 연속 배열하고 있다.

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한지형 잔디의 조성시기, 초종 혼합 비율이 잔디 피복에 미치는 영향 (Effects of Sodding and Seeding Time and Rate of Seed Mixture on the Establishment of Cool-Season Turfgrasses)

  • 심규열;김창수;이성호;주영규
    • 아시안잔디학회지
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    • 제18권4호
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    • pp.179-191
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    • 2004
  • 피복율 가을 조성 시(2001. 9. 4)의 피복율은 롤잔디의 경우 KB100, KB80+PR20 처리구 모두 1.5개월(2001. 10. 20)이 경과하면 $100\%$의 피복율을 나타내었으며, 파종의 경우는 초종의 혼합비율에 따라 피복율이 차이를 보였는데 PR100 처리구가 다른 처리구에 비하여 가장 높은 피복율을 보였으며 다음으로 KB70+PR 30, KB80+PR20, KB100처리구 순으로 나타났다. 휴면기를 거친 후의 피복율은 PR100 처리구가 가장 높게 나타났으며 파종 후 7개월 (2002. 5. 5)만에 $100\%$ 피복되었다. KB100, KB80+PR20, KB70+PR30처리구들은 처리구간의 피복율에 차이가 거의 없었으며 공히 7.5개월(2002. 5. 20)만에 $100\%$ 피복율을 나타내었다. 봄 조성시(2002. 4. 11)의 조성속도는 모든 처리구가 가을 조성(2001. 9. 4)시 보다 빨랐다. 봄조성시의 피복율은 롤잔디의 경우 KB100, KB80+PR20 처리구 모두 조성 1개월(2002. 5.11) 후 1$100\%$ 피복율을 나타내었으며 파종의 경우는 $100\%$ 피복되는데 소요되는 기간은 PR100 처리구의 경우 3개월(2002. 7, 12)로 가장 빠른 조성을 보였으며 다음으로 KB80+PR2O, KB70+PR30 처리구가 3.5개월(2002. 7. 26)이 소요되었으며 KB100 처리구는 4개월(2002. 8. 9)이 소요되었다. 봄 파종시기별 피복율 4월, 5월, 6월에 각각 파종하여 파종시기별, 초종혼합비율에 따른 한지형 잔디의 피복율을 조사한 결과, 파종시기에 따른 피복율은 모든 초종혼합비에서 4월 파종이 가장 높은 피복율을 나타내었으며 다음으로 5월, 6월 순으로 나타났다. 4월 파종과 5월 파종간의 피복율 차는 상대적으로 낮았으나 6월 파종은 4월, 5월에 비하여 피복율 차이가 크게 나타났다. 초종혼합비 율에 따른 피복율은 4월 5월 파종의 경우는 Perennial ryegrass의 혼합비가 높을수록 피복율이 높았으나 6월 파종의 경우는 KB100, KB80 : PR20, KB70 : PR30, KB50 : PR5O의 혼합구는 Perennial ryegrass의 혼합비가 높을수록 피복율이 낮은 경향을 보였으며 PR 100 구는 이들 혼합구보다 약간 높은 피복율을 보였다. 봄 파종시기별, 초종혼합 비율에 따른 개체수 2002년 4월 1일 파종 후 2002년 7월 5일(조성 후 95일)에 초종혼합비율에 따른 개체수 및 총직립 경수를 조사한 결과, KB100:PR0, KB80 :PR20, KB70:PR30, KB50:PR50, PR100:KB0 처리구의 $1m^2$ 당 개체 수는 각각 16,600개, 6,700개, 4,900개, 3,300개, 12,400개였으며 총직립경 수는 각각 33,200개, 22,800개, 18,000개, 15,000개, 62,000개였다. 개체 수는 KB100:PR0처리구가 가장 높았고, 다음은 PR100:KB0처리구였으며 혼합처리구의 경우는 Kentucky bluegrass 혼합비 율이 높을수록 높았다. 총직립경 수는 PR100:KB0 처리구가 KB100:PR0 처리구보다 오히려 높았으며 혼합 처리구의 경우는 개체수와 비슷한 경향을 보였다. 혼합처리구의 경우 초종별 개체수의 비율은 KB80:PR20는 87:13, KB70:PR30는 78:22, KB50:PR50은 48:52의 비율로 나타났다. 조성시기의 기상과 피복율과의 상관관계 2001년 가을과 2002년 봄의 일일평균기온을 비교하여 보면 가을(9월, 10월, 11월) 3개월간의 일일평균기온은 $13.0^{\circ}C$였으며, 봄(4월, 5월, 6월) 3개월간의 일일평균기온은 $17.3^{\circ}C$로 봄철이 가을철 보다 $4.5^{\circ}C$ 높게 나타났다. 조성시기에 따른 한지형 잔디의 피복율 결과에서 봄철이 가을철보다 조성속도가 빠른 것은 일일평균 기온이 피복율에 영향을 미치는 요인중의 하나로 작용하였다. 2001년 가을과 2002년 봄의 일조시간을 비교하여 보면 가을(9월, 10월, 11월) 3개월간의 평균일조시간은 277시간 이였으며, 봄(4월, 5월, 6월) 3개월간은 301.2시간으로 봄철의 일조시간이 가을철보다 월 94.2시간 많은 것으로 조사되었다. 봄철, 가을철의 강수량은 봄철이 95mm/월, 가을철이 27.3mm/월로 봄철이 가을철보다 약 3배정도 높게 나타났으나 강수량이 많은 봄철에 잔디피복율이 높은 점으로 보아 강수량이 많을수록 잔디생육에 부정적인 영향을 미쳤다고 보기는 어렵다.

A Plausible Method for the Diagnosis of Genetic Disorders Using Full Length cDNA

  • Hur, Hyang-Suk;Lee, Young-Won;Park, Hyoung-Woo;Kim, Myoung-Hee
    • 대한의생명과학회지
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    • 제7권1호
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    • pp.1-5
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    • 2001
  • A cDNA of coagulation Factor IX gene has been screened from the $\lambda$gt11 human fetal liver cDNA library, and used to construct a 2.8-kb full length cDNA after recombining with the N-terminal fragment from pTZ-FIX. Human genomic DNA was isolated, digested with the restriction endonucleases, TaqI, EcoRI, and HindIII, and Southern hybridization was performed using the full length factor IX cDNA as a probe. The hybridized bands generated by the restriction endonucleases were the followings: TaqI, 0.3, 1.0, 1.6, 1.8, 2.7, 3.7, and 5.3 kb bands; EcoRI, 1.8, 4.8, 4.9, 5.5, 6.8, and 12.6 kb bands; HindIII, 4.1, 4.4, 5.2, 5.8, 7.6, and 12.5 kb bands. When the Southern bands were physically mapped along the genome, about 50-kb continuous region harboring almost all of the genomic region of Factor Ⅸ gene was covered. These results suggest a possibility of using an exonal cDNA probe to diagnose abnormalities including large deletions, insertions, and rearrangements along the genome, if there is any.

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Duchenne Muscular Dystrophy에 관한 세포유전학 및 분자유전학적 연구 (Cytogenetic and Molecular Genetic Studies on Duchenne Muscular Dystrophy)

  • 홍해숙
    • Journal of Korean Biological Nursing Science
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    • 제7권1호
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    • pp.29-46
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    • 2005
  • Purpose ; 본 연구는 X-염색체와 관련된 장애 중에서 가장 흔하고 심한 Duchenne Muscular Dystrophy(DMD)의 세포유전학 및 분자유전학적 특성을 설명하기 위해서 DMD에 영향을 받고 있는 두 가계의 13명을 대상으로 가계도 분석과 염색체 분석 및 DNA 분석을 하였다. Method ; DNA분석은 DNA probe을 이용한 Southern blotting method로써 RFLPs와 DMD유전자 부위의 exon소실 유무를 조사하여 아래와 같은 결과를 얻었다. Conclusion ; A 염색체 분석 : 말초혈액과 양수를 표본으로 High-Resolution GTG염색에서 A가계와 B가계의 염색체 분석에서 12명의 염색체는 정상 X-염색체였으나 B가계의 I-2(DMD여성)에서 46, x,-x,+t(2:x)(q 21.1 : p21.2)로 나타난다. B. DNA분석3 : 1) RFLPs의 분석 J66,XJ-1.1,754-11로써 B가계의 RELPs(Restriction Fragment Length Polymorphisms)에서 J66/Pst I은 1.7hb(E), 1.6kb(e)을 보여 주었고 XJ-1.1/Taq I은 3.6kb(F), 3.0kb(f), 754-11/EoR I은 4.2kb(G), 2.0kb(g)의 대립인자를 나타내었다. 이상의 결과를 바탕으로 영향을 받고 있는 남자 (II-2)의 haplotype는 보인자인 어머니의 한쪽 인자를 받았으며 어머니와 딸은 보인자이고 임산부의 태아는 남아였고 태아의 인자들은 그의 할아버지로부터 물려받아 DMD에 영향을 받지 않은 것으로 진단되었다. 2) DMD 유전자의 exon 소실에 대한 분석 cDNA probe 8과 cDNA probe 2b-3으로써 소실에 대한 진단은 영향을 받은 남자(II-2)는 cDNA probe 8에서 12, 7.3, 6.6, 4.2kb에 소실이 있고 cDNA 2b-3은 1.7kb에 소실에 나타났다.

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고삼 추출물의 암세포에 대한 세포독성 (Cytotoxicity on Cancer cells of the Extract of Sophora flavescens Ait.)

  • 이현옥;전주연;이지연;김창희
    • 치위생과학회지
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    • 제2권1호
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    • pp.15-19
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    • 2002
  • 고삼 추출물의 암세포에 대한 세포독성을 파악하기 위하여 고삼의 에틸 아세테이트 소분획으로 MTT 정량분석을 실시하였다. 고삼의 에틸 아세테이트 소분획은 암세포인 KB 세포, B16 세포, HeLa 세포와 MCF-7 세포에 대하여 $6.25{\mu}g/ml$ 농도부터 세포독성이 나타났으며, 12.5, 25, 50 및 $100{\mu}g/ml$까지 각각의 농도별로 세포독성은 증가하였고, 통계적으로 유의성이 인정되었다(p<0.05). KB 세포에 대한 $IC_{50}$$56.58{\mu}g/ml$, B16 세포에 대한 $IC_{50}$$65.43{\mu}g/ml$, HeLa 세포에 대한 $IC_{50}$$83.95{\mu}g/ml$, MCF-7 세포에 대한 $IC_{50}$$106.65{\mu}g/ml$로 나타났다. 고삼의 에틸 아세테이트 소분획은 암세포의 성장을 억제하였고, 세포독성의 강도는 B16 세포, HeLa세포, MCF-7 세포, KB 세포 순서로 높게 나타났다.

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시계열분석과 요인분석에 의한 결정질 암반의 지하수 유동 평가 (Evaluation of Goundwater Flow Pattern at the Site of Crystalline Rock using Time Series and Factor Analyses)

  • 이정환;정해룡;윤시태;김지연;조성일
    • 한국지하수토양환경학회지:지하수토양환경
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    • 제19권4호
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    • pp.12-22
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    • 2014
  • This study evaluated the pattern of groundwater fluctuation in cyrstalline rock using time series and factor analyses. From the results, groundwater level for the 18 wells was classified into 4 types reflecting the hydrogeological properties and rainfall event. Type 1 (DB1-5, DB1-6, DB2-2, KB-10, KB-13) was significantly influenced by groundwater flow through water-conducting features, whereas type 2 (DB1-3, DB1-7, KB-1~KB-3, KB-7, KB-11, KB-14, KB-15) was affected by minor fracture network as well as rainfall event. Type 3 (DB1-1, DB1-2) was mainly influenced by surface infiltration of rainfall event. Type 4 (DB1-8, KB-9) was reflected by the irregular variation of groundwater level caused by anisotropy and heterogeneity of crystalline rock.

Carboxydobacteria 를 위한 재조합 Plasmid 백터와 형질전환방법 개발

  • 김진욱;송택선;김영민
    • 미생물학회지
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    • 제30권3호
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    • pp.218-224
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    • 1992
  • Carboxydobacteria 의 일산화 탄소 산화에 대한 유전학적 연구를 위해 Pseudomonas caarboxydovorans 에 존재하는 pYK100 plasmid 와 pBR322 를 이용하여 pYK322 (7.2 kb, Ap, Tc) 와 pYK324 (7.2 kb, Ap, Tc) 등 두가지 재조합 plasmid shuttle 백테를 만들고, pYK100와 pACYC184를 이용하여 pYK210(5.2 kb, $CM^{r}$ ), pYK220 (5.2kb,$CM^{r}$ ), pYK230 (5.2 kb, $Cm^{r}$ ), pYK232 (5.2 kb, $CM^{r}$) 등 네가지 shuttle 벡터를 만들었다. 재조합된 벡터들은 보두 대장균에서 안정되게 복제되었다. pYK322 와 pYK220 을 이용한 carboxydobacteria 의 형질전환 실험에서 Bagdasarian 과 Timmis 의 방법 (Curr. Top. Microbiol. Immunol., 96 :47-67, 1982) 을 변형하여 0.2% succinate 가 포함된 무기염류배지에서 지수성장 중기까지 배댜ㄷ한 세균을 이용하고, 형질전환용액의 10 mM RbCI 을 100 mM KCI 로 대체하며, 형질전환용액 처리후 4.deg.C 에서의 방치시간을 12시간으로 하고, DNA첨가휴 45.deg.C 에서 3 분간 heat shock 을 준 경우에 높은 형질전환이 일어났다. 형질전환된 세균으로 부터 형질전환에 사용한 plasmid 를 발견할 수 없었는데, 이는 도입된 plasmid 가 염색체 DNA 에 결합되었기 때문인 것으로 추측된다.

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각섬석 지압계를 이용한 영남육괴 내 화강암의 정치심도와 그 의미 (Implication for the emplacement depth of the granites in the Yeongnam Massif, using the aluminum-in-hernblende barometry)

  • 홍세선
    • 암석학회지
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    • 제10권1호
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    • pp.36-55
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    • 2001
  • 각섬석지압계를 이용하여 영남육괴 내에 분포한 영주, 안동과 김천일대의 쥬라기 화강암체를 대상으로 정치심도를 측정하여 이의 지구조적 의미를 해석하였다. 영주화강암에서 22개, 안동화강암에서 10개, 김천화강암에서 12개의 시료를 선택하여 각섬석의 연변부 성분을 측정하였다. IMA(Leake et at., 1977)에 의한 각섬석 분류에서 이들은 에데나이트, 파가사이트와 페로파가사이트 성분영역에 속한다. Schmidt(1992)의 식에의해 계산된 정치압력은 영주화강암이 5.6~7.9 kb. 안동화강암이 5.5~7.5 kb, 김천화강암은 4.1~5.3 kb의 범위를 나타낸다. 특징적으로 영주화강암은 예천전단대 부근의 남동 경계부에서 북서 경계부로 가면서 정치심도가 7.5 kb에서 6 kb로 감소하는 경향을 보이며 5km의 정치심도 차이에 해당한다. 이를 경사각도로 적용하면 영주화강암은 대체로 북서방향으로 약 $10^{\circ}$정도 기울어져 있음을 보여준다. 즉, 정치이후 단층운동이나 전단운동 등과 같은 지구초적 환경에 의해 남쪽 부분이 더 상승한 이후 현재 지표면에 노출되었음을 의미한다. 또한 영주화강암은 북동-남서 방향으로 신장되어 있음에도 불구하고 장축방향으로의 압력 차이는 거의 보이지 않는다. 이러한 현상은 같은 영남육괴내에 관입한 김천지역 화강암에서도 동일한 양상을 보인다. 이러한 정치 심도의 분포 결과를 볼 때 적어도 영남육괴 내 일부 화강암은 비록 화강암체가 전단대와 접하더라도 북동-남서방향의 장축 방향으로 기울어짐(tilting)이 전연 일어나지 않았음을, 즉, 조구조운동에 의한 암체의 고결 후 동적 변화가 없었음을 지시한다.

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Generation of transposon insertion mutants from type A Pasteurella multocida

  • Choi, Keum-hwa;Maheswaran, Samuel K.
    • 대한수의학회지
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    • 제39권2호
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    • pp.327-337
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    • 1999
  • The transposon TnphoA was used to generate avirulent mutants from a type A Pasteurella multocida. A suicide vector plasmid pRT733 carrying TnphoA, having the kanamycin resistant gene and harbored in Escherichia coli K-12 strain SM10(${\lambda}pir$), was mated with streptomycin resistant P. multocida P-1059 strain as recipient. This resulted in the generation of two TnphoA insertion mutants (transconjugants, tc95-a and tc95-b) which were resistant both to kanamycin ($Km^{R}$) and streptomycin ($Sm^{R}$), secreted alkaline phosphatase, and were avirulent to turkeys. Southern blot hybridization using two probes derived from internal fragments of TnphoA, confirmed the insertion of TnphoA into 12.9kb or 13.7kb DNA fragment from the EcoRV digested genomic fragments of transconjugants. The two transconjugants, tc95-a and tc95-b, were distinguishable from their parent strains by differences in ribotypes, and outer membrane protein profiles. TnphoA insertion in both transconjugants also resulted in constitutive expression of a 33Kd iron regulated outer membrane protein (IROMP). The gene encoding $Sm^{R}$ was also located within the same 12.9kb EcoRV genomic fragment from both transconjugants. Furthermore, our finding that the recipient P. multocida P-1059 $Sm^{R}$ strain and both transconjugants were avirulent to turkeys suggest that the either 12.9kb or 13.7kb genomic DNA contains the virulence gene and speculate that the presence of $Sm^{R}$ gene or TnphoA insertion may be responsible for regulating and inactivating the gene(s) encoding virulence in P. multocida.

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