• 제목/요약/키워드: 해양 유전

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라카디브 해역 몰디브 자생 해조류 Padina boryana 추출물의 항산화 효능 평가 (Evaluation of the Antioxidant Efficacy of Padina boryana Extract from Maldivian Seaweed from Laccadive Sea Area)

  • 김현수;;;이정민;임미진;고석천;이효근;제준건;전유진;이대성
    • 한국수산과학회지
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    • 제54권2호
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    • pp.162-169
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    • 2021
  • Global warming has affected the distribution of organisms for decades and has displayed rapid ascent recently. Research into the effects on tropical organisms are vital. Padina boryana is a resourceful marine microalgae in the Maldives Sea in the Laccadive region. A 70% ethanol extraction (PBE) of this seaweed was used to investigate its antioxidant potential. Both in vitro and in vivo models were implemented. PBE exhibited protective potential against H2O2 induced apoptosis. ROS levels were suppressed due to PBE. PBE expressed a cytoprotective nature. In vivo experiments involving the zebra fish model conformed its validity. The antioxidant efficacy of PBE was dose dependent. Study outcomes suggest PBE has potential as a novel and valuable marine resource to aid the functional food and cosmeceutical industries.

한국 연어의 소상하천간 유전적 유사성과 차이점 및 일본 연어와 유전적 관계 (Genetic Similarity-dissimilarity Among Korea Chum Salmons of Each Stream and Their Relationship with Japan salmons)

  • 김고은;김충곤;이윤호
    • 한국해양학회지:바다
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    • 제12권2호
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    • pp.94-101
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    • 2007
  • 한국 동해안의 가장 대표적인 연어과 어류인 연어(Oncorhynchus keta)의 집단 분석을 위한 연구가 국내에서는 많이 수행되지 않았다. 최근 연어과 어류의 계군을 분석하는데 유전자를 이용하는 방법들이 시도되고 있으며, 단일염기다형성(SNP)을 이용한 집단 구분 방법이 점차 많이 이용되고 있다. 본 연구에서는 한국 연어의 소상하천간 유전적 유사성과 차이점 및 일본 연어와 유전적 관계를 살펴 보기 위하여, 미토콘드리아의 COIII-ND3-ND4L 지역 720 bp 염기 서열을 분석하였다. 한국의 3개 지역(고성 북천, 양양 남대천, 울진 왕피천)에서 채집된 108개체와 일본의 2개 지역(홋카이도의 마시케와 하코다데)에서 채집된 44개체를 분석하여 29개의 haplotype을 확인하였다. 유전적 다양성은 남대천 연어에서 가장 높고 하코다데에서 가장 낮았다. Pairwise $F_{ST}$와 AMOVA를 이용한 집단 분석 결과, 한국 연어는 소상하천간 유전적 차이가 거의 없으며 일본 연어와도 크게 구분되지 않았다($F_{ST}<0.07$). 그러나, haplotype 유사성으로 본 각 개체의 유전적 관계는 한국 연어의 일부(약 25%)가 일본 연어와 구분되는 독특한 유전적 가계(lineage)를 형성하고 있으며, 국내 남대천과 북천 연어에는 왕피천과 구분되는 연어 가계가 존재함을 보여준다.

미토콘드리아 전장 유전체로 동정한 아귀목 Himantolophus groenlandicus 자어의 형태적 특징 (Morphology of a Larval Atlantic Footballfish Himantolophus groenlandicus Reinhardt, 1837 (Lophiiformes: Himantolophidae) Identified by Complete Mitochondrial DNA)

  • 최해영;장요순;김성
    • 한국어류학회지
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    • 제34권1호
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    • pp.1-7
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    • 2022
  • 북서태평양 표층에서 채집한 후기 자어 (2.2 mm BL)의 미토콘드리아 전장 유전체를 근거로 Himantolophus groenlandicus로 동정하였다. 후기 자어는 둥근 몸통, 작은 이빨, 발달하기 시작한 등 지느러미, 아래 부분이 들어간 눈, 그리고 지느러미, 정수리, 등 부분에 분포하는 흑색소포를 가졌다. 이러한 특징은 크기가 유사한 동종으로 보고된 자어(2.1 mm BL)와 차이가 컸다. 본 연구 자어의 유전적, 형태적 특징은 유사종의 동정에 유용할 것이다.

알긴산을 분해하는 세균 Tamlana sp. UJ94의 완전한 유전체 서열 (Complete genome sequence of Tamlana sp. UJ94 degrading alginate)

  • 정재준;배승섭;정다운;백경화
    • 미생물학회지
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    • 제54권4호
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    • pp.463-464
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    • 2018
  • Tamlana sp. UJ94는 해수로부터 분리되었으며 알긴산을 분해할 수 있다. 알긴산 분해 관련 특성을 이해하기 위해 이 세균의 유전체를 분석하였다. UJ94의 유전체는 4,116,543 bp의크기로 3,609개의 코딩서열을 가지고 있으며 35.2 mol%의 G + C 함량을 가진다. BLASTp 검색 결과 9개의 alginate lyase 외에도 6개의 agarase, 5개의 amylase, 4개의 carrageenase, 1개의 cellulase, 4개의 pectate lyase, 7개의 xylanase의 존재가 예측되어 UJ94의 다양한 다당류 분해 능력을 암시하였다. Tamlana sp. UJ94의 유전체는 생물전환 공정에 사용할 수 있는 다당류 분해 유전자를 제공할 수 있을 것이다.

해양구조물의 초기생산단가 산정 알고리즘 개발 (Estimation of the Initial Production Cost for Offshore Structures)

  • 손세환;남종호;이종학;김원돈
    • 한국전산구조공학회:학술대회논문집
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    • 한국전산구조공학회 2011년도 정기 학술대회
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    • pp.191-194
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    • 2011
  • 전 세계적으로 에너지원 확보에 많은 관심을 가지고 있다. 육상유전에서 석유가 고갈되고 있는 시점에서 해양유전개발이 활발하게 이루어지고 있고 해양구조물 발주도 활발히 이루어지고 있다. 하지만 해양구조물은 아주 다양한 장비 물품과 복잡한 기하학적 구조를 가지고 있어 설계, 생산, 설치 운용에 어려움을 겪고 있고 기본설계, 장비 등과 같은 핵심기술은 외국에 의존하고 있는 실정이다. 이러한 상황을 극복하기 위해서는 해양플랜트 산업분야의 설계 및 생산기술력이 요구되고 있다. 본 연구에서는 해양구조물의 설계와 생산 작업에 중요한 인자로 적용되는 초기생산 단가산정 알고리즘을 이용한 Tool을 제시하고자 한다. 초기원가산정 알고리즘을 개발함으로써 생산 공정의 난이도를 미리 예측하여 준비 및 대비 할 수 있도록 하여 생산 공정의 발전을 이끌 수 있고 초기 설계 단계에서 사전 평가에 중요한 지표로 활용하며 설계 작업에 가이드라인을 제시하여 좀 더 경제적이고 효과적인 설계를 가능하게 해줄 것이다.

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3세대 DNA 염기서열 분석과 Hi-C기술을 이용한 꼬막 게놈의 유전체 연구 (Chromosomal Assembly of Tegillarca granosa Genome using Third-generation DNA Sequencing and Hi-C Technology)

  • 김진무;이승재;조은아;최은경;조민주;신소령;이정식;박현
    • 한국해양생명과학회지
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    • 제6권2호
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    • pp.97-105
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    • 2021
  • 꼬막은 해양 어업으로써 아시아 전 지역에 있어서 중요한 수산자원 중 하나이다. 하지만, 공장의 산업화, 해양 환경오염, 그리고 지구 온난화로 인해 해양 어업 생산량이 급격히 떨어졌다. 우리나라 남해안의 주요 수산자원인 꼬막의 유전적 특성을 파악하기 위하여 꼬막의 전장유전체를 해독하고 염색체 서열을 규명하였다. 915.4 Mb의 게놈을 조립하였고, 19개의 염색체 유전자 서열을 식별하였다. 꼬막의 유전체에서 25,134개의 유전자들을 확인하였고, 그 중에 22,745개의 유전자들에 대한 기능을 확인했으며, 4,014개의 유전자들에 대한 KEGG pathway를 분석하였다. 꼬막유전체와 8종의 다른 패류와 비교유전체 분석을 통하여 확장/감소(gene gain and loss) 분석을 수행한 결과, 725개의 유전자군의 확장과 479개의 유전자군의 감소를 확인하였다. 꼬막의 homeobox 유전자 클러스터는 촉수담륜동물 내에서 잘 보존된 유전자 구조를 보였다. 또한, 꼬막은 3개의 hemoglobin 유전자들이 피조개의 hemoglobin과 높은 유사성을 보였다. 꼬막의 전장유전체 정보를 통해 꼬막의 환경 적응과 진화의 유전적 특성과 생리적 특성뿐만 아니라, 꼬막 양식의 효율성을 높이는 양식산업에 널리 이용될 수 있는 유전적 정보를 제공할 것이다.