Journal of the Korean Society for Marine Environment & Energy
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v.6
no.2
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pp.3-15
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2003
Recently more than 450 incidents of oil spill a year have occurred in nearshore of Korea, which caused unmeasurelable losses in fisheries and severe damage in marine ecosystem. Two approaches remain paramount in any response to marine oil spill : the enhancement of natural dispersion of the oil by using dispersants, and mechanical recovery using booms and skimmers. A technique currently receiving fresh attention is the enhancement of the natural bioremediation of oil through the application of micro-organisms and/or nutrient. Oil, like many natural substances, will biodegrade over a period of time into simple compounds such as carbon dioxide, water and biomass. Bioremediation is the term used to describe a range of processes which can be used to accelerate natural biodegradation. More specifically biostimulation is the application of nutrients, and bioaugremetation or seeding is the addition of microbes specially selected to degrade oil. Bioremediation is an economically attractive method for the clean-up of oil-contaminated area. Bioremediation has been demonstrated to be an effective oil spill countermeasure for use in cobble, sand beach, salt marsh, and mud flat environment.
The Sea:JOURNAL OF THE KOREAN SOCIETY OF OCEANOGRAPHY
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v.17
no.3
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pp.189-201
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2012
Radiocarbon is a powerful tool for studies of carbon cycling in the ocean. Development of measurement technology of accelerator mass spectrometry has enabled researchers to measure radiocarbon even in specific compounds. In this paper, a brief introduction on radiocarbon measurement and reporting of radiocarbon data is provided. Researches that used radiocarbon measurements on bulk organic matter, organic compound classes, and specific organic compounds are reviewed. Examples include works to understand the cycling of particulate and dissolved organic matter, biochemical composition of particulate organic matter, post-depositional transport of sedimentary organic matter, selective incorporation of fresh organic matter by benthic organisms, chemoautotrophy by archaea, and sources of halogenated chemical compounds found in marine mammals.
Squid jeotgal is a very popular traditional, salted, and fermented seafood in Korea. Due to the development of a distribution structure, a lot of imported squid jeotgal has recently entered Korea. In this study, we analyzed and compared the microbial contamination levels of domestic and imported squid jeotgal. The total viable bacterial count in domestic and imported jeotgal was 5.20 and 5.38 log CFU/g, respectively. The highest contamination level was 6.94 log CFU/g in one of the imported squid jeotgal samples. Coliforms were not detected in domestic jeotgal but were detected at 50% with 2.21 log CFU/g in imported jeotgal. Escherichia coli and Staphylococcus aureus were not detected (ND: <1 log CFU/g) in both domestic and imported jeotgal. All samples of jeotgal were negative for Bacillus cereus and Clostridium perfringens. The microbial contamination levels determined in the current study may be utilized as primary data to execute microbial risk assessments on domestic and (or) imported jeotgal.
Journal of the Korean Society of Marine Environment & Safety
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v.14
no.1
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pp.39-43
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2008
It is generally recognized that monitering of bio-molecules, which are related to the ocean environment, becomes more important. So far, for the detection of the bio-molecules, ocean samples were brought to laboratory to be analyzed using a complicate and expensive measuring system The "ship and dip" method takes a relatively long time to complete a analysis cycle and causes significant errors due to the time difference between the analysis processes. In order to overcome the drawbacks, developments of sensors for the detection of bio-molecules were suggested using nano-technology, such as nano-spintronic device, carbon nano tube device, and nano-semiconductors. The pros and cons of the technology were examined and reinvestigated to overcome the technical problems in the application to real sensors.
To figure out the conserved genes and newly added genes at each phylogenetic level of Archaea, COG (clusters of orthologous groups of proteins) algorithm was applied. The number of conserved genes within 9 species of Archaea was 340 and that of 8 species of Euryarchaeota was 388. Many of conserved 265 COGs, which are specific to Archaea and absent in Bacteria and S. cerevisiae, were concerned with 'information storage and processing' (94 COG, 35.5%) and 'metabolism' (82 COG, 30.9%). COGs related to these functions were assumed as highly conserved and permit peculiar life form to Archaea. It seemed that there was some difference in 'nucleotide transport and metabolism' and there was little difference in 'information storage and processing' between Euryarchaeota and Crenarchaeota. Marine-origin Euryarchaeota showed different conserved COGs with terrestrial Euryarchaeota. Conserved COGs, related to carbohydrate transport and metabolism and others, were different between marine- and terrestrial-origin Euryarchaeota. Hence it was assumed that their physiology might be different. This study may help to understand the origin and conserved genes at each phylogenetic level of marine-origin Euryarchaeota and may help in the mining of useful genes in marine Archaea as Manco et al. (Arch. Biochem. Biophy. 373, 182 (2000)).
Kim, Byung-Hyuk;Baek, Kyung-Hwa;Sung, Youl-Boong;Choi, Gang-Kook;Cho, Dae-Hyun;Oh, Hee-Mock;Kim, Hee-Sik
Proceedings of KOSOMES biannual meeting
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2007.11a
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pp.185-185
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2007
Starting at the beginning q the 20th century, increasing amounts of tetrach1oroethene (PCE) and trichloroethene (TCE)were manufactured due to the extensive use of these compounds in industry, in the military, and in private households, mainly as nonflammable solvents. This widespread use, along with careless handling and storage, are among the most serious contaminants of soil, sediment and groundwater. Highly chlorinated ethenes are typically not degraded through oxygenation by aerobic bacteria Since complete reductive dechlorination of PCE and TCE to ethene (ETH) has been observed in anaerobic enrichment culture, anaerobic dehalorespiring bacteria have received increased attention in the last decade. Under anaerobic conditions, these compounds con be reductively dehalogenated to less-chlorinated ethenes or innocuous ethene by microorganism through dehalorespiration. We have been studying anaerobic enrichment culture which used lactate as the electron donor for reductive dechlorination of PCE to ETH the anaerobic mixed microbial culture was enriched from the sediment sample taken from site contaminated with PCE. PCE was consistently and completely converted to ethene. In addition, the accumulation of intermediate products such as 1,2-ds-dichloroethene (cis-DCE) and vinyl chloride (VC) was observed in the anaerobic mixed microbial culture. the established dechlorinating enrichment culture was analyzed by DGGE using primers specific to DefrJ1ococcoides 16S rRNA gene sequences. In conclusion, we established the PCE dechlorinating enrichment culture and confirmed the existence of Dehalococcoides in an enrichment culture.
Proceedings of the Korean Society of Fisheries Technology Conference
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2001.05a
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pp.142-143
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2001
본 연구의 목적은 젓갈 제조 공정에서 미생물학적, 화학적 위해 요소를 조사하고 젓갈 산업에 HACCP system의 적용과 관리 대책을 연구하는데 있다. 작업장내 공중낙하균을 측정하였으며 젓갈원료 및 제조공정별 생균수, 분변계대장균, 병원성균, VBN 등의 의해 요소를 검토했다. (중략)
Song, Min Gyu;Kim, So Hee;Kim, Jin Soo;Lee, Jung Suck;Heu, Min Soo;Park, Shin Young
Korean Journal of Fisheries and Aquatic Sciences
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v.55
no.4
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pp.431-436
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2022
For the safety assessment of microbiological and chemical hazards in katsuobushi, fifteen samples of katsuobushi were purchased from supermarkets. The contamination levels of total viable bacteria, coliforms, Escherichia coli, and nine pathogenic bacteria [Staphylococcus aureus, Salmonella spp., Listeria monocytogenes, Bacillus cereus, Vibrio parahaemolyticus, Clostridium perfringens, Enterohemorrhagic E. coli (EHEC), Yersinia enterocolitica and Campylobacter jejuni/coli] were quantitatively or qualitatively assessed. Additionally, the heavy metals (total and methyl mercury) content, radioactivity (131 I, 134 Cs+ and 137 Cs) were quantitatively assessed. Microbial and chemical analyses were performed using standard methods in Korean food code. The contamination level of total viable bacteria was 2.70 (1.18-4.42) log CFU/g. Coliforms, E. coli and S. aureus were not detected in any samples. Other eight pathogenic bacteria were negative in all samples. The contamination levels of total and methyl mercury were 0.366 (0.227-0.481) and 0.120 (0.002-0.241) mg/kg, respectively. In addition, radioactivity was not detected in any samples. The results will be helpful in revitalizing domestic use and boosting exports of katsuobushi because the microbiological and chemical safety of katsuobushi has been assured. Furthermore, the results may be used as a basis for performing chemical and microbial risk assessments of katsuobushi.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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