• 한국축산식품학회:학술대회논문집
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• 한국축산식품학회 2005년도 제36차 추계 학술발표대회
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• pp.217-220
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• 2005

햄버거 패티에 기능적 특성을 부여하고자 실크 펩타이드를 첨가하여 햄버거 패티를 제조한 후 품질특성 및 최적 실크 펩타이드 첨가량을 평가하였다. 실크 펩타이드가 햄버거 패티의 가열 감량에 미치는 영향을 분석한 결과 실크 펩타이드 첨가량이 증가함에 따라 가열감량이 유의적으로 감소하는 것으로 나타났다. 실크 펩타이드가 첨가된 햄버거 패티의 경도, 탄성 및 점착성을 분석한 결과 경도는 실크 펩타이드 첨가량이 증가함에 따라 감소하는 경향이었으나, 탄성과 점착성의 경우 실크 펩타이드 첨가에 의해 영향을 받지 않는 것으로 나타났다. 또한, 색도 측정결과 실크 펩타이드 첨가량이 증가함에 따라 명도(L) 및 적색도(a)는 유의적으로 증가하였으며, 황색도(b)는 감소하는 것으로 나타났다. 실크 펩타이드를 첨가한 햄버거 패티의 관능적 특성을 분석한 결과 실크 펩타이드가 첨가된 햄버거 패티는 외관, 후각, 미각, 조직감 및 종합적 기호도 등 모든 평가항목에서 무첨가구에 비해 높게 나타났다.

• KSBB Journal
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• 제25권4호
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• pp.395-400
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• 2010

본 연구에서는 파파인으로 가수분해된 피브로인 펩타이드에 글리세롤을 추가하고 동일한 효소인 파파인을 이용하여 글리세릴 에스터 결합을 형성시키는 반응을 수행하였다. 피브로인 펩타이드 10%와 글리세롤 50% 포함된 반응용액을 pH 3, $40^{\circ}C$의 반응 조건에서 글리세릴 에스터가 생성됨을 ESI 질량 분석을 통하여 확인하였다. 아울러 반응전 시료의 펩타이드의 조성과 생성된 글리세릴 펩타이드 에스터의 조성으로부터 헥사 및 옥타펩타이드의 비율은 감소하였고 디펩타이드와 테트라펩타이드의 글리세릴 에스터가 반응 생성물을 주로 구성되어 있으며 특히 AG-OGl의 조성이 증가하였음을 확인하였다. 글리세릴 펩타이드를 양이온교환수지 칼럼을 사용하여 미반응된 펩타이드와 분리하여 17.8%의 수율로 수득하였고, 이 시료를 FT-IR로 분석하여 펩타이드의 C말단의 $COO^-$의 감소를 확인하여 글리세릴 펩타이드임을 재확인하였다.

• 인터넷정보학회논문지
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• 제13권4호
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• pp.45-52
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• 2012

감염된 미생물에서 유래한 단백질 펩타이드가 HLA에 결합하여 숙주의 세포표면에 제시되면, T 세포가 이를 인식하여 면역반응을 유발함으로써 감염원을 제거하게 된다. HLA와 펩타이드간의 결합이 안정적일수록 T 세포반응이 강하게 일어나 효율적으로 감염원을 제거할 수 있다고 알려져 있다. 따라서 특정 HLA에 안정적으로 결합할 수 있는 펩타이드(HLA binder)를 찾아낼 수 있다면 감염질환이나 암의 예방을 위한 펩타이드 백신의 개발에 활용될 수 있다. 그런데 HLA는 매우 다형하기 때문에 하나의 집단 내에서도 어느 정도의 빈도를 가지는 대립유전자의 수가 매우 많다. 따라서 이들 모든 대립유전자들에 대해 가능한 펩타이드조합을 제작한 후 직접 실험을 통해 안정적으로 결합하는 펩타이드를 찾아내는 것은 매우 비효율적이다. 이를 극복하기 위하여 특정 HLA에 안정적으로 결합하는 펩타이드를 예측하는 정보전산적인 방법이 최근 개발되어 왔다. 이들 방법을 통해 제시된 펩타이드에 대해서만 직접 생물학적 실험을 시행함으로써 연구자는 검증해야 할 후보 펩타이드의 수를 현격히 감소시킬 수 있게 된다. 본 논문에서는 HLA 결합 펩타이드 예측을 위해 기계학습을 이용한 방법을 소개할 뿐만 아니라, 지금까지 HLA 결합 펩타이드 예측에 시도된 적이 없는 '지식기반 유전자 알고리즘(knowledge-based genetic algorithm)'이라는 새로운 모델을 제시하고자 한다. 이것은 유전자알고리즘(GA)에 기반한 것이었지만 전문가 지식을 접목함으로써 GA보다 더 향상된 성능으로 한국인에 흔한 HLA에 결합하는 펩타이드를 예측하였다. 뿐만 아니라 이것은 결합하는 펩타이드의 규칙을 한국인에 흔한 HLA 대립유전자에 대하여 추출해 줄 수 있는 새로운 방법이었다.

• 생명과학회지
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• 제25권7호
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• pp.833-838
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• 2015

다제약제 내성을 가지는 슈퍼 박테리아, 곰팡이, 바이러스, 기생충 감염은 주요한 건강위협인자들이다. 하지만, 건강위협 상황을 극복하기위해 현재 약제의 대안들중 항생펩타이드를 들 수 있다. 항생펩타이드는 자연계 다양한 종에서 생산된다. 항생펩타이드는 작은 단백질로 어류, 양서류, 파충류, 식물 그리고 동물의 감염으로부터 다세포생명체를 보호하는 선천성 면역에 관여하고 있다. 1980년대 이후로 매년 항생펩타이드의 수가 증가하고 있다. 박테리아, 원생생물, 곰팡이, 식물, 동물로부터 동정된 2,000가지 이상의 항생펩타이드가 항생펩타이드 데이터베이스에 등록되어 있다. 이러한 항생펩타이드의 대부분은 11-50개의 아미노산으로 구성되어 있고 하전상태는 0에서 +7까지이며 소수성은 31-70%를 차지하고 있다. 본 보고는 항생펩타이드를 생물학적 원천, 생물학적 기능, 펩타이드 성질, 공유결합패턴, 3차구조등에 의해 분류하였다. 항생펩타이드의 기능은 항균작용외에 세포주화성과 같은 세포생물학적 활성에도 기능성을 가지고 있다. 더욱이 림프절 스트로마로부터 기원한 fibroblastic reticular cell (FRC)에 염증상황 유도시 항생펩타이드가 발현되는 것을 확인하였다. FRC로부터 유도된 항생펩타이드는 whey acidic protein (WAP) 도메인을 포함하고 있었다. 이것은 단백질 도메인에 의해서도 항생펩타이드를 분류 할 수 있다는 것을 제시한다.

• 미생물학회지
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• 제46권1호
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• pp.96-103
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• 2010

단백질의 N-글리코실화는 대표적인 번역 후 변형 중의 하나로 진핵생물 뿐 아니라 원핵생물에서도 발견된다. N-글리코실화는 단백질 상의 N-글리코실 서열인 N-x-S/T 위치에 지질과 연결된 올리고당(lipid-linked oligosaccharide, LLO)으로부터 올리고당 전이효소(oligosaccharyltransferase, OTase) 활성에 의해 글리칸(glycan)이 전달되어 당단백질의 합성이 이루어진다. 본 연구에서는 OTase의 세포내 활성을 측정하기 위하여 5/6-carboxyltetramethylrhodamine (TAMRA)이 도입된 형광펩타이드 TAMRA-DA$\underline{N}$Y$\underline{T}$K-$NH_2$를 이용하였다. OTase활성 측정은 단일 서브유닛으로 효소의 활성을 갖는 운동핵 편모충류인 Leishmania major Stt3p와 병원성 미생물인 Campylobacter jejuni PglB를 진핵생물과 원핵생물의 모델 효소로 각각 사용하여 Saccharomyces cerevisiae와 C. jejuni 유래 LLO와 형광 펩타이드를 반응시켜 당-펩타이드를 합성하였다. 합성된 당-펩타이드를 미반응한 형광펩타이드와 분리 및 당-펩타이드의 정량 분석을 위하여 Tricine SDS-PAGE, ConA 렉틴 컬럼 및 fluorospectrophotometer, HPLC를 사용하였으며, 당-펩타이드 분석을 통해 각 방법의 장단점을 비교하였다. 비교 분석 결과 Tricine SDS-PAGE를 이용한 형광 이미지 분석과, 렉틴 컬럼을 통해 분리된 당-펩타이드의 fluorospectrophotometer 정량법에 비해, HPLC를 이용한 방법이 OTase에 의해 생성된 당-펩타이드를 분석하는데 더 정확하고 정량적인 값을 제시하는 것으로 확인되었다.

• 폴리머
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• 제38권4호
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• pp.550-556
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• 2014

펩타이드-고분자 하이브리드 소재(PPs)들은 선택적 용매에서 나노구조 형성을 위한 잠재적 구성 요소로서 많은 연구분야에 이용되고 있다. PPs는 잘 정의된 펩타이드-고분자로 이루어진 바이오콘주게이트의 손쉬운 제조방법과 다양한 응용분야에서 이들의 고유활성도에 대한 연구는 중요한 이슈이다. 본 연구에서는 atom transfer radical polymerization(ATRP)와 고체상 펩타이드 합성법을 이용하여 펩타이드-고분자 하이브리드 소재를 제조하였다. PYGK(proline-tyrosine-glycine-lysine) 펩타이드를 제조하기 위하여 일반적인 고체상 펩타이드 합성법을 이용하였다. PYGK 펩타이드는 섬유소용해(fibrinolysis) 과정에서 플라스미노젠과 반응하는 PFGK(proline-phenylalanine-glycine-lysine)와 유사한 펩타이드이다. 펩타이드와 펩타이드 개시제는 MALDI-TOF와 $^1H$ NMR을 이용하여 분석하였다. 펩타이드-고분자인 pSt-PYGK는 GPC, IR, $^1H$ NMR 분석법, 그리고 TLC를 이용하여 분석하였다. 구형 마이셀 집합체는 TEM과 SEM으로 측정하였다. 본 합성방법은 고유결합 활성도를 가진 잘 정의된 펩타이드-고분자 하이브리드 소재를 합성할 수 있는 기회를 제공한다.

• 한국작물학회지
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• 제59권3호
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• pp.252-262
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• 2014

혈당 강하를 목적으로 선발된 수수계통의 종자 유래 펩타이드의 양적, 질적 형질을 특성화하고 혈당 강하 수수에서 특이적으로 발현 펩타이드를 선발하기 위하여, 혈당 강하수수 7계통과 비 혈당 강하 수수 5계통에 대한 종자 펩타이드 프로파일링을 SELDI-TOF MS 기법을 활용하여 분석하였다. 1. 분자량의 범위가 2~20 kDa에서 검출된 수수 12계통 종자의 펩타이드는 CM10 (weak cation exchanger)에서 104개와 Q10 (strong anion exchanger)에서 95개였으며, 펩타이드 양적발현에서 12계통 간 유의성(p < 0.01)을 보인 펩타이드는 CM10에서 99개와 Q10에서 93개였다. 2. 12계통 간 양적 발현에 유의적(p < 0.01) 펩타이드를 이용한 heat map 분석에서 수수 각 계통 종자의 고유한 펩타이드 프로파일과 특이적으로 발현하는 펩타이드를 제시하고 있다. 3. 수수 12계통간의 근연거리를 이용한 군집분석에서 혈당 강하 수수 7계통과 비 혈당 강하 수수 5계통이 서로 다른 2개의 군집을 형성하였다. 4. 혈당 강하 계통에서 유의성(p < 0.00001)이 있게 발현되는 펩타이드를 29개 선정하였으며, 이중에서 혈당강하 계통에서만 공통적으로 높게 발현된 10개의 펩타이드(분자량이 2231.6, 2845.4, 2907.9, 3063.5, 3132.6, 3520.8, 4078.8, 5066.2, 5296.5, 5375.5 Da)를 선발하였다.

• 디지털융복합연구
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• 제20권2호
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• pp.311-316
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• 2022

Tertomotide는 hTert의 일부분이며 항암 백신으로 개발된 펩타이드이나 임상시험과 동물실험에서 염증성 질환을 개선하는 활성이 다수 보고된 바 있다. 다양한 연구에서 발견된 항염활성에도 불구하고 약물성이 높지 않아 일반적인 항염약물로의 개발이 어렵다. 다양한 부위에서 일어나는 염증성 증상에 활용하기 위해서는 항염활성과 약물성이 동반되어야 하므로 구조의 개선이 필요하다. 본 연구에서는 tertomotide의 구조를 기반으로 12 종의 옥타펩타이드를 설계하고 항염증 활성을 측정하여 약물성이 개선된 tertomotide 유래의 항염 펩타이드를 도출하고자 하였다. 이를 위해 활성화된 단핵구에서 염증성 cytokine인 TNF-α의 분비에 미치는 영향을 측정하여 각 펩타이드의 항염 활성을 평가하였고 양성대조군으로 비교한 estradiol이나 tertomotide 이상의 항염활성을 가진 펩타이드를 도출하였다. 본 연구의 결과는 tertotmotide 유래 펩타이드들을 활용한 신규 항염증 소재 개발 연구에 도움이 될 것으로 예상되며, 항염증 활성 등의 생리활성이 있으나 약물성이 낮은 펩타이드에 대해 계산화학적 접근으로 구조를 변경하여 기능적 잠재력 있는 신규활성물질을 도출하는 융합연구의 좋은 예가 될 것으로 사료된다.

• 융합정보논문지
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• 제10권6호
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• pp.209-216
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• 2020

단백질 항원에 존재하는 에피토프는 에피토프를 기반으로 한 백신 개발의 표적이 되고 있다. 인간의 주조 직적합 복합체 (MHC-1)에 결합하는 펩타이드를 확인할 수 있는 여러 서버들이 보고되고 있으나 인간의 MHC-I 분자의 수가 매우 많고 각 서버 검색 방법의 표준화 부재 등의 문제로 인해 펩타이드 예측에 적절한 서버를 선정하는 것이 쉽지 않다. 본 논문에서는 MHC-I 결합 펩타이드를 예측하는 서버 30 종을 비교하였으며, 다발성 골수종에 적용하기 위해 survivin 단백질로부터 사람의 HLA-A2 제한 펩타이드를 예측하였다. 본 연구의 결과는 MHC-I 결합 예측의 표준화된 방법을 제시하고 펩타이드 에피토프를 예측하는데 도움을 줄 것이다.

• 한국식품영양과학회지
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• 제20권2호
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• pp.126-132
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• 1991

식이 단백질의 질적인 차이에 의해 뇨중에 배설되는 산가용성 펩타이드의 배설과 단백질의 체내 이용효율을 검토하였다. PE식이의 산가용성 펩타이드의 배설량과 ASP-form 아미노산 pattern을 G식이, C식이, GLT식이 군과 비교한 결과, 각 단백질식이군에서 산가용성 펩타이드 배설량이 많았지만, 산가용성 펩타이드를 구서 고 있는 아미노산의 조성은 거의 유사하였으므로 뇨중 펩타이드가 내인성 대사 생성물임이 확이되었다. 그리고 뇨중에 배설되는 산가용성 펩타이드를 토대로 각 식이 단백질의 체내 이용효율을 계산한 결과 G식이는 $74{\pm}1%$, C식이는 $93{\pm}3%$, GLT식이는 $91{\pm}2%$였다.TEX>였다.