• Journal of rehabilitation welfare engineering & assistive technology
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• v.10 no.1
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• pp.87-92
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• 2016

In this paper, we improved classification performance of benign and malignant lung nodules by including the parenchyma features. For small pulmonary nodules (4-10mm) nodules, there are a limited number of CT data voxels within the solid tumor, making them difficult to process through traditional CAD(computer aided diagnosis) tools. Increasing feature extraction to include the surrounding parenchyma will increase the CT voxel set for analysis in these very small pulmonary nodule cases and likely improve diagnostic performance while keeping the CAD tool flexible to scanner model and parameters. In AdaBoost learning using naive Bayes and SVM weak classifier, a number of significant features were selected from 304 features. The results from the COPDGene test yielded an accuracy, sensitivity and specificity of 100%. Therefore proposed method can be used for the computer aided diagnosis effectively.

• Korean Journal of Plant Resources
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• v.17 no.2
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• pp.107-115
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• 2004

To develop universal primers for phylogenetic analysis and species-specific marker for breeding program of kiwifruit, eighteens primers were designed from kiwifruit genome-specific repeat sequences. Seven species including twenty two varieties collected from native eastern Asia were examined using 18 to 22 mer kiwifruit target(KT) primers. among eighteen primers, we selected seven primers for phylogenetic relationship. The genus Actinidia was divided into two large groups; group I,A. arguta, A. melanandra, A. kolomikta, and A. marcrosperma, characterized by the non-hair in fruits and loaves or a few pubescences only in young stage, which belongs to the section Leiocarpae, and group II, A. chinensis, A. deliciosa, and A. eriantha, characterized by a lot of hairs only in young fruit stage and with a lot of hairs or fuzzes in leaves and branches, which belongs to the section Stellatae. Group II especially belongs to the series Perfectae of the section Stellatae and was divided into two subgroups; subgroup I containing A. chinensis and A. deliciosa, and subgroup II containing A. eriantha. In contrast, the two species, A. chinensis and A. deliciosa, which are known to have common parents, were divided into two independent subgroups with 80％ of a similarity value. On the other hand, we selected KT6F for variety specific bands, KT12E primers for 'Hayward' and 'Tomuri'. KT7F or KT12F primers were useful for analysis of inheritance pattern in kiwifruit cross-breeding. We suggest that these primers will be a powerful tool for elucidating phylogenetic relationship and selection of novelty kiwifruit in a breeding program.

• 한국전기화학회:학술대회논문집
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• 2005.07a
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• pp.177-186
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• 2005

미래의 친환경 에너지인 수소에너지 생산을 위해서 생물학적인 수소생산방법에 관한 관심이 증폭되고 있다. 생물학적인 수소생산 방법에는 여러 가지가 있으나 그중 유기물을 혐기발효하여 수소를 생산하는 방법에 관한 연구가 수행되었다. 본 연구에서 혐기성 미생물인 Enterobacter asburiae SNU-1이 쓰레기 매립지 토양에서 분리되어 수소생산 조건의 최적화 실험을 수행하였다. 본 실험에 이용된 미생물의 경우는 기존에 연구 된 적이 없는 새로운 종으로써 다른 미생물과는 다른 특징을 나타내며 수소생산 능력도 뛰어난 것을 알 수 있었다. 미생물을 이용한 수소생산에 영향을 미치는 인자로는 pH, initial glucose concentration 등이 있으며 각각의 조건에서 수소생산량을 비교하였다. 실험 결과 strain SNU-1의 최적 pH는 7이었으며 최적 initial glucose concentration은 25 g/1이다 이와 같은 최적 조건에서 strain SNU-1은 6.87 mmol/l/hr의 productivity를 나타내었다. 또한 다른 미생물과 달리 미생물이 더 이상 자라지 않는 정지기에서 더 많은 수소생산량을 나타내는 특이한 거동을 보이는 것이 관찰되었다.

• Proceedings of the Korean Society of Applied Pharmacology
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• 1994.04a
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• pp.206-206
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• 1994

1차년도에 F9 EC cell의 분화유도 시스템을 확립한뒤 계속적으로 해양생물로 부터 분리한 여러가지 물질을 처리하여 세포의 형태 변화 및 분화 관련 유전자 즉 laminin Bl, type IV collagen, RAR-$\beta$ 의 발현을 조사하였다. 그 결과 다수의 물질이 F9 세포를 분화시키는데 효과가 있는 것으로 나타났으며, 효과있는 물질들에 대한 구조분석이 계속적으로 실시되고 있다. 뿐만 아니라 분화효과가 있는 물질중에서 그 구조적으로 특이한 성질을 가진 물질에 대하여 이 물질이 암세호의 분화에 미치는 기작에 대해 조사하였다. 구체적인 실험내용을 요약하면 다음과 같다. 1. F9 EC cell에 스크리링할 물질의 처리 후 형태 변화 관찰 2. 분화 maker 유전자의 발현 조사 3, 작용 기작에 대한 조사

• Journal of the Korean Society of Clothing and Textiles
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• v.19 no.1
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• pp.96-103
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• 1995

의류산업의 효율성 (efficiency) 제고를 위한 중요한 결정의 한가지는 상품생산지 및 생산방법 즉 생산지 결정전략(sourcing strategy)에 관한 것이다. 점차 생산의 대상지역과 방법이 다양해짐에 따라 이는 복잡한 의사결정체계를 요하게 퇸다. 본 연구는 생산지 결정의 의사결정과정에서 흔히 중요시되는 생산비용 이외에 비생산비용, 즉 거래비응(transaction cost)으로 포현될 수 있는 인자를 분석하고자한다. 이를 위해 미국 의류, 신발 산업의 생산지 결정의 첫단계로서 해외기지생산과 국내생산의 문제점을 비교하였다. 의류산업과 신발산업에 있어 적시공급과 품질관리가 생산지에 관계없이 공통된 문제점으로 지적되었고 의류산업의 겋우 노동력 부족과 재료의 공급이 국내생산의 문제점으로, 오랜생산기일과 생산국가의 환경적요소(예를 들면, 정치적 불안정, 정부규제 등)가 해외기지생산의 특이한 문제점으로 지적되었다. 본 연구는 비국의 의류, 신발 산업을 대상으로 한 것이나, 최근 저가의 노동력을 찾아 동남아 또는 남미로 생산지를 이전하는 국내 의류, 신발업체들이 급격히 증가하고 있음을 감안할 때, 우리 산업에도 시사하는 바가 크다고 할 수 있다.

• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2005.07b
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• pp.286-288
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• 2005

MicroRNA (miRNA)는 작은 크기의 RNA분자로서 동식물의 유전자 발현 과점을 직접적으로 조절하는 인자로 알려져 있다. MiRNA는 보통 목표 유전자의 3'-UTR 영역에 상보성을 갖고 결합함으로써 작용하며 특히 miRNA의 5'부분의 8 nt 정도가 seed로서 중요하다고 알려져 있다. 반면 최근의 연구에 따르면 seed 부분의 서열의 조성 및 양상이 변화함에 따라 특이도가 결정됨을 알 수 있지만 기존의 컴퓨터를 이용한 miRNA 목표 유전자 예측 방법들은 이러한 정보를 활용하지 못한다. 본 논문에서는 열역학적인 수치와 서열의 조성뿐 아니라 miRNA:mRNA pair의 위치에 기반한 정보들을 학습에 자질로서 포함하여 목표 유전자를 예측한다. 그 결과는 위치 기반 자질이 학습 성능 향상에 중요하게 기여함을 보여준다.

• The Journal of Korean Society of Virology
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• v.30 no.3
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• pp.211-217
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• 2000

Nef is a lentiviral protein involved in pathogenesis of AIDS, but its molecular mechanism of action remains incompletely understood. Here we report the isolation of the interacting protein with the HIV-1 Nef, using the yeast two hybrid system for expression cloning. One of the positive colonies was selected as the final candidate for the interacting protein gene. The nucleotide sequencing revealed that this interacting protein is Human Ikaros/LyF-1. This protein interacted with the C-terminal region of Nef specifically in yeast system, not with the N-terminal region. This interaction was also confirmed by in vitro binding assay.

• Journal of Life Science
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• v.16 no.7 s.80
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• pp.1109-1111
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• 2006

The present study was carried out to investigate the blood markers of the Korean native horse. A total number of 158 horses were tested using microhaemagglutination with 11D system reagents (Da, Db, Dc, Dd, De, Df, Dg, Dh, Dk, Dm and Dn). Of the 158 horses, 3 horses showed an unusual D system phenogroups; these phenogroups may be silent (null) alleles, De or Dk and Dc, respectively. Dacdfgm, Dacdfgmn, and Ddegmn phenogroups were recognized. These results present basic information for detecting the genetic markers among the Korean native and alien horses.

• Korean Journal of Agricultural Science
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• v.33 no.1
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• pp.1-10
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• 2006

This study was deal with the development of breed-specific DNA marker which is able to identify Hanwoo and European cattle breeds(Non-Hanwoo) meat. Genetic differentiation between Korean cattle(Hanwoo) and European cattle breeds was examined by Random Amplified Polymorphic DNA(RAPD) analysis. The RAPD patterns were identical among Non-Hanwoo, such as Holstein, Hereford, Aberdeen Angus, Brown Swiss, Limousin or Simmental, but the above pattern was different from that of Hanwoo. All bands detected in the Hanwoo samples were observed in Non-Hanwoo cattle samples, but one of the common bands found in samples was not detected in the Hanwoo samples. The band(1.4kb) may be useful as a marker for identifying a meat of Hanwoo from imported cattle meat. Actually, the detection of the DNA marker was tested by DNA analysis with 929 samples which were prepared from bloods of 673 Hanwoo cattles and 141 Holstein cattles, from 115 imported cattle meats. The DNA marker was absent in 644 of 673 Hanwoo cattles (96%) but present in 245 of 256 Non-Hanwoo cattles (95%). These results show that the DNA marker is effective to characterize Hanwoo and Non-Hanwoo meat by its detection. This DNA marker, however, was not useful in detecting unwanted crossbreeding between two cattle breeds, because the band pattern in hybrid cattle shows one of two band patterns in Hanwoo and Non-Hanwoo.

• Journal of Life Science
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• v.14 no.1
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• pp.154-162
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• 2004

Thrombospondin-1 (TSP-1), a negative regulator in tumor growth and angiogenesis, is cell-type specifically regulated and at transcriptional level by external stimuli. Previously, we found that phorbol 12-myristate 13-acetate (PMA) suppressed TSP-1 expression in porcine aortic endothelial (PAE) cell, but enhanced in hepatoma cell line, Hep 3B cell. A region between -767 and -723 on the tsp-1 promoter was defined as a responsive site to the suppression in PAE cell. eased on the previous results, the molecular mechanism of TSP-1 expression was determined by characterizing interactions between cis-elements and trans-factors using three overlapped oligonucleotide probes, oligo a-1 (from -767 to -738), a-2 (-759 to -730) and a-3 (-752 to -723). The results from electromobility shift assay showed that PMA-induced suppression of TSP-1 transcription in PAE cell might be caused via a negative regulator binding to the region from -752 to -730 and additionally generated by lacking two positive regulators binding to the sites from -767 to -760 and from -752 to -730. Especially, PMA enhanced the binding ability of the negative regulator to the site from -752 to -730 in PAE cell, but anti-c-Jun did not affected its binding ability.