• 제목/요약/키워드: 제한 효소

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감국(Dendranthema indicum (L.) Des Moul.) 및 산국(D. boreale (Makino) Ling ex Kitam.)의 종판별 분자마커 개발 (Development of molecular marker for species authentication of Dendranthema indicum (L.) Des Moul. and D. boreale (Makino) Ling ex Kitam.)

  • 변지희
    • 한국자원식물학회:학술대회논문집
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    • 한국자원식물학회 2018년도 추계학술대회
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    • pp.66-66
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    • 2018
  • 국화과(Compositae) 다년생 초본인 산국속(Dendranthema)은 국내 약 13여종이 자생하는 것으로 알려져 있으며, 이 중 감국(D. indicum (L.) Des Moul.)과 산국(D. boreale (Makino) Ling ex Kitam.), 구절초(D. zawadskii var. latilobum (Maxim.) Kitam.)가 주로 차 또는 한약재 등의 원료로 이용되고 있다. 차로 이용되는 꽃은 산국이 감국에 비해 상대적으로 작아서 구분이 가능하지만 시중에는 건조된 형태로 가공 유통되므로 육안으로 구분이 쉽지 않고, 산국 유래 제품들은 국내에서 감국 또는 국화로 혼용해서 표기되어 유통되고 있어 그 기원을 명확히 정립할 필요가 있다. 이에 본 연구는 감국과 산국의 분자유전학적 판별을 위해 DNA 바코드 후보 유전자를 활용하여 염기서열분석으로 확보된 SNP 및 InDel 정보를 바탕으로 CAPS 마커를 개발하고자 수행되었다. 감국과 산국 모두 trnL-trnF intergenic spacer 구간에서 약 1kb의 PCR 산물이 확인되었고, 이들 염기서열에서 분석한 2 SNP 및 3 InDel을 대상으로 CAPS 마커 개발을 위한 제한효소 사이트를 탐색하였다. Gap을 포함한 774bp (감국/산국=A/G) 위치의 SNP에서 BstUI(GC^GC)처리로 CAPS 마커로 전환 가능함이 확인되었고, 이에 감국과 산국의 PCR 산물에 제한효소를 처리한 결과, 제한효소 인식 사이트가 존재하는 산국에서 두 개의 DNA 단편이 확인되었다. 위 결과는 다양한 형태로 가공 유통되는 감국과 산국의 판별을 위한 마커로 활용될 수 있으며, 본 연구에 활용된 기술은 추후 건강기능식품 개발을 위한 원료표준화 확립 연구에 유용할 것으로 판단된다.

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PCR-RFLP 분석기법을 이용한 가금육의 종(닭, 칠면조, 오리) 판별 기술 개발

  • 신성철;최은주;이준제;김희선;조하나;전상희;정구용;정의룡
    • 한국축산식품학회:학술대회논문집
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    • 한국축산식품학회 2005년도 정기총회 및 제35차 춘계 학술 발표대회
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    • pp.199-202
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    • 2005
  • 본 연구는 cytochrome B 유전자의 PCR-RFLP 분석기법을 이용하여 다양한 가금류 식육자원 및 각종 가공 육제품의 원료육에 대한 정확하고 재현성 높은 축종 및 육종 감별기술을 개발하기 위하여 수행되었다. 국내에서 유통되고 있는 종간 근연관계가 높은 3종의 가금육(닭, 칠면조 및 오리)의 육류에서 분리한 DNA 시료를 대상으로 cytochrome B 유전자의 특정 염기서열을 포함하는 primer를 설계 제작하여 PCR-RFLP 분석을 실시하였다. 각 축종의 근육조직으로부터 genomic DNA를 추출하고 PCR 증폭 반응을 수행한 후 얻어진 PCR 증폭산물(359 bp)을 두 종류의 제한효소(HaeШ 및 Hinf I)로 각각 절단한 결과 특히, HaeШ 제한효소에서 가금류의 축종 간 그리고 제한효소 간에 명확한 차이를 보이는 종 특이적인 PCR-RFLP marker를 검출하였다. 따라서, 본 연구에서 개발한 cytochrome B 유전자의 가금류 종 특이적 PCR-RFLP marker는 가금류의 식육 및 가공 육제품의 육종 및 축종 판별에 매우 유용한 DNA marker로 이용될 수 있을 것이다.

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토양세균 군집의 대사 다양성과 16S rDNA의 제한효소 지문분석에 의한 유전적 다양성의 비교 (Comparison of metabolic diversity by sole carbon source utilization and genetic diversity by restriction patterns of amplified 16S rDNA (ARDRA)in soil bacterial communities.)

  • 송인근;최영길;김유영;조홍범
    • 미생물학회지
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    • 제35권1호
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    • pp.72-77
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    • 1999
  • BIOLOG GN microplate를 이용한 유일탄소원의 이용능 비교를 통한 대사적 유사성과 16S rDNA 의 PCR 증폭산물의 제한효소 지문 분석에 따른 유전적 유사성을 5종의 식생토양에 따른 토양미생물 군집을 대상으로 비교하였다. 16S rDNA를 증폭하여 제한효소 지문을 분석한 결과, 토양으로부터 직접 추출하여 증폭한 토양세균 군집의 16S rDNA의 유전적 유사도는 BIOLOG GN microplate를 이용한 대사적 구조와 일치하는 경향을 보았다. 그러나 배양된 종속영양세균 군집의 다양성과는 유전적 유사도가 매우 낮게 나타났다.

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피조개, Scapharca broughtonii Schrenck RFLP 마커 개발 (Development of Molecular Detection Marks Using PCR-RFLP Technique for Arkshell (Scapharca broughtonii Schrenck))

  • 조은섭;정춘구;김철원;손상규
    • 생명과학회지
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    • 제15권6호
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    • pp.879-883
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    • 2005
  • 한국산과 중국산 피조개의 신속 진단, 유전적 특성 및 유연관계를 분석하기 위하여 DNA 수준에서 확인 할 수 있는 PCR-aided RFLP를 사용하였다. 피조개 mtDNA 165 rDNA gene를 제한효소로 처리하여 그 band 양상을 조사하고자 하였다. 165 rDNA gene을 분리하기 위하여 ArkF-3, ArkR-3 primer를 사용한 결과 한국산과 중국산 피조개 모두 분자량이 720 bp band가 나타났다 PCR에 의하여 증폭된 16S rRNA gene을 총 8종류의 제한효소(PvuII, BamHI, HinfI, HaeIII, EcoRI, RsaI, Ksp221, BstX21)로 절단하여 RFLP 양상을 보았다. HinfI의 제한효소 처리 시 득량, 가막, 남해, 진해, 태안산 피조개 모두 275 band절편이 관찰되었으나, 중국산은 나타나지 않았다. HinfI를 제외한 나머지 제한효소는 다형형이 관찰되지 않았고 한국산과 중국산 모두 700 bp의 동일한 band를 보였다. HaeIII에서도 득량, 가막, 태안과 남해와 진해산 PCR product가 700 bp위치에서 상이하게 보였다. 또한 한국산과 중국산 절편이 다르게 나타났다. 한국산 피조개 종내 restriction 쇼pe에 의해 유연관계의 결과에 의하면 득량, 가막, 태안은 동일한 유사도를 보였고, 남해와 진해와는 거리가 7 정도로 나타났다. 특히 한국산과 중국산 거리는 25로 나타났다. 이상의 결과를 보아서,HinfI 제한효소는 한국산과 중국산을 구별하는데 매우 유용한 molecular marker가 될 수 있을 것으로 판단되며, 유전적으로 거리가 먼 것으로 보인다. 또한 HaeIII은 한국산 종내 구분 및 중국산 신속 동정에 좋은 molecular tool로 사용될 것으로 예상된다.

생명공학 단원의 제한 효소 지도 작성 탐구실험 수업이 고등학생의 과학긍정경험에 미치는 영향 (The Effects of Positive Experience about Science of High School Students in an Inquiry Experiment Class on Restriction Enzyme Mapping in Biotechnology Chapter)

  • 정수연;장정호
    • 과학교육연구지
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    • 제46권3호
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    • pp.293-311
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    • 2022
  • 본 연구는 분자생물학 기초 소양 함양을 위한 제한 효소 지도 작성의 탐구실험을 구성하였고, 일반계 고등학교 2학년을 대상으로 학생 중심의 제한 효소 지도 작성 탐구실험 수업을 통해 탐구실험 능력과 과학긍정경험에 미치는 영향을 분석하였다. 우선, 탐구실험 수업이 일반계 고등학생의 과학긍정경험에 있어 '그렇다' 이상으로 응답한 비율이 사전에 비해 사후에서 높은 것으로 보아 유의미하게 효과가 있는 것으로 나타났다. 제한 효소 지도 작성을 위한 연속의 5단계로 구성하여 적용한 결과 학생들의 과학 분야 학업에 대한 흥미 유발뿐만 아니라 학생들의 수업 참여도가 높아졌고, 구체적인 과학 학습 동기, 과학 진로 포부 및 체험 자료로도 효과적인 것으로 나타났다. 탐구실험 수업의 과학 환경이 학생들의 학습 태도와 과학긍정경험의 향상으로 이어져 수업의 집중과 수업의 질적 향상, 학생간의 적극적인 의사 소통과 상호 협력의 중요성에 긍정적인 영향을 끼쳤다. 또 탐구실험 수업이 진로 체험의 기회를 제공함으로써 분자생물학의 기초 소양 함양과 이공계 진학의 토대가 될 것이다.

Clostridium thermocellum으로 부터 새로운 type I I 제한효소 Cth I 의 분리 (A New Restriction Endonuclease from Clostridium thermocellum)

  • Choi, K.D.;Kim, Kitae;Yoo, Ook-Joon
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제15권5호
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    • pp.352-355
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    • 1987
  • 새로운 제한효소인 Cth I을 Clostridium thermocellum ATCC 27405로부터 분리하여, 그 효소의 생화학적 특성을 연구하였다. 이 효소는 Bcl I endonuclease의 isoschizomer로서 5'-TGATCA-3'를 인식한다. Cth I endonuclease는 섭씨 60도의 높은 온도에서 잘 작용하며, 10mM까지의 저농도의 NaCl과 MG$^{2+}$ 이온의 존재하에서 pH7.5와 10.5사이에서 최적의 활성을 보여주었다. Cth I endonuclease의 활성은 DNA 기질이 dam methylation 되었을 때 저해를 받았다.

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Lactobacillus casei 의 Phospho-$\beta$-galactosidase 유전자의 지도작성과 Escherichia coli 내에서의 발현 (Mapping of Gene Encoding Phospho-$\beta$-galactosidase from Lactobacillus casei and its Expression in Escherichea coli)

  • 박정희;문경희;민경희
    • 미생물학회지
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    • 제30권6호
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    • pp.539-545
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    • 1992
  • Lactobacillus casei SM-M1 의 플라스미드로부터 phospho-$\beta$-galactosidase gene 을 갖는 DNA 를 E. coli 에 클로닝한 pPLac15(13kb) 의 재조합 플라스미드를 제조하였다.(15). pPLac15 DNA 를 분리하여 제한효소로 처리하여 제한효소 지도를 작성하였다. Phospho-$\beta$-galactosidase 유전자의 발현을 높이기 위하여 lac promoter 를 가진 pUC18 의 PstI 위치에 클닝하여 pPLac18 을 제조하였으며, 이것을 다시 EcoRI 으로 절단하여 pUC 18 에 클로닝하여 얻은 pPLac23 (7.6 kb) 를 얻었다. Phospho-$\beta$-galactosidase 효소활성은 pPLac23 의 형질전환주인 E. coli SW-23 에서는 pPLac15 를 가진 형질전환주인 E. coli SW-15 보다 약 1.8 배의 효소의 활성을 나타내었으며 pPLac18 을 가진 E. coli SW-18 보다는 약간 높은 활성을 나타내었다.

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형질전환체의 xylanase유전자의 유전해석과 효소학적 성질

  • 성낙계;심기환;장덕화;전효곤
    • 한국미생물생명공학회:학술대회논문집
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    • 한국미생물생명공학회 1986년도 추계학술대회
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    • pp.519.2-519
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    • 1986
  • 고온 호알카리성 Bacillus K-17의 xylanase유전자의 구조해명과 대량 생산 균주를 개발하기 위채 Bacillus K-17의 염색체를 pER 322를 사용하여 E. coli에 형질전환시켜 xylanase 활성을 나타내는 형질전환체를 얻었다. 이 형질전환체에서 hybrid plasmid를 분리하여 제한효소로 mapping하였고 이 유전자가 Bacillus K-17유래인가를 hybridization에 의해 확인하였다. Recombinant plasmid pAX 1113은 5.1kb HindIII 절편을 가졌으며 BgIII site가 두곳, ECoRI과 pst site가 한곳이었으며 효소를 정제한 결과 Bacillus K-17이 생산하는 두 가지 xylanase중에서 xylanase I과 동일하였다.

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토양으로부터 분리한 Klebsiella pneumoniae 의 pullulanase 유전자의 cloning 및 발현

  • 유주현;공인수;정용준;이정기
    • 한국미생물생명공학회:학술대회논문집
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    • 한국미생물생명공학회 1986년도 추계학술대회
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    • pp.518.2-519
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    • 1986
  • 토양으로부터 분리한 질소고정균인 Klebsiella pneumoniae NFB320의 chromosomal DNA를 BamHI으로 절단하여 동일한 제한효소로 절단한 pBR322에 ligation시켜 E. coli HB101에 형질전환을 행하여 pullulanase activity를 나타내는 clone을 얻어내었다. 이 형질 전환체로부터 분리한 pullulanase 유전자가 재조합된 plasmid DNA는 약 10kb의 DNA단편을 가지고 있었으며, 재조합된 plasmid로부터 생산되는 pullulanase의 특성은 최적 활성 pH가 6.0이며, 효소의 pH안정성은 5-10이었다. 또한 형질 전환체로부터 생산되는 pullulanase의 localization,효소활성에 영향을 미치는 온도안정성 둥을 조사하였다.

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