• Title/Summary/Keyword: 이차원전기영동

Search Result 21, Processing Time 0.021 seconds

Optimization of Conditions for Two-Dimensional Electrophoresis of the Flounder (Paralichthys olivaceus) Serum (넙치(Paralichthys olivaceus) 혈청단백질의 이차원전기영동분석 조건확립)

  • Han, Yoon Hee;Nam, Bo-Hye;Kim, Young-Ok;Kim, Woo Jin;Kong, Hee Jeong;Lee, Sang Jun;Choi, Tae-Jin
    • Journal of Marine Bioscience and Biotechnology
    • /
    • v.2 no.1
    • /
    • pp.68-72
    • /
    • 2007
  • Flounder is one of the major aquacultured fish and of an economically important item in Korean fisheries. Recently, there are trends of research worldwide that aim to analyze and characterize a whole genome or a whole proteome of interesting species. The data are utilized for the understanding and development of preventive and curative technologies for the serious diseases. However, there are very limited information of proteome for marine organisms, we optimized first the conditions for two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis (2D-PAGE) with serum form a marine fish, flounder (Paralichthys olivaceus). A pre-treatment of serum and an optimization of protein concentration analyzed were surveyed for enhancing the separation for proteins. A statistical analysis was performed on the overall 1,820 protein spots to overcome the variability among individual fishes.

  • PDF

이차원전기영동법(Two-dimensional Electrophoresis)을 이용한 단백질체(Proteome)의 분리와 동정(Identification)

  • 이소영;김진회
    • Proceedings of the KSAR Conference
    • /
    • 2004.06a
    • /
    • pp.173-175
    • /
    • 2004
  • 단백질체(Proteome)이란 말은 어원적으로 단백질(protein)에 전체란 뜻을 가진 어미(-body, -some)가 연결된 합성어로 주어진 순간에 세포나 조직이 발현하는 모든 단백질의 총체를 의미하고 이를 연구하는 학문은 Proteomics라 일컫는다. 2001년 2월 International Human Genome Project에 의해 human genome sequence가 밝혀짐으로써 유전체 연구는 일단락 완성되었지만, 염기서열만 가지고는 이 유전자 산물의 기능을 알 수 없었고, 이것이 전사되고 최종적으로 완벽한 모양이 갖추어진 단백질을 분석해야만 그 기능을 알 수 있었다. (중략)

  • PDF

Expression Patterns of P21-Activated Kinase 2 by Sterne Spores on Human Macrophages (사람 대식세포에 스턴아포에 처리에 의한 P21-activated kinase 2 단백질의 발현양상)

  • Seo Gwi-Moon;Jung Kwang-Hwa;Kwak Hyun Jung;Kim Seong-Joo;Kim Ji-Chon;Chai Young-Gyu
    • Journal of the Korea Institute of Military Science and Technology
    • /
    • v.7 no.4 s.19
    • /
    • pp.87-90
    • /
    • 2004
  • In order to elucidate the mechanism of infection on human macrophages, we peformed the 2-dimensional electrophoresis and the western blot analysis using the infected human macrophages with the spores of live and inactivated Sterne. We confirmed P21-activated kinase 2 protein which related to cell death(apoptosis) human macrophages at the early stage events. The inhibition of the P21-activated protein kinase 2 protein will be reduced apoptosis on infected human macrophages with Sterne spores.

한우 수정란 생산에 있어서 체외성숙의 생물학적 요인 III. 소 난포란의 체외성숙에 있어서 단백질 변화

  • 박용수;이재협;변명대;박흠대
    • Proceedings of the Korean Society of Developmental Biology Conference
    • /
    • 2003.10a
    • /
    • pp.117-117
    • /
    • 2003
  • 체외에서 한우 난포란의 감수분열과 배발달 능력의 획득에는 단백질 합성이 수반되어야 한다. 그러나 이러한 변화와 관련된 연구 보고는 거의 전무한 실정이다. 본 실험은 난자의 핵성숙과 관련된 세포질내 단백질 변화를 파악하기 위하여, 체외성숙 시간에 다른 배발달율과 세포질내 단백질을 비교하여 배발달능력 획득과 관련 있는 단백질을 규명하고자 실시하였다. 한우 난소에서 2-8mm의 가시난포로부터 난포란을 회수하였다. 회수된 난포란은 10% FBS와 호르몬이 첨가된 TCM199 용액에서 18시간 또는 24시간 체외성숙을 실시하였다. 난자 세포질내 단백질 변화는 2D gel electrophoresis를 이용하였고, 유의적인 변화를 나타낸 spot은 peptide mass fingerprinting을 통하여 단백질 동정을 실시하였다. 체외수정은 fer-TALP 용액을, 체외배양은 CR1aa 용액을 배양 3일째까지는 0.3% BSA, 그 이후에는 10% FBS와 난관상피세포를 첨가하여 사용하였다. 통계분석은 t-test를 이용하였다. 난자의 세포질에 대한 이차원전기영동 결과 29개의 단백질 spot들을 확인하였다. 한편 체외성숙 18시간째에 PB가 출현된 난자는 PB가 출현되지 않은 난자에 비하여 15개의 spot에서 유의적인 변화를 나타냈다. 이들 중 4개의 단백질 spot은 낮았고, 11개 spot의 수준은 높은 경향이었다. 체외성숙 18시간째와 24시간째의 배발달율을 조사한 결과 18시간째에서 유의적으로 높은 배반포 발달율을 나타냈다. 그리고 체외성숙 18시간과 24시간째 난자의 세포질내 단백질 spot들의 변화를 비교한 결과 PB가 출현된 난자 세포질에서 단백질의 변화와 유사한 경향이었다. 그러나 2개의 단백질 spot은 상반된 경향을 나타냈다. 따라서 본 실험에서 난자의 핵성숙과 관련 있는 15개의 spot을 확인하였고, 이들 단백질 spot중에서 2개가 배발달 능력과 관련이 있을 것으로 사료된다.보다는 육질등급에 많은 영향을 받는 것으로 판단된다. 한편 육질 1등급에서 배발달율이 낮은 이유는 육질 향상을 목적으로 암소를 비육 하는 경우 발생하는 번식장애와 밀접한 관계가 있는 것으로 사료된다.각각 가장 높았다. 배양 8일째 배반포의 세포수에 있어서 총세포수와 TE 세포수는 차이가 없었으나, ICM 세포수가 l0mg 첨가군에서 가장 높았다. 본 실험 결과에서 체외성숙 배지에 NEAA와 EAA 첨가가 배발달율에는 효과가 없었지만, 첨가농도의 증가에 따라 ICM 세포수가 증가하였다. 한편 체외성숙 배지에 LAH 첨가는 첨가 농도가 높을수록 배발달율은 낮았지만 ICM 세포수는 증가하였다.에 Csk가 관여하고 있음을 알 수 있다. 결론적으로 성적 성숙에 따른 생쥐 정소 내 Src-Csk loop의 발현과 Src kinase 활성의 변동은 정소 내 간충조직, 세정관 상피의 증식 및 기능적 분화 과정을 매개하는 생리적 활성분자 수용체 하위의 신호전달 과정에 Src-Csk loop에 의한 조절가능성을 확인할 수 있었다.rugrene의 향기성분이 주요 성분군으로 확인되었다. 2. 생강나무에서 생강의 향기를 발산하는 성분으로는 $\beta$-myrcene, o-terpinolene, phellandrone, ι-limonene, $\beta$-eudesmol, $\delta$-cadinone, elemol, trans-caryophyllene으로 동정되었으며 그 중에서도 phellandrene, $\beta$-eudesmol이 주된 역할을 하는 성분으로 확인하였다. 유의적인 관련성이 나타났고, 복부 비만의 지표인 허리엉덩이둘레비는 GPT, alkaline phosphatase, 공복시 혈당 및 MCV 등 다양한 건강지표와 관련성을 나타내어 향후 비만에 있어 다양한 혈액 성상의 변화 및 역할규명에 대한 연구가 이루어져야 할 것으로 본다.hat

  • PDF

Two-Dimensional Electrophoresis Analysis of Proteins between Bacillus licheniformis DM3 and Its Antifungal Activity Deficient Mutant (이차원전기영동법을 이용한 길항세균 Bacillus licheniformis DM3와 이의 항진균 활성 결여 돌연변이균주간 단백질 비교 분석)

  • Lee, Young-Keun;Kim, Jae-Sung;Chung, Hye-Young;Jang, Yu-Sin;Jang, Byung-Il
    • Korean Journal of Environmental Agriculture
    • /
    • v.22 no.3
    • /
    • pp.203-209
    • /
    • 2003
  • In the course of screening for antifungal agents, a bacterial strain, DM3 was isolated from a mud sample collected at Daechon in Chungnam province and identified as Bacillus licheniformis based on API 50CHB test. It has antifungal activity against 12 plant pathogenic fungi in paper disc assay. At the 95% lethal dose of gamma radiation ($^{60}Co$, 10 kGy, $D_{10}=2.32\;kGy$), the antifungal activity deficient mutant (mDM3) against Colletotrichum gloeosporioides was induced From 2-D electrophoresis analysis, serine hydroxymethyltransferase (45.0 kDa), hypothetical protein(40.7 kDa), NifU protein homolog(15.4 kDa), and resolvase(12.5 kDa) homologous proteins were detected only in B. licheniformis DM3. Lysozyme(18.1 kDa) and alkyl hydroperoxide reductase(15.6 kDa) homologous proteins were expressed uniquely in B. licheniformis mDM3. Further studies are needed to reveal that these proteins from B. licheniformis DM3 could be closely related to the antifungal activity against plant pathogenic fungi.

Comparative Analysis of Muscle Proteome from Porcine White and Red Muscles by Two-dimensional Electrophoresis (이차원전기영동법을 이용한 white muscle과 red muscle간의 단백질 발현양상의 비교분석)

  • Kim, N.K.;Joh, J.H.;Chu, K.S.;Park, H.R.;Park, B.Y.;Kim, O.H.;Lee, C.S.
    • Journal of Animal Science and Technology
    • /
    • v.45 no.5
    • /
    • pp.731-738
    • /
    • 2003
  • The technique known as proteomics is useful for characterizing the protein expression pattern of a particular tissue or cell type as well as quantitatively identifying differences in the levels of individual proteins. In present study, we carried out the comparative expression patterns of white and red muscles. We used the two-dimensional electrophoresis(2-DE) for analyzing the protein expression. Proteins isolated from porcine white and red muscles were separated by 12% poly-acrylamide gel and then were detected by coomassie blue and silver staining. More than 600 protein spots were detected on each 2-DE gel. By visual analysis of the stained gel, five proteins were identified to be differentially expressed in the white vs red muscle. By database searching based on the molecular weights and pI(isoelectric point) of the five proteins, three of them were found to be most close to troponin I, T and myoglobin. However, further researche is needed for identification and functional analysis of the unidentified proteins. In conclusion, we found five proteins, which are differentially expressed in the white vs red muscle. The functional analysis of the differentially expressed proteins will provide valuable information on biochemical characteristics of the muscle type.

groES Expression Related to Antifungal Activity of Streptomyces sp. SAR01 (Streptomyces sp. SAR01 균주에서의 항진균 관련 groES의 발현)

  • 이영근;김재성;조규성;장병일;추철형
    • Korean Journal of Microbiology
    • /
    • v.38 no.3
    • /
    • pp.162-167
    • /
    • 2002
  • To analyse proteins and gene related to antifungal activity, SAR01 strain was isolated from a brown seaweed and identified as Streptomyces sp. by FAME(fatty acid methyl ester) analysis. Antifungal activity deficient mutant(SAR535) of Streptomyces sp. SAR01 was induced by gamma radiation$({60}^Co)$. It was found that 6 specific protein spots appeared only in SAR01 by 2-D electrophoresis analysis. Among them, a protein of 10 kDa had homology of 96% with 10 kD chaperonin cpn 10 (GroES) by Basic Local Alignment Search Tool(BLAST, NCBI) analysis. SAR535 transformants into which groES was transferred by electroporation revealed antifungal activity newly similar with SAR01 It suggested that groES be supposed to be related to the antifungal activity of Streptomyces sp. SAR01.

Inhibitory Melanogenesis of Bambusae caulis in Taeniam and Profiling of Related Proteins (죽여의 멜라닌 생성 억제 효과 및 관련 단백질 동향 분석)

  • Lee, Chung-Hyun;Kim, Sang-Bum;Byun, Sang-Yo
    • KSBB Journal
    • /
    • v.25 no.5
    • /
    • pp.478-482
    • /
    • 2010
  • Inhibitory melanogenesis by Bambusae caulis in Teaniam (Phyllostaachys nigra var. henonis Stapf) was studied. Tyrosinase inhibition activities were evaluated with six different extracts. Among them the extract with methanol showed the highest tyrosinase activity inhibition. MTT assay with B16 melanoma showed that the extract was not toxic up to the concentration of 50 ppm. The melanogenesis was clearly inhibited by the extract when it was examined by the melanin content assay in the cell. When the extract was dosed as 10 ppm, the melanogenesis was reduced to 68% in culture medium and 74% in the cell. By the proteome analysis with 2-D electrophoresis, 171 protein spots were found in the control gel and 282 spots were detected in the sample gel. Among 120 spot proteins matched, 12 spots were identified as proteins involved in the melanogenesis mechanism.