• Title/Summary/Keyword: 유전체분석

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Transcriptomic Analysis of Triticum aestivum under Salt Stress Reveals Change of Gene Expression (RNA sequencing을 이용한 염 스트레스 처리 밀(Triticum aestivum)의 유전자 발현 차이 확인 및 후보 유전자 선발)

  • Jeon, Donghyun;Lim, Yoonho;Kang, Yuna;Park, Chulsoo;Lee, Donghoon;Park, Junchan;Choi, Uchan;Kim, Kyeonghoon;Kim, Changsoo
    • KOREAN JOURNAL OF CROP SCIENCE
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    • v.67 no.1
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    • pp.41-52
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    • 2022
  • As a cultivar of Korean wheat, 'Keumgang' wheat variety has a fast growth period and can be grown stably. Hexaploid wheat (Triticum aestivum) has moderately high salt tolerance compared to tetraploid wheat (Triticum turgidum L.). However, the molecular mechanisms related to salt tolerance of hexaploid wheat have not been elucidated yet. In this study, the candidate genes related to salt tolerance were identified by investigating the genes that are differently expressed in Keumgang variety and examining salt tolerant mutation '2020-s1340.'. A total of 85,771,537 reads were obtained after quality filtering using NextSeq 500 Illumina sequencing technology. A total of 23,634,438 reads were aligned with the NCBI Campala Lr22a pseudomolecule v5 reference genome (Triticum aestivum). A total of 282 differentially expressed genes (DEGs) were identified in the two Triticum aestivum materials. These DEGs have functions, including salt tolerance related traits such as 'wall-associated receptor kinase-like 8', 'cytochrome P450', '6-phosphofructokinase 2'. In addition, the identified DEGs were classified into three categories, including biological process, molecular function, cellular component using gene ontology analysis. These DEGs were enriched significantly for terms such as the 'copper ion transport', 'oxidation-reduction process', 'alternative oxidase activity'. These results, which were obtained using RNA-seq analysis, will improve our understanding of salt tolerance of wheat. Moreover, this study will be a useful resource for breeding wheat varieties with improved salt tolerance using molecular breeding technology.

Development and Characterization of EMS-induced Mutants with Enhanced Salt Tolerance in Silage Maize (EMS 유도 내염성 증진 사료용 옥수수 돌연변이체 선발 및 특성 분석)

  • Cho, Chuloh;Kim, Kyung Hwa;Seo, Mi-Suk;Choi, Man-Soo;Chun, Jaebuhm;Jin, Mina;Kim, Dool-Yi
    • KOREAN JOURNAL OF CROP SCIENCE
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    • v.65 no.4
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    • pp.406-415
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    • 2020
  • Maize (Zea mays L.) is one of the most valuable agricultural crops and is grown under a wide spectrum of environmental conditions. However, maize is moderately sensitive to salt stress, and soil salinity is a serious threat to its production worldwide. In this study, we used ethyl methane sulfonate (EMS) to generate salt-tolerant silage maize mutants. We screened salt-tolerant lines from 203 M3 mutant populations by evaluating the morphological phenotype after salt stress treatment and selected the 140ES91 line. The 140ES91 mutant showed improved plant growth as well as higher proline content and leaf photosynthetic capacity compared with those of wild-type plants under salt stress conditions. Using whole-genome re-sequencing analysis, 1,103 single nucleotide polymorphisms and 71 insertions or deletions were identified as common variants between KS140 and 140ES91 in comparison with the reference genome B73. Furthermore, the expression patterns of three genes, which are involved in salt stress responses, were increased in the 140ES91 mutant under salt stress. Taken together, the mutant line identified in our study could be used as an improved breeding material for transferring salt tolerance traits in maize varieties.

A Study on Batch-Type Remote Plasma Dry Cleaning Process for Native Oxide Removal (배치식 플라즈마 세정 설비를 이용한 자연산화막 제거 공정)

  • Park, Jae-Young;Yi, Wook-Yeol;Hyung, Yong-Woo;Nam, Seok-Woo;Lee, Hyeon-Deok;Song, Chang-Lyong;Kang, Ho-Kyu;Roh, Yong-Han
    • Proceedings of the Korean Institute of Electrical and Electronic Material Engineers Conference
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    • 2004.11a
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    • pp.247-251
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    • 2004
  • 반도체 소자의 제조에 있어 실리콘 표면에 성장한 자연산화막을 제거하기 위해 일반적으로 습식 세정 기술이 이용되어 왔다. 하지만 소자의 최소 선폭(design rule)이 nano급으로 고집적화 됨에 따라 contact hole 바닥의 자연산화막을 깨끗이 제거하는데 있어서 그 한계를 나타나고 있다. 이에 대한 효과적인 대안 공정으로 가스 건식 세정 기술이 연구되고 있다. 본 논문에서는 한 번에 50매 이상의 웨이퍼를 처리함으로써 생산성 측면에서 월등한 배치식 설비에서 원거리 플라즈마(remote plasma) 장치에서 2.450Hz의 마이크로웨이브(${\mu}$-wave)에 의해 형성시킨 수소라디칼과 $NF_3$ 가스를 이용하여 실리콘에 결함을 주지 않고 자연산화막을 선택적으로 제거하는 공정에 대해 고찰하였다. AFM을 이용한 표면분석, TEM을 이용한 물성분석, 그리고 ToF-SIMS 및 XPS를 이용한 화학 분석을 습식 및 건식 세정을 비교 평가한 결과, 건식 세정 공정이 실리콘 표면에 결함을 주지 않고 자연산화막을 제거 할 수 있음을 확인하였다. 산화막$(SiO_2)$, 질화막$(Si_3N_4)$, 그리고 다결정 실리콘(Poly-Si) 등의 각 막질별 식각 특성을 고찰하였으며, $NH_3$의 캐리어 가스인 $N_2$의 주입량을 조절함으로써 수소라디칼 형성 효율의 개선이 가능하였으며, 이로부터 게이트와 소스/드레인 사이를 절연하기 위해 이용되는 질화막의 식각 선택비를 2배 정도 개선할 수 있었다. nano급 소자에 실장하여 평가한 결과에서 불산(HF)에 의한 습식 세정 방식에 비하여 약 $20{\sim}50%$ 정도의 contact 저항 감소 효과가 있음이 확인되었다.두 소자 모두 $40mA/cm^2$ 에서 이상적인 화이트 발란스와 같은(0.33,0.33)의 색좌표를 보였다.epsilon}_0=1345$의 빼어난 압전 및 유전특성과 $330^{\circ}C$의 높은 $T_c$를 보였고 그 조성의 vibration velocity는 약4.5 m/s로 나타났다.한 관심이 높아지고 있다. 그러나 고 자장 영상에서의 rf field 에 의한 SAR 증가는 중요한 제한 요소로 부각되고 있다. 나선주사영상은 SAR 문제가 근원적으로 발생하지 않고, EPI에 비하여 하드웨어 요구 조건이 낮아 고 자장에서의 고속영상방법으로 적합하다. 본 논문에서는 고차 shimming 을 통하여 불균일도를 개선하고, single shot 과 interleaving 을 적용한 multi-shot 나선주사영상 기법으로 $100{\times}100$에서 $256{\times}256$의 고해상도 영상을 얻어 고 자장에서 초고속영상기법으로 다양한 적용 가능성을 보였다. 연구에서 연구된 $[^{18}F]F_2$가스는 친핵성 치환반응으로 방사성동위원소를 도입하기 어려운 다양한 방사성의 약품개발에 유용하게 이용될 수 있을 것이다.었으나 움직임 보정 후 영상을 이용하여 비교한 경우, 결합능 변화가 선조체 영역에서 국한되어 나타나며 그 유의성이 움직임 보정 전에 비하여 낮음을 알 수 있었다. 결론: 뇌활성화 과제 수행시에 동반되는 피험자의 머리 움직임에 의하여 도파민 유리가 과대평가되었으며 이는 이 연구에서 제안한 영상정합을 이용한 움직임 보정기법에 의해서 개선되었다. 답이 없는 문제, 문제 만들기, 일반화가 가능한 문제 등으로 보고, 수학적 창의성 중 특히 확산적 사고에 초점을 맞추어 개방형 문제가 확

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Human Parechovirus as an Important Cause of Central Nervous System Infection in Childhood (소아청소년기 중추신경 감염의 주요 원인으로서 Human Parechovirus의 의의)

  • Jung, Hyun Joo;Choi, Eun Hwa;Lee, Hoan Jong
    • Pediatric Infection and Vaccine
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    • v.23 no.3
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    • pp.165-171
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    • 2016
  • Purpose: Human parechovirus (HPeV) is an increasingly recognized pathogenic cause of central nervous system (CNS) infection in neonates. However, HPeV infections have not been studied in older children. This study determined the prevalence and clinical features of HPeV CNS infection in children in Korea. Methods: Reverse transcription polymerase chain reaction assays were performed using HPeV-specific, 5' untranslated, region-targeted primers to detect HPeV in cerebrospinal fluid (CSF) samples from children presenting with fever or neurologic symptoms from January 1, 2013, to July 31, 2014. HPeV genotyping was performed by sequencing the viral protein 3/1 region. Clinical and laboratory data were retrospectively abstracted from medical records and compared with those of enterovirus (EV)-positive patients from the same period. Results: Of 102 CSF samples, six (5.9%) were positive for HPeV; two of 21 EV-positive samples were co-infected with HPeV. All samples were genotype HPeV3. Two HPeV-positive patients were <3 months of age and four others were over 1 year old. While HPeV-positive infants under 1 year of age presented with sepsis-like illness without definite neurologic abnormalities, HPeV-positive children over 1 year of age presented with fever and neurologic symptoms such as seizures, loss of consciousness, and gait disturbance. The CSF findings of HPeV-positive patients were mostly within the normal range, whereas most (73.7%) EV-positive patients had pleocytosis. Conclusions: Although HPeV is typically associated with disease in young infants, the results of this study suggest that HPeV is an emerging pathogen of CNS infection with neurologic symptoms in older childhood.

Mosquito Prevalence and Flavivirus Infection Rates in Gangwon-do, Republic of Korea (2012~2017년 강원지역에서 채집된 모기의 계절적 발생소장과 플라비바이러스 감염률)

  • Chung, Se-Jin;Ko, Seuk-Hyun;Ko, Eun-Mi;Lim, Eun-Joo;Kim, Young-Su;Lee, Wook-Gyo;Lee, Dong-Kyu
    • Korean journal of applied entomology
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    • v.58 no.2
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    • pp.89-99
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    • 2019
  • In total, 654,362 adult mosquitoes were captured using black light traps in Gangwon-do Province of the Republic of Korea from 2012 to 2017. The collected mosquitoes were identified to the species level, placed in pools of up to 50 mosquitoes each, by species and date of collection, and screened for flaviviruses using a reverse transcription-polymerase chain reaction assay. A total of 276,224 adult mosquitoes were grouped in 7,721 pools for virus testing, and 68 flavivirus positive pools (0.9%) were detected. Flavivirus-positive products were confirmed by DNA sequencing. Japanese encephalitis viruses were detected in single pools collected from Chuncheon (2012, 2017: Culex pipiens, 2,728 and 1,111 mosquitoes, respectively), Hoengseong (2013: Culex orientalis, 19), and Gangneung (2017: C. pipiens, 724). All the Japanese encephalitis viruses detected were revealed as genotype V. Chaoyang viruses were detected in 63 pools of 5,055 Aedes vexans nipponii and a single pool of 585 C. pipiens collected in Gangwon-do Province from 2012 to 2017. Chuncheon was the region with the highest minimum infection rates (MIR, 0.32) and maximum likehood estimate (MLE, 0.33; confidence interval (CI) 95%, 0.23-0.46) of A. vexans nipponii for Chaoyang virus, followed by Hoengseong (MIR 0.30, MLE 0.30, CI 0.16-0.52) and Gangneung (MIR 0.21, MLE 0.21, CI 0.13-0.31). Monthly MIR and MLE values of A. vexans nipponii for Chaoyang virus were the highest in October (MIR 0.38, MLE 0.38, CI 0.07-1.25).

축산식품중(畜産食品中)의 Cholestrerol에 관(關)한 고찰(考察)

  • Han, Seok-Hyeon
    • Proceedings of the Korean Society for Food Science of Animal Resources Conference
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    • 1995.11a
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    • pp.1-48
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    • 1995
  • 식생활은 인간 생활의 주체이고 먹는다는 것은 그 수단이다. 그중 중요한 하나의 명제는 인간이 놓여진 여러 환경에서 어떻게 건강을 유지하고 그 개체가 소유하고 있는 능력을 최대치까지 생리적으로 성장 발전시킴과 동시에 최대한 수명을 연장시키기 위한 식물 섭취방법을 마이크로 레벨까지 해명하는데 있다. 인간은 일생동안 엄청난 양의 음식물을 먹는다(70세 수명일 경우 200만 파운드 즉 체중의 1,400배). 그러나 먹기는 먹되 자신의 건강과 장수를 위하여 어떤 음식을 어떻게 선택하여 어떻게 먹어야 하는 문제가 매우 중요하다. 최근 우리나라도 국민 소득이 늘면서 식생활은 서구화 경향으로 기우는 듯하다. 공해를 비롯한 수입식품 등 여러 가지 문제점이 제기됨에 따라 자연식과 건강식을 주장하는 소리가 높이 일고 있다. 그중에는 축산 식품이 콜레스테롤 함량이 다른 식품에 비하여 높게 함유하고 있다는 것으로 심혈관질환의 주범인양 무차별 강조하는 나머지 육식공포 내지는 계란 등의 혐오감 마저 불러 일으키는 경향까지 있는 듯하다. 따라서 본논고에서는 축산식품중의 콜레스테롤 함량수준이 과연 성인병의 주범인지 아니면 다른 지방산과 관련해서 올바르게 평가하고 그 문제점과 대책을 개관해 보고 요약하면 다음과 같다. 1. 사람은 유사이래 본능적으로 주변의 식물이나 동물의 고기를 먹고 성장하여 자손을 증식시키고 어느 사이에 늙으면 죽음을 맞이 하는 싸이클을 반복하면서 기나긴 세월동안 진화를 하여 오늘날의 인간으로서의 자태를 이루었다. 유인원과 같은 인류의 선조들은 수렵을 통해 육식을 많이 하였을 것이므로 인간은 원래 육식동물이 아닐까? 구석기시대의 유물을 보면 많은 뼈가 출토되고 “얄타미라”나 “라스코” 동굴벽화가 선명하게 묘사되고 있다. 2. 우리나라 선조 승구족의 일파가 백두산을 비롯한 만주 송화강 유역에 유입되면서 수렵과 목축을 주요 식품획득의 수단으로 식품문화권을 형성하면서 남하하여 한반도 민족의 조상인 맥족(貊族)으로 맥적(貊炙)이라고 하는 요리(오늘날의 불고기)를 먹었다는 기록이 있다. 3. 인간의 수명을 1900년대로 거슬러 올라가서 뉴질랜드가 세계최장수국(호주는 2위)로서 평균수명은 남자 58세, 여자 69세인 반면 일본과 한국은 당시 남자 36세, 여자 37세이던 것이 일본은 1989년에 이르러 세계 최장수국으로 등장했으나 1990년 당시 뉴질랜드${\cdot}$호주 등은 목축 및 밀(小麥) 생산국가였기 때문이라는 것과 일본은 오늘날 합리적인 식생활 국가라는 것을 간과해서는 안된다. 4. 우리나라 10대 사망원인중 (1994년도) 뇌혈관질환이 1위, 교통사고 2위, 암이 3위 순위로서 연령별로는 10~30대의 불의의 사고(교통사고), 40~60대는 암, 70대 이상은 뇌혈관질환이 가장 많다. 구미${\cdot}$일 7개국 정상국가들은 심질환 사망이 가장 높다. 5. 식생활의 변화에 있어서 우리나라는 주식으로 섭취해 왔던 곡류는 70년 대비 94년에는 0.7배 감소된 반면 육류 5배, 계란 2.4배, 우유는 무려 29.3배 증가되었다. 식생활 패턴이 서구화 경향으로 바뀌는 것 같다. 6. 71년도 우리나라의 지질섭취량은 국민 1인당 1일 평균 13.1g에 섭취에너지의 5.7%수준이었으나 92년도에는 34.5g으로서 총에너지 섭취량의 16.6%에 달하고 총섭취 지방질중 동물성 섭취 비율은 47%를 차지 한다. 국민 평균 혈청콜레스테롤 농도는 80년에 비해 88년에는 11%가 증가되었고 80년에 210mg/dl 이상 되는 콜레스테롤 혈증인 사람의 비율이 5%에서 88년에는 23%로 크게 증가했다. 7. 세계 정상국가들의 단백질 즉 축산식품의 섭취는 우리나라보다 적게는 2배, 많게는 6~7배 더 섭취하고 90년도 우리나라의 지질섭취량은 일본의 1/3수준에 불과하다. 8. 콜레스테롤은 인체를 비롯한 모든 동물체에 필수적으로 분포하고 있는 것으로 체내 존재하고 있는 총량은 90~150g, 이중 혈청콜레스테롤은 4%(6g)를 차지하고 있음에도 불구하고 이 아주 적은 콜레스테롤에 일희일비(一喜一悲) 논쟁은 60~70년 끄러오고 있다. 9. 콜레스테롤의 생체내 기능으로서는 (1) 세포벽의 지지물질 (2) 신경세포 보호막물질 (3) 담즙산의 합성 (4) 비타민 D의 합성 (5) 임신시에 반듯이 필요한 분자 (6) 기타 여러 가지 기능을 수행하는 것으로 필수적인 물질이다. 10. 우리가 식이를 통해서 섭취 콜레스테롤을 550mg정도를 섭취한다고 하더라도 이 정도의 양은 배설 소모되는 양과 거의 맞먹는 양이다. 피부와 땀샘에서 소실되는 양만도 100~300mg에 달하기 때문에 미국농무성에서 섭취량을 300mg로 제한하는 것은 무의미하다. 11. 콜레스테롤 운반체로서의 지단백질은 그 밀도가 낮은 것으로부터 킬로미크론(chylomicron), 초저밀도 지단백질(VLDL), 저밀도 지단백질(LDL) 및 고밀도 지단백질(HDL)으로 나누는데 LDL은 혈청콜레스테롤 중 약 70%, HDL은 약20%를 함유한다. 12. 혈중 콜레스테롤 수준에 영향을 미치는 요인을 열거하여 보면 다음과 같다. 1) 음식을 통해서 섭취되는 콜레스테롤 중 단지 10~40%정도가 흡수되고, 체내에서 합성되는 콜레스테롤이 증가할수록 식이콜레스테롤은 실제 혈청콜레스테롤 수준에 거의 영향을 미치지 않으므로 식이중함량에 대하여 공포를 느끼고 기피할 필요가 없다. 2) 고도불포화지방산, 단가불포화지방산, 포화지방산의 비 즉 P/M/S의 비가 균형되도록 권장한다. 3) 동맥경화를 비롯한 성인병의 원인이 되는 혈전증에는 EPA의 양을 높여줌으로서 성인병을 예방할 수 있다. 4) 오메가6지방산 아라키도닉산과 오메가3지방산인 EPA로 유도되는 에이코사에노이드 또는 프로스타노이드는 오메가6와 3지방산을 전구체로 하여 생합성되는 중요한 생리활성 물질이다. 5) 사람은 일반적으로 20세에서 60세까지 나이를 먹어감에 따라 혈중 콜레스테롤 수준이 증가하고 60세 이후부터는 일정한 수준을 유지하며 심장보호성 HDL-콜레스테롤은 감소하는 반면에 죽상경화성 LDL콜레스테롤은 증가한다. 6) 높은 HDL콜레스테롤 수준이 심장병 발생 위험요인을 감소시키는 기능을 갖고 있기 때문에 좋은 HDL이라 부르고, LDL은 나쁜 콜레스테롤이라 부르기도 하는데, 이것은 유전적 요인보다도 환경적 요인이 보다 큰 영향을 미친다. 7) 이것은 생활 형태와 영양섭취상태를 포함해서 개인적 생활패턴에 영향을 받는다. 8) 많은 실험에서 혈중 콜레스테롤 상승은 노년의 가령(加齡)에 적응하기 위한 자연적 또는 생리적인 세포의 생화학적이고 대사적인 기능을 위해 필수적일 수 있다는 것을 간과해서는 안될 것이다. 이 점으로 미루어 노년의 여성들을 위한 콜레스테롤 농도를 200mg/dl이 가장 알맞은 양이 아닌 듯하다. 9) 스트레스는 두가지 모양으로 유발되는데 해로은 스트레스(negative), 이로운 스트레스(positive)로서 긴장완화는 혈중 콜레스테롤 농도를 10% 떨어진다. 10) 자주 운동을 하는 사람들은 혈중 HDL콜레스테롤치가 운동을 하지 않는 사람보다 높다. 육체적인 운동의 정도와 혈중 HDL콜레스테롤 농도와는 정비례한다. 11) 흡연은 지방을 흡착시키므로 혈전증의 원이이 되며 혈관속의 HDL농도를 감소시킨다. 12) 에너지의 과잉섭취에 의한 체중 증가느 일반적으로 지단백질대사에 영향을 미치고, 간에서는 콜레스테롤 과잉 생산과 더불어 VLDL콜레스테롤의 LDL콜레스테롤 혈증을 나타냄으로 운동과 더불어 비만이 되지 않도록 하여야 한다. 13. 콜레스테롤 함량에 대한 조절기술 1) 식품의 우열을 평가할 때 단순히 동물성 또는 식물성 식품으로 분류해서 총괄적으로 논한다는 것은 지양되어야 한다. 이것은 그 식품에 함유하고 있는 지방산의 종류에 따라서 다르기 때문이다. 2) 인체의 원할한 기능 유지를 위해서는 P /M /S비율 뿐만 아니라 섭취 지방질의 오메가6 /오메가3계 지방산의 비율이 모두 적절한 범위에 있어야 하며 한두가지 지방산만이 과량일 때는 또 다른 불균형을 일으킬 수 있다는 점을 알아야 한다. 3) 닭고기는 오메가6지방산 함량을 높이기 위하여 사료중에 등푸른 생선이나 어분이나 어유를 첨가하여 닭고기는 첨가수준에 따라 증가됨을 알 수 있다. 4) 오늘날 계란내의 지방산 조성을 변화시켜 난황내의 오메가 3계열 지방산 함량을 증가시킨 계란의 개발이 활발해졌다. 14. 계란 콜레스테롤에 대한 소비자들의 부정적 인식을 불식시키고자 계란의 클레스테롤 함량을 낮추는 과제가 등장하면서 그 기술개발이 여러모로 시도되고 있으나 아직 실용 단계에 이르지 못했다. 15. 계란의 콜레스테롤 문제에 대한 대책으로서 난황의 크기를 감소시키는 방법에 대한 연구도 필요하다. 16. 계란 중 콜레스테롤 함량 분석치는 표현 방식에 따라서 소비자들을 혼란시킬 가능성이 있다. 또한 과거에는 비색법으로 분석했으나 오늘날은 효소법으로 분석하면 분석치에 상당한 차이가 있다. 17. 소비자의 요구를 만족시키고 버터 소비를 촉진시키기 위해 콜레스테롤을 감소시키는 물리적${\cdot}$생물학적 방식이 제안되어 있으나 현장적용이 가능한 것은 아직 없다. 18. 우리나라에서 이미 시판되고 있는 DHA우유가 선보였고 무콜레스테롤 버터의 경우 트란스(trans)형 지방산에 관해서는 논란의 여지가 많을 것이다. 끝으로 국가 목표의 하나는 복지사회 건설에 있고 복지국가 실현에는 국민 기본 욕망의 하나인 식생활 합리화가 선행되어야 한다. 소득이 늘고 국가가 발전해감에 따라 영양식${\cdot}$건강식 및 기호식을 추구하게 됨을 매우 당연한 추세라 하겠다. 우리의 식생활이 날로 향상되어 지난날의 당질 위주에서 점차 축산물쪽으로 질적 개선이 이루어진다는 것은 고무적임에 틀림없다. 이 축산물을 통한 풍요로운 식의 문화를 창출하면서 건강과 장수 그리고 후손에 이르기까지 번영하고 국가 경쟁력 강화에 심혈을 기우려야 할 때이다.

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Risk Factor's Affecting long-term Outcome of Alport syndrome (Alport 증후군의 예후와 관련된 위험요인 분석)

  • Byun Ji-Yoon;Baek Seoung-Yon;Lee Young-Mock;Kim Ji-Hong;Lee Jae Seung;Kim Pyung-Kil;Hong Soon-Won;Jeong Hyeon-Joo;Kim Soon-Il;Kim Yu-Seun;Park Ki-Il
    • Childhood Kidney Diseases
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    • v.5 no.2
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    • pp.164-175
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    • 2001
  • Purpose : Alport syndrome is a hereditary nephrotic disease characterized by progressive nephrotic symptom, sensorineural hearing loss, ophthalmic abnormality, typical microscopic findings, and familial occurrence. In this study, we tried to find the risk factors related with its prognosis by taking a close observation on clinical symptoms of children with Alport syndrome reviewing retrospectively. Materials & methods : We chose children diagnosed as Alport syndrome in renal biopsy during 20 years(from 1980, Jan. until 1999, Dec.) who could receive follow up studies in tile department of pediatrics. They were divided into two groups by comparing renal function at the time of diagnosis and at current status. We compared several clinical aspects in them, and applied nonparametric test for statistical analysis. Results : The sex ratio(male:female) of 24 children was 3:1. The most common clinical symptom presented at their first visit was gross hematuria. Among those 24 children, 11 cases($46\%$) of progressing into chronic renal failure(Group II) were observed. Hypertension, proteinuria and edema were seen much frequently in group II. The level of serum protein, albumin, and creatinine clearance were decreased while BUN, creatinine were relatively increased. All the results were statistically significant. Conclusion Clinically significant risk factors related to prognosis in Alport syndrome were the presence of hypertension, edema, and proteinuria at the time of diagnosis. Also, the level of serum protein, albumin, BUN, creatinine, and glomerular filtration rate were proved to be important factors in predicting prognosis. We believe that studies on these possible risk factors would be of great help in treating and predicting prognosis of children suffering with Alport syndrome. (J Korean Soc Pediatr Nephrol 2001;5 : 164-75)

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Resistance Screening to Pepper mild mottle virus Pathotypes in Paprika Cultivars (고추약한모틀바이러스 병원형에 대한 파프리카 품종의 저항성 스크리닝)

  • Choi, Gug-Seoun;Choi, Seung-Kook;Cho, In-Sook;Kwon, Sun-Jung
    • Research in Plant Disease
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    • v.20 no.4
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    • pp.299-302
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    • 2014
  • The Paprika plant infected with Pepper mild mottle virus (PMMoV) do not produce commercial fruit as causing necrotic spots symptom on the fruit. Ten cultivars of paprika were analyzed to select the resistance cultivars against PMMoV pathotypes, $P_{1.2}$ and $P_{1.2.3}$, using bioassay and genetic markers. $L^1$, $L^3$, and $L^4$ genotypes expressing resistance to the pathotypes existed in those cultivars but $L^2$ genotype did not. $L^4L^4$ in cvs. Easy and Magnifico, $L^4L^3$ in cvs. Scirocco and Orange glory F1, $L^4L^1$ in cv. Special F1, $L^3L^3$ in cvs. Fiesta, Piero and Derby, and $L^3L^1$ in Cupra and Mazzona F1 were identified with SCAR and CAPS markers. The resistant cvs. to the 2 pathotypes were Magnipico, Easy, Scirocco F1, Orange glory and Special F1 and the susceptible cvs. were Fiesta, Piero, Derby, Cupra and Mazzona F1. The susceptible cvs. of the absence of $L^4$ genotype showed systemic infection when inoculated with PMMoV-$P_{1.2.3}$. However, those cvs. despite the presence of $L^3$ genotype showed vein necrosis on the inoculated leaf and hypersensitive necrosis symptom on the upper parts when inoculated with PMMoV-$P_{1.2}$.

Characterization of Salt Tolerant Rice Mutant Lines Derived from Azetidine-2-Carboxylic Acid Resistant Cell Lines Induced by Gamma Ray Irradiation (AZCA 저항성 돌연변이 세포주로부터 선발 육성만 내염성 벼 돌연변이 계통의 특성 검정)

  • Song, Jae-Young;Kim, Dong-Sub;Lee, Geung-Joo;Lee, In-Sok;Kang, Kwon-Kyoo;Yun, Song-Joong;Kang, Si-Yong
    • Journal of Plant Biotechnology
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    • v.34 no.1
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    • pp.61-68
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    • 2007
  • To develop rice (Oryza sativa L.) cultivars to be planted on salt-affected sites, cell lines with enhanced proline content and resistance to growth inhibition by Azetidine-2-carboxylic acid (AZCA), a proline analogue, were screened out among calli irradiated with gamma ray of 50, 70, 90, and 120 Gy. The calli had been derived from embryo culture of the cultivar Donganbyeo. Selected AZCA resistant lines that had high proline accumulation were used as sources for selection of NaCl resistant lines. To determine an optimum concentration for selection of NaCl resistant lines, Donganbyeo seeds were initially cultured on the media containing various NaCl concentrations (0 to 2.5%) for 40 days, and 1.5% NaCl concentration was determined as the optimum concentration. One hundred sixteen salt-tolerant (ST) lines were selected from bulked 20,000 seeds of the AZCA resistant $M_{3}$ seeds in the medium containing 1.5% NaCl. The putative 33 lines ($M_{4}$ generation) considered with salt-tolerance were further analyzed for salt tolerance, amino acid and ion contents, and expression patterns of the salt tolerance-related genes. Out of the 33 lines, 7 lines were confirmed to have superior salt tolerance. Based on growth comparison of the entries, the selected mutant lines exhibited greater shoot length with average 1.5 times, root length with 1.3 times, root numbers with 1.1 times, and fresh weight with 1.5 times than control. Proline contents were increased maximum 20%, 100% and 20% in the leaf, seed and callus, respectively, of the selected lines. Compared to control, amino acid contents of the mutants were 24 to 29%, 49 to 143%, 32 to 60% higher in the leaf, seed and callus, respectively. The ratio of $Na^{+}/K^{+}$ for most of the ST-lines were lower than that of control, ranging from 1.0 to 3.8 for the leaf and 11.5 to 28.5 for the root, while the control had 3.5 and 32.9 in the leaf and root, respectively. The transcription patterns for the P5CS and NHXI genes observed by RT-PCR analysis indicated that these genes were actively expressed under salt stress. The selected mutants will be useful for the development of rice cultivar resistant to salt stress.

Cloning and Transcription Analysis of Sporulation Gene (spo5) in Schizosaccharomyces pombe (Schizosaccharomyces bombe 포자형성 유전자(spo5)의 Cloning 및 전사조절)

  • 김동주
    • The Korean Journal of Food And Nutrition
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    • v.15 no.2
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    • pp.112-118
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    • 2002
  • Sporulation in the fission yeast Schizosaccharomyces pombe has been regarded as an important model of cellular development and differentiation. S. pombe cells proliferate by mitosis and binary fission on growth medium. Deprivation of nutrients especially nitrogen sources, causes the cessation of mitosis and initiates sexual reproduction by matting between two sexually compatible cell types. Meiosis is then followed in a diploid cell in the absence of nitrogen source. DNA fragment complemented with the mutations of sporulation gene was isolated from the S. pombe gene library constructed in the vector, pDB 248' and designated as pDB(spo5)1. We futher analyzed six recombinant plasmids, pDB(spo5)2, pDB(spo5)3, pDB(spo5)4, pDB(spo5)5, pDB (spo5)6, pDB(spo5)7 and found each of these plasmids is able to rescue the spo5-2, spo5-3, spo5-4, spo5-5, spo5-6, spo5-7 mutations, respectively. Mapping of the integrated plasmid into the homologous site of the S. pombe chromosomes demonstrated that pDB(spo5)1, and pDB(spu5)Rl contained the spo5 gene. Transcripts of spo5 gene were analyzed by Northern hybridization. Two transcripts of 3.2 kb and 2.5kb were detected with 5kb Hind Ⅲ fragment containing a part of the spo5 gene as a probe. The small mRNA(2.5kb) appeared only when a wild-type strain was cultured in the absence of nitrogen source in which condition the large mRNA (3.2kb) was produced constitutively. Appearance of a 2.5kb spo5-mRNA depends upon the function of the meil, mei2 and mei3 genes.