• The Korean Journal of Mycology
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• v.26 no.3 s.86
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• pp.365-372
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• 1998

In this study, we evaluated the genetic relationships of fourty seven Pestalotiopsis theae isolates collected from diseased sweet persimon in various places in southern part of Korea using RAPD (Randomly Amplified Polymorphic DNAs) method. As a result of the amplification, eight primers showed total of 86 bands ranging from 0.3 Kb to 3.2 Kb. Among those 86 bands, 84 polymorphic bands were used for bionominal matrix code (0, 1), and UPGMA dendrogram analysis. Similarities among the compared isolates ranged from below 60% to more than 95%. Most of the compared isolates showed $50{\sim}80%$ similarities. The number of isolate pairs which showed more than 80% similarity were 248. The number of isolate pairs which showed $50{\sim}80%$ similarity were 789, and the number of isolate pairs which showed below 50% similarity were 21. Isolate SP-21 (No.9) showed below 50% similarity with all the isolates compared. At 50% similarity level, all the isolates compared, except isolate SP-21 (No.9), were included in one big group. At 65% similarity level, all the isolates compared, except isolate SP-21 (No.9), were divided into three different groups. At 75% similarity level, all the isolates compared, except isolates SP-47 (No. 23) and SP-21 (No.9), were divided into six different groups.

• Korean Journal of Plant Taxonomy
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• v.47 no.1
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• pp.46-50
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• 2017

The genus Lilium comprises about 100 species and is a major element of the family Liliaceae in temperate region of North Hemisphere. In the light of recent studies on the genus, we tried to examine the taxonomy of three Korean species (L. hansonii, L. tsingtauense, and L. distichum) belonging to section Martagon. The four available chloroplast regions (rbcL, matK, ndhF, and atpB) in Lilium species were selected and analyzed for a maximum likelihood phylogeny. As a results, three Korean species of section Martagon formed a monophyletic group. However, they nested within paraphyletic section Sinomartagon. Further, the discussions on taxonomic affinities of Korean species have made based on comparison between topology of phylogenetic tree and morphology.

• Proceedings of the Speleological Society Conference
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• 1994.05a
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• pp.106-110
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• 1994

$\bigcirc$ 동굴생물은 식물과 동물, 미생물로 크게 구분되지만 태양광선이 완전히 차단된 동굴내 환경에서는 동굴 동물들이 주종을 이루고 있다. $\bigcirc$ 동굴내의 동물에 관한 연구는 1966년 고씨동굴, 용담굴을 시발로 고수굴, 천동굴, 노동굴, 백룡굴, 대이굴, 환선굴 등 강원도내에 분포하는 동굴 중 약 30%정도는 동물을 포함한 생물상이 조사되었다. $\bigcirc$ 강원도의 동굴동물로서 확인된 것온 9종 30목141종이며 강별로는 곤충강이 9목 50종 주형강이 4목 49종 갑각강이 6목 18종의 순으로 우세하고 목별로는 거미목이 15과 39종, 톡토기목이 7과 20종, 딱정벌레목이 8과 15종으로 우세한 편이다 (남, 1987). $\bigcirc$ 동굴생물에 관한 연구는 육상생태계와 격리된 환경에서 생리, 생태적 적응을 통한 종의 분화나 유전, 진화문제를 추구하며 지하생태계와 육상생태계의 생물적인 유연관계 규명에 중요한 분야로 인정되며 아울러 독특한 특성을 지닌 동굴생물의 보존을 위한 방안과 노력이 일부동굴의 개방 및 개발에 앞서 더욱 구체적으로 모색되고 증대되어야 한다. $\bigcirc$ 동굴환경의 주요 특성은 첫째 햇빛이 차단되어 암흑상태이며, 둘째 내부습도가 높고 기온이나 수온의 연중변화가 심하지 않고, 셋째 먹이연쇄에 필수적인 영양공급원이 제한되어 있다. 따라서 광합성작용으로 성장하는 녹색식물은 태양광선이 유입되는 곳이나 인공조명시설 지역을 제외한 곳에서는 서식이 불가능하고 대형동물이나 초식동물은 생존이 어렵다. $\bigcirc$ 동굴내에는 환경에 적응하는 종들만이 서식할 수 있고 이들을 생태적 특성에 따라 세가지로 구분 할 수 있다. 환경적응 요인으로는 광도, 습도, 온도 영양공급원과 섭식장소, 수중생물의 경우는 특히 수온, 수량 영양원등이다.(중략)다. 본 연구의 접근방법으로는 ASRS의 개념적인 Reference Model을 수립하고 이 Reference Model에 대한 Formal Model로 DEVS(Discrete Event System Specification)을 이용하여 시스템을 Modeling하였다. 이의 Computer Simulation을 위하여 DEVS형식론 환경에서의 Simulation Language인 DEVSim ++ⓒ를 이용하여 시스템을 구현하였다.. 실형 결과로는 먼저 선형 상미분방정식의 예로 mass-damper-spring system, 비선형 상미분방정식의 예로는 van der Pol 방정식, 연립 상미분방정식의 예로는 mixing tank problem 등을 보였으며, 그의 공학에서 일어나는 여러 가지 문제들도 다루었다.화물에 대한 방어력이 증가되어 나타난 결과로 여겨지며, 또한 혈청중의 ALT, ALP 및 LDH활성을 유의성있게 감소시키므로서 감잎 phenolic compounds가 에탄올에 의한 간세포 손상에 대한 해독 및 보호작용이 있는 것으로 사료된다.반적으로 홍삼 제조시 내공의 발생은 제조공정에서 나타나는 경우가 많으며, 내백의 경우는 홍삼으로 가공되면서 발생하는 경우가 있고, 인삼이 성장될 때 부분적인 영양상태의 불충분이나 기후 등에 따른 영향을 받을 수 있기 때문에 앞으로 이에 대한 많은 연구가 이루어져야할 것으로 판단된다.태에도 불구하고 [-wh]의미의 겹의문사는 병렬적 관계의 합성어가 아니라 내부구조를 지니지 않은 단순한 단어(minimal $X^{0}$ elements)로 가정한다. 즉, [+wh] 의미의 겹의문사는 동일한 구성요 소를 지닌 병렬적 합성어([$[W1]_{XO-}$ $[W1]_{XO}$ ]$_{XO}$)로 그리고 [-wh] 의미의 겹의문사는 중복된 발은을 지닌 한 단어로 ([W]$_{XO}$

• Proceedings of the Speleological Society Conference
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• 1995.09a
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• pp.39-44
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• 1995

$\bigcirc$ 동굴생물은 식물과 동물, 미생물로 크게 구분되지만 태양광선이 완전히 차단된 동굴내 환경에서는 동굴 동물들이 주종을 이루고 있다. $\bigcirc$ 동굴내의 동물에 관한 연구는 1966년 고씨동굴, 용담굴을 시발로 고수굴, 천동굴, 노동굴, 백룡글, 대이굴, 환선굴 등 강원도내에 분포하는 동굴 중 약 30% 정도는 동물을 포함한 생물상이 조사되었다. $\bigcirc$ 강원도의 동굴동물로서 확인된 것은 9강 30목 141종이며 강별로는 곤충강이 9목 50종 주형강이 4목 49종 갑각강이 6목 18종의 순으로 우세하고 목별로는 거미목이 15과 39종, 톡토기목이 7과 20종, 딱정벌레목이 8과 15종으로 우세한 편이다(남, 1987). $\bigcirc$ 동굴생물에 관한 연구는 육상생태계와 격리된 환경에서 생리, 생태적 적응을 통한 종의 분화나 유전, 진화문제를 추구하며 지하생태계와 육상생태계의 생물적인 유연관계 규명에 중요한 분야로 인정되며 아울러 독특한 특성을 지닌 동굴생물의 생존을 위한 방안과 노력이 일부동굴의 개방 및 개발에 앞서 더욱 구체적으로 모색되고 증대되어야 한다. $\bigcirc$ 동굴환경의 주요 특성은 첫째 햇빛에 차단되어 암흑상태이며, 둘째 내부습도가 높고 기온이나 수온의 년중변화가 심하지 않고, 셋째 먹이연쇄에 필수적인 영양공급원이 제한되어 있다. 따라서 광합성작용으로 성장하는 녹색식물은 태양광선이 유입되는 곳이나 인공조명시설 지역을 제외한 곳에서는 서식이 불가능하고 대형동물이나 초식동물은 생존이 어렵다. $\bigcirc$ 동굴내에는 환경에 적응하는 종들만이 서식할 수 있고 이들을 생태적 특성에 따라 세가지로 구분 할 수 있다. 환경적응 요인으로는 광도, 습도, 온도 영양공급원과 섭식장소, 수중생물의 경우는 특히 수온, 수량 영양원등이다.(중략). 본 연구의 접근방법으로는 ASRS의 개념적인 Reference Model을 수립하고 이 Reference Model에 대한 Formal Model로 DEVS(Discrete Event System Specification)을 이용하여 시스템을 Modeling하였다. 이의 Computer Simulation을 위하여 DEVS형식론 환경에서의 Simulation Language인 DEVSim ++ⓒ를 이용하여 시스템을 구현하였다.. 실형 결과로는 먼저 선형 상미분방정식의 예로 mass-damper-spring system, 비선형 상미분방정식의 예로는 van der Pol 방정식, 연립 상미분방정식의 예로는 mixing tank problem 등을 보였으며, 그의 공학에서 일어나는 여러 가지 문제들도 다루었다.화물에 대한 방어력이 증가되어 나타난 결과로 여겨지며, 또한 혈청중의 ALT, ALP 및 LDH활성을 유의성있게 감소시키므로서 감잎 phenolic compounds가 에탄올에 의한 간세포 손상에 대한 해독 및 보호작용이 있는 것으로 사료된다.반적으로 홍삼 제조시 내공의 발생은 제조공정에서 나타나는 경우가 많으며, 내백의 경우는 홍삼으로 가공되면서 발생하는 경우가 있고, 인삼이 성장될 때 부분적인 영양상태의 불충분이나 기후 등에 따른 영향을 받을 수 있기 때문에 앞으로 이에 대한 많은 연구가 이루어져야할 것으로 판단된다.태에도 불구하고 [-wh]의미의 겹의문사는 병렬적 관계의 합성어가 아니라 내부구조를 지니지 않은 단순한 단어(minimal $X^{0}$ elements)로 가정한다. 즉, [+wh] 의미의 겹의문사는 동일한 구성요 소를 지닌 병렬적 합성어([$[W1]_{XO-}$ $[W1]_{XO}$ ]$_{XO}$)로 그리고 [-wh] 의미의 겹의문사는 중복된 발은을 지닌 한 단어로 ([W]$_{XO}$

• Korean Journal of Environmental Biology
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• v.30 no.3
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• pp.164-172
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• 2012

In this study, samples were collected from Lake Soyang in Kangwon-do in order to isolate novel Flavobacterium sp. strains. Totally, 21 strains of Flavobacterium showing 97%~98% similarity in 16S rRNA were selected and thoroughly investigated individual characteristics and ecological differences. As results, we could categorize Flavobacterium isolated from Lake Soyang into four major node groups, where most of Flavobacterium belonged to single group. Next, fatty acid analyses were performed demonstrating similar pattern of the majority of fatty acids as either iso $C_{15:0}$ or summed feature 3 (comprised $C_{16:1}$ ${\omega}7c$ and/or $C_{16:1}$ ${\omega}6c$) of the other Flavobacterium. However, other phenotypic data were different from the other Flavobacterium sp. Group. Our data showed that genetically related species of Flavobacterium have been distributed in Lake Soyang. Those Flavobacterium strains were phenotypically different from previously reported genus of Flavobacterium species. Taken together, we speculated that isolated Flavobacterium strains from Lake Soyang might be ecologically important members to maintain ecosystem.

• The Korean Journal of Malacology
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• v.26 no.4
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• pp.285-290
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• 2010

The nucleotide sequences of the mitochondrial cytochrome oxidase subunit 1 (CO1) gene of octopus groups collected from Muan, Taean, Yesu, Jeju in Korea and Youngsung, Daeryen in China were analyzed for the identification of species and populations. Six haplotypes were identified from the analyzed 60 individuals. All of the individuals (N = 10) from Jeju showed the A haplotype which was not observed from other groups, and could be classified as a distinct group. The analyzed groups could form two separate clade in MEGA4 analysis. The individuals from Muan, Taean, Yesu in Korea and Daeryen in China form a clase and the others from Jeju in Korea and Youngsung in China formed the other clade. The analysis of relationship among the groups showed the same results. Individuals belong to the group A (Muan, Taean, Yesu and Daeryen) showed closer relationship than individuals belong to the group B (Jeju and Youngsung). Although the CO1 universal primers used in this study was useful as a marker for species identification among Octopus, analysis of population was limited because of few variations in the partial sequences of CO1 analyzed in this study. However, it was possible to show the limited gene flow among the groups which is resulted from the spatial separation and differences in their habitats.

• Research in Plant Disease
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• v.29 no.4
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• pp.440-444
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• 2023

In August 2021, water-soaking symptoms of bacterial spot disease were observed on castor bean in a field in Gangseo District, Busan. Bacteria isolated from the lesion when cultured on tryptic soy agar appeared to be nonmucoid and pale green. To confirm whether the isolates were the causative agent of the spot disease, they were inoculated onto healthy castor bean plants. The same symptoms were observed on the inoculated tissue, and the bacteria were reisolated from the lesion. Furthermore, the isolates were consistent with the biochemical and physiological features of Pseudomonas capsici. Sequencing analysis using 16S rRNA and housekeeping genes (gyrB, rpoD) showed that the isolates shared a high sequence similarity with P. capsici. These results confirmed that the strains belonged to P. capsici. To our knowledge, this is the first report of bacterial spot disease caused by P. capsici on castor bean in Korea.

• Korean Journal of Plant Tissue Culture
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• v.26 no.1
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• pp.41-47
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• 1999

Phenylalanine ammonia-lyase (PAL; EC 4, 3, 1, 5) genomic clones were isolated from tomato(Lycopersicon esculentum L.) genomic DNA libraries using tomato PAL5 cDNA sequences as probes. The nucleotide sequences of tPAL1, tPAL4 and tPAL5 were compared. tPAL5 contains an open reading frame encoding a polypeptide of 722 amino acids, interrupted by a 710 bp intron in the codon for the amino acid 139. tPAL1 encodes a polypeptide of 249 amino acids which is much shorter than tPAL5 gene due to a premature stop codon and does not contain an intron. tPAL4 encodes a polypeptide of 357 amino acids, interrupted by a 305 bp intron in the codon for the amino acid 138. Premature stop codons observed in tPAL1 and tPAL4 gene produce a short polypeptide rather than a normal polypeptide (722 aa). tPALl shows 87.2% homology with tPAL4 and 85.3% homology with tPAL5 gene whereas tPAL4 showes 91.4% homology with tPAL5 at nucleotide level. In general, phylogenetic analysis showed that genes isolated from tomato, potato, and sweet potato were belong to the same group and another dicot plants such as parsley, bean, soybean, pea and alfalfa formed another group. PAL genes isolated from rice and yeast showed very low homology with other PAL genes and formed the other group.

• Korean Journal of Medicinal Crop Science
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• v.9 no.3
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• pp.205-210
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• 2001

Dried parts of the two species are difficult to distinguish morphologically, thus Codonopsis radix has been sold instead of Adenophorae radix in herbal medicine market. Therefore, this study was conducted to develop the genetic marker through the examination of the phylogenetic relationships between two Adenophora triphylla(Thunb.) A. DC. var. japonica Hara, two Adenophora radiatifolia Nakai, five Codonopsis lanceolata(Sieb. et Zucc)Trautv. using RAPD analysis. Fifty decarmer oligonucleotide primers were screened for the RAPD analysis, and four primers generated distinct RAPD markers specific to Adenophorae radix and Codonopsis radix. Based on the RAPD patterns, the genetic relationships between three herbal medicine were analyzed by UPGMA method. As a result, Adenophorae radix and Codonopsis radix were classified into two major subgroups on the basis of the genetic similarity coefficient. The specific RAPD patterns generated by the selected primers were reproducible from dried materials. Furthermore, the specific RAPD patterns were produced from the mixture of dried roots of A. triphylla and C. lanceolata. These results prone the usefulness of the RAPD analysis for the discrimination of pure materials from the mixtures of A. triphylla and C. lanceolata.

• Journal of Life Science
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• v.22 no.7
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• pp.987-990
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• 2012

Mungbean sprout rot is one of the most serious problems of the commercial mungbean sprout industry. In this study, 70 strains of mungbean sprout rot pathogens were isolated from rotten sprouts at different time intervals. The pathogenicity of the isolated pathogens was tested. The highly pathogenic strain (YV-St-033) was identified as Pseudomonas sp. by 16S rRNA gene sequencing. In phylogenetic analysis, the YV-St-033 strain was grouped with P. mosselii, P. putita, P. fluorescens, P. entomophila, and P. lecoglossicida. The results of the 16S rRNA gene sequence analysis revealed that the YV-St-033 strain shared the highest sequence identity (more than 99%) with the P. mosselii R10 strain. The mungbean lines of Yeungnam University germplasm were screened against the YV-St-033 strain. Based on the growth rate of the sprouts after 3 days of inoculation with the pathogen, the YV148 line was highly resistant to the pathogen. The remaining lines were either partially or fully infected. The highly resistant line YV 148 is suitable for future breeding programs due to their thin sprouts and fast growing nature.