• Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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• 2012.11a
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• pp.1728-1731
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• 2012

본 논문에서는 부모 개체의 해밍 거리에 기반하여 선택적 변이연산을 적용한 유전알고리즘을 제안한다. 유전자 형이 매우 유사한 개체들 간의 유전연산은 알고리즘의 탐색성능을 저하시키고 조기 수렴의 가능성을 증가시킨다. 본 논문에서는 이러한 현상을 극복하기 위하여, 교차연산 시 선택된 두 부모 개체간의 해밍 거리에 따라 그 값이 낮으면 교차연산 후 생성된 두 자식 개체 중 한쪽에게 높은 변이확률을 적용하고 다른 한쪽 자식은 부모와 비슷한 유전자 형으로 탐색을 계속하게 하여 조기 수렴을 방지하면서 해집단의 다양성 유지 기능을 향상 시켰다. 제안한 유전 알고리즘을 다차원 배낭 문제에 적용한 결과, 같은 조건에서 단순 유전 알고리즘(SGA) 보다 향상된 탐색 성능을 보여주었다.

• The Journal of Korean Academy of Prosthodontics
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• v.49 no.4
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• pp.341-345
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• 2011

Genetic association study has been progressed in medicine along with advance in genetic technology. It focused on the individual differences in genotype due to errors occurring during DNA duplication, which can cause vulnerability to specific diseases. Polymorphism defines the varieties in phenotype due to those genetic variations. Polymorphism due to change in one DNA base sequence is called as a Single Nucleotide Polymorphism. In the near future, the evaluation of relative risk to specific disease according to SNP will be essential part of fundamental of medicine for the diagnosis, treatment and prevention. Dental caries and periodontal diseases has been first subject to genetic association study in dentistry and broaden out to other areas like bone formation and resorption. This article presents the current state of genetic association study and its application to dentistry.

• Neonatal Medicine
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• v.18 no.2
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• pp.374-378
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• 2011

Noonan syndrome is an autosomal dominant disorder characterized by typical facial features, congenital heart disease, and short stature. Diagnosis is difficult only with clinical symptoms and it is recently confirmed with gene study. The genotype-phenotype correlations have been reported. We report a newborn with KRAS gene mutation. This is the second report of case with KRAS gene mutation in Korea. So we hope this case will be a help to diagnosis and treatment of Noonan syndrome from birth.

• The Korean Journal of Malacology
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• v.9 no.1
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• pp.39-45
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• 1993

한국산 부산입술대고둥의 지역 집단간에 있어 유전적 변이, 종내 유연관계를 밝히기 위하여 애월, 세화, 삼척, 통도사, 거문도 및 여수 지역에서 채집한 총 180개체를 대상으로 전기영동을 실시하였고 여기서 나타난 16개의 유전자를 분석하였다. 각 집단의 유전전 변이 정도를 조사한 결과 전 집단의 평균 대립인자 수 (A)는 1.528이고, 평균 다형형의 빈도(P)는 45.5%이며, 평균이형접합자(H$_{D}$)는 0.205로 나타났다. 이중 삼척집단의 대립인자 수는 1.46으로 가장 낮고, 애월집단의 다형형의 빈도는 28.58%, 통도사의집단은 57.14%로 가장 낮은 빈도를 나타냈다. 각 집단간 유전적 유연관계를 분석한 결과 6개 집단간의 평균 유전적 근연치는 S=0.716이었고, 애월과 삼척집단은 0.903으로 가장 가까운 유전적 유연관계를 4보여주고 있다. 여수집단과 삼척집단의 유전적 유연관계는 0.562로 가장 낮은 값을 나타냈다. Nei의 공식에 따라 각 집단의 유전적 차이치(D)를 계산한 결과 평균D값은 0.267이며, 이중 애월과 삼척집단이 0.067로 가장 가깝게 나타났고 이는 Roger에 의한 유전적 근연관계와 유사한 양상을 보였다.

• Journal of The Korean Society of Inherited Metabolic disease
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• v.11 no.1
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• pp.106-109
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• 2011

MCG는 3-methylcrotonyl-CoA의 결핍으로 발생하는 선천성 leucine 대사 장애이다. 무증상에서 간질지속증 등의 다양한 임상양상을 보이며 주로 신생아대사이상선별검사에서 의심되어, 소변 유기산 검사를 통해 3- hydroxyisovaleric acid의 증가의 소견이 보인다. 치료는 leucine 제한 식이와 L-carnitine의 복용 등의 식이요법이 있다. 서울아산병원에서 MCG로 확진된 9가계 11명의 환자를 대상으로 임상상과 분자 유전학적 특성을 조사하였다. 9명은 신생아 대사이상검사로 발견되었으며, 나머지 2명은 가족검사를 통해서 진단되었다. 총 2-10세($2.6{\pm}1.96$년)까지의 관찰 기간 동안 모든 환자는 정상 발달을 보였으며, 신경학적 이상이나 대사불균형의 이상소견은 보이지 않았다. 총 18개의 대립유전자 중 17개에서 돌연변이를 발견하였으며, p.D280Y 돌연변이가 66.7%의 대립유전자에서 확인되어, 한국인 MCG에서 흔한 돌연변이임을 알 수 있었다. 또한 p.S342K, p.P459S, p.552S, p.Q496H, p.T556A 등 대부분의 돌연변이가 이전에 보고된 바가 없던 돌연변이로 한국인 MCG환자의 유전학적 특성이 다른 민족과 다름을 시사한다.

• Horticultural Science & Technology
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• v.17 no.3
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• pp.352-354
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• 1999

Randomly and specifically amplified polymorphic DNA band patterns based on polymerase chain reaction (PCR) analysis were used to assess genetic variation of somaclonal variants obtained from tissue culture of lisianthus (Eustoma grandiflorum). Five different types of variant were classified by morphological characters such as leaflet number, leaf shape, caulicle length, plant height, and leaf area. Five primers out of 20 primers (10 mer) resulted in 34 random amplified DNA fragments with polymorphisms (64.7%) in all tested plants. The dissimilarity coefficient was from 0.71 to 0.91 by UPGMA cluster analysis. Based on the presence of polymorphic bands, normal plant and five somaclonal variants were divided into two groups at the similarity coefficient value of 0.79.

• Korean Journal of Plant Taxonomy
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• v.44 no.4
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• pp.250-256
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• 2014

This study was carried out to understand the genetic relationship of three Aloe spp. cultivated in Korea, A. saponaria, A. vera and A. arborescens and a new variant in Korea based on three plastid (matK, trnL-F, rbcL) and one nuclear (ITS regions) DNA barcode markers. A total of 2,420 bp sequence was amplified. Two indels were detected in the trnL region, and also several species specific nucleotide loci were detected in all 29 parsimonious informative sites, and 148 variable sites were detected among four taxa studied while 170 variable and 75 parsimonious sites were detected when other Aloe spp. in worldwide were used. An UPGMA phenogram with 10,000 bootstrap replication showed that the new variant was closest to A. vera. The variant was not morphologically and genetically concurrent with any reported species so far. The clustering of Aloe species were broadly in agreement with previously reported results.

• Journal of Plant Biotechnology
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• v.47 no.1
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• pp.46-52
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• 2020

This experiment study aimed to identify the continuous genetic variation caused by benzyladenine (BA) treatment in strawberry tissue culture. The 'Goha' cultivar was used and treated with different concentrations of BA (0.0, 0.5, 1.0, 2.0 mg·L^-1). Morphological and genetic variation tests were performed, and genetic continuity tests were performed for three years. The morphological variation induced by BA was distinctively high (10.5 ~ 20.0%) and the genetic variation was 7.0 ~ 15.0%, 1.8 ~ 10.0%, and 5.0% in the first, second, and third year of cultivation, respectively. The rate of genetic variation decreased with increasing cultivation years. In addition, genetic variation caused by BA 1.0 mg·L^-1 and BA 2.0 mg·L^-1 occurred in the first and second years of cultivation, whereas only BA 2.0 mg·L^-1 caused genetic variation in the third year of cultivation. Therefore, a concentration of less than 1.0 mg·L^-1 BA was used for the propagation of strawberry tissue culture plants, and it was necessary to identify their variation.

• The KIPS Transactions:PartD
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• v.18D no.2
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• pp.89-100
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• 2011

The CNV (Copy Number Variation) which is one of the genetic structural variations in human genome is closely related with the function of gene. In particular, the genome-wide association studies for genetic diseased persons have been researched. However, there have been few studies which infer the genetic function of CNV with normal human. In this paper, we propose the analysis method to reveal the functional relationship between common CNV and genes without considering their genomic loci. To achieve that, we propose the data integration method for heterogeneity biological data and novel measurement which can calculate the correlation between common CNV and genes. To verify the significance of proposed method, we has experimented several verification tests with GO database. The result showed that the novel measurement had enough significance compared with random test and the proposed method could systematically produce the candidates of genetic function which have strong correlation with common CNV.

• The Korean Journal of Zoology
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• v.35 no.4
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• pp.497-504
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• 1992

한국특산종인 Colitis rotundicuudutu의 지리적 변이를 전국 5개 집단 132개체를 대상으로 조사하였다. 4개 집단의 계측형질로 본 다변량분석 결괴 산청집단은 타 집단과 형태적 차이가 있었다 전기영동으로 조사된 5개 집단의 평균 유전적 변이 정도는 A=1.48, P=37. IpA, HD=0. 139, 및 H6=0. 124로 변이 정도가 타 어류에 비하여 비교적 높았다. 5개 집단의 평균 유전적 근인치(S)는 0.83으로 낮았으나 산청집단을 제외한 4개 집단의 근연치는 0. 91로 매우 가까웠다. 반면 산청집단은 나머지 집단과 형태적으로나 유전적으로 유의한 차이가 나타나는 것으로 보아 산청집단의 별종 가능성이 매우 높음을 시사한다. 앞으로 보다 면밀한 연구로 산청집단의 별종 여부를 명백히 구명하여야 할 것이다.