• Proceedings of the Korean Society of Propulsion Engineers Conference
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• 2008.05a
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• pp.307-311
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• 2008

Ground test of model Scramjet engine was performed with T4 free-piston shock tunnel at University of Queensland, Australia. Test condition of free stream was Mach 7.6 at 31 km altitude. With this condition, variation effects of fuel equivalence ratio, cavity, cowl setting were investigated. In the results, supersonic combustion or thermal choking was observed depending on the amount of fuel. Cavity and W-shape cowl showed early ignition and enhanced mixing respectively.

• Proceedings of the Korean Environmental Sciences Society Conference
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• 2005.05a
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• pp.301-305
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• 2005

3-메틸-1-페닐-2-피라졸린-5-은과 N,N-디에틸-1,4-페닐렌디아민의 반응에서 마젠타 아조메틴색소(M)를 합성하였다. 마젠타 아조메틴 색소는 에탄올, 아세톤, 그리고 클로로포름에 잘 녹는다. 원소분석, 핵자기공명스펙트럼, 적외선 홉수 스펙트럼, 그리고 GC/MS 스펙트럼에서부터 마젠타 아·조메틴 색소임을 확인하였다. 마젠타 아조메틴 색소는 염기성용액에서 분해된다. 에탄을 수용액에서 염기에 의한 마젠타 아조메틴 색소의 퇴색반응을 분광학적인 방법으로 540 nm에서 측정하였다. 그리고 OH$^-$와 H$_{2}$O(11${\sim}$40 M의 범위)의 농도가 증가함에 따라 퇴색반응속도는 증가하였다. 이 반응에 대한 실험속도 식은 다음과 같다. -d[D]/dt = {k$_{OH}$[OH$^-$][H$_{2}$O]}[D] 이 속도식과 일치하는 메커니즘을 제시하였다.

• Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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• 2000.10a
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• pp.207-210
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• 2000

지금까지 인간이나 다른 생물체의 전체 유전체 염기서열을 밝혀내는 작업은 크게 세가지 방법으로 진행되었다. Clone-by-clone approach, sequence tagged connector approach, random shotgun approach(1)가 그것인데 마지막의 random shotgun approach는 fragment assembly problem을 비롯한 여러 가지 전산학적인 문제들을 수반한다. 이 논문은 저자들의 국내 최초로 미생물체의 전체 염기서열을 random shotgun approach를 이용하여 밝혀낸 경험을 바탕으로 그에 따르는 문제인 fragment assembly problem에 대해 소개하고 그에 수반되는 몇 가지 전산학적인 문제와 몇 가지 해결책에 대해 설명하려 한다.

• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2006.06a
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• pp.52-54
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• 2006

특정한 기능을 하는 DNA 조각은 특정한 염기 서열들을 가진다. 이를 이용하여 특정 조각의 DNA 서열을 위치 점수 행렬을 이용하여 표현할 수 있다. 하지만 찾고자 하는 DNA 부분들이 완전히 밝혀진 것이 아닐 수 있다. 따라서 현재 밝혀진 정보만을 이용하여 위치 점수 행렬을 만들 경우, 실제 서얼 패턴이 아닌 편중된 정보가 얻어질 수 있다. 따라서 본 논문에서는 위치 점수 행렬의 혼합 모델을 이용하여, 각각의 특정 군집들을 대표할 수 있는 행렬들을 구분하여 구성하였다. 본 논문에서는 약 22개의 염기로 구성된 microRNA 서열 중, 초반부의 8개의 염기 서열정보를 이용하여, 이들 위치의 서열상의 특성을 확인해 보고자 하였다. miRNA 서열을 대표하기 위한 위치 점수 행렬들은 구분하여 만들고, EM 알고리즘을 이용하여 학습한다. 학습 결과 얻어진 혼합 모델과 은닉 변수를 통해 microRNA들을 군집화하고, 각각의 군집에 속한 microRNA 서열의 특성을 확인한다.

• Korean Journal of Plant Taxonomy
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• v.34 no.2
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• pp.173-183
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• 2004

한국산 미나리아재비속 미나리아재비(Acris Schur)절에 속하는 미나리아재비(Ranunculus japonicus)와 근연종인 산미나리아재비(R. acris var. nipponicus) 및 바위미나리아재비(R. crucilobus)의 실체와 분류학적 한계를 파악하기위해 속, 종간 규명에 많이 이용하고 있는 핵리보좀(ribosomal) DNA의 internal transcribed spacer 구간의 염기서열을 분석하였다. 본 연구는 6개의 군외군을 포함하여 총 18개의 DNA 재료(accessions)의 정열된 염기서열들을 바탕으로 bootsrap을 포함한 maximum parsimony와 maximum likelihood 분석법에 의한 계통수로 평가하였다. 연구 결과 Acris절에 속하는 미나리아재비, 산미나리아재비 및 바위미나리아재비는 단계통군으로 나타났으며 특히 미나리아재비(R. japonicus)와 산미나리아재비(R. acris var. nipponicus)는 같은 분계조를 형성하였다. 이와 달리 바위미나리아재비는 미나리아재비와 산미나리아재비에서 분지된 결과를 보여, 한라산 해발 1500m이상의 높은 지역에 분포하는 바위미나리아재비는 미나리아재비의 아종(R. japonicus Thunb. subsp. chrysotrichus (Nakai) Y. N. Lee, comb. nud.)으로 처리하기보다는, 독립된 고유종인 R. crucilobus H. L$\acute{e}$v.으로의 처리를 지지하였다.

• Proceedings of the Korea Contents Association Conference
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• 2012.05a
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• pp.355-356
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• 2012

후성유전은 DNA 염기 서열이 변화하지 않고 DNA의 메틸화(methyaltion) 및 히스톤 단백질의 변형(modification)등의 후천적 과정에 의해 유전자 발현이 조절되는 현상이다. 특히 DNA 메틸화 정도에 대한 패턴 분석은 후성유전을 이해하는 중요한 접근방법중 하나이다. DNA 메틸화 패턴 분석을 위해 발생에 관련된 123개 유전자들의 -5000bp ~ +200bp사이에 있는 DNA 염기 서열 정보를 추출하였다. 추출한 염기 서열 정보를 기반으로 기존에 알려진 메틸화 경향성 모티프와 메틸화 저항성 모티프를 모니터링 함으로써 발생관련 유전자들의 메틸화 모티프 패턴을 분석하였다. 결과적으로 메틸화 저항 모티프만이 발견되었고 따라서 메틸화 저항 모티프 패턴과 발생관련 유전자들의 상관관계를 분석하였다.

• Journal of the Korean Chemical Society
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• v.34 no.6
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• pp.658-662
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• 1990

A method for regioselective mono-carbonylation of halobenzyl halide is described. Alkyl halophenylacetate is easily prepared by carbonylating a benzylic halide of halobenzyl halide in the presence of catalytic amount of cobalt carbonyl, a base, and an alcohol under atmospheric pressure of carbon monoxide. The base plays a decisive role in the selectivity of product and NEt$_3$ is the best one among bases used.

• Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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• 2013.05a
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• pp.894-897
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• 2013

서열 정렬(sequence alignment)은 유전학(genomic)에서 널리 사용되는 도구 중 하나이다. 최근에는 차세대 시퀀싱 기술(NGS)이 발달함에 따라 데이터의 생산량이 크게 증가했고, 이에 따라 높은 처리량(throughput)을 가진 서열 정렬 알고리즘의 필요성이 증가하였다. 본 논문에서 제안하는 염기 서열 정렬 알고리즘은 시퀀스(sequence)데이터를 그래프 형태로 변형시킨 다음, 마이크로소프트사의 그래프 기반인 메모리(in-memory) 분산시스템(distributed system) 트리니티(Trinity)를 이용해 서열 정렬을 수행한다. 본 논문의 알고리즘은 트리니티 시스템에서 시뮬레이션 염기 데이터를 성공적으로 정렬하였으며, 슬레이브의 개수가 늘어날수록 빠른 속도를 나타내어 확장성(scalability)을 입증했다.

• The Journal of the Petrological Society of Korea
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• v.11 no.3_4
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• pp.103-120
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• 2002

In the Baekdong-Hongseong area, the southwestern part of the Gyeonggi Massif in Korea, ultramafic rocks occur as lenses within Precambrian granitic gneiss. At Baekdong area, ultramafic lens contains metabasite boudin which had undergone at least three stages of metamorphisms. The mineral assemblage on the first stage, Garnet+Sodic Augite+Hornblende+Plagioclase+Titanite, is recognized from the inclusions in garnet. The second stage is represented by the assemblage in matrix, Garnet+ Augite+Hornblende+Plagioclase, while the third stage is identified by the Hornblende+Plagjoclase $\pm$ Garnet assemblage in the symplectite formed around garnet. The P-T conditions of the first and the third stages are $690-780^{\circ}C$, 11.8-15.9 kb and $490-610^{\circ}C$, 4.0-6.3 kb, respectively. These data indicate that metabasite in Baekdong area had experienced a retrouade P-T path from the eclogite(EG) - high-pressure granulite (HG)-amphibolite (AM) transitional facies to the AM through HG-AM transitional facies. The core and rim of garnet in country granitic gneiss give $605-815^{\circ}C$, 10.7-16.0 kb and $575-680^{\circ}C$, 5.4-7.0 kb, respectively, indicating that the retrograde P-T path of granitic gneiss is similar to that of metabasite. Trace element data reveals that the tectonic setting of metabasite is island uc. The general geology, the metamorphic evolution, the mineral chemistry and the tectonic setting of Baekdong area indicate that the Baekdong-Hongseong area in Korea is a possible extension of the Sulu collision Belt in China. On the other hand, the Sm-Nd whole rock-garnet isochron ages of metabasites are 268.7-297.9 Ma which are older than the ages of UHP metamorphism (208-245 Ma) in the Dabie-Sulu Collision Belt. The older metamorphic ages suggest that collision between Sino-Korea and Yangtz plates may have occurred earlier in Korean Peninsula than China.

• Pediatric Infection and Vaccine
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• v.7 no.1
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• pp.83-93
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• 2000

Purpose : Urabe AM-9 strain was known to be associated with increased aseptic meningitis. The reason for high incidence of vaccine-associated meningitis was known that nucleotide(nt) substituted form G to A at position 1081 of the hemagglutinin-neuraminidase(HN) gene and therefore, glutamic acid changed to lysine at amino acid 335. We assessed by comparing nt sequence of the HN gene form Urabe AM-9 strain with wild strain and documented the correlation between nt substitution and vaccine-associated meningitis. Methods : Two lots of Urabe AM-9 vaccine distributed in Korea and mumps wild strains isolated from 1998 through 1999 were analysed. Analysis was made by nt sequencing following amplification of HN gene by RT-PCR. Results : Nucleotide substitution at position 343, 1476, 1570 was not found in both Urabe AM-9 vaccines and wild strains. But analysis of vaccine strains and wild strains isolated from patients revealed substitution from G to A at nt 1081 of the HN gene. Therefore, it encodes lysine instead of glutamic acid at amino acid 335. There was no mixture from of G and A at nt 1081. Nt at 1470 of one lot of Urabe AM-9 vaccines changed from C to A after Vero cell passage. Nt at 1727 of vaccines and wild strains was substituted A to G, so it encodes glycine instead of aspartic acid. Conclusion : Nucleotide analysis of HN gene revealed that nt 1081 of Urabe AM-9 vaccines and wild strains had wild type AAA($Lys^{335}$) instead of variant type GAA($Glu^{335}$). The results of this study suggest that there was a probability of vaccine-associated meningitis due to Urabe AM-9 in Korea before. But incidence of actual side effect was not evaluated because there was no reporting system in Korea.