Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference (한국정보처리학회:학술대회논문집)
- 2000.10a
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- Pages.207-210
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- 2000
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- 2005-0011(pISSN)
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- 2671-7298(eISSN)
Whole-Genome Sequencing by the random shotgun approach
Random shotgun 방법을 이용한 생물체의 염기서열 분석
- Jung, Chol-Hee (Dept. of Computer Science & Engineering, Korea University) ;
-
Yoon, Kyong-Oh
(Macrogen, Corp.)
;
- Park, Hyun-Seok (Dept. of Computer Science & Engineering, Sejong University) ;
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Choi, Jin-Young
(Dept. of Computer Science & Engineering, Korea University)
- Published : 2000.10.13
Abstract
지금까지 인간이나 다른 생물체의 전체 유전체 염기서열을 밝혀내는 작업은 크게 세가지 방법으로 진행되었다. Clone-by-clone approach, sequence tagged connector approach, random shotgun approach(1)가 그것인데 마지막의 random shotgun approach는 fragment assembly problem을 비롯한 여러 가지 전산학적인 문제들을 수반한다. 이 논문은 저자들의 국내 최초로 미생물체의 전체 염기서열을 random shotgun approach를 이용하여 밝혀낸 경험을 바탕으로 그에 따르는 문제인 fragment assembly problem에 대해 소개하고 그에 수반되는 몇 가지 전산학적인 문제와 몇 가지 해결책에 대해 설명하려 한다.
Keywords