• Journal of Convergence for Information Technology
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• v.11 no.1
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• pp.109-117
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• 2021

In this paper, the meta-model based approximate optimization was carried out for the structure design of an ocean automatic salt collector in order to minimize the structure weight. The structural analysis was performed by using the finite element method to evaluate the strength performance of the ocean automatic salt collector in its initial design. In the structural analysis, it was evaluated the strength performance of the design load conditions. The optimum design problem was formulated so that design variables of main structure thickness would be determined by minimizing the structure weight subject to strength performance constraints. The meta-models used in the approximate optimization were the response surface method, Kriging model, and Chebyshev orthogonal polynomials. Regarding to the numerical characteristics, the solution results from approximate optimization techniques were compared to the results of non-approximate optimization. The Chebyshev orthogonal polynomials among the meta-models used in the approximate optimization showed the most appropriate optimum design results for the structure design of the ocean automatic salt collector.

• Journal of Animal Science and Technology
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• v.54 no.1
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• pp.1-8
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• 2012

This study aimed to investigate the single nucleotide polymorphisms (SNPs) of the porcine MC4R gene and validate the effect of the MC4R genotype for marker assisted selection (MAS). Six amplicons were produced to analyze the entire base sequences of the porcine MC4R gene and six SNPs were detected (c.-780C>G, c.-135C>T, c.175C>T-Leu59Leu, c.707A>G-Arg236His, c.892A>G-Asp298Asn, and c.*430A>T). Linkage disequilibrium (LD) of the six SNPs was analyzed by performing haploid analysis. There was a perfect linkage disequilibrium in c.-780C>G, c.-135C>T, c.175C>T-Leu59Leu, c.707A>G-Arg236His, and c.*430A>T. Only the c.892A>G (Asp298Asn) SNP showed a very low LD with an $r^2$ value of 0.028 and the D' value of 0.348. As a result, the two SNPs-c.707A>G (Arg236His) and c.892A>G (Asp298Asn)-were selected to extract the genotype frequencies from the 5 pig breeds by using the polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) genotype analysis method. The SNP frequency of c.707A>G (Arg236His) indicated the presence of the A (His) allele only in Yorkshire, while the G allele was fixed in the KNP, Landrace, Berkshire, and Duroc. Association analysis was carried out in 484 pigs with the c.707A>G (Arg236His) SNP and the meat quality traits of four different pig cross populations: a significant association was noted in crude fat, sirloin moisture, meat color, and the degree of red and yellow coloration. The frequency of the c.892A>G(Asp298Asn) SNP genotype varied among the breeds; while Duroc showed the highest frequency of the A (Asn) allele, KNP showed the highest frequency of the G (Asp) allele. Association analysis was carried out in 1126 pigs with the c.892A>G (Asp298Asn) SNP and the meat quality traits of four pig populations: a highly significant linkage was noted in the back-fat thickness (P<0.002). It was found that the back-fat thickness was higher in individuals with the AA genotype than in those with the AG or GG genotype. Thus, in this study, we verified that the c.892A>G (Asp298Asn) SNP in the pig MC4R gene has a sufficient effect as a gene marker for MAS in Korean pork industry.

• Journal of Embryo Transfer
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• v.31 no.3
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• pp.227-233
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• 2016

This study was conducted to analyze the effect of single nucleotide polymorphisms (SNPs) on the equine chromosomes (ECA) 3 for the body conformations of 12 month of age in Jeju crossbred (Jeju horses ${\times}$ Thoroughbred). A total of 199 Jeju crossbred horse samples were obtained from the National Institute of Subtropical Livestock Research Institute for this study. To correctly estimate the body conformations, we measured thirteen elements relevant to the body conformation such as body weight, wither height, body length for all the 199 horses at 12 month of age. Furthermore, all the horses were genotyped using four SNPs including the BIEC2-808466, BIEC2-808543, BIEC2-808967, BIEC2-809370, of which genomic coordinates range approximately from 105.1Mbp to 110 Mbp in the ECA3. For the phenotypic data sets, the average body weight was $193.7{\pm}24.5kg$ and the height was $124.5{\pm}4.0cm$. As for the genotypic data, the miner allele frequencies of the SNPs were shown to be varied from 0.01 to 0.291. Using the phenotypic and genotypic data sets, analysis of covariance was performed to find any association between those SNP genotypes and body conformations, using year of birth, month of birth, sex, and parity as the covariance components. The result showed that alternative genotypes in the BIEC2-808967 and BIEC2-809370 SNPs were significantly associated with the body length (P<0.05) and the wither height (P<0.05) respectively in the Jeju crossbred horses. Therefore, it is estimated that there are significant associations in the body conformation of 12 month of age of Jeju crossbred for those two SNPs used in this study.

• Food Science of Animal Resources
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• v.28 no.3
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• pp.276-282
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• 2008

It is estimated that over 80% of deer antlers produced in the world are consumed in Korea. However, mislabeling or fraudulent replacement of costly antlers with cheaper ones is one of the most common problems in the domestic antler market. Therefore, there is a great need for the development of technology to identify species of antlers. This study was carried out to develop an accurate and reliable method for the identification and authentication of species or subspecies of antlers using DNA sequence analysis and comparison of mitochondrial cytochrome band D-loop region genes among antlers of five deer species, Cervus elaphus sibericus, Cervus elaphus canadensis, Cervus nippon, Cervus elaphus bactrianus and Rangifer tarandus. A variable region of cytochrome band D-loop genes was amplified using PCR with specifically designed primers and sequenced directly. The cytochrome band D-loop region genes showed different DNA sequences between the species of antlers and thus it is possible to differentiate between species on the basis of sequence variation. To distinguish between reindeer (Rangifer tarandus) antlers and other deer antlers, PCR amplicons of the cytochrome b gene were digested with the restriction enzymes NlaIV and TaqI, respectively, which generates a species-specific DNA profile of the reindeer. In addition, samples of 32 sliced antlers labeled Cervus elaphus sibericus from commercial markets were collected randomly and the mt DNA D-loop region of these antler samples was sequenced. Among the antler samples investigated, only 62.5% were from Cervus elaphus sibericus, and others were from Cervus elaphus bactrianus (25.0%), elk (Cervus elaphus canadensis) and reindeer (Rangifer tarandus). Our results suggest that DNA sequencing of mt DNA and PCR-RFLP methods using NlaIV and TaqI enzymes are useful for the identification and discrimination of deer antler species by routine analysis.

• The Korean Journal of Malacology
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• v.12 no.2
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• pp.85-90
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• 1996

3종의 복족류(Rapana venosa, Reishia bronni, Anthosiphonaria sirius)와 1종의 다판류, Lepidosona(Lepidosona) coreanica에 대한 18S ribosomal DNA의 염기서열을 밝히고 이들을 이미 보고된 18종의 이매패류, 2종의 복족류 그리고 1종의 다판류의 염기서열과 비교분석하였다. 그 셜과 복족류는 V4 region에서 다른 연체동물과 구별되는 독특한 inseerted sequinces를 가지고 있었으며, V2 region에서 복족류(Prosobranchia와 Pulmonata)와 이매패류(Pteriomorphia 와Heteerodonta) 각각의 두 아강들이 서로 다른 특징적인 insertions 또는 deletions으로 구분되었다.

• Journal of the Korean Crystal Growth and Crystal Technology
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• v.8 no.3
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• pp.431-434
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• 1998

Layered basic copper acetate, $Cu(OH)(CH_3COO){cdot}H_2O$ was synthesized. Intercalation compounds of alkyl sulfonates into layered basic copper acetate have been synthesized via anionic exchange. From the X-ray diffraction data and the alkyl sulfonate size, the orientation of the intercalated alkyl sulfonate into layered basic copper acetate was determined.

• Proceedings of the Korean Nuclear Society Conference
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• 1998.05b
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• pp.84-89
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• 1998

Alloy 600 및 alloy 690과 Ni-8Cr-lOFe 합금 등의 응력부식(stress corrosion cracking, SCC) 거동을 고온의 염기성 분위기에서 C-ring 시편을 사용하여 연구하였다. Alloy 600과 alloy 690을 여러 조건에서 열처리하여 etching한 후 탄화물의 분포와 입계 주변의 Cr고갈 정도 등의 미세조직을 광학현미경과 주사 전자현미경(SEM)으로 관찰하였다. 이들 재료에 대한 SCC 시험을 315$^{\circ}C$의 40% NaOH 수용액에서 일정한 부하전위(부식전위 + 200㎷)를 가하면서 수행하였으며, 동일 조건에서의 분극거동도 측정하였다. Alloy 600 MA(mill anneal) 및 TT(thermal treatment)의 SCC 저항성은 alloy 690 TT와 Ni-8Cr-10Fe SA(solution anneal)보다 낮았다. Alloy 600 TT 재료는 alloy 600 MA 및 SA 재료에 비해 SCC 저항성이 더 컸다. 고용 탄소농도는 alloy 600의 SCC 저항성에 큰 영향을 주지 못했다. 대부분의 Alloy 600은 균열전파 입계균열을 보였으나, 일부에서는 입계 및 입내 혼합양상(mixed mode cracking)을 보였다. 염기성 분위기에서 Ni기 합금의 SCC 거동을 미세조직, 분극거동의 관점에서 고찰하였다.

• The Microorganisms and Industry
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• v.14 no.1
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• pp.22-28
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• 1988

DNA 클로닝과 조작기술의 발전은 어떤 유전자의 특정한 위치에 선택적으로 돌연변이를 도입할 수 있는 site-specific mutagenesis 기술을 창출해 내었다. 이 기술로 DAN 염기의 치환, 결실, 삽입등을 클론된 유전자에 직접 도입할 수가 있게 되어 생체의 유전자 조작이나 유전자의 산물인 단백질의 구조와 기능을 의도적으로 변화시키는 protein engineering에 광범위하게 이용되고 있다. Protein engineering은 주로 단백질의 촉매 및 생리활성의 증가, 효소의 특성및 기질 특이성의 변화, 단백질 구조의 안정화 및 내염성 증가, 분자량의 감소, 효소및 생리활성 단백질의 구조의 안정화및 내열성 증가 등에 활용되고 있으며 산업적 유용성이 큰새로운 단백질의 창조에도 기여할 것으로 기대를 모으고 있다. Site-specific mutagenesis 기술로 현재 가장 널리 이용되는 것이 in vitro상에서 수행하는 oligonucleotide-directed site specific mutagenesis이다. 이 방법은 생화학적으로 합성한 특정한 염기서열을 가진 oligonucleotide들을 일종의 mutagen으로 사용하거나 효소적 DNA 합성을 위한 primer로 사용하여 클론된 DNA의 염기서열을 선택적으로 개조하거나 혹은 다른 조작을 하는 것이다. 여기서는 돌연변이율을 높이는 여러가지 개량된 방법들이 나왔으며 그중의 몇가지를 소개하였다.

• Proceedings of the KAIS Fall Conference
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• 2007.05a
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• pp.270-272
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• 2007

본 연구는 서산 6쪽 마늘로부터 완전장 유전자 은행의 제작과 이를 통해서 확보된 1,000여개 재조합 클론에 대한 염기서열 결과를 web-based database를 통한 상동성 분석으로 부터 서산 마늘의 발현 유전자에 대한 생물정보학적 분석에 관해 것이며 본 연구로 부터 마늘의 대표적 생리활성 물질인 allicin의 생성에 관여하는 효소인 allinase의 cDNA를 클로닝 및 완전 염기서열을 해석하였으며 allinase 유전자의 genomic structure 에 대한 일부의 결과를 확보하였다. 또한 다양한 생물종에서 연구 되어지고 있는 생리활성 단백질인 lectin 유전자 cDNA를 클로닝하여 완전 염기서멸을 분석하고, 6xHis Tag올 통한 재조합 단백질을 대장균에서 E.coli에서 발현시켰다.

• Proceedings of the Membrane Society of Korea Conference
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• 1996.10a
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• pp.8-11
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• 1996

전기투석은 역삼투압, 한외여과와 함께 가장 많이 이용되고 막공정 중의 하나이다. 전기투석은 다른 막공정과 같이 막의 선택성에 의한 분리조작이며 병렬식 배열에 의한 막의 이용이 가능하고 막오염 현상이 있으며 따라서 막-유체간의 접촉에 대한 제어가 필요하다. 전기투석은 운전목적에 따라 desalting electrodialysis(ED)와 water-splitting electrodiaiysis(WSED)로 구분할 수 있다. Desalting electrodialysis는 고전적 의미의 탈염을 위한 전기투석공정이며 WSED는 bipolar membrane을 이용하여 염을 산과 염기로 분리시키는 기능을 갖는 전기투석 공정을 말한다. WSED는 전기적으로 물을 분리한다는 의미로서 Electrohydrolysis로 불리기도 한다. WSED의 기본원리는 bipolar membrane의 양쪽면에서 수소이옹과 수산이온을 발생시켜 산 또는 염기용액으로 전달하고 bipolar membrane에 접하고 있는 양이온 또는 음이온 교환막에서는 각 용액의 전기적 중성을 유지하기 위해 대응하는 이온을 투과시키는 것이다. WSED는 염으로부터 산 염기제조 뿐만아니라 염의 형태로 생성되는 유기산, 아미노산 등 발효생성물의 회수 또는 acidification에 이용되고 있다.