• Title/Summary/Keyword: 연어추출

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DNA Heteropolymorphism of Chum Salmon Detected by Denaturing Gradient Gel Electrophoresis and Real Time PCR (Denaturing gradient gel electrophoresis와 real time PCR 방법을 이용한 연어 유전자들의 DNA 이형 다양성 검색)

  • Ham Seung Hub;Lee Suk Keun;Han Hyon Sob;Jin Deuk Hee
    • Korean Journal of Fisheries and Aquatic Sciences
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    • v.35 no.5
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    • pp.490-496
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    • 2002
  • In order to detect the DNA heteropolymorphism of chum salmon, selected essential genes were examined in different regional chum salmons, i.e., Korean, Japanese and American by denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) and real time PCR methods. From the promoter regions and introns of growth hormone, mtDNA NDI region, D-loop region, IGF-I, histone H3 and MCH2 several representative primer pairs were obtained and employed for the DGGE with the PCR products from the genomic DNAs of the different regional chum salmons. mtDNA NDI, D-loop region and IGE-I genes showed marked heteropolymorphism between Korean and American chum salmons. Intron C of growth hormone also showed a heteropolymorphism between Korean and Japanese chum salmons. Whereas heteropolnnorphism of histone liH and MCH2 genes was detected among in Korean, Japanese and Asnerican chum salmons in the examined region. The real time PCR disclosed the characteristic incremental production of target DNAs dependent on the heteropolymorphic conditions of genomic DNAa of chum salmons, thus the different regional chum salmons could be grouped by the variable incremental curies. Although the DGGE and real time PCR did not produce the identical results in this study, we suggest that the DGGE and real time PCR could be used for the primary screening of the DNA heteropolymorphism of different animal genome.

열목어 생식선자극호르몬의 cDNA cloning 및 CHO 세포를 이용한 발현검토

  • 최은주;손영창
    • Proceedings of the Korean Aquaculture Society Conference
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    • 2003.10a
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    • pp.21-21
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    • 2003
  • 경골어류의 뇌하수체에서는 두 종류의 생식선자극호르몬 (FSH, LH)이 생산되며, 이 호르몬들은 공통적인 α 쇄와 특이적인 β 쇄를 가진다. 연어과 어종들에서, FSH는 난황형성과 정자형성의 역할을 하며, LH는 배우자의 최종성숙을 조절한다. 냉수성 고유어종인 열목어 (Brachymystax lenok)의 멸종을 방지하고 종묘생산을 원활히 하기 위하여 먼저 열목어의 GTHα, FSHβ 및 LHβ 쇄를 cloning하여 염기서열을 결정하였다. 열목어 GTHα, FSHβ 및 LHβ의 cDNA는 산천어의 해당 cDNA와 높은 상동성 (각각 84, 95, 98%)을 보였다. 다음으로 기능적인 생식선자극호르몬을 제작하기 위해서 2개의 쇄를 single-strand로 연결하여 진핵세포를 숙주로하는 시스템에서 생식선자극호르몬을 생산할 수 있는 구조체인 FSHβ-GTHα (235 amino acids) 와 LHβ-GTHα (240 amino acids)를 각각 재조합하였다. 또한 각각의 융합단백질 생산용 구조체의 3'-말단에는 단백질추출이 용이하도록 histidine×6 구조를 첨가하였다. 이상의 단일쇄 FSH와 LH 유전자재조합 산물을 포유동물 유래의 세포 (CHO-K1)에 liposome chemical을 사용하여 유전자도입 후 세포에서 분비되는 단백질을 모니터링하였다. 배지를 부분정제한 후 SDS-PACE로 조사한 결과, LH 재조합 유전자를 도입한 후 48-60 시간째에 약 25 kDa의 단백질로서 관찰되었다. 현재 FSH 재조합 유전자에 대해서도 조사중이며, 향후 이를 재료로 하여 기능형 생식선자극호르몬을 생산하고 추출하기 위한 연구가 계속적으로 수행 될 것이다.

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Hybrid POS Tagging with generalized unknown word handling and post error-correction rules (일반화된 미등록어 처리와 오류 수정규칙을 이용한 혼합형 품사태깅)

  • Cha, Jeong-Won;Lee, Won-Il;Lee, Geun-Bae;Lee, Jong-Hyeok
    • Annual Conference on Human and Language Technology
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    • 1997.10a
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    • pp.88-93
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    • 1997
  • 본 논문에서는 품사 태깅을 위해 여러 통계 모델을 실험을 통하여 비교하였으며 이를 토대로 통계적 모델을 구성하였다. 형태소 패턴 사전을 이용하여 미등록어의 위치와 개수에 관계없는 일반적인 방법의 미등록어 처리 방법을 개발하고 통계모델이 가지는 단점을 보완할 수 있는 오류 수정 규칙을 함께 이용하여 혼합형 품사 태깅 시스템인 $POSTAG^{i}$를 개발하였다. 미등록어를 추정하는 형태소 패턴 사전은 한국어 음절 정보와 용언의 불규칙 정보를 이용하여 구성하고 다어절어 사전을 이용하여 여러 어절에 걸쳐 나타나는 연어를 효과적으로 처리하면서 전체적인 태깅 정확도를 개선할 수 있다. 또 오류 수정 규칙은 Brill이 제안한 학습을 통하여 자동으로 얻어진다. 오류 수정 규칙의 자동 추출시에 몇 가지의 휴리스틱을 사용하여 보다 우수하고 일반적인 규clr을 추출할 수 있게 하였다. 10만의 형태소 품사 말뭉치로 학습하고 학습에 참여하지 않은 2만 5천여 형태소로 실험하여 97.28%의 정확도를 보였다.

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Efficiency of PDNR (Polydeoxyribonucleotide) extraction from various plant species and its in vitro wound healing activity (다양한 식물에서의 PDRN(Polydeoxyribonucleotide) 추출 수율 비교 및 상처치유 효능 분석)

  • Song, Mi-Hee;Choi, Moon-Hyeok;Jeong, Jin-Hyoung;Lee, Sang-Sik;Jeong, Woo-Young
    • The Journal of Korea Institute of Information, Electronics, and Communication Technology
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    • v.15 no.5
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    • pp.387-395
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    • 2022
  • PDRN (Polydeoxyribonucleotide) is a DNA-derived polymer that promotes self-renewal of damaged cells and tissues as a tissue regeneration active material. PDRN is a DNA fragment cut into small sizes by various physical or chemical methods. When administered to the body, PDRN binds and stimulates the adenosine A2A receptor on the surface of tissue cells to promote cell regeneration, accelerate wound healing, and reduce pain. Although PDRN is prepared from testis or semen of fish in most cass, PDRN extraction from various plants species was performed in the present study. Among 7 tested plant species, the highest DNA yield and purity was obtained form mugwort (Chrysanthemum coronarium, C.c), followed by broccoli (Brassica oleracea, B.o). Then, we evaluated the in vitro wound healing capacity of PDRNs prepared from these two selected plants. PDRN from C.c and B.o. significantly stimulated the wound healing process at ㎍/ml range. The present study suggests that PDRN from plant species can be an effective alternative to PDRN from marine organism.

Improvement in the Fish Odor of Extracts Obtained from Salmon Frame using the Maillard Reaction Treated at High Temperature and Pressure (Maillard 반응에 의한 고온가압처리 연어 frame 추출물의 비린내 개선)

  • JI, Seong-Gil;Koo, Jae-Geun;Kwon, Jae-Seok;Han, Byung-Wook;Kim, Hyung-Jun;Heu, Min-Soo;Kim, Jin-Soo
    • Korean Journal of Fisheries and Aquatic Sciences
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    • v.42 no.4
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    • pp.316-321
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    • 2009
  • This study was conducted to improve the fish odor of extracts obtained from salmon frame. Salmon frame extracts were prepared using four kinds of pretreated salmon frame (salmon frame soaked in soybean milk and fried salmon frame) or containing additives (cystine and xylose-added salmon frame, and methionine and xylose-added salmon frame). Among the extracts prepared in this study, extracts containing cystine and xylose had the highest volatile component intensity and odor sensory score. These suggested that the fish odor of salmon frame extracts can be reduced by adding cystine and xylose before extraction.

Preparation Conditions of Extracts from Salmon Frame using an Autoclave (고온가압에 의한 연어 frame 추출물의 제조조건)

  • JI, Seong-Gil;Koo, Jae-Geun;Kwon, Jae-Seok;Han, Byung-Wook;Kim, Hyung-Jun;Heu, Min-Soo;Kim, Jin-Soo
    • Korean Journal of Fisheries and Aquatic Sciences
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    • v.42 no.4
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    • pp.307-315
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    • 2009
  • This study was conducted to investigate optimal conditions for preparation of extracts from salmon frame using an autoclave. According to the results of various extraction conditions (extraction method, extraction time, volume and pH of extraction solution, and necessity of re-extracting), higher quality extracts could be prepared by adding salmon frame into 3 times (vol/wt) of water to raw material, and then autoclaving for 4 hrs before filtering extracts with cheese cloth. For efficient use as basic materials of liquid or powder Gomtang, however, fish odor of the extracts prepared under optimal condition should be improved.

Antimicrobial and Antioxidant Activity of Protamine Prepared from Salmon Sperm (연어정자로부터 제조된 프로타민의 항균성 및 항산화성)

  • Joo, Dong-Sik;Cho, Soon-Yeong;Kang, Hyun-Joo;Jin, Deok-Hee;Lee, Chang-Ho
    • Korean Journal of Food Science and Technology
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    • v.32 no.4
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    • pp.902-907
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    • 2000
  • Protamine-strong basic protein was prepared from salmon(chum salmon, Oncorhynchus keta) sperm by several pretreatment method. And there were determined yield, amino acid composition, antimicrobial and antioxidant activity of protamine on each pretreatment condition. The yield of protamine was different according to pretreatment, and ultrasonicating, homogenizing and microwaving pretreatment were about 16.0%, 15.5% and 10%, respectively. The main amino acid of P60(microwaving pretreatment for 10 min at $80^{\circ}C$) and UU6(ultrasonicating pretreatment for 60 min at $20^{\circ}C$) were arginine, proline and tryptophan, and arginine content of P60 and UU6 were 61%, 53%, respectively. On the other hand, main amino acid of M(homogenizing pretreatment by mixer) were methionine, proline and arginine, the content were 34%, 28% and 11%, respectively. Also MC(homogenizing pretreatment with $H_{2}SO_{4}$ soln. by mixer) was very different with P60, UU6 and M, the content of MC were proline 44.8% and arginine 39.7%. Prepared protamines showed antimicrobial activity to several gram(+) and gram(-) strain. In particular, the UU6 and P60 protamine has strong antimicrobial activity to Bacillus subtilis and Escherichia coli, and the activity was increased with concentration increasing. Regardless of pretreatment method, all protamine showed antioxidant activity and the $EDA_{50}$ of P60, UU6, M and MC were $101\;{\mu}g/mL$, $410\;{\mu}g/mL$, $523\;{\mu}g/mL$ and $490\;{\mu}g/mL$, respectively.

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Development of Subcategorization Dictionary for the Disambiguation Korean Language Analysis (한국어 분석의 중의성 해소를 위한 하위범주화 사전 구축)

  • Lee, Su-Seon;Park, Hyun-Jae;Woo, Yo-Seop
    • Annual Conference on Human and Language Technology
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    • 1999.10e
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    • pp.257-264
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    • 1999
  • 자연언어 처리에 있어 문장의 성분 구조를 파악하는 통사적 해석에서는 애매성 있는 결과가 많이 생성된다. 한국어의 경우 어순 등의 통사적 특성뿐 아니라 상황과 의미, 문맥이 문장의 분석에 더 중요한 역할을 하기 때문에 문맥 자유 문법에 의한 접근 방법만으로는 중의적 구조의 해결이 어렵다. 이는 또한 의미 분석시 애매성을 증가시키는 원인이 된다. 이러한 통사적, 의미적 중의성 해결을 위해 용언 중심의 하위범주화 사전을 구축하였다. 본 논문에서는 용언에 따라 제한될 수 있는 하위범주 패턴을 정의하고 패턴에 따라 하위범주 사전을 구축하였다. 하위범주화 사전에는 명사의 시소러스와 정합하여 보어를 선택 제한(Selectional Restriction)할 수 있도록 용언과 명사와의 의미적 연어 관계에 따라 의미마커를 부여했다. 말뭉치를 통해 수집된 용언 12,000여개를 대상으로 25,000여개의 하위범주 패턴을 구축하였고 이렇게 구축한 하위범주화 사전이 120,000여 명사에 대한 의미를 갖고 있는 계층 시소러스 의미 사전과 연동하도록 하였다. 또한 논문에서 구현된 하위범주화 사전이 구문과 어휘의 중의성을 어느 정도 해소하는지 확인하기 위해 반자동적으로 의미 태깅(Sense Tagging)된 2만여 문장의 말뭉치를 통해 검증 작업을 수행하고, 의존관계와 어휘의 의미를 포함하고 있는 말뭉치에 하위범주 패턴이 어느정도 정합되는지를 분석하여, 하위범주 패턴과 말뭉치의 의존관계만 일치하는 경우와 어휘의 의미까지 일치하는 경우에 대해 평가한다. 이 과정에서 하위범주 패턴에 대한 빈도 정보나, 연어 정보를 수집하여 데이터베이스에 포함시키고, 각 의미역과 용언의 통계적 공기 정보 등을 추출하는 방법도 제시하고자 한다.을 입증하였다.적응에 문제점을 가지기도 하였다. 본 연구에서는 그 동안 계속되어 온 한글과 한잔의 사용에 관한 논쟁을 언어심리학적인 연구 방법을 통해 조사하였다. 즉, 글을 읽는 속도, 글의 의미를 얼마나 정확하게 이해했는지, 어느 것이 더 기억에 오래 남는지를 측정하여 어느 쪽의 입장이 옮은 지를 판단하는 것이다. 실험 결과는 문장을 읽는 시간에서는 한글 전용문인 경우에 월등히 빨랐다. 그러나. 내용에 대한 기억 검사에서는 국한 혼용 조건에서 더 우수하였다. 반면에, 이해력 검사에서는 천장 효과(Ceiling effect)로 두 조건간에 차이가 없었다. 따라서, 본 실험 결과에 따르면, 글의 읽기 속도가 중요한 문서에서는 한글 전용이 좋은 반면에 글의 내용 기억이 강조되는 경우에는 한자를 혼용하는 것이 더 효율적이다.이 높은 활성을 보였다. 7. 이상을 종합하여 볼 때 고구마 끝순에는 페놀화합물이 다량 함유되어 있어 높은 항산화 활성을 가지며, 아질산염소거능 및 ACE저해활성과 같은 생리적 효과도 높아 기능성 채소로 이용하기에 충분한 가치가 있다고 판단된다.등의 관련 질환의 예방, 치료용 의약품 개발과 기능성 식품에 효과적으로 이용될 수 있음을 시사한다.tall fescue 23%, Kentucky bluegrass 6%, perennial ryegrass 8%) 및 white clover 23%를 유지하였다. 이상의 결과를 종합할 때, 초종과 파종비율에 따른 혼파초지의 건물수량과 사료가치의 차이를 확인할 수 있었으며, 레드 클로버 + 혼파 초지가 건물수량과 사료가치를 높이는데 효과적이었다.\ell}$ 이었으며 , yeast extract 첨가(添加)하여 배양시(培養時)는 yeast extract

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Determination of polycyclic aromatic hydrocarbons in processed foods (가공식품 중 다환방향족탄화수소 분석)

  • Hu, Soo-Jung;Jin, Sun-Hee;Lee, Kwang-Ho;Choi, Dong-Mi
    • Analytical Science and Technology
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    • v.23 no.2
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    • pp.196-204
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    • 2010
  • In this study, the following concentrations of some PAHs (Polycyclic Aromatic Hydrocarbons) were investigated; [benzo(a)anthracene, chrysene, benzo(b)fluoranthene, benzo(k)fluoranthene, benzo(a)pyrene, dibenzo(a,h)anthracene, benzo(g,h,i)perylene, indeno(1,2,3-c,d)pyrene] in processed foods (n=165) and cooked meats (n=45) and established the analytical method by characteristics of processed foods. The methodology involved extraction (alkali digestion, liquid-liquid extraction, microwave extraction), clean-up on Sep-Pak Florisil Cartridges and determination by HPLC/FLD (High Performance Liquid Chromatography/Fluorescence Detector). The recovery of overall method for 8 PAHs spiked into these products ranged from 92 to 103%. The mean level of detected foods was found to be benzo(b)fluoranthene $0.9\;{\mu}g/kg$ in smoked salmon, benzo(b)fluoranthene $1.0\;{\mu}g/kg$, benzo(k)fluoranthene $0.3\;{\mu}g/kg$, benzo(a)pyrene $0.9\;{\mu}g/kg$ in dried banana, benzo(b)fluoranthene $0.2\;{\mu}g/kg$, benzo(k)fluoranthene $0.1\;{\mu}g/kg$, benzo(a)pyrene $0.2\;{\mu}g/kg$ in smoked chicken, benzo(b)fluoranthene $1.3\;{\mu}g/kg$, benzo(k)fluoranthene $0.3\;{\mu}g/kg$, benzo(a)pyrene $0.9\;{\mu}g/kg$ in charcoal grilled pork, respectively.

Antimicrobial Activity and Characteristics of Protamine Extracted from Tuna Spermary (참치백자로부터 추출한 Protamine 의 특성 및 항균활성)

  • Jeon, Tae-Woog;Kim, Jin-Ho;Park, Ki-Moon
    • Korean Journal of Food Science and Technology
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    • v.31 no.2
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    • pp.540-546
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    • 1999
  • The purpose of this study was to investigate the antimicrobial effects and characteristics of protamine extracted from spermary of tuna. The result of amino acids analysis showed that the contents of arginine were 46%. It was 10% lower when compared to standard protamine (SP: Asama kasei LTD, Japan). Also, there were significant difference in the contents of proline adn glycine. The average molecular weights of main protein in TP were 13,400 Da, whereas those in SP were 11,300 Da and 2,600 Da. To increase antimicrobial activities of TP, pepsin or trypsin was treated at $37^{\circ}C$. After TP was hydrolyzed with pepsin (pepsin hydrolyzed protamine: PHP) for 4hrs, the average molecular weights of the main protein were 11,300 Da and 3,900 Da, and the antimicrobial activities were significantly increased compared to TP. After TP was hydrolyzed with trypsin (trypsin hydrolyzed protamine: THP) for more than 10 min, the average molecular weights of the main protein were below 2,500 Da. PHP had higher antimicrobial effects on some gram positive bacteria (Staphylococcus aureus, Lactobacillus helveticus, Lactobacillus plantarum) than SP. However, THP had no antimicrobial activities. When TP was hydrolyzed with pepsin (PHP), its antimicrobial activities increased in the same level with those of SP, and this increase might be resulted rather from the changes of molecular weights of the main protein than from the contents of arginine in protamine.

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