Proceedings of the Korean Society for Bioinformatics Conference
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2006.02a
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pp.116-123
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2006
생물체의 cDNA를 유리기판위에 고밀도로 첨착 시킨 유전자 칩과 정량적인 방법으로 개별 유전자 발현을 진단 가능한 Real- time PCR (실시간 고분자중합연쇄반응 기술) 기법은 첨단 의학분야와 신약개발 및 독성유전체 연구분야에 활발히 도입되고 있는 기술이다. 본 발표의 첫 번째 부분에서는 유전자칩 에서 얻어진 유전자 발현패턴분석에 기반한 바이오마커 선정 및 real time PCR에 의한 확증 관련 기술 과 유전자칩에서 얻어지는 수많은 데이터를 재정렬 및 다양한 분석기법과 display기술을 활용하여 광범위한 화학물질에 대한 독성효과 분석을 가능하게 해주며, 특정 독성물질에 대한 관련유전자 그룹 발견 및 독성영향에 따른 분류방법에 관한 결과를 발표할 것이다. 또한 바이오마커 활용의 하나로 박테리아세포 기반 바이오센서 제작및 세포칩 개발등에 대한 결과도 추가될 것이다. 두 번째 부분에서는 non-model organism(유전체정보가 확보되지 않은 생물체)인 송사리를 이용하여 새로운 2K 유전자칩을 개발하고, 여기서 각종 화학물질에 대하여 얻어진 수많은 유전자칩 분석 데이타를 활용하여 각각의 화학물질이 보여주는 독성효과를 매우 효과적이고 쉽게 이해할 수 있는 display기술을 개발, 적용함으로써 유전자칩 발현에 기반한 화학물질 독성 screening 및 specificity discrimination을 가능케 하는 예가 발표될 것이다. 이 연구에서 개발한 송사리 유전자칩은 간조직의 RNA를 직접 cDNA화 하는 방식을 취하고 있어 전체 송사리의 유전정보를 필요로 하지 않아 비용 및 효율에서 전체 송사리의 유전정보를 얻는 비용과 노력을 취하지 않고 간에서 발생하는 독성학적 영향 및 유전자의 발현정도를 정밀하고 효율적인 방법으로 얻어 낸다. 현재 2000여개의 cDNA유전자중 50%이상의 유전자가 17베타에스트라디올, 페놀, 노닐페놀, 비스페놀, 감마레이조사, 잔류약품중 이보프란, 다이클로펜악, 농약중의 파라???R, 돌연변이 유발물질 중의 이티비알, 금속류중의 카드뮴을 통해 발현양상과 특정 캐미칼별 발현 특이성이 조사되었고, 이들 유전자는 염기서열 분석을 통해 염기서열이 분석되었으며, 미국 NCBI의 유전자 은행과의 비교를 통해 일부유전자는 새로운 유전자로 밝혀지고 있다. 또한 이 발표에서는 소염진통제계열 의약품인 dichlofenac 이 송사리의 각종 조직에 미치는 독성영향을 Real-time PCR을 이용하여 대표적 스트레스 유전자의 발현에 미치는 영향에 대한 분석 예가 발표될 것이다.
Korean Journal of Construction Engineering and Management
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v.15
no.4
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pp.139-149
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2014
Lifeline service disruptions can have significant impacts on local community in the aftermath natural disaster. Although effective restoration strategies with accurate damage assessment are required, the internal complexity of lifeline networks and their interdependency makes the understanding restoration process of lifeline systems a difficult issue. Additionally, the limitations of previous research relating the influence assessment of lifeline to community disaster resilience, highlight the need for understanding of lifeline networks. Therefore, this paper presents an agent-based model to discover emergent behavior and evaluate the interdependency and resiliency in lifeline networks. This research will provide basic guideline of resource allocation in order to mitigate cascading failures of the post disaster restoration processes.
Kim, Bohoon;Kim, Minsung;Yang, Seungho;Oh, Sean;Kim, Jinseok;Choi, Sangkyung;Yoh, Jai-Ick
Journal of the Korean Society of Propulsion Engineers
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v.18
no.5
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pp.1-11
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2014
Sympathetic detonation (SD) of high explosives occurs when a detonating donor initiates neighboring acceptors. The present study focuses on the hydrodynamic simulation of one-on-one sympathetic detonation of 155 mm charge filled with PBXN-109. Both unbuffered and buffered SD configurations are performed while changing the distance between each charge, in order to investigate the detonation sensitivity to a donor initiation. The cause of a SD is by a shock impact for the unbuffered case at a close range, while at a distant range, blast fragment penetration is the primary cause. The buffers can reduce the incident sensitivity to a SD by reducing the strengths of shock wave and impinging fragments.
The suppression mechanisms of carbon dioxide ($CO_2$) as a representative fire suppression agent were revisited using a counterflow diffusion flame which could be applied the concept of a local application system. To end this, the low strain rate $CH_4$/air counterflow diffusions with $CO_2$ addition in either fuel or oxidizer stream were examined numerically using detailed-kinetic chemistry. Radiative heat loss due to radiating gas species including $CO_2$ added was considered by the optically thin model (OTM). As a result, the critical $CO_2$ volume fractions in the oxidizer stream required to extinguish the flame were in good agreement with the experimental data reported in the literature, while somewhat under-prediction was observed with $CO_2$ added in the fuel stream. The surrogate agents were adopted to estimate the quantitative contribution with changing in global strain rate ($a_g$) on the flame extinguishment among pure dilution effect, thermal effects including radiation heat loss and chemical effect due to the $CO_2$ fire suppression agent.
Due to the lack of national consensus on the importance and value of the character industry and the lack of recognition of value as a national strategic industry, the development of the character industry is experiencing great difficulties. The purpose of this study is to analyze the economic effects of character industry in China to help establish policies and strategies for the character industry in the future. To this end, this study utilized the China 2017 Industrial Association Table. The analysis results are as follows. China's character industry has a lower production inducement effect than other industries with a column total of 3.45514, and a row total of 1.30015. This shows that China's character industry is still being produced by small and medium-sized companies with a low equity ratio. Second, in the character industry, the index of the sensitivity of dispersion representing the forward linkage effect is 0.01426 and the impact factor is 0.03790, which are all less than 1. Therefore, it can be said to be the final demand manufacturing type.Third, in China character industry's income induction is 0.47690 and the production tax induction effect is -0.04912. It can be seen that the character industry has less income induction and tax burden generated every time the final demand increases by one unit in the entire industry than in other industries.Despite the quantitative growth of the character industry in China, the impact on other industries is low and it is not playing a role as an income-generating industry. Structural improvement is needed for the qualitative development of China's character industry.
Jeon, Se Yun;Choi, Suk Joo;Kim, Yong Bae;Nam, Hae Seon;Park, Kwi Sung;Baek, Kyung Ah;Park, Joon Soo
Clinical and Experimental Pediatrics
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v.49
no.11
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pp.1186-1193
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2006
Purpose : Enterovirus infection is a type of viral infection that occurs relatively frequently in children during summer. It has clinical symptoms of non-specific fever, aseptic encephalomeningitis, gastrointestinal diseases, skin rash and, hand-foot-mouth disease. However, it can also occcaisionally, result in fatal symptoms like myocarditis, epicardial inflammation, transverse myelitis, quadriplegia and etc. There have been epidemic enterovirus studies, but not in the Chungnam area. Therefore, we undertook this study in order to comprehend the cause viruses in this area. Methods: We enlisted 157 children hospitalized with enteroviral infections at Soonchunhyang University hospital in Cheonan between May and August 2005. Cerebrospinal fluids or feces were collected during the acute phase after hospitalization, and observed the cytopathic effects caused by enterovirus and using reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). Results : The number of children hospitalized due to possible enteroviral infection during the period of study was 157. The number of children who tested positive with the reverse transcription polymerase chain reaction totalled 32 cases (20.4 percent). Among the children with entroviral diseases, 20 were male and 12 were female, thus the sex ratio of male to female was 1.67:1. Their clinical symptoms included fever most frequently (93.7 percent), was followed by headaches (90.0 percent), meningeal irritation signs (65.0 percent), and abdominal pain (30.0 percent). As for the type of isolated enterovirus, there were 17 cases of echovirus 18 and 6 cases of coxsackievirus B5. Furthermore, there were 2 cases of echovirus 9, 1 case of coxsackievirus A6 and coxsackievirus B3, respectively. But 5 cases were not determined by genotype. Conclusion : Echovirus 18 is circulating in Korea. We reported on identified enteroviruses, including echovirus 18, using RT-PCR in the Chungnam area during the summer of 2005.
Kim, Seung Yun;Lee, Ko Eun;Kang, Su Young;Choi, Eun Hwa;Lee, Hoan Jong
Pediatric Infection and Vaccine
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v.22
no.3
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pp.172-177
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2015
Purpose: This study aimed to analyze the epidemic period of RSV infection and evaluate the appropriate time of palivizumab immunoprophylaxis. Methods: From January 1991 to July 2012, nasopharyngeal (NP) aspirates were obtained from patients who visited Seoul National University Children's Hospital for respiratory symptoms. NP samples were used to detect respiratory viruses. Among them, we analyzed the positive number and detection rate of RSV infection in two-week interval. The beginning of RSV season was defined when RSV positive number was more than 4 and RSV detection rate was over 10%. From January 2007 to March 2014, we analyzed the starting time of palivizumab immunoprophylaxis for the infants at high risk. Results: The RSV detection rate was 2,013/21,698 (9.69%) over 22 years. The median RSV season was from $2^{nd}-3^{rd}$ week of October to $1^{st}-2^{nd}$ week of February. The earliest starting week was the 3rd week of July in year 2001, and the latest end week was the 3rd week of May in year 1990. Palivizumab immunoprophylaxis was initiated most frequently at the 3rd week of October (18.7%). However, the percentage of starting palivizumab on the 1st week of September has increased from 3.8% in the year 2007 to 14.1% in 2013. Conclusions: The year to year variability of RSV season exists. The starting time of palivizumab immunoprophylaxis should be adjusted based on the season of RSV epidemic.
In March 2015, The Agency for Cultural Affairs of Japan implemented a project called "Japan Heritage," which aims to promote the unique narratives of cultural properties of the region by branding the locality for revitalization in preparation for the 2020 Tokyo Olympics and Paralympics. This bottom-up approach of cultural policy has been called a "Cool Japan Strategy of Cultural Heritage" in the 21st century, which effectively incorporates local cultural heritage and tourism. However, although a total of 67 Japan Heritage projects have been designated as of December 2018, almost none has been introduced in the academic forum in Korea. On the basis of this background and a lack of academic awareness in Korea on Japan's recent cultural policies, this research aims to focus on the three cases of Gunma Prefecture implemented in local, global, and glocal aspects. To specify, the cases are the "Gunma Silk Heritage" project, implemented in 2011, the "Tomioka Silk Mill and Related Sites" project that was included on the UNESCO World Heritage List in 2014, and "The Best Wife in the World - Silk Story of Gunma," case certified as the first project of "Japan Heritage" launched in 2015. Based on the questionnaire method conducted with the World Heritage Registration Promotion Division in Gunma Prefectural Government, as well as a literature view, the research revealed that the consecutive implementation of a series of cultural heritage projects in Gunma is not coincidental, but rather a strategy aiming to create a synergism where each project complements the others. Moreover, this paper demonstrates that Gunma Prefecture has been utilizing the local silk industry as a tangible and intangible cultural resource in multi-layered heritage projects, resulting in a "spiral synergy effect" and a "chain of the recognition process." In conclusion, it illustrates the recent trend of utilizing cultural heritage in the context of the Cool Japan strategy, which seeks to move away from the administration of maintaining the status quo cultural heritage protection to a proactive one with greater potential growth. This research may thus provide meaningful insight into the utilization of domestic historical and cultural resources as well as related policy-making, in that it will ultimately promote the chain effect of linking the multiple heritage policies and projects at the local, global, and glocal levels.
Journal of the Korea Academia-Industrial cooperation Society
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v.22
no.4
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pp.312-320
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2021
In this study, we aimed to develop a feed additive that can promote the growth of stone flounder (Kareius bicoloratus). To this end, we fermented mealworm medium (5%, w/v) with lactic acid bacteria (LAB) with antibacterial function (HeTm_LpWpPa) and evaluated its efficacy as a feed additive. Fish (approximately 5-6 g) were reared in six completely recirculating tanks (100 fish/tank) for 6 weeks. The total length of fish with and without HeTm_LpWpPa supplementation was 8.26 and 8.42 cm and body weight was 19.71 and 20.28 g, respectively, at 6 weeks. The weight gain of the control and experimental groups was 223.26 % and 248.76 %, respectively. The specific growth rate at 6 weeks was 2.79 % (control) and 2.98% (experimental), and the growth rate of the experimental group was slightly higher (0.19 %) than that of the control group. At the end of the experiment (i.e. 6 weeks), the number of fish below the mean weight in the experimental group was 3 (1 %) and that in the control group was 17 (5.7 %). These results indicate that feed supplementation of 10 % HeTm_LpWpPa could be utilized to promote the growth of flounder in farming.
In this study, the antioxidative effects and component analysis of Polygonum aviculare (P. aviculare) extracts were investigated. The ethyl acetate and the aglycone fraction from P. aviculare extracts were more active than (+)-${\alpha}$-tocopherol and $\small{L}$-ascorbic acid, which are known as strong antioxidants for their antioxidative activity by the DPPH method and chemiluminescence assay. The cellular protective effects of fractions of P. aviculare on the rose-bengal sensitized photohemolysis of human erythrocytes, increased in a concentration dependent manner ($1-10{\mu}l$). In particular, the ethyl acetate fraction at a concentration of $10{\mu}l$ showed the most prominent protective effect among all the extracts (${\tau}_{50}$, 314.70 min). TLC and HPLC chromatogram of the ethyl acetate fraction of P. aviculare extracts revealed 3 main bands (PA8, PA5, PA6) and peaks (peak 1, peak 2, peak 3), which were identified as myricetin-3-O-rhamnoside (myricitrin, PA8, peak 1), quercetin-3-${\alpha}$-rhamnoside (quercitrin, PA6, peak 3) by LC/ESI-MS/MS and $^1H$-NMR respectively. These results indicate that fractions from P. aviculare could be applicable to new functional cosmetics as antioxidants.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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