• Title/Summary/Keyword: 생화학 합성과정

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Prediction and Identification of Biochemical Pathway of Acteoside from Whole Genome Sequences of Abeliophyllum Distichum Nakai, Cultivar Ok Hwang 1ho (미선나무 품종 옥황 1호의 유전체를 활용한 Acteoside 생화학 합성과정 예측 및 확인)

  • Park, Jaeho;Xi, Hong;Han, Jiyun;Lee, Jeongmin;Kim, Yongsung;Lee, Jun-mi;Son, Janghyuk;Ahn, Joungjwa;Jang, Taewon;Choi, Jisoo;Park, Jongsun
    • Journal of Convergence for Information Technology
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    • v.10 no.3
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    • pp.76-91
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    • 2020
  • Whole genome sequence of Abeliophyllum distichum Nakai (Oleaceae) cultivar Ok Hwang 1 Ho, which is Korean endemic species, was recently sequenced to understand its characteristics. Acteoside is one of major useful compounds presenting various activities, and its several proposed biochemical pathways were reviewed and integrated to make precise biochemical pathway. Utilizing MetaPre-AITM which was developed for predicting secondary metabolites based on whole genome with the precise biochemical pathway of acteoside and the InfoBoss Pathway Database, we successfully rescued all enzymes involved in this pathway from the genome sequences, presenting that A. distichum cultivar Ok Hwang 1 Ho may produce acteoside. High-performance liquid chromatography result displayed that callus of A. distichum cultivar Ok Hwang 1 Ho contained acteoside as well as isoacteoside which may be derived from acteoside. Taken together, we successfully showed that MetaPre-AITM can predict secondary metabolite from plant whole genomes. In addition, this method will be efficient to predict secondary metabolites of many plant species because DNA can be analyzed more stability than chemical compounds.

Carbon Monoxide Consumption in Digestate and its Potential Applications (혐기성 소화액에서 일산화탄소 소비특성 분석과 그 활용 방안)

  • Hong, Seong-Gu
    • Journal of The Korean Society of Agricultural Engineers
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    • v.51 no.2
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    • pp.1-6
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    • 2009
  • Acetogen과 같은 일부 혐기성미생물은 소위 acetyl-CoA 경로에 의해 아세트산, 에탄올, 그리고 몇 가지 생화학 물질을 생산한다. 이 경로에서는 일산화탄소를 기질로 이용할 수 있다. 일산화탄소 이외에 수소가 이용될 수 있다. 즉 이들 미생물은 독립영양생물로서 이산화탄소와 태양광에너지를 이용하는 녹색식물과 비유될 수 있으며, 일산화탄소는 탄소원으로서 동시에 에너지원으로서 이용된다. 본 연구에서는 혐기성 소화액 중 아세트산을 생성하는 미생물이 존재한다고 가정하고, 일산화탄소와 수소가 주 가연성분인 합성가스를 공급하면 추가의 메탄이 생성가능성을 평가하였다. 혐기성 소화과정에서 발생되는 메탄은 주로 아세트산으로부터 만들어지므로 일산화탄소를 공급하는 경우 추가로 메탄이 생성될 것으로 추측할 수 있기 때문이다. 이를 확인하기 위하여 현재 운영중인 바이오가스 생산 설비로부터 얻은 혐기성 소화액을 생물반응조에 넣은 후, 합성가스를 순환-공급하여 가스 생산량의 변화 및 조성을 분석하였다. 질소가스를 공급한 대조구와는 달리 일산화탄소 또는 합성가스를 공급한 경우에는 메탄가스가 생산되는 것을 확인하였다. 질소가스를 공급한 대조구와는 달리 일산화탄소 또는 합성가스를 공급한 경우에는 메탄가스가 생산되는 것을 확인하였다. 일산화탄소만을 공급했을 때에는 이산화탄소의 생성으로 가스 생산량이 증가하였으나, 수소가 포함된 합성가스를 공급하였을 때에는 이산화탄소가 탄소원이로 소비되어 가스 저장도 내의 가스량이 감소하는 것을 확인할 수 있었다. 가스화공정에 으해 얻어지는 합성가스는 온도와 가스 조성을 고러할 때, 바이오가스 생산을 위한 혐기성 소화조와 연계하면 소화조의 가온에 필요한 열을 공급할 수 있고 바이오가스 중 이산화탄소 농도를 낮추어 발열량을 개선할 수 있을 것으로 판단된다.

Epoxide Hydrolase-catalyzed Hydrolytic Kinetic Resolution for the Production of Chiral Epoxides (에폭사이드 가수분해효소에 의한 동력학적 가수분해반응을 이용한 광학활성 에폭사이드 생산)

  • 이은열
    • KSBB Journal
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    • v.17 no.4
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    • pp.321-325
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    • 2002
  • Chiral epoxides are valuable intermediates for the asymmetric synthesis of enantiopure bioactive compounds. Microbial epoxide hydrolases (EHs) are newly discovered enzymes and versatile biocatalysts for the preparation of chiral epoxides by enantioselective hydrolysis of cheap and easily available racemic epoxide substrates. EHs are commercially potential biocatalysts due to their characteristics such as high enantioselectivity, cofactor-independent catalysis, and easy-to-Prepare catalysts. In this Paper, recent progresses in biochemistry and molecular biology of EH and developments of novel reaction systems are reviewed to evaluate the commercial feasibility of EH-catalyzed hydrolytic kinetic resolution for the production of chiral epoxides.

Molecular Engineering of Epoxide Hydrolases for Production of Enantiopure Epoxides (분자공학 기반의 광학활성 에폭사이드 제조용 epoxide hydrolase 생촉매 개발)

  • Kim, Hee-Sook;Lee, Eun-Yeol
    • Journal of Life Science
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    • v.16 no.1
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    • pp.168-174
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    • 2006
  • Enantiopure epoxides are valuable intermediates for the asymmetric synthesis of enantiopure bioactive compounds. Microbial epoxide hydrolases (EHs) are versatile biocatalysts for the preparation of enantiopure epoxides by enantioselective hydrolysis of cheap and easily available racemic epoxide substrates. EHs are commercially potential biocatalysts due to their characteristics such as high enantioselectivity, cofactor-independent catalysis, and easy-to-prepare catalysts. In this paper, recent progresses In molecular engineering of EHs are reviewed to evaluate the commercial feasibility of EH-catalyzed hydrolytic kinetic resolution for the production of enantiopure epoxides.