• Proceedings of the Korean Society of Applied Pharmacology
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• 1995.04a
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• pp.61-61
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• 1995

1993년 국내토양으로부터 분리동정된 Streptomyces속 균주중 항종양성이 우수한 균주 3주(DKM104, DKM117, DKM409)를 선정하고 이들을 대량 배양하여 종양억제인자를 분리하고 시험관내 종양세포 독성능 및 생체내 항암활성능과 이들 물질생산과 PLASMID DNA와의 관련성, $LD_{50}$등을 시험하여 새로운 항종양물질의 개발을 목적으로 하였다. 분리선별균주의 배양조건을 확립하였으며 배양여액을 국성이 적은 유기용매로부터 큰쪽으로 단계적으로 유효성분을 추출하여 Gel Chromatography를 이용하여 유효성분을 분획하였다. 시험관내 항종양능 시험은 MTT colorimetric검정법을 이용하여 $IC_{50}$값을 산정하였으며 생체내 항종양능은 마국의 NIC에서 권장하는 tumor panel system에 따랐다. 선정된 균주의 plasmid 분리는 alkalin lysis법을 채택하였으며 agarose gel electrophoresis로 plasmid profile을 시험하였다. Novobiocin등을 이용하여 Curing test를 시행하였고 독성실험은 $LD_{50}$량을 구해 항암효과 측정시에 Maximum dost로 투여하였고 최고용량을 기준으로 일정한 공비를 적응하여 3단계의 투여량을 설정하였다.(중략)

• Journal of Sensor Science and Technology
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• v.14 no.5
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• pp.308-312
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• 2005

We present a microfluidic chip designed for the detection of antibody by using quantum dots fluorescence and a microbead-based assay. A custom designed PDMS microfluidic chip with multi-layer channel is utilized for capturing microbeads; antibody injection into each micro-well; QD injection; and fluorescence detection. The experiment using the fabricated microfluidic chip has been performed on solutions with various concentrations of antibody and has shown correlated fluorescent intensities.

• Proceedings of the KOSOMBE Conference
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• v.1996 no.05
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• pp.65-68
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• 1996

Neural networks are increasingly being used to enhance the classification and recognition powers of data collected from sensor array. This papers reports the effectiveness of multilayer perceptron network based on back-propagation algorithm combined with the outputs from "Electronic Nose" using electrically conducting polymers as sensor materials. Robust performance and classification results are produced with preprocessing method.

• Journal of Biomedical Engineering Research
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• v.14 no.2
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• pp.185-193
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• 1993

In this paper, the peak detection algorithm was developed for the purpose of screening of the target compounds. Algorithm is divided into searching the characteristic ion and peak detection. The heuristic knowledge about analytical chemistry was applied for the searching the characteristic ion. Peak detection was accomplished in comparison with the peak identification strings and pattern strings around the retention time. Pattern strings are composed with the number which generated by pattern identification function. The variables of pattern identification function are the codes which represent the difference of two adjacent abundances Some of the free steroids were selected to demonstrate the proposed algorithm.

• Journal of Biomedical Engineering Research
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• v.21 no.5
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• pp.449-455
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• 2000

순간적으로 승모판에서 혈류가 역류하는 영역을 측정하기 위해서, PISA 방법이 자주 이용되고 있다. 이 방법은 물질보존법칙에 근거하여, 구멍을 통과하는 유체량을 isotach 표면적과 이에 대응하는 속도의 곱으로 구하는 것이다. 이러한 PISA 방법에서 사용되는 유동모델은 반구모델과 비반구모델의 형태인데, 이는 isotach 표면적이 반구이거나 비반구임을 가정하여 계산된 것이다. 이러한 isotach 모델링에서는 isotach의 높이와 폭의 결정이 유체량을 추정하는데 아주 중요한 변수가 된다. 본 연구에서는 in-vitro 칼라 도플러 영상으로부터 PISA 영역을 추정을 위하여 영역기반을 근간으로 하는 비반구모델에 대한 표면적 추정방법을 제안하였다. 이 방법의 타당성을 알아보기 위해 180개의 칼라 도플러 영상에 대해 isotach의 높이와 폭을 추정한 결과, 기존의 에지기반방법이 19개 영상에서 에러를 가지는 반면, 제안한 방법에서는 에러영상이 없음을 알 수 있었다.

• Prospectives of Industrial Chemistry
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• v.22 no.6
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• pp.13-25
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• 2019

건강한 미래, 건강 사회 구현과 함께 질병 진단, 치료, 예방에 대한 관심이 급증하고 있다. 이에 따라 적시적기에 질병을 치료하고 예방하기 위한 건강 검진용 바이오센서 수요가 증가하였고 이에 따라 바이오센서 시장은 전세계적으로 급격히 확장되고 있다. 혈액 샘플을 기반으로 한 검진 방법이 보편적이지만 최근에는 고감도 센서 개발에 따라 소변, 침, 눈물 등과 같은 체액으로도 검진이 가능한 환자 친화적 비침습 센싱 방법도 활발하게 연구되고 있다. 이러한 센서 시장 패러다임의 변화 및 급속한 발전은 마이크로, 나노 재료 제작과 분석 기술 발전으로 체액 내 존재하는 나노 크기의 바이오 마커(단백질, 유전자, 펩타이드, 사이토카인)를 검출하는 소형화된 고감도의 센서를 개발할 수 있게 되었고 그 결과 화학, 물리, 재료, 의약 등 다양한 학문 분야에서 다양한 형태의 센서가 활발히 보고되었다. 본 기고문에서는 바이오센서용 소재 중에서 나노입자에 집중하여 첨단 센서 구현을 위해 사용된 입자의 종류, 센서 내에서의 입자의 역할을 소개하고 나노입자의 광학적, 물리적 특성에 따른 타겟 물질 검출 방법 및 동향에 대해 논의하고자 한다.

• Proceedings of the Korean Vacuum Society Conference
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• 2013.08a
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• pp.294-294
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• 2013

자연계의 많은 생물들은 의사소통이나 분위기 표현, 위장 등을 하기위해 자신의 색을 바꾸는 것으로 알려져 있으며, 현재 많은 연구자들이 이러한 자연 현상으로부터 영감을 받아 생체모방 구조와 메커니즘을 이용한 바이오센서를 개발하고 있다. 하지만 기존의 컬러센서는 수용체 개발에 있어 복잡한 디자인, 어려운 합성 방법 및 낮은 감도와 저선택성 등의 한계점을 가지고 있다. 이에 본 연구에서 우리는 바이러스(M13-박테리오파지)를 기반으로 한 신개념 고감도 고선택성 컬러센서를 개발하고자 한다. 우리가 개발하고자 하는 컬러센서는 자가 조립방법으로 만들어진 나노 구조체로 형성되어 있으며, 다양한 종류의 화학물질이나 오염물질을 감지할 수 있다. 이 컬러센서는 아주 낮은 농도의 휘발성 유기화합물(volatile organic compounds)을 감지해 색변화를 보였으며, 다양한 독성 물질이나 방향족을 가진 화학 물질을 감지할 수 있었다. 따라서 우리가 개발한 컬러 센서는 국가의 안보나 국민의 건강을 증진시키기에 아주 유용할 것으로 보인다.

• Tuberculosis and Respiratory Diseases
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• v.53 no.4
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• pp.409-419
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• 2002

Background : The therapeutic effects of surfactant on acute lung injury derive not only from its recruiting action on collapsed alveoli but also from its anti-inflammatory effects. Pro-apoptotic action on alveolar neutrophils represents one of the important anti-inflammatory mechanisms of surfactant. In the present study, we evaluated the effects of sufactant on the apoptosis of human peripheral and rat alveolar neutrophils. Methods : In the (Ed- the article is not definitely needed but it helps to separate the two prepositions 'in') in vitro study, human neutrophils were collected from healthy volunteers. An equal number of neutrophils ($1{\times}10^6$) (Ed-confirm) was treated with LPS (10, 100, 1000ng/ml), surfactant (10, 100, $1000{\mu}g/ml$), or a combination of LPS (1000ng/ml) and surfactant (10, 100, $1000{\mu}g/ml$). After incubation for 24 hours, the apoptosis of neutrophils was evaluated by Annexin V method. In the in vivo study, induction of acute lung injury in SD rats by intra-tracheal instillation of LPS (5mg/kg) was followed by intra-tracheal administration of either surfactant (30mg/kg) or normal saline (5ml/kg). Tenty-four hours after LPS instillation, alveolar neutrophils were collected and the apoptotic rate was evaluated by Annexin V method. In addition, changes of the respiratory mechanics of rats (respiratory rate, tidal volume, and airway resistance) were evaluated with one chamber body plethysmography before, and 23 hours after, LPS instillation. Results : in the in vitro study, LPS treatment decreased the apoptosis of human peripheral blood neutrophils (control: $47.4{\pm}5.0%$, LPS 10ng/ml; $30.6{\pm}10.8%$, LPS 100ng/ml; $27.5{\pm}9.5%$, LPS 1000ng/ml; $24.4{\pm}7.7%$). The combination of low to moderate doses of surfactant with LPS promoted apoptosis (LPS 1000ng/ml + Surf $10{\mu}g/ml$; $36.6{\pm}11.3%$, LPS 1000ng/ml +Surf $100{\mu}g/ml$; $41.3{\pm}11.2%$). The high dose of surfactant ($1000{\mu}g/ml$) decreased apoptosis ($24.4{\pm}7.7%$) and augmented the anti-apoptotic effect of LPS (LPS 1000ng/ml + Surf $1000P{\mu}g/ml$; $19.8{\pm}5.4%$). In the in vivo study, the apoptotic rate of alveolar neutrophils of surfactant-treated rats was higher than that of normal saline-treated rats ($6.03{\pm}3.36%$ vs. $2.95{\pm}0.58%$). The airway resistance (represented by Penh) of surfactant-treated rats was lower than that of normal saline-treated rats at 23 hours after LPS injury ($2.64{\pm}0.69$ vs. $4.51{\pm}2.24$, p<0.05). Conclusion : Surfactant promotes the apoptosis of human peripheral blood and rat alveolar neutrophils. Pro-apoptotic action on neutrophils represents one of the important anti-inflammatory mechanisms of surfactant.

• Proceedings of the Korea Society of Environmental Biology Conference
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• 2005.12a
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• pp.22-35
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• 2005

내분비계 장애물질 (Endocrine Disruptors: EDs)이란 ‘내분비 기능에 변화를 일으켜, 생체 또는 그 자손의 건강에 위해한 영향을 미치는 외인성 물질’로서 세계야생생물보호기금 (World Wildife Fund: WWF)의 목록에는 67 여종, 일본 후생성에서는 142 여종의 물질을 내분비계 장애물질로 분류하고 있다. 이렇게 분류된 내분비계장애물질 가운데에는 많은 종류의 농약이 포함되어 있으며, 이들이 자연상태계에 미치는 영향에 대한 많은 보고가 있다. 양서류는 먹이연쇄의 중위포식자로 내분비계 장애물질의 순환 및 생채축적 회로에서 중요한 위치를 갖는다. 또한 농경지나 계류 등에 서식하며 산란하는 습성이 있다. 이러한 서식지는 농약 등에 노출받기 쉬우므로 환경오염평가 대상동물로 중요하다. 본 연구에서는 국내에서 사용되고 있는 제초제, 살충제 등이 양서류 발생에 미치는 영향을 평가하고, 이들 물질에 의한 노출을 평가할 수 있는 biomarker 유전자를 발굴하고자 하였다. 우리나라 전역에 많이 분포하는 무당개구리(Bombina orientalis)의 초기 배아발생 과정에서 이들 농약을 처리하였을 때, 물질의 종류에 따라 정도의 차이는 있으나 농도 의존적으로 배아 및 올챙이의 치사율이 높게 나타났다. 또한 농약은 배아 및 올챙이의 기형을 유발하였다. 기형의 종류는 농약에 따라 서로 상이한 형태로도 나타났으나, 특히 몸통휨 또는 꼬리휨등의 척추골 기형이 많이 나타났다. 환경 위해성 평가 biomarker 유전자로서 골격계 형성에 관여하는 Sox9 유전자를 선택하였다. 무당개구리에서 처음으로 Sox9 유전자를 동정하였으며, 농약을 처리한 실험군에서의 Sox9 유전자의 발현 양상은 대조군에 비하여 높게 나타났다. 본 연구결과 생태계에서 내분비계 장애물질의 위해성 평가를 위해 양서류 초기배아의 치사 및 기형의 정도를 관찰하는 방법이 유효할 것으로 사료된다. 또한 야생동물의 biomarker 유전자를 발굴과 이를 이용한 위해성 평가는 더욱 정밀한 평가법으로 유용할 것이다.

• Nuclear Medicine and Molecular Imaging
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• v.41 no.4
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• pp.299-308
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• 2007

Purpose: The aim of this study was to develop a bioinformatics software and to test it in serum samples of papillary thyroid cancer using mass spectrometry (SELDI-TOF-MS). Materials and Methods: Development of 'Protein analysis' software performing decision tree analysis was done by customizing C4.5. Sixty-one serum samples from 27 papillary thyroid cancer, 17 autoimmune thyroiditis, 17 controls were applied to 2 types of protein chips, CM10 (weak cation exchange) and IMAC3 (metal binding - Cu). Mass spectrometry was performed to reveal the protein expression profiles. Decision trees were generated using 'Protein analysis' software, and automatically detected biomarker candidates. Validation analysis was performed for CM10 chip by random sampling. Results: Decision tree software, which can perform training and validation from profiling data, was developed. For CM10 and IMAC3 chips, 23 of 113 and 8 of 41 protein peaks were significantly different among 3 groups (p<0.05), respectively. Decision tree correctly classified 3 groups with an error rate of 3.3% for CM10 and 2.0% for IMAC3, and 4 and 7 biomarker candidates were detected respectively. In 2 group comparisons, all cancer samples were correctly discriminated from non-cancer samples (error rate = 0%) for CM10 by single node and for IMAC3 by multiple nodes. Validation results from 5 test sets revealed SELDI-TOF-MS and decision tree correctly differentiated cancers from non-cancers (54/55, 98%), while predictability was moderate in 3 group classification (36/55, 65%). Conclusion: Our in-house software was able to successfully build decision trees and detect biomarker candidates, therefore it could be useful for biomarker discovery and clinical follow up of papillary thyroid cancer.