• Journal of the Korean Association of Geographic Information Studies
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• v.16 no.1
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• pp.59-66
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• 2013

When the typhoons are passing over the ocean, the ocean environment has both physical and biological impacts on the East, South sea and Yellow sea of Korea. As a result of typhoon path, vertical mixing and upwelling injured colder subsurface water, and leaded to phytoplankton blooming along the typhoons. The ocean environment before and after a typhoon played an important role in the biological effect of sea surface. Although the magnitude of sea surface temperature (SST) gets cooler because of typhoon path, other physical and biophysical responses are quite different such as chlorophyll, K490 and SST. The purpose of this study is to compare with the typhoon path that influenced the Korean Peninsula and ocean environment parameters which were observed by ocean color remotely-sensed data. The MODIS data were used to assess the parameters of ocean environments such as K490 and chlorophyll data from 2002 to 2005. Mean chlorophyll from MODIS data increased by about 1-4% in the East sea after the typhoon. Mean concentration of MODIS chlorophyll in the post-typhoon period increased along the typhoon passage. However, Jeju coastal area has different patterns from those of the East sea.

• Journal of the Korean Association of Geographic Information Studies
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• v.8 no.4
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• pp.102-113
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• 2005

Ecosystem is composed of human, biotic and abiotic environment. Landscape is an ecosystem which appear in a unit region. These landscape are the spatiotemporal land mosaic which is combined with various landscape elements. And, land use and land cover changes are important factors of landscape structure changes. This study is mainly focused on the analysing the spatiotemporal change patterns of Daegu metropolitan sphere forest landscape, using landscape indices and Ecosystem Service Value (ESV) which quantify ecosystem structures and functions. The results of this study are as follow: The encroachment and fragmentation of forest were due to linear developments, i. e. road construction, rather than large-scale developments such as residental lands or industrial complexes. And, the core area percentages of landscape gradually decreased and these could possibly deteriorate the soundness of forest areas by reducing the core areas which are habitats of species. In addition, there was intimate relations between ESV and forest landscape area. The results of this study can be detached standards for impartial judgements between the logic of development & conservation, and basic standards for the establishment of development plans, i. e. metropolitan-plans, which are adequately reflected ecosystem value.

• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2012.06a
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• pp.403-405
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• 2012

접미사 트리는 문자열 압축, 텍스트 처리, 생물정보학 등 다양한 응용 분야에서 사용되는 인덱스 자료구조이다. 최근 64bit 하드웨어와 멀티코어 CPU가 보급됨에 따라 메모리상에서 병렬로 접미사 트리를 생성하는 알고리즘이 활발히 연구되고 있다. 본 논문에서는 McCreight의 선형시간 알고리즘과 Chen의 병렬 알고리즘을 기반으로 메모리상에서 접미사 트리를 병렬로 생성하는 구현 방법을 보였으며, TBB, Cilk Plus와 같은 병렬 프로그래밍 라이브러리를 이용하여 병렬 알고리즘을 구현하였다. 알고리즘 실험 결과 병렬로 수행한 알고리즘이 직렬로 수행한 결과보다 최대 4배 가량 성능 향상을 얻을 수 있었으며, 병렬 라이브러리를 사용함으로써 가지는 오버헤드는 극히 적은 것으로 나타났다.

• The Magazine of the IEIE
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• v.5 no.2
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• pp.31-40
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• 1978

신경섬유는몸체 안에서 정보의 전달을 액숀 포텐셜(action potential) 형태의 신호(signal)에 의해 수행하고 있다. 우리 몸체에서 두뇌의 지령을 받아 어떠한 동작을 근육에 신경을 통하여 전달하는 것을 생각할 때 두뇌는 정보의 원천(source)으로서, 근육과의 신경접점은 리시버(receiver)로서, 신경섬유는 전화선으로서 간주될 수 있다. 그리고 몸체·안에서의 정보의 전달의 원리는 통신공학이론에 의하여 설명되어 질 수 있다. 저자는 생리학에 깊은 지식이 없어 전자공학분야에 종사 하시는 분들을 위해 이 재미있는 생물학적 현상을 설명할 수 있는 신경조직의 구조(mechanism)와 수학적 모델을 소개하고자 한다. 저자는 독자가 신경조직의 구조의 이해를 위해 액숀 포텐셜(action potential)의 구조를 소개하고 수학적 모델를 위해서는 호지킨-헉슬리 방정식 (Hodgkin-Huxley equation)과 케이불 방정식 (cable equation)을 설명하려고 한다.

• Journal of Korean Society for Geospatial Information Science
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• v.18 no.1
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• pp.47-53
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• 2010

The correct river discharge is a important item to keep a river role of using, controlling and ecology. Especially river role of ecology is very important for environmental development of river. In assesment of ecological flow, exact information of river life and topograph is very important. In this paper, the assesment of environmental flow is conducted using geo-spatial data of basin and river. The geo-spatial data is used as a important basic data in river restoration.

• Proceedings of the Korea Contents Association Conference
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• 2017.05a
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• pp.299-300
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• 2017

세포사멸(Apoptosis)은 유전자에 의해 일어나는 세포의 능동적인 죽음을 의미한다. 본 연구에서는 식물의 세포사멸과 동물의 세포사멸을 진화적 관점에서 접근함으로써 세포사멸이라는 기작을 분석하고자하였다. 먼저 인간에서는 세포사멸에 관여하는 단백질이지만 식물과 효모에서는 다른 기능을 하는 단백질 정보를 확인하였다. 확인한 단백질 정보를 바탕으로 다른 생물종과의 유전체 비교분석을 통해 해당 단백질과 세포사멸기작에 대한 정보를 확인 할 수 있었다.

• Proceedings of the Korea Information Processing Society Conference
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• 2003.05c
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• pp.1615-1618
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• 2003

최근 생물정보학 분야에서는 이질적인 데이터 형식으로 제공되는 모티프 자원들을 하나의 자원으로 통합하고자 하는 많은 연구가 진행되고 있다. 이러한 통합을 위해 웹 기반 cross-reference를 이용한 논리적 통합이 주로 사용되어져 왔고, 이러한 이질적인 데이터의 상호교환을 위한 표준 형식으로 XML을 정의하여 이응하기 시작하였다. 피러나 이러한 웹 기반 cross-reference를 이용한 논리적 통합은 복잡한 질의 처리 문제, 중복된 데이터베이스 핸들링 문제 등을 지니고 있다. 따라서 이 논문에서는 이러한 문제점들을 개선하기 위해 물리적으로 모티프 자원들을 하나의 통할 데이터베이스로 구축하였고, 통합된 모티프 자원의 표준적 상호 교환을 위해 XML 생성기를 구현하였다.

• Journal of KIISE:Databases
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• v.32 no.2
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• pp.120-128
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• 2005

Recently main Bioinformatics databases(DDBJ, ENSEMBL, KEGG, etc.) provide analysis tools and data using web services for the convenience of bioinformaticians. Thus, defining SOAP server objects and their methods are very important to provide services for web services. We define SOAP server objects for interaction databases such as BIND, MINT and DIP.

• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2004.10a
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• pp.739-741
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• 2004

최장 공통 부분 스트링이란 주어진 두 개 이상의 스트링에서 가장 길게 일치하는 공통 부분 스트링을 계산하는 문제이다 최장 공통 부분 스트링은 스트링 프로세싱이나 생물정보학 분야에서 널리 사용되고 있는 중요한 문제이지만, 현재까지 연구된 동적 프로그래밍이나 써픽스 트리를 사용한 방법은 저장 공간을 많이 차지하므로 효율적이지 못하다 따라서 적은 저장 공간을 차지하면서도 최장 공통 부분 스트링을 빨리 구할 수 있는 알고리즘이 필요하며, 본 논문에서는 이를 위해 써픽스 배열을 도입하였다. 본 논문에서 제시한 알고리즘은 선형 시간, 공간 복잡도를 가지며, 써픽스 트리의 최하 공통 조상(LCA, Lowest Common Ancestor) 연산이나 써픽스 배열에서 사용하는 그와 비슷한 구간 최소 값 질의(RMQ, Range Minima Query)를 전혀 사용하지 않으므로 매우 효율적이다.

• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2004.10a
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• pp.202-204
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• 2004

앙상블은 다수의 분류기를 효과적으로 결합하여 분류의 성능을 향상시키는 대표적인 기술이다. 효과적인 앙상블을 위해서는 다양한 특성을 지닌 분류기를 확보하여야 한다. 기존의 앙상블은 개별 분류기의 결과를 바탕으로 분류기 사이의 의존성이나 유사성을 평가하여 분류기 결합을 시도하였다. 따라서 분류기 사이의 유사도의 정확한 측정에 한계를 지니고 있다. 본 연구에서는 이를 극복하기 위해서 다수의 산술연산자 기반 분류규칙을 유전자 프로그래밍을 이용하여 획득하고, 실제 표현형의 유사성을 측정한 후 이를 바탕으로 분류기를 결합한다. 생물정보학에서 많이 사용되는 유전자 데이터 중 하나인 림포마 암 데이터에 제안하는 방법을 적용하여 97% 수준의 높은 분류 성능과 해석 가능한 분류규칙을 획득하였다.