Kim, Jee-In;Park, Sung-Jun;Lee, Jun;Choi, Young-Jin;Jung, Seun-Ho
Journal of the Korea Computer Graphics Society
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v.10
no.2
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pp.1-9
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2004
본 논문에서는 바이러스와 같은 생화학 물질의 분자구조를 3 차원 모델로 시각화하여 관찰하고, 그 분자모델을 직관적인 방법으로 조작하기 위한 가상 현실 분자 모델링 시스템을 제안한다. 이 시스템을 사용하면, 입체영상 디스플레이 장치와 데이터 글러브 및 동작 추적 장치를 사용하여 3 차원 분자 모델을 실감나게 조작할 수 있어서 효율적으로 분자들을 관찰하고 결합, 분리하는 등의 분자 모델링 작업이 가능하다. 사용자들은 마우스나 키보드 등의 장비 대신에 자연스러운 몸 동작이나 손 동작을 이용하여 분자 모델링 작업을 위한 동작을 하게 된다. 분자들의 결합을 화학적으로 정확하게, 그리고 실시간으로 시뮬레이션 하기 위해서 에너지 계산 알고리즘을 구현하였으며 이러한 작업이 가능하도록 분자 구조를 표현하는 새로운 자료구조를 제안하였다. 본 연구에서 제안하는 동작 기반의 VR 분자 모델링 시스템의 타당성을 검증하기 위하여 HIV 바이러스 분자를 가지고 분자 모델링 작업을 수행하였고, 사용자 테스트를 실시하여 기존의 방식과 작업 성능 및 사용자 만족도를 비교하였다.
Purpose: Optical imaging is providing great advance and improvement in genetic and molecular imaging of animals and humans. Optical imaging system consists of optical imaging devices, which carry out major function for monitoring, tracing, and imaging in most of molecular in-vivo researches. In bio-luminescent imaging, small animals containing luciferase gene locally irradiate light, and emitted photons transmitted through skin of the small animals are imaged by using a high sensitive charged coupled device (CCD) camera. In this paper, we introduced optical imaging system for the image acquisition of bio-luminescent signals emitted from small animals. Materials and Methods: In the system, Nikon lens and four LED light sources were mounted at the inside of a dark box. A cooled CCD camera equipped with a control module was used. Results: We tested the performance of the optical imaging system using effendorf tube and light emitting bacteria which injected intravenously into CT26 tumor bearing nude mouse. The performance of implemented optical imaging system for bio-luminescence imaging was demonstrated and the feasibility of the system in small animal imaging application was proved. Conclusion: We anticipate this system could be a useful tool for the molecular imaging of small animals adaptable for various experimental conditions in future.
Purpose: Luciferase is one of the most commonly used reporter enzymes in the field of in vivo optical imaging. D-luciferin, the substrate for firefly luciferase has very high cost that allows this kind of experiment limited to small animals such as mice and rats. In this current study, we validated local injection of D-luciferin in the articular capsule for bioluminescence imaging in rabbits. Materials and Methods: Chondrocytes were cultured and infected by replication-defective adenoviral vector encoding firefly luciferase (Fluc). Chondrocytes expressing Fluc were injected or implanted in the left knee joint. The rabbits underwent optical imaging studies after local injection of D-luciferin at 1, 5, 7, 9 days after cellular administration. We sought whether optimal imaging signals was could be by a cooled CCD camera after local injection of D-luciferin. Results: Imaging signal was not observed from the left knee joint after intraperitoneal injection of D-luciferin (15 mg/kg), whereas it was observed after intraarticular injection. Photon intensity from the left knee joint of rabbits was compared between cell injected and implanted groups after intraarticular injection of D-luciferin. During the period of imaging studies, photon intensity of the cell implanted group was 5-10 times higher than that of the cell injected group. Conclusion: We successfully imaged chondrocytes expressing Fluc after intraarticular injection of D-luciferin. This technique may be further applied to develop new drugs for knee joint disease.
Kim, Hyeon-Sik;Choi, Eun-Seo;Tak, Yoon-O;Choi, Heung-Kook;Lee, Ju-Young;Min, Jung-Joon;Lee, Byeong-Il
Nuclear Medicine and Molecular Imaging
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v.43
no.5
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pp.451-458
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2009
Purpose: Optical molecular luminescence imaging is widely used for detection and imaging of bio-photons emitted by luminescent luciferase activation. The measured photons in this method provide the degree of molecular alteration or cell numbers with the advantage of high signal-to-noise ratio. To extract useful information from the measured results, the analysis based on a proper quantification method is necessary. In this research, we propose a quantification method presenting linear response of measured light signal to measurement time. Materials and Methods: We detected the luminescence signal by using lab-made optical imaging equipment of animal light imaging system (ALIS) and different two kinds of light sources. One is three bacterial light-emitting sources containing different number of bacteria. The other is three different non-bacterial light sources emitting very weak light. By using the concept of the candela and the flux, we could derive simplified linear quantification formula. After experimentally measuring light intensity, the data was processed with the proposed quantification function. Results: We could obtain linear response of photon counts to measurement time by applying the pre-determined quantification function. The ratio of the re-calculated photon counts and measurement time present a constant value although different light source was applied. Conclusion: The quantification function for linear response could be applicable to the standard quantification process. The proposed method could be used for the exact quantitative analysis in various light imaging equipments with presenting linear response behavior of constant light emitting sources to measurement time.
The chemical bond differences between a normal tissue and a fat tissue make a chemical shift artifact which is caused by a primary inacuracy of resonance signal location. The chemical shift also makes a variation of the transverse time T$_2$. An attempt is made to compare the values of SNR(Signal-to-Noise Ratio), the signal response, and the imaging time computed by applying T$\sub$2/$\^$*/ for a fat-proton with ones of those computed by applying T$_2$ for a water-proton under the conditions of T$_1$/T$_2$=3 and T$\sub$2/$\^$*/T$_2$=0.9. The results of the attempt show that the first two reduce to 5% and 8% out of 100%, respectively, and the last rather increases up to 10%. This shows that the chemical shift contributes to the deterioration of an MR imaging efficiency in addtion to the image distortion.
We present the results from narrow-band spectrophotometry of Comet Hale-Bopp (C/1995 O1) near perihelion obtained at Sobaeksan Optical Astronomy Observatory 61cm telescope equipped with PM 512 CCD camera(512$\times$512, 0.5"/pixel) and narrow-band filter set for the comet on 19 nights from February 21 to May 1, 1997. We discuss molecular emission band morphology and photometric behavior of Comet Hale-Bopp. The morphology of CN band shows more symmetric light distributions than $C_2$ or $C_3$ bands. On other hand, $C_2$ and $C_3$ band have more compact light distributions than CN band. Similar to wide-band image, molecular band morphology shows spiral structures at the core of the comet. The CN surface brightness variation with changing heliocentric distance shows difference from those of $C_2$ and $C_3$. The brightness, however, of these molecular bands near perihelion shows previously known 7day period light variations.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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