• Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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• 2001.10a
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• pp.724-726
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• 2001

본 논문에서는 컴퓨터 바이러스의 자기 복제 특성을 용한 바이러스 탐지 및 복구 방안을 제안한다. 바이러스의 행동 패턴은 바이러스의 종류 만큼 다양하지만 파일 바이러스의 경우, 자기 복제 행동 패턴은 대부분의 바이러스가 유사하다. 파일 바이러스가 시스템 감염시키기 위해서는 기생할 실행파일을 열고, 자기 자신을 그 실행 파일에 복사해야 한다. 이와 같은 자기 복제 행위를 통해 바이러스가 광범위하게 선과될 때 피 피해도 커지게 된다. 바이러스치 자기 복제 특성을 감안하여 본 연구에서 제안하는 바이러스 탐지 알고리즘은 다음과 같은 득징을 가진다. 첫째, 바이러스의 자기복세 행동 패턴은 파일 입출력 이벤트로 표현하여 바이러스의 행동 패턴으로 일반화시켰다. 둘째, 바이러스의 1차 감염행위는 허용하고 2차 이후 감염 행위부터 탐지하고, 탐지되기 이전에 감염되었던, 파일들을 복구한다. 이는 일반적인 바이러스들이 자기 복제를 지속적으로 수행한다는 점에 착안하여 false-positive 오류를 줄이기 위한 것이다. 본 고에서 제안하는 방법을 사용함으로써 특정 문자열에 의한 바이러스 탐지 및 복구 방법의 단점을 보안할 수 있을 것으로 기대된다.

• Proceedings of the Korea Contents Association Conference
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• 2016.05a
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• pp.189-190
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• 2016

바이러스는 RNA나 DNA의 유전물질과 그것을 둘러싸고 있는 최소한의 단백질들만으로 구성되어 있기 때문에 바이러스가 증식하기 위해서는 숙주세포에 침투하여 전적으로 숙주의 복제 기구를 이용해야만 한다. 하지만 아직까지 뎅기 바이러스의 감염 및 복제 기전은 명확하게 밝혀지지 않았다. 이에 본 연구에서는 바이러스의 감염 및 복제기전에 대한 유용한 정보를 도출하기 위하여 사람 단백질과 뎅기 바이러스 단백질의 상호작용(Hu-DV PPI) 네트워크를 분석하였다. 우선 문헌조사를 통하여 실험적으로 검증된 뎅기 바이러스 단백질(9개)과 상호작용하는 사람 단백질(149개)을 추출하였으며, 이 정보를 이용하여 사람-뎅기 바이러스 단백질 상호작용 네트워크를 구축하였다. 이 네트워크를 기반으로 바이러스 감염 전/후의 네트워크 구조 및 특성을 분석하였으며, 이 정보를 바탕으로 감염경로를 탐색하였다.

• Proceedings of the Korean Society of Applied Pharmacology
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• 1994.04a
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• pp.277-277
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• 1994

Human immunodeficiency virus type (HIV-1 )은 복사에 필수적인 전사촉진단질유전자인 tat를 가지고 있다. 우리는 유전자 재조합기법을 사용하여 tat 유전자와 nef 유전자가 결핍된 HIV-1을 제조하였다. nef, tat-결핍 HIV-1 은 C $D_4$$^{+T}$ 세포에서 전혀 복제를 하지 못하였다. 반면, tat 단백질을 발현하도록 만들어진 재조합 Jurkat-tat세포에서는 복제능력을 다시 회복함을 알 수 있었다. 이러한 nef, tat-결핍 바이러스를 Jurkat-tat 세포에서 두달이상 계대배양했을 때, revertant가 전혀 생기지 않았다. 또한, nef, tat- 결핍 HIV-1 에 chloramphenicol acetyltransferase 유전자를 삽입시키고, 이의 발현정도를 측정함으로써 원형바이러스와 마찬가지로 민감하면서도 안전하고 편리하게 바이러스의 복제를 측정할 수 있었다. nef, tat- 결핍 바이러스는 항 HIV-1 제의 활성도를 측정하고자할 때 원형 바이러스의 대용으로 안전하게 사용될 수 있을것이다.다.

• Proceedings of the Korean Society of Applied Pharmacology
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• 1993.04a
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• pp.80-80
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• 1993

(목적) 본 연구에서 사용된 바이러스는 HIV-1 nef유전자가 일부 삭제되고 대신 Chloramphenicol acetyltransferase(CAT)가 pSVCAT recombinant 바이러스다. 이러한 recombinant 바이러스를 사용하는 이유는 첫째, CAT activity가 매우 민감하므로 바이러스의 복제억제 정도를 정확하게 측정 할 수 있고 둘째, simian immunodeficiency virus(SIV)의 경우 nef 유전가 in vivo에서는 바이러스의 복제에 필수적이므로 HIV가 SIV와 유사한 것으로 미루어 본 연구에서 사용되는 recombinant SVCAT 바이러스가 안전한 것으로 고려되기 때문이다. (방법) 특히 화합물이 HIV-1의 복제에 얼마나 영향이 있는가는 1) 어느정 도의 virus inoculm을 넣었는지 2) 사용하는 cell line 3) 사용한 cell line의 infection kinetics 4) 실험의 지속기간 5) 테스트하는 assay의 sensitivity에 의존한다. 따라서 $10^{5}$ cell의 H9과 sup T1을 24 well plate에 넣고 sup T1 cell line의 경우 3일 후 항 화합물에 의한 syncytia 형성 및 CAT activity의 억제정도를 현재 AIDS drug으로 쓰이고 있는 Zidovudine을 control로 비교 관찰하였다. H9 cell line의 경우 3일 간격으로 media의 3/4을 fresh media로 바꾸어 주고 9일 후 CAT assay를 하였다. 이러한 assay에서 activity를 보이는 화합물을 reverse transcriptase와 P24 ELISA assay를 재확인하였다.다.

• Korean Journal of Veterinary Service
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• v.25 no.2
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• pp.153-174
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• 2002

파라믹소바이러스과 (Parnxouiridae) 바이러스는 외피당단백질의 생물학적 특성에 있어서 Orthomyxoviridae와, 분절되지 않은(nonseg-mented)게놈과 그 발현의 구성 측면에서 Rhbdoviridae와 유사성을 갖는 바이러스로서 외피로 둘러 싸여 있는 마이너스쇄(negative strand) RNA 바이러스이다. 마이너스쇄 RNA 바이러스의 게놈 RNA는 2가지 기능으로 작용한 다. 즉, 첫째는 mRNA 합성을 위한 주형(鑄型, template)으로 작용하고, 둘째는 플러스쇄 (anti-genome(+) strand)의 합성을 위한 주형으로서 작용한다. 마이너스쇄 RNA바이러스는 그들 자신의 RNA전사효소를 코드화 하여 저장하지만, mRNA는 감염세포 내에서 게놈이 노출된 후에만 합성된다. 바이러스 복제는 mRNA의 합성후 일어나며 연속된 바이러스단백질의 합성을 필요로 한다. 새로 합성된 플러스쇄(antigenome(+)strand)는 마이너스쇄 게놈 RNA의 복제를 도모하기 위한 주형(鑄型)으로서 작용한다.

• The Korean Journal of Pharmacology
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• v.28 no.2
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• pp.213-222
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• 1992

We investigated effects of several chemical carcinogens, i.e., $benzo({\alpha})pyrene$ (BP),7,12-dimethylbenz(a)anthracene (DMBA), nitrosomethyl urea (NMU), and nicotine on the replication, cytolyticity, DNA synthesis, and protein synthesis of type 1 herpes simplex virus (HSV-1) in viral infected Vero cell monolayers. We observed that the BP and DMBA did not show such activity. All chemical carcinogens did not inhibit the synthesis of viral DNA, but the expression of gamma viral proteins that are expressed from the newly synthesized progeny viral DNA was somewhat notably inhibited by BP and DMBA. However, the synthesis of alpha and beta viral proteins was not altered by the chemical carcinogens. These data indicate that the gamma viral proteins expressed from the newly synthesized DNA in the presence of chemical carcinogens in the culture medium may be defective. This is further supported by the fact that the virus fail to replicate in the presence of these chemical carcinogens, in spite of viral DNA and proteins are somewhat normally synthesized.

• Applied Chemistry for Engineering
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• v.10 no.4
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• pp.599-602
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• 1999

Chitosan was depolymerized by using nitrous acid. In order to synthesize new fluorinated chitosan oligomer(FCO) derivative, free amine groups of resulting low molucular weight chitosan oligomers were reacted with trifluoroacetic anhydride. The structure changes in the samples were conformed by using FT-IR, $^{1}H\;NMR$, $^{13}C\;NMR$ and $^{19}F\{^{1}H\}NMR$. Antiviral activity of FCO was studied by measuring DAN amounts of the replication viruses at 36 hr after the cells were infected with the viral solution containing FCO of various concentrations. The viral replications in the cells infected with the viral solution containing FCO were proportionally decreased with the FCO does, compared to those of the control groups, indicating that FCO efficiently inhibits viral infection. In particular, viral replication was decreased to 40% in the 1% FCO-treated cells.

• Korean journal of applied entomology
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• v.43 no.3 s.136
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• pp.225-231
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• 2004

An endoparasitoid wasp, Cotesia plutellae, has been used for a biological control agent against the diamondback moth, Plutellae xylostella. It has a symbiotic polydnavirus in their reproductive tract, which is required for its successful parasitization. Here, we measured a specific replication time of the polydnavirus during female development of C. plutellae. We, also, analyzed the reproductive potentials of female C. plutellae under mating or different host conditions. At $25^{\circ}C$, pupal C. plutellae began to develop adult tissues such as compound eyes and wings since day 2. At day 5, all adult tissues including antennae were developed and were ready to emerge. With polyclonal antibody raised against C. plutellae polydnavirus, an immunobloting could confirm virus replication at day 4 during pupal stage. Virus particles could be visualized by transmission electron microscope in the oviduct lumen of day 5 pupae. After adult eclosion, venom gland and ovarian calyx increased in size, though ovarioles did not. Mated females layed large number of eggs (over $60\%$) at first 4 days during their mean longevity of ca. 8 days at $25^{\circ}C$. Unmated females showed less active ovipositional behavior, where all the eggs developed into males. C. Plutellae parasitized both P. xylostella and fall webworm, Hyphantria cunea. However, C. Plutellae developed faster and showed higher successful paarasitization in P. xylostella than in H. cunea.

• Korean Journal of Microbiology
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• v.38 no.3
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• pp.221-229
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• 2002

Japanese encephalitis virus (JEV) persistence was established and maintained in Vero cell culture for over 1 year. Eleven clones of plaque morphology mutant JEV, with large and small plaque sizes, were obtained from the cell culture supernatant. Genomic RNA replication efficiency of the mutants in naive Vero cell appeared to correspond to their different plaque sizes. No significant changes in envelop protein ORF or in non-coding regions at both ends of the RNA genome suggested that there could be an unidentified factor(s) playing role in JEV attenuation. Unlike to the replication of wild-type JEV, the mutants did not induce severe degree of cytopathic effect in Vero cells upon infection. While obvious decrease of Bcl-2 and its mRNA expression and sharp increase of p53 in naive Vero cells infected with either wild-type JEV or the large plaque-forming mutant, those changes were not observed with the small plaque-forming one. Together with these observation, internucleosomal DNA fragmentation and chromosomal DNA profile in the Vero cells infected with the mutants suggest that an overall changes in cytopathic effect in the plaque morphology mutants-infected cells should be primarily due to the reduced genomic RNA replication and the compromised degree of p53-independent apoptosis by the virus infection at least in part.

• Journal of Life Science
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• v.7 no.4
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• pp.392-401
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• 1997

The poliovirus is a small, and non-enveloped virus. The RNA genome of poliovirus is continuous, linear, and has a single open reading frame. This polyprotein precursor is cleaved proteolytically to yield mature products. Most of the cleavages occur by viral protease. The mature proteins derived from the P1 polyprotein precursor are the structural components of the viral capsid. The initial cleavage by 2A protease is indirectly involved in the cleavage of a cellular protein p220, a subunit of the eukaryotic translation initiation factor 4F. This cleavage leads to the shut-off of cap-dependent host cell translation, and allows poliovirus to utilize the host cell machinery exclusively for translation its own RNA, which is initiated by internal ribosome entry via a cap-independent mechanism. The functional role of the 2B, 2C and 2BC proteins are not much known. 2B, 2C, 2BC and 3CD proteins are involved in the replication complex of virus induced vesicles. All newly synthesized viral RNAs are linked with VPg. VPg is a 22 amino acid polypeptide which is derived from 3AB. The 3C and 3CD are protease and process most of the cleavage sites of the polyprotein precursor. The 3C protein is also involved in inhibition of RNA polymerase II and III mediated transcription by converting host transcription factor to an inactive form. The 3D is the RNA dependent RNA polymerase. It is known that poliovirus replication follows the general pattern of positive strand RNA virus. Plus strand RNA is transcribed into complementary minus strand RNA that, in turn, is transcribed for the synthesis of plus strand RNA is transcribed into complementary minus strand RNA that, in turn, is transcribed for the synthesis of plus strand RNA strands. Poliovirus RNA synthesis occurs in a membranous environment but how the template RNA and proteins required for RNA replication assemble in the membrane is not much known. The RNA requirements for the encapsidation of the poliovirus genome (packaging signal) are totally unknown. The poliovirus infection cycle lasts approximately 6 hours.