• 제목/요약/키워드: 바이러스단백질

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양식새우(Penaeus chinensis)에서의 White Spot Baculovirus의 분리 및 특성 (Isolation and Characterization of White Spot Syndrome Baculovirus in Cultured Penaeid Shrimp (Penaeus chinensis))

  • 허문수;손상규;심두생;김진우;박명애;이주석;최동림;정승희;김영진;오명주
    • 한국어병학회지
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    • 제13권1호
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    • pp.7-13
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    • 2000
  • 1993년부터 한국 서해안의 새우 양식장에서는 양식새우의 대량폐사가 일어났다. 외부증상은 두흉갑과 표피에 흰 반점이 나타났고 어류주화세포에는 배양되지 않았다. 열($50^{\circ}C$) 및 강산(pH 3)에는 쉽게 실활되었으나 강알카리(pH 11)에는 내성이 강했다. 바이러스의 입자 형태는 Rod Shaped한 형태를 보였다. 바이러스 단백질의 분석결과는 Hypodermal Hematopoietic Necrosis Baculovirus(HHNBV)와 유사했고 바이러스 핵산분석 결과는 약 114kb로 Penaeid Acute Viremia(PAV)와 유사했다.

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감자 바이러스 Y 저항성 형질전환 감자 개발 (Development of Potato Virus Y-Resistant Transgenic Potato)

  • PARK, Young Doo;RONIS D.H.;DUYSEN M.E.;CHENG Z.M.;LORENZEN J.H.
    • 식물조직배양학회지
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    • 제24권5호
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    • pp.313-317
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    • 1997
  • ND860-2, Norchip, Russet Norkotah, Goldrush 및 Norgueen Russet 등 5개 품종의 감자 잎 조직을 감자 바이러스 Y(PVY)의 외피단백질 (CP) 유전자를 운반하는 Agrobacterium tumefaciens을 이용하여 형질전환시켰다. ND860-2와 Norchip품종과 같은 흰색 감자에서 재분화율과 형질전환율이 높게 나타났다. 형질전환체를 선발한 후 CP의 생성을 western blot으로 확인한 결과 30 kD의 밴드가 나타났다. 온실에서 재배된 형질전환체는 한 개체를 제외하고는 표현형에 있어서는 기존의 품종과 다르지 않았다. 인위적으로 감자 바이러스 Y를 감염시킨 15일 후의 검사결과 control구는 80%의 감염율을 보인 반면 형질전환체들은 38-58%의 감염율을 보였다. 30일 후의 검사 결과는 모든 5품종의 control구에서 100%의 감염을 보였으나 형질전환체는 7개체가 저항성을 보였다. 마지막 85일 후의 검사 결과 4개의 저항개체를 발견하였으며 이 개체들은 현재 계속 연구가 진행 중에 있다.

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구리 기반 표면코팅 및 산화수에 따른 항균·항바이러스 특성 (Copper-based Surface Coatings and Antimicrobial Properties Dependent on Oxidation States)

  • 고상원
    • 공업화학
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    • 제34권5호
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    • pp.479-487
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    • 2023
  • 구리(Cu)는 저렴한 비용으로 용이하게 도입이 가능하여 다양한 소재 표면에 살균 코팅제로 쓰이고 있다. 자연적 산화 반응이 구리의 효능을 손상시키지 않아 장기간 노출 조건에서도 항균 성능을 유지할 수 있다. 더 나아가 구리 화합물은 그람 음성균 및 그람 양성균 뿐만 아니라, 병원성 효모, 외피 보유 및 외피 미보유 타입의 바이러스에 대해 모두 폭넓은 살균 효과를 보인다. 구리 코팅 표면의 접촉 살균은 구리의 침투로 단백질 변성을 일으키고 세포막 손상으로 뉴클레오티드 및 세포질 등의 내용물이 용출되게 한다. 또한 구리 산화환원 활성에 의한 활성 산소종 생성으로 효소작용을 억제하고 DNA를 파괴하여 세포를 영구적으로 손상시킨다. 구리는 안정한 금속 성질 때문에 나노입자, 이온, 복합물, 합금 등의 여러 형태로 쓰이고 있으며 코팅 방법이 다양하다. 본 총설에서는 구리 이온과 구리 산화물의 대표적인 표면 도입 방법을 살펴보고 구리 산화수에 따른 항균·항바이러스 특성을 다루고자 한다.

산마늘(Allium victorialis var. platyphyllum)에서 바이러스병의 최초보고 (First Report of the Virus Diseases in Victory Onion (Allium victorialis var. platyphyllum))

  • 박석진;남문;김정선;이영훈;이재봉;김민경;이준성;최홍수;김정수;문제선;김홍기;이수헌
    • 식물병연구
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    • 제17권1호
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    • pp.66-74
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    • 2011
  • 2005년 울릉도에 자생하고 있는 산마늘에 대하여 바이러스병을 조사하기 위하여 성인봉 부근에서 61점의 시료를 채집하였다. 채집한 시료를 동정하기 위해 전자현미경 검경과 종 특이적 프라이머(GCLV, LYSV, SLV, OYDV) 및 속 특이적 프라이머(Allexivirus)를 이용하여 RT-PCR을 각각 수행하였다. 전자현미경 검경을 실시한 결과 61점의 시료중 4점의 시료에서 600~900 nm의 긴 사상형 입자가 관찰되었으며, RT-PCR 진단결과 SLV가 4점, 이 중 하나는 Allexivirus가 복합감염되었다. 바이러스에 감염된 산마늘은 외관상으로 병징을 나타내지 않았다. RT-PCR 분석결과 SLV와 Allexivirus로 동정된 울릉도 산마늘 바이러스의 외피단백질 유전자 염기서열을 비교 분석하였다. 분석결과, SLV로 분류된 울릉도 산마늘 바이러스 개체간은 약 99%의 상동성을 가지고 있었으며, 이전에 보고된 다양한 SLV와 GLV의 strain과의 염기 서열의 비교에서는 75.7~83.7%의 상동성을 보였으며 아미노산 서열의 비교는 89.2~97.0%의 높은 상동성을 나타냈다. 또한 산마늘에서 검출된 GarV-A는 이전에 마늘에서 보고된 GarV-A와 99.2% 외피단백질 유전자 염기서열 상동성을 보였으며, 아미노산 서열은 98% 상동성을 보였다. 그러나 다른 Allexiviruses(GarV-C, GarV-E, GarV-X, GMbMV and Shal X)와 아미노산 서열을 비교한 결과 60.6%~81.5%의 상대적으로 낮은 상동성을 보였다. 이러한 자료들을 바탕으로 산마늘에서 분리한 SLV와 GarV-A를 각각 SLV-Ulleungdo와 GarV-A-Ulleungdo로 명명하였다. 본 논문은 산마늘에서 발생하는 바이러스에 대한 첫 번째 보고이다.

로타바이러스 감염이 관련된 신생아 괴사성 장염 (Rotavirus-associated neonatal necrotizing enterocolitis)

  • 서현주;정유진;박수경;최서희;이지혁;김묘징;장윤실;박원순
    • Clinical and Experimental Pediatrics
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    • 제52권1호
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    • pp.56-60
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    • 2009
  • 목적 : 본 연구에서는 로타바이러스와 관련된 신생아 괴사성 장염(RV+NEC)이 로타바이러스와 연관되지 않은 신생아 괴사성 장염(RV-NEC)과 서로 다른 경과 및 예후를 보이는지 알아보고자 하였다. 방 법 : modified Bell stage II 이상의 환아들을 monoclonal antibody-based enzyme immunoassay (EIA) 결과를 통해 8명의 RV+NEC군과 22명의 RV-NEC군으로 분류하였고 이 두군의 임상양상과 방사선소견 및 치료 결과를 후향적으로 조사하여 비교하였다. 결 과 : RV+NEC군에서 RV-NEC군보다 재태주령과 출생체중이 통계적으로 유의하게 더 높았다($33.5{\pm}3.3$ 주 vs $29.3{\pm}4.4$ 주; P=0.01). 두 군간의 C-반응성 단백질의 최고치, 혈소판 감소증, 장벽 내 공기와 장 천공의 비교에서는 차이가 없었으나 문맥 정맥 내 공기의 빈도는 RV+NEC군에서 유의하게 많았다(88% vs 9%; P<0.01). III 이상의 병기와 수술율 그리고 합병증과 사망률을 비교한 결과에서는 두 군 간에 차이를 보이지 않았다. 결 론 : 로타바이러스와 관련된 신생아 괴사성 장염은 로타바이러스와 연관되지 않은 신생아 괴사성 장염에 비해 더 높은 재태주령과 출생체중을 가지나 질환의 중증도와 결과 면에서는 차이가 없었다.

소아장염을 유발하는 한국형 아데노바이러스들의 지놈형별 (Genome Type Analysis of Human Adenoviruses Associated with Pediatric Gastroenteritis in Korea)

  • 김희진;양재명;김경희
    • 대한바이러스학회지
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    • 제26권1호
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    • pp.23-30
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    • 1996
  • 대략 36,000 base pairs (bp)의 두 가닥짜리 DNA를 지놈으로 가진 사람 아데노바이러스 (Ad)는 DNA 상동성(相同性) 및 생물학적/생화학적 성격이 특이한 49개의 혈청형이 알려져 있는데, 이들 대부분의 Ad가 영유아군 및 면역능이 저하된 성인에서 치사적 결과를 초래할 수 있다. Ad의 세포향성(向性)(tropism)은 매우 다양하여 종류에 따라 상기도 감염, 각결막염, 영유아 장염등을 유발하는데 최근 Ad의 다양한 병원성에 대한 원인을 분자생물학적 수준에서 규명하려는 노력의 일환으로 지역에 따라 주되게 출현하는 Ad형 규명이 활발히 이루어지고 있다. Ad 동정/확인은 표면을 이루고 있는 group 공통항원인 hexon 단백질을 탐지하는 효소면역 측정법 (EIA)에 의하며, Ad형별은 Ad fiber의 세포독성 중화시험에의 한다. 그러나, 세포독성 중화시험이 엄청난 노동력 및 시간을 요구하면서도 민감도/특이도가 만족스럽지 못하여 이를 개선하기 위하여 검체 또는 세포배양에서 Ad DNA를 추출하여 제한효소 절단형태를 비교하는 방법이 개발되었는데 이는 세포배양에 잘 자라지 않는 바이러스주의 형별뿐만 아니라 지역 분리주들의 지놈 변형주를 관찰하는 분자생물학적/분자역학적 연구에도 도움이 되고 있다. 국내에는 Ad와 관련된 소아장염의 빈도가 rotavirus에 의한 것 다음으로 빈번한데도 Ad40/41외에 주되게 출현하는 장내 Ad형들이 전혀 규명된 바 없고, 한국형 Ad들의 지놈형태가 전혀 보고된 바가 없다. 또한 세계적으로 Ad형별 조사지역이 늘어감에 따라 유아장염과 연관된 Ad 역시 Ad40, 41이 외의 형들이 Ad40, 41을 능가하는 것으로 보고되고 있는 지역도 있으나 국내에서는 Ad40, 41이외의 형들은 그 역학적 중요도가 전혀 알려져 있지 않다. 이로서 본 연구의 목적은 Ad주들에 특이 중화항체를 이용한 세포독성 중화시험과 Ad DNA 절단법을 적용하여 한국형 장내 Ad주들의 형별을 처음으로 시도함과 동시에 1989-1991사이 출현한 Ad들의 유전적 변형을 관찰하려는 것이었다. 두 방법 모두 사용하였을 때 주되게 출현하는 장내 Ad형들은 Ad4l, Ad2, Ad7, Ad5, 및 Ad40이었다. Ad40/41-양성 검체를 제외한 Ad hexon-EIA양성들의 77.5%를 형별 할 수 있었던 Ad DNA의 제한효소 절단방법은 형들간의 교차중화로 특이성이 낮았던 중화방법 (47.5%)보다 매우 효율적이어서 두 가지 방법을 함께 적응하였을 때는 40주중의 81.5%인 35주를 형별 할 수 있었다. 또한Ad DNA 제한 효소 절단방법은 Ad7 변이주 (Ad7b)도 탐지 할 수 있었다.

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Transmissible gastroenteritis virus(TGEV)와 porcine epidemic diarrhea virus(PEDV)의 nucleocapsid(N) 단백질 유전자에 대한 염기서열 분석과 cDNA probe hybridization (Sequence analysis and cDNA probe hybridization of the nucleocapsid(N) protein gene of transmissible gastroenteritis virus(TGEV) and porcine epidemic diarrhea virus(PEDV))

  • 박지용;김철중;신광순;김원용;강신영;박용호;한혜정;박용하
    • 대한수의학회지
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    • 제35권3호
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    • pp.515-530
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    • 1995
  • Coronaviridae에 속하는 transmissible gastroenteritis virus(TGEV)와 porcine epidemic diarrhea virus(PEDV)를 specific하게 detection할 수 있는 방법을 개발하고자 본 연구를 수행하였다. 두 바이러스 모두 RNA 바이러스이기 때문에 reverse transcription-polymerase chain reaction(RT-PCR)으로 nucleocapsid(N) protein gene의 cDNA를 증폭시켰다. SmaI으로 처리한 pTZ19R에 ligation시킨 후 염기서열을 밝히고자 sequencing하였다. 각각의 prototype virus와 비교하여 상동성을 밝혔다. 두 바이러스에 대한 cDNA probe를 제작하여 Southern blot hybridization을 실시하였다. TGEV의 경우 백신주인 P45와 병독주인 Miller strain을 사용하였다. cDNA를 증폭시키기 위해 N1/N1R과 N2/N2R 두 가지 primer를 이용한 결과, N1/N1R primer의 경우 586bp 크기의 PCR product를 얻을 수 있었고, N2/N2R primers로 582bp의 cDNA를 증폭시킬 수 있었다. PEDV 실험을 위하여 PED 임상 증상을 나타내는 분변을 이용하여 RT-PCR을 실시하였다. P2/P2R primer로 753bp의 PCR product를 얻을 수 있었다. TGEV의 두 가지 strain의 N protein gene을 sequencing하여 prototype인 Purdue strain과 염기서열 상동성을 조사한 결과, 97%이상의 높은 homology를 나타내었다. PED-V 역시 N protein gene을 sequencing하여 CV777과 염기서열 상동성을 조사한 결과 97%이상의 homology로 PEDV임을 알 수 있었다. TGEV와 PEDV의 염기서열을 비교한 결과 29%의 낮은 homology를 관찰할 수 있었다. 두 가지 바이러스의 N protein gene에 대한 cDNA probe를 제작하여 Southern blot hybridization을 한 결과, 각 바이러스에 매우 특이적 반응을 나타내었다.

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한국에서 분리된 전염성 조혈괴저바이러스의 N 단백질의 유전자 클로닝과 염기서열 분석 (Molecular Cloning and Nucleotide Sequence of the N Protein of a Korean Isolate of Infectious Hematopoietic Necrosis Virus)

  • 문창훈;김현주;박정민;조화자;차승주;윤원준;박정재;이은희;강호성;김한도;박정우
    • 미생물학회지
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    • 제34권1_2호
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    • pp.69-73
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    • 1998
  • 한국에서 분리된 전염성 조혈괴저바이러스(infectious hematopoietic necrosis virus, IHNV)인 IHNV-PRT의 nucleocapsid(N)를 암호화하고 있는 cDNA를 클로닝하여 분석하였다. N 유전자는 391개의 아미노산으로 구성된 42.3 kDa의 분자량을 가진 단백질을 암호화하는 1,176 bp 크기의 open reading frame을 가지고 있었다. N 단백질의 아미노산 서열을 다른 외국에서 분리한 IHNV들의 N과 비교한 결과 75-90% 정도의 유사성을 보였으나 다른 종의 fish rhabdovirus인 hirame rhabdovirus(HRV) 및 viral hemorrhagic septicemia virus(VHSV)와는 각각 43%와 38%의 유사성을 보였다. 그러나 아미노산 서열 214-265의 52개의 아미노산들은 모든 종의 fish rhabdovirus간에 매우 높은 유사성을 보여 주었다.

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사료급이(oral feeding)에 의한 vaccination을 통한 흰반점바이러스(WSSV)에 대한 재조합단백질 rVP19+28의 백신효능의 확인 (Vaccination of Shrimp (Litopenaeus vannamei) against White Spot Syndrome Virus (WSSV) by Oral Vaccination of Recombinant Fusion Protein, rVP19+28)

  • 응위엔 호아이;김영진;최미란;김성구
    • 생명과학회지
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    • 제20권8호
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    • pp.1181-1185
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    • 2010
  • 본 연구는 WSSV의 주요 구조단백질인 VP19와 VP28을 모두 포함하는 VP19+28 fusion protein을 제조하여, Litopenaeus vannamei에서 WSSV에 대한 백신으로서의 효능을 평가하고자 수행하였다. VP19와 VP28 유전자를 fusion하여 제작한 VP19+28 유전자를 pET-28a(+) vector에 삽입하고 단일단백질로서 제작된 VP19+28 유전자를 E. coli BL21 (DE3)에서 발현시켰다. 백신실험을 위해 새우에게 2주 동안 실험용 사료를 급이하였으며, 그 후 바이러스액($1{\times}10^2$배로 희석한 WSSV)을 이용하여 새우에게 주사 감염에 의해 in vivo 공격실험(challenge test)을 수행하였다. 실험결과, vaccination을 하지 않은 새우들은 감염 후 11일째에 100%의 누적폐사율을 보였으며, host control로써 E. coli BL21을 사용하여 vaccination한 새우들은 감염 후 17일째에 100%의 누적폐사율을 보였다. rVP19, rVP28, rVP19+28을 이용하여 vaccination한 새우들의 경우 감염 후 21일째에 각각 66.7%, 41.7%, 41.7%의 누적폐사율을 보였다. 이상의 결과를 통해 rVP28과 rVP19+28이 WSSV에 대해 높은 백신효능을 가짐을 확인하였다. 또한 감염 후 21일째에 fusion protein rVP19+28과 rVP28의 누적폐사율은 동일하였지만 공격실험기간 동안 폐사율이 rVP19+28을 투여 한 실험군이 낮게 나타나는 것을 보아 WSSV에 대한 새우의 방어효능은 rVP19+28이 더 높음을 나타내는 것이다.

C형 간염바이러스(HCV)의 NS5B RNA Replicase에 의해 그 활성이 조절되는 HCV지놈 표적 Hammerhead 리보자임 개발 (Development of Hepatitis C Virus (HCV) Genome-Targeting Hammerhead Ribozyme Which Activity Can Be Allosterically Regulated by HCV NS5B RNA Replicase)

  • 이창호;이성욱
    • 미생물학회지
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    • 제43권3호
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    • pp.159-165
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    • 2007
  • C형 간염바이러스(hepatitis C virus; HCV)증식을 효과적이며 특이적으로 제어할 수 있는 유전산물을 개발하기 위하여 HCV 중식조절이자인 NS5B RNA replicase 존재에 의해 allosteric하게 그 활성 이 조절될 수 있는 HCV internal ribosome entry site (IRES) 표적 hammerhead 리보자임을 개발하였다. 우선 HCV IRES 염기서열 중+382 nucleotide(nt) 부위가 리보자임에 의해 가장 잘 인식되었음을 관찰하였다. 이러한 allosteric 리보자임은 NS5B RNA replicase와 특이적으로 결합하는 RNA aptamer 부위, aptamer와 NS5B와의 결합에 의해 리보자임 활성을 유도할 수 있도록 구조적 변이를 전달할 수 있는 communication module부위 및 HCV IRES의 +382 nt를 인지하는 hammerhead 리보자임 등으로 구성되도록 설계하였다. 특히 in vitro selection기법을 활용하여 NS5B 의존적으로 리보자임 활성을 증가시킬 수 있는 communication module 염기서열을 밝혀내었다. 이러한 리보자임은 단백질이 없거나 대조 단백질인 bovine serum albumin이 존재할 때에는 절단반응을 유도하지 못하였으나 HCV NS5B 단백질이 존재할 매에만 효과적으로 NS5B 농도 의존적으로 절단 반응을 유도할 수 있음을 관찰하였다. 이러한 allosteric 리보자임은 HCV중식의 효과적인 증식 억제 선도물질 뿐만 아니라 HCV 치료선도물질의 스크리닝용 도구 및 HCV 조절 인자를 탐색할 수 있는 HCV 진단용 리간드로서도 활용될 수 있을 것이다.