Three actinobacterial strains exhibiting broad spectrum antibiotic activities were isolated from soil, and characterized. Through the comparative analysis of 16S rRNA genes, the three isolates could be assigned to the genus Streptomyces, as S. tanashiensis, S. nashivillensis, and S. rubiginosohelvolus were found to be the mostly related species, but the strains formed independent phylogenetic lineage. Each strain exhibited different antimicrobial profile against Gram-positive bacteria Bacillus subtilis and Staphylococcus aureus, Gram-negative bacteria Salmonella typhi, Enterobacter cloacae, Serratia marcescens, and Pseudomonas aeruginosa, and also fungi Candida tropicalis and Candida krusei. In addition to the antimicrobial profile, the strains also differed in API ZYM test results, which implies that the three strains might produce difference antimicrobial substances.
The aim of this study was to isolate a potential multifunctional biocontrol agent from bacteria for control of multiple plant diseases as an alternative to fungicides. A total of 201 strains were isolated from soil undamaged by repeated cultivation in Sunchang and their ability to produce antibiotics, siderophores and extracellular enzymes such as protease, cellulase and amylase was investigated. Selected strain SCS3 produced cellulose, protease and amylase. This strain also produced siderophores and showed excellent antifungal activity against various phytopathogens. SCS3 was identified as Bacillus subtilis using 16S rRNA sequencing, and named Bacillus subtilis SCS3. Finally, physiological and biochemical characteristics of B. subtilis SCS3 were examined. From the results, B. subtilis SCS3 was found to be a useful multifunctional biocontrol agent against various phytopathogens.
To control Phytophthora blight of red pepper biologically caused by Phytophthora capsici, we developed Trichoderma harzianum DYMC for commercial product. DYMC was storage at room temperature and was investigated their population every 3 months for 1 year. For investigating the dynamic population of T. harzianum in the pot soils, we applied powder and suspension applications with DYMC, and then investigated for 95 days. The efficacy of powder and suspension applications of DYMC for control of Phytophthora blight of red pepper and plant growth were investigated for 50 days in greenhouse experiment. The population of T. harzianum was decreased at the room temperature for 1 year but there was not statistically significance. After soil treated in the pot with DYMC, the population of Trichoderma spp. was the highest when DYMC powder at 5 g was applied to mix with pot soil, and the population was deceased significantly among treatment means as time goes by ($R^2=0.76$, F=10.5960, P=<.0001). Incidence of Phytophthora blight of, red pepper was significantly reduced among treatment means on 50th day after treated with DYMC ($R^2=0.82$, P=16.4758, P=<.0001). Disease control value was the highest at 62.5% when DYMC powder at 5 g was applied to mix with pot soil. No significant difference (P=0.05) of effects of plant and root growth showed by treated with DYMC on 60th day, except stem. Mixing the application of DYMC powder with soil to control Phytophthora blight of red pepper was greater than suspension application to dilute with water. DYMC could be used as an effective biocontrol agent to control Phythophthora blight of red pepper.
Several antagonistic bacteria, SD-1, 4, 10, 11, 14, 15, and 16, which have strong CMCase and amylase activities, were isolated from the fermented mushroom media. Among them, SD-1, 10, 11, and 15 have strong antibacterial activities against the mushroom pathogenic bacteria Pseudomonas sp., and SD-1, 10, 11, 14, and 16 have strong antifungal activities against the mushroom pathogenic fungi, Trichoderma sp. SD-14, 15, and 16 did not inhibit the growth of mushroom Pleurotus eryngii ASI-2302, and Pleurotus ostreatus ASI-2042 and ASI-2180. When the culture broth mixture of the seven bacterial strains was applied to the mushroom media, the growths of pathogens, Pseudomonas sp. and Trichoderma sp., were inhibited.
In vitro and in vivo activities of a biocontrol agent, Bacillus stearothermophilus strain YC4194 was evaluated for the control of Pythium damping-off of cucumber. B. stearothermophilus YC4194 inhibited germination of cystospores and formation of zoosporangia of Pythium aphanidermatum in vitro. Incorporation of a bentonite and talc based formulation(10$^{9}$ cfu/g) of B. stearothermophilus YC4194 to the nursery soils (10 g/ι soil) resulted In a significant (p=0.01) reduction in the disease severity of cucumber damping-off after inoculation with P. aphanidermatum. The control efficacy of B. stearothermophilus YC4194 formulation was not different from that of the fungicides, dimethomorph, metalaxyl, ethaboxam. When the cucumber plants were transplanted to the soil inoculated with P. aphanidermatum zoospores, the B. stearothermophilus YC4194 maintained the high population density in rhizosphere soil upto 10$^{7}$ cfu/g until 15 days after treatment.
Universal characteristics of ginseng replanting problems appeared to be decrease in root yields due to root rot and inhibition of root growth. Incitants of ginseng replanting problems have not been clearly elucidated, however, it appeared to be a complex phenomenon with several pathogenic soil microorganisms and environmental changes in the soil due to decomposition of ginseng debris such as rootlets and shoots. Decomposition of ginseng debris may cause direct or indirect damage to the root. The effect of conventional fungicide on the control of the problems has not been recognized. However, it has been suggested that treatment with soil fumigants may solve the problems. Meanwhile paddy-rice and ginseng rotation system appeared to be the best way of solving the problems so far.
Proceedings of the Turfgrass Society of Korea Conference
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2011.02a
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pp.35-35
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2011
A large patch disease caused by Rhizoctonia solani AG2-2(IV) is a serious problem in turfgrass sites including golf courses and sports fields in Korea. The objectives of this study were to isolate some antagonistic microorganisms and to explain some involving mechanisms. Initially single colonies which were formed from the filtrates of various soil samples were obtained from LB culture and then co-cultured with R.solani AG2-2(IV) on PDA plate to explore some antagonistic microbes against for large patch fungus, Rhizoctonia solani AG2-2(IV). Out of total 82 antagonistic isolates which commonly had inhibition effect on Rhizoctonia solani AG2-2(IV) mycelial growth, one candidate (YPIN22) showed the most antifungal effect, which was confirmed by the longest distance from the edge of bacterial colony to the mycelial edge of the Rhizoctonia solani AG2-2(IV) in the dual culture. A succeeding investigation was to test any potential effect of the isolate on growth inhibition of 5 other turfgrass pathogens including R. solani solani AG2-2(IIIB), P. ultimum, C. caudatum, C. lunata, and F.oxysporum. Preliminary result indicated that the new isolate YPIN22 was also found to have antagonistic potential on the growth inhibition of those turfgrass pathogenic fungi, which was explained by inhibition zones ranging from 8 to 22mm. A further explanation of some characteristics of the isolate YPIN22 will be discussed in detail.
Kim, Yo-Hwan;Lim, Jong-Hui;An, Chang-Hwan;Jung, Byung-Kwon;Kim, Sang-Dal
Journal of Applied Biological Chemistry
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v.55
no.1
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pp.47-53
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2012
Increasing concerns over green farming technology, plant growth promoting rhizobacterium (PGRP) having growth promoting as well as plant disease suppressing properties was recently preferred to use for biological control of plant pathogens infecting plant. We measured the influence of the selected microbial consortium agents-a mixture of PGPR strains-, commercial bio-fungicide, and chemical pesticides on soil microbial community in red pepper field. The activities of soil enzyme such as dehydrogenase, urease, phosphatase, ${\beta}$-glucosidase, and cellulase were analyzed to investigate that of soil microbial community. We also measured plant length, main stem, stem diameter, number of branches and yields of red-pepper in order to observe the red pepper growth promotion. The results of measuring enzyme activities were dehydrogenase 3.5584 ${\mu}g$ TPF $g^{-1}h^{-1}$, urease 15.8689 ${\mu}g$$NH_4{^-}N$$g^{-1}h^{-1}$, phosphatase 0.5692 ${\mu}g$ PNP $g^{-1}h^{-1}$, ${\beta}$-glucosidase 2.4785 ${\mu}g$ PNP $g^{-1}h^{-1}$, and cellulase 86.1597 ${\mu}g$ glucose $g^{-1}h^{-1}$ in the soil treated with the microbial consortium agents, so it came out to be very active in the soil. Observing the growth of red-peppers, the main-stem length and the stem diameter were 6.1% and 8.1% higher in the soil treated with the selected microbial consortium agent than the chemical pesticides. After harvesting, yields were 7.3% higher in the soil treated with selected microbial consortium agents than the chemical pesticides. These results showed that microbial consortium agents contribute to increasing soil microbial diversity, growth promoting, and yield of red pepper.
Mass culturing of two beneficial organisms used as biofertilizers for crops would reduce the risks in production and minimize the capital involved and this demands appropriate media that supports both organism and also selection of organisms that are not antagonistic to each other. A study was initiated to culture a nitrogen fixer (Rhizobium) and phosphate solubilizer (Bacillus megaterium) in a single medium and to study their growth patterns and shelf life in carrier. The growth of Rhizobium and Bacillus megaterium was assessed in different media and a slight modification in the traditional yeast extract mannitol media promoted the growth of both the organisms. The growth of the individual organisms in the modified medium was assessed by estimating the population at regular intervals and compared to their original medium. Maximum population of Rhizobium and phosphobacteria was at 60 hr when the phosphiobacteria inoculation of later was after 48 hr of Rhizobium inoculation. The shelf life of the individual inoculants in the inoculant containing both the organism in a sterile carrier base revealed no significant differences compared to individual organisms inoculated in a sterilized carrier. The population of both organisms in carrier based mixed inoculant remained at $10^8$ cells till 90 days.
Kim, Byung-Yong;Ahn, Jae-Hyung;Weon, Hang-Yeon;Song, Jaekyeong;Kim, Sung-Il;Kim, Wan-Gyu
The Korean Journal of Pesticide Science
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v.16
no.4
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pp.357-363
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2012
Ginseng (Panax ginseng C. A. Meyer) is an economically important crop in Korea. While the consumption of the crop is gradually increasing, the yield is decreasing due to the injury of continuous cultivation or infection of soil-borne fungal pathogens such as Cylindrocarpon destructans, Fusarium solani, Rhizoctonia solani and Sclerotinia nivalis. In order to find promising biocontrol agents, we have isolated 439 soil bacteria from ginseng cultivated soil and tested their antifungal activities against ginseng rot pathogens. Among them, 3 strains were finally selected and tested for the elucidation of their genetic and biochemical properties. They were identified as Bacillus amyloliquefaciens using phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequences. Moreover, all selected strains showed positive reaction for PCR detection targeting biosynthetic gene sequences of iturin A and surfactin. The results provided promising evidences that the bacterial strains isolated from ginseng cultivated soil can be novel biocontrol agents for ginseng cultivaion.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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