• Title/Summary/Keyword: 결합구조

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HDM2-p53 상호작용 억제제 개발에서의 탄화수소체인의 역할과 중요성

  • Yeo, Jin-Hui;Im, Hae-Ri;Ham, Si-Hyeon
    • Proceeding of EDISON Challenge
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    • 2017.03a
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    • pp.158-164
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    • 2017
  • 암을 억제시키는 기능을 하는 단백질로 잘 알려진 p53은, 주로 종양세포에서 과도하게 발현되는 단백질인 HDM2와 복합체를 형성하여 비활성화되고 항암기능을 상실하게 됩니다. 때문에 종양세포에서의 p53-HDM2의 상호작용을 억제하기 위해 현재까지 많은 연구가 진행되어왔으며, 다양한 p53-HDM2 억제제가 개발된 바 있습니다. 최근 연구들에 따르면, HDM2와 결합친화도를 높이고 소수성 작용(hydrophobic interaction)에 기여하여 보다 안정한 구조를 만드는 탄화수소체인(staple)을 연결시킨 펩타이드 설계에 대한 관심이 높아지고 있는 추세입니다. 이에, 본 연구에서는 분자동역학 모의실험을 통해서 얻은 탄화수소체인-p53과 비탄화수소체인-p53 및 각각의 HDM2와 결합한 복합체를 기반으로 EDISON의 용매화 자유에너지(Solvation Free Energy) 프로그램을 이용하여 탄화수소체인의 특징 및 역할을 구조적인 측면과 열역학적인 측면으로 분석하여 비교하고자 합니다. 우리 연구에서 비탄화수소체인-p53의 구조는 분자동역학 시뮬레이션을 수행하는 동안 나선구조형태로 풀려 HDM2와 결합 유도 시에 주요결합 아미노산 잔기가 올바른 결합부위와 상호작용하지 못한 결과를 확인한 반면, 탄화수소체인이 형성된 구조는 시뮬레이션 동안에도 펩타이드의 나선구조를 유지시켜 HDM2와 주요 결합을 형성하는 아미노산 잔기들을 올바른 방향으로 배치시켜 HDM2와의 결합친화도를 높였습니다. 이 연구 결과는 탄화수소체인이 펩타이드의 나선성을 유지시키고, HDM2와의 상호작용을 통한 구조적인 안정성 유도 및 용매화 자유에너지에 큰 기여를 통해 p53-HDM2상호작용 억제제에서 긍정적인 역할을 할 가능성을 보여줍니다.

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Design of Asymmetric Parallel Coupled-line Array using Finite Element Analysis (유한요소해석을 이용한 배열구조의 평면형 비대칭 결합선로 설계)

  • 윤재호;박준석;김형석
    • The Journal of Korean Institute of Electromagnetic Engineering and Science
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    • v.13 no.6
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    • pp.521-527
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    • 2002
  • In this paper, we introduce a procedure to find design parameter for array coupled lines using 2-D finite element analysis. To extract design parameters using FE calculation, we set up several design conditions. In order to show the validity of our approach, we designed, simulated and fabricated a comb-line bandpass filter.

An algorithm for finding binding propensities of nucleic acids and amino acids (핵산과 아미노산의 결합 경향성을 발견하기 위한 알고리즘)

  • 한남식;한경숙
    • Proceedings of the Korean Information Science Society Conference
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    • 2003.10b
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    • pp.814-816
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    • 2003
  • 오늘날 핵산과 단백질의 결합체에 관한 자료가 PDB(Protein Data Bank)와 같은 공공 데이터베이스에 급속도로 증가되고 있고 하나하나의 자료 자체도 많은 양의 데이터를 가지고 있기 때문에 더 이상 수작업으로 이를 분석하기란 거의 불가능할 뿐 아니라 정확도에 많은 문제가 있다. 그래서 본 연구에서는 방대한 생물학 자료를 효율적으로 분석하기 위해 자동화된 알고리즘을 개발하여 수작업에 의존하던 기존방식을 개선하였다. 이 알고리즘으로 51개의 RNA와 단백질간의 결합구조로 구성된 Dataset과 129개의 DNA와 단백질 간의 결합구조로 구성된 Dataset 분석하여 각각의 경우에 있어서의 결합성향과 결합유형을 찾아내었다. 이러한 본 연구의 결과가 아직 구조가 밝혀지지 않은 단백질-핵산간의 결합부위를 예측하는 알고리즘 개발에 기초 자료로 이용될 수 있다. 신약을 개발하는 과정에서 표적단백질의 결합부위를 예측하는데 활용될 수 있을 것이다.

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A Study on Compound Technique for Increasing the Bandwidth of Microstrip Antennas Using the Parallel Coupled Lines (평행 결합 선로를 이용한 복합 광대역 기법 적용 마이크로스트립 안테나에 관한 연구)

  • 김정일;한만군;윤영중
    • Proceedings of the Korea Electromagnetic Engineering Society Conference
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    • 2000.11a
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    • pp.328-332
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    • 2000
  • 본 논문에서는 기생 패치 구조와 적층 구조의 광대역 마이크로스트립 안테나에 평행 결합 선로 형태의 광대역 임피던스 정합 회로를 결합하여 쉽게 추가적인 임피던스 대역폭 개선을 얻을 수 있음을 제안하였다. 평행 결합 선로 형태의 광대역 임피던스 정합 회로 설계를 위하여 분포 회로 방식의 반복적인 방법을 제시하였고. 설계\ulcorner제작 결과 기생 패치 구조와 적층 구조에서 각각 56.23%와 16.45%의 추가적인 임피던스 대역폭 개선을 이룰 수 있었다. 그리고 방사 패턴과 측정된 이득을 보면 평행 결합 선로의 결합으로 인한 방사 패턴에서의 큰 변화는 보이지 않았고, 이득에서는 평행 결합 선로 부분의 커플링 손실로 인해 최대 이득이 약 1 dB 정도 감소하는 것을 확인할 수 있었다.

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Magnetic Properties of Fe-Pt Nanowires with Linear and Zigzag Structures (전이금속 Fe-Pt 나노선의 자기적 성질)

  • Jang, Y.R.;Jo, Chul-Su;Lee, J.I.
    • Journal of the Korean Magnetics Society
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    • v.15 no.6
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    • pp.299-302
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    • 2005
  • We investigated the structural md magnetic properties of Fe-Pt nanowires with linear and zigzag structures by using first-principle calculational methods. Structural degrees of freedom are optimized, the bond lengths and bond angles are determined, magnetic moments, spin density, and density of states are calculated. Results show that the zigzag structure is more stable than the linear one, and has a longer bond length and smaller magnetic moments for both Fe and Pt atoms.

비정질 결정도에 따른 박막의 결합구조의 변화

  • O, De-Re-Sa
    • Proceedings of the Korean Society Of Semiconductor Equipment Technology
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    • 2007.06a
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    • pp.39-42
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    • 2007
  • 최근 C-H 수소결합의 강한 상한 상호작용에 의하여 blue shift를 나타내는 현상이 보고 되고 있다. 비정질 불화탄소의 화학적 이동유기 절연막의 경우, 화학적 이동의 원인은 매우 서로 다른 원인에 발생하지만 이러한 물질의 상호작용은 친핵성 첨가반응에 의한 것임을 확인하였다. a-C:F 박막의 화학적 이동은 XRD 패턴에 의해서 결합 구조와 연관이 있으며, C-H 결합이 불소에 의한 끌림현상으로부터 발생되면서 비정질 구조로 변하는 것을 확인하였다.

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Multi-channel Bandpass Filtering Characteristics of a Fiber to $LiMbO_3$ MMOW Coupler (광섬유와 리튬나오베이트 다중모드 도파로 결합기의 다중 채널 대역통과 필터 특성)

  • 손경락;이남권;송재원
    • Proceedings of the Optical Society of Korea Conference
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    • 2001.02a
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    • pp.216-217
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    • 2001
  • 광섬유와 평면 도파로를 결합한 도파로 구조에서 광 결합 현상은 다양한 응용 가능성 때문에 이론적으로 또는 실험적으로 많은 연구가 되어오고 있다. 광섬유는 단일모드를 이용하고 적당한 곡률이 주어진 블록에 고정한 후 연마하여 클래딩의 일부를 제거하고, 그 상부에 다중모드 평면 도파로(Multi-Mode Overlay Waveguide; MMOW)를 구성한다. 제작된 결합기 구조에서 평면 도파로는 광섬유의 감쇠장 결합(Evanescent field coupling)을 유도하게 되므로, 소자의 특성은 평면 도파로의 구조와 조건에 의해 결정된다. (중략)

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A study on design and implementation of oscillator with intermediate synchronized coupling in the X-Band (X-대역에서 중간동기결합 발진기의 설계 및 제작에 관한 연구)

  • Kim, Hee-Gon;Seo, Kyung-Hwan
    • KSCI Review
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    • v.15 no.1
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    • pp.11-16
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    • 2007
  • 본 논문에서는 X-Band용 두 개의 발진기를 사용하여 중간결합을 통한 위상잡음 특성을 개선할 목적으로 중간동기결합 구조의 발진기를 제안하였다. 제안된 구조는 각각의 발진기는 Hai-Pin을 이용한 발진기로 설계를 하였으며, 두 발진기가 중간결합을 위해 갖는 위상차는 발진기들의 바이어스를 이용하여 조정을 한다. 제안된 구조의 수치계산을 통한 설계, 하드웨어 구현 및 실험을 통해 측정된 결과를 제시하였으며, 측정 결과로 위상잡음 특성이 약 100dBc/Hz 개선됨을 보였다.

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The Directional Coupler Using the Vertical Coupling Structure (수직 결합 구조를 이용한 방향성 결합기)

  • Yun, Tae-Soon
    • The Journal of the Korea institute of electronic communication sciences
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    • v.12 no.3
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    • pp.445-450
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    • 2017
  • In this paper, the directional coupler with half-power division is designed and fabricated by using the vertical coupling structure based on the CPW transmission-line. Even-mode and odd-mode of the vertical coupling structure can be analyzed by the conventional CPW-line and the CBCPW-line, respectively, with half thickness of the substrate. The directional coupler is designed by using the tefron substrate with the dielectric constant of 2.55 and the thickness of 0.76mm. Manufactured directional coupler has the center frequency of 2.45 GHz and the bandwidth of 66.1%. Also, the return loss and isolation are 19.52dB and 19.47dB, respectively, at the center frequency.

CPW Directional Couplers with Enhanced Directivity by Using Expanded Slot Width as Compensation Structures (Slot 폭의 조절을 이용하여 향상된 방향성을 갖는 CPW방향성 결합기의 설계)

  • 이창언;최경민;박정훈;신철재
    • The Journal of Korean Institute of Electromagnetic Engineering and Science
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    • v.15 no.4
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    • pp.368-378
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    • 2004
  • In this paper, we proposed the compensation structures for the enhanced directivity of CPW(Coplanar waveguide) directional couplers with finite-extent backed conductor. The proposed compensation structures are. realized by expanding the slot width between signal line and ground plane in center region of couplers. The CPW couplers with expanded slot have the same phase velocity for even and odd mode because of added inductance and changed capacitance appropriately, so the enhanced directivity is accomplished. The designed CPW directional couplers have good directivity and matching characteristic at center frequency in simulation and measurement.