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Antibiofilm Activity and Binding Specificity of Polyclonal DNA Aptamers on Staphylococcus aureus and Escherichia coli

  • Arizah Kusumawati;Apon Zaenal Mustopa;Rifqiyah Nur Umami;Adi Santoso;I Wayan Teguh Wibawan;Agus Setiyono;Mirnawati Bachrum Sudarwanto
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제50권3호
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    • pp.328-336
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    • 2022
  • Aptamers are short, chemically synthesized, single-stranded DNA or RNA oligonucleotides that fold into unique three-dimensional structures. In this study, we aim to determine the antibiofilm activity and binding specificity of the six polyclonal DNA aptamers (S15K3, S15K4, S15K6, S15K13, S15K15, and S15K20) on Staphylococcus aureus BPA-12 and Escherichia coli EPEC 4. Aptamer S15K6 showed the highest percentage of antibiofilm activity against S. aureus BPA-12 (37.4%) as shown by the lowest OD570 value of 0.313. Aptamer S15K20 showed the highest percentage of antibiofilm activity against E. coli EPEC 4 (15.4%) as shown by the lowest OD570 value of 0.515. Aptamers S15K13 and S15K20 showed antibiofilm activities against both S. aureus BPA-12 and E. coli EPEC4, and thus potentially have broad reactivity. Furthermore, based on the binding capacity and Kd values from our previous study, the binding specificity assay of selected polyclonal DNA aptamers (S15K3 and S15K15) against S. aureus BPA-12, E. coli EPEC 4, S. aureus BPA-6, S. agalactiae, E. coli MHA-6, and Listeria monocytogenes were performed using qPCR. Aptamers S15K3 and S15K15 showed specific binding to S. aureus BPA-12, E. coli EPEC 4, S. aureus BPA-6, and S. agalactiae, but could not bind to E. coli MHA-6 and L. monocytogenes. Therefore, this study showed that the polyclonal DNA aptamers have antibiofilm activity and were able to bind to S. aureus BPA-12 and E. coli EPEC 4 bacteria.

Spectral Properties of k-quasi-class A(s, t) Operators

  • Mecheri, Salah;Braha, Naim Latif
    • Kyungpook Mathematical Journal
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    • 제59권3호
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    • pp.415-431
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    • 2019
  • In this paper we introduce a new class of operators which will be called the class of k-quasi-class A(s, t) operators. An operator $T{\in}B(H)$ is said to be k-quasi-class A(s, t) if $$T^{*k}(({\mid}T^*{\mid}^t{\mid}T{\mid}^{2s}{\mid}T^*{\mid}^t)^{\frac{1}{t+s}}-{\mid}T^*{\mid}^{2t})T^k{\geq}0$$, where s > 0, t > 0 and k is a natural number. We show that an algebraically k-quasi-class A(s, t) operator T is polaroid, has Bishop's property ${\beta}$ and we prove that Weyl type theorems for k-quasi-class A(s, t) operators. In particular, we prove that if $T^*$ is algebraically k-quasi-class A(s, t), then the generalized a-Weyl's theorem holds for T. Using these results we show that $T^*$ satisfies generalized the Weyl's theorem if and only if T satisfies the generalized Weyl's theorem if and only if T satisfies Weyl's theorem. We also examine the hyperinvariant subspace problem for k-quasi-class A(s, t) operators.

4세대 가속기 고정밀 고전압CCPS 개발 (Development of high-precision high-voltage CCPS)

  • 문용조;박성수;김상희;권세진;장성덕;이병준;이흥수;강흥식;황정연;김동수;이수영;신현석;장계용;노성채
    • 전력전자학회:학술대회논문집
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    • 전력전자학회 2012년도 전력전자학술대회 논문집
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    • pp.172-173
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    • 2012
  • 포항가속기 연구소에서는 4세대 가속기의 전자를 가속시키기 위해서 100ppm(0.01%) 이하의 고전압 안정도를 가진 200MW 펄스 모듈레이터가 요구된다. 그러므로 본 연구소에서는 고전압 안정도를 가진 고정밀 고전압 CCPS를 일반 CCPS와 병행하여 산업체와 함께 공동 개발을 진행하였다. 개발된 일반 CCPS의 사양은 50 kV, 30 kJ/sec, 600mA, 1000ppm이하이고, 고정밀 CCPS의 사양은 50 kV, 5 kJ/sec, 100mA, 100ppm이하이다. 본 논문에서는 CCPS의 개발 및 실제 모듈레이터에 설치하여 시험한 결과를 발표하고자 한다.

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Streptococcus salivarius K12의 배양조건에 따른 항균활성의 특징 (Characteristics of antimicrobial activity of Streptococcus salivarius K12 by culture condition)

  • 송영균;이성훈
    • 구강회복응용과학지
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    • 제37권4호
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    • pp.244-250
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    • 2021
  • 목적: 본 연구의 목적은 Streptococcus salivarius K12의 성장과 항균활성에 대한 배양조건의 영향을 알아보는 것이다. 연구 재료 및 방법: S. salivarius K12는 동물 또는 식물 단백질을 함유한 배지 또는 중성 및 산성 조건의 배지에서 배양되었다. S. salivarius K12의 성장은 2시간마다 분광광도계로 측정하였다. S. salivarius K12의 Streptococcus mutans, Porphyromonas gingivalis 및 Candida albicans에 대한 항균 또는 항진균 활성을 배양액을 이용한 감수성 분석으로 조사하였다. 결과: S. salivarius K12의 성장은 식물 단백질과 중성 pH 조건에서 더 빠른 성장을 보였다. S. salivarius K12의 항균 및 항진균 활성은 동물성 단백질보다 식물성 단백질을 함유한 배지에서 더 강하게 나타났다. 결론: S. salivarius K12를 세균성 구강질환에 적용하기 위해서는 S. salivarius K12가 구강 내에서 군집화하여 항균 활성을 향상시키기 위한 보조물질이 필요할 수 있다.

고정밀 고전압 CCPS을 이용한 XFEL 200MW 펄스 모듈레이터 시험 (XFEL Pulse Modulator Test using High Precision High Voltage CCPS)

  • 박성수;김상희;권세진;이흥수;강흥식;김동수;신현석
    • 전력전자학회:학술대회논문집
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    • 전력전자학회 2014년도 전력전자학술대회 논문집
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    • pp.97-99
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    • 2014
  • 포항가속기 연구소에서 4세대 전자를 가속시키기 위하여 RF 공급원으로 사용하는 펄스 모듈레이터의 고전압 안정도는 50ppm 이하의 고전압이 요구된다. 200 MW 모듈레이터에 공급하기 위하여 개발된 고전압 CCPS사양은 50 kV, 120 kJ/sec, 2400mA, 20ppm이하이다. XFEL용 모듈레이터는 고정밀 고전압 CCPS를 적용하여 운전하였으며 모듈레이터 사양은 400kV, 500A, 8us, 60Hz, beam voltage stability 0.005(%)이다. 본 논문에서는 개발한 고정밀 고전압 CCPS를 사용하여 시험한 모듈레이터의 시험 결과에 대하여 발표하고자 한다.

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PAL-XFEL 200MW 펄스 모듈레이터용 고정밀 고전압 CCPS 개발 (Development of High Precision High Voltage CCPS for PAL-XFEL)

  • 박성수;김상희;권세진;이병준;이흥수;강흥식;고인수;김동수;서민호;이수형;신현석;장계용;노성채
    • 전력전자학회:학술대회논문집
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    • 전력전자학회 2013년도 전력전자학술대회 논문집
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    • pp.132-134
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    • 2013
  • 포항가속기 연구소에서 4세대 전자를 가속시키기 위하여 RF 공급원으로 사용하는 펄스 모듈레이터의 고전압 안정도는 100ppm 이하의 고전압이 요구된다. 따라서 본 연구소에서 산업체와 연계하여 인버터를 적용한 고정밀 고전압 CCPS를 개발하였다. 개발된 고정밀 고전압 CCPS의 사양은 50 kV, 5 kJ/sec, 100 ppm 이하 1set와 50 kV, 30 kJ/sec, 1000 ppm 4set이다. 고정밀 고전압 CCPS를 시험하기 위하여 4세대용 200 MW 모듈레이터를 설치하여 시험하였다. 본 논문에서는 고정밀 고전압 CCPS의 개발하고 제작하여 모듈레이터에 적용하여 시험한 내용을 보이고자 한다.

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