• 제목/요약/키워드: $\alpha$-tubulin

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순창군 장류로부터 분리된 황국균의 동정 및 특성 (Identification and Characterization of Aspergillus oryzae Isolated from Soybean Products in Sunchang County)

  • 임은미;이지영;모하메드;한갑훈;이보순;조용식;김현영
    • 한국균학회지
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    • 제42권4호
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    • pp.282-288
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    • 2014
  • 본 연구에서는 순창지역에서 만들어지는 장류에서 곰팡이를 분리하고 동정하여 보다 안전하고 기능성이 높은 발효제품을 위한 균주를 확보하고자 하였다. 순창지역에서 생산되는 장류 제품으로부터 곰팡이를 분리하여 ${\beta}$-tubulin 유전자 분석 통해 10개의 균주가 Aspergillus oryzae/flavus complex임을 알 수 있었다. 보다 정확한 동정을 위하여 아플라톡신 클러스터 유전자 중에 하나인 omtA의 염기서열을 증폭하여 A. oryzae와 A. flavus 표준 균주의 omtA 서열과 함께 계통 분류한 결과, A. oryzae의 표준 균주와의 유연관계가 높음을 알 수 있었다. 또한 norB-cypA 사이의 염기서열을 증폭한 결과 500 bp이 증폭 산물이 확인되었는데 이는 표준 균주인 A. oryzae의 norB-cypA 사이의 염기서열 증폭 산물과 동일한 크기임을 확인할 수 있었다. A. oryzae로 확인된 10균주를 활용하여 코지를 제조하고 ${\alpha}$-amylase 활성과 protease 활성을 측정하였다. Protease 활성은 6, 13, 17, 27, 37, 그리고 38 균주로 제조된 코지는 대조구(시판되고 있는 종균으로 제작한 코지)보다 2배 정도 높은 protease 활성을 보였으며, ${\alpha}$-amylase 활성은 257~320 U/mL로 측정되었다. 식품안전성을 위한 아플라톡신 분비 확인 결과, 63번 균주로 제조된 코지를 제외한 모든 코지에서 아플라톡신을 만들지 않는 것으로 확인되어, 순창에서 분리된 A. oryzae는 추후 메주 접종균으로 개발할 수 있음을 보여주었다.

유전자변형 배추를 섭취한 마우스 장기에서의 Housekeeping Gene의 발현 분석 (Analysis of Housekeeping Gene Expression in Mice Administered to GM and non-GM Cabbage)

  • 이동엽;허진철;김경해;한송이;조현석;이상한
    • 한국식품저장유통학회지
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    • 제15권1호
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    • pp.84-87
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    • 2008
  • 유전자 변형 작물은 생산성 측면에서 많은 장점이 있지만 이를 섭취할 경우 잠재적인 위험 요소들에 의해 많은 문제가 대두대고 있다. 본 연구는 저항성유전자를 이입한 배추에서 Profillin, Tubulin-${\alpha}$ (Tub-${\alpha}1$), Heat-shock protein (Bchsp 17.6) and Ubiquitin conjugating enzyme (UBE)의 발현과 이를 30일간 섭취한 마우스에서 ${\beta}$-actin(${\beta}$-act), ${\beta}$-2-microglobulin (B2m), Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) and ${\beta}$-glucuronidase (Gus)의 발현 정도를 RT-PCR을 통해 알아보았다. 실험 결과 저항성유전자를 이입한 배추와 그렇지 않은 배추의 유전자 발현 패턴은 큰 차이를 보이지 앓았으며, 이를 섭취한 마우스 장기에서도 발현에 따른 큰 차이는 나타나지 않았다.

베타 튜불린에 의한 포스포리파제 C-감마1의 활성화 (Phospholipase C-γ Activation by Direct Interaction with β-Tubulin Isotypes)

  • 이인범;김성국;최장현;서판길;장종수
    • 생명과학회지
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    • 제16권4호
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    • pp.612-617
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    • 2006
  • 포스포리파제 C-감마1$(phospholipase\;C-{\gamma}\;1;\;PLC-{\gamma}\;1)$은 활성화될 경우 세포 내의 이차전령인 inositol 1,4,5-trisphosphate$(IP_3)$와 diacylglycerol(DG)을 생성하는 중요한 세포 신호전달 분자이다. 튜불린은 미세소관과 방추사의 주요 구성 단백질로서 알파형과 베타형의 두 가지 동위형이 있는데 이들은 모든 진핵세포에 존재하면서 이형 이합체를 형성한다. 이 중 베타형 튜불린은 사람의 경우 6종의 또 다른 동위형이 존재하는 것으로 밝혀졌는데 이들은 각 조직에서 그 발현양상이 서로 다르게 나타난다. 이전의 연구에서 우리들은 $PLC-{\gamma}\;1$과 4종의 베타튜불린 동위형 즉, ${\beta}1$, ${\beta}2$, ${\beta}3$${\beta}6$이 세포 내에서 서로 결합할 수 있으며 또한 외부의 자극이 전달될 경우 이들 4종의 동위형이 $PLC-{\gamma}\;1$을 활성화시켜 준다는 사실을 보고한 바 있다. 이번 실험에서는 이전의 연구에서 조사하지 못하였던 베타 튜불린의 나머지 두 가지 동위형 즉, ${\beta}4$${\beta}5$$PLC-{\gamma}\;1$에 결합하여 $PLC-{\gamma}\;1$의 활성을 증가시켜줌으로서 세포 내에서의 신호전달계를 조절하고 있음을 확인하였다. 이 결과는 이전의 연구결과와 연관 지워볼 때, 6종의 모든 베타형 튜불린은 세포 외부의 자극이 있을 경우 $PLC-{\gamma}\;1$을 활성화시켜줌을 시사한다.

A Tubulin Inhibitor, N-(5-Benzyl-1,3-thiazol-2-yl)-3-(furan-2-yl)prop-2-enamide, Induces Anti-inflammatory Innate Immune Responses to Attenuate LPS-mediated Septic Shock

  • Park, Hyun Jung;Lee, Sung Won;Park, Hwangseo;Park, Se-Ho;Hong, Seokmann
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제35권11호
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    • pp.3307-3312
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    • 2014
  • The anti-inflammatory effect of a tubulin inhibitor, N-(5-benzyl-1,3-thiazol-2-yl)-3-(furan-2-yl)prop-2-enamide (1), on innate immune responses remains unclear. Thus, we investigated the effect of 1 on the immune responses mediated by lipopolysaccharide (LPS). The in vitro addition of 1 to dendritic cells and macrophages dose-dependently reduced tumor necrosis factor alpha production elicited by LPS stimulation. Additionally, the stimulation of natural killer (NK) and natural killer T (NKT) cells with 1 resulted in the decrease of interferon gamma ($IFN{\gamma}$) induced by LPS treatment. Moreover, 1 substantially reduced interleukin 12 in dendritic cells (DC) as well as $IFN{\gamma}$ in NKDCs induced by LPS in vitro. Furthermore, the in vivo administration of 1 ameliorated LPS/D-galactosamine-induced endotoxic lethality in mice. Taken together, our results demonstrate for the first time that 1 possesses anti-inflammatory properties, most notably by modulating LPS-induced innate immune responses. Therefore, 1 might have therapeutic potential for the treatment of inflammation-mediated diseases such as sepsis.

원목 및 톱밥배지 버섯 재배사 내 실내 공기서 분리한 미기록 진균 보고 (Unrecorded Fungal Species Isolated from Indoor Air in the Log Bed- and Sawdust Media-based Mushroom Cultivation Houses)

  • 안금란;김지은;김준영;김성환
    • 한국균학회지
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    • 제46권4호
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    • pp.495-503
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    • 2018
  • 2016년 4월부터 6월까지 표고 원목재배 임가 4곳과 표고 톱밥재배 임가 1곳의 재배사 내 실내 공기에서 진균을 포집 및 분리 동정하였다. 총 6개의 국내 미기록 진균(Cenangium acuum, Periconia macrospinosa, Neopestalotiopsissurinamensis, Metarhiziummarquandii, Trichoderma petersenii, Trichoderma paratroviride)을 분리하였으며 이들 균류에 대하여 형태학적 특성 및 internal transcribed spacer rDNA region, large subunitregion, ${\beta}-tubulin$ 또는 translation elongation factor $1{\alpha}$유전자 염기서열에 기반하여 계통학적 분석 결과를 기술하였다.

Botryosphaeria dothidea에 의한 오미자 줄기마름병 (Twig Blight on Chinese Magnolia Vain Caused by Botryosphaeria dothidea in Korea)

  • 박상규;김승한;이승열;백창기;강인규;정희영
    • 식물병연구
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    • 제22권1호
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    • pp.44-49
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    • 2016
  • 2015년 6월에 경북 문경시에서 재배하는 오미자에서 줄기마름증상이 발생하였다. 발병 초기에는 잎의 선단 부위부터 위축되면서 고사현상이 발생하였고, 병이 진행됨에 따라 줄기를 거쳐 식물체 전체가 고사하였으며 주변으로 전염되었다. 감염된 줄기에서 병원균을 분리배양하여 배양적, 형태적 특징을 관찰한 결과 해당 병원균은 Botryosphaeria속에 속하는 것으로 나타났으며, 인공접종에 의한 병원성 검정에서도 동일한 병징을 나타내었다. 병원균의 정확한 동정을 위해 ITS 영역과 ${\beta}$-tubulin, EF1-${\alpha}$ 유전자의 염기서열을 복합적으로 사용한 염기서열 분석을 수행하였으며, 분석 결과 오미자의 줄기마름 증상을 일으키는 원인균은 B. dothidea로 동정되었다. 지금까지 국내에서 B. dothidea에 의한 오미자의 병이 보고되지 않았기에 본 연구를 통해 국내 처음으로 B. dothidea에 의한 오미자 줄기마름병을 보고한다.

Fusarium avenaceum에 의한 복숭아 신규 과실 썩음병 발생 보고 (First Report of Peach Fruit Rot Caused by Fusarium avenaceum in Korea)

  • 허아영;구영모;최영준;김상희;정규영;최형우
    • 식물병연구
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    • 제26권1호
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    • pp.48-52
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    • 2020
  • 2019년 7월 안동지역 노지 재배지에서 복숭아에 과실 썩음병 피해가 발생하였다. 피해 과실에서는 병이 진전됨에 따라, 썩음증상과 함께, 흰색과 자주색을 띄는 균사 및 포자가 관찰되었다. 병원균을 순수 분리한 뒤, 건전한 복숭아 과일에 접종하였을 때 동일한 과실 썩음 증상을 유도하였다. 분리된 병원균의 internal transcribed spacer (ITS), translation elongation factor 1-alpha (TEF) 그리고 β-tubulin (β-TUB) sequence 분석을 통해 Fusarium avenaceum으로 동정되었다. 따라서, 이 증상을 Fusarium avenaceum에 의한 "복숭아 과실 썩음병"으로 명명하고자 한다. 분리된 균주는 농촌진흥청 국립농업과학원 미생물 은행[Korean Agricultural Culture Collection(KACC)]에 기탁되었다(KACC accession number 48936).

Keeping house: evaluation of housekeeping genes for real-time PCR in the red alga, Bostrychia moritziana (Florideophyceae)

  • Shim, Junbo;Shim, Eunyoung;Kim, Gwang Hoon;Han, Jong Won;Zuccarello, Giuseppe C.
    • ALGAE
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    • 제31권2호
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    • pp.167-174
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    • 2016
  • Biological response of cells to variable conditions should affect the expression level of certain genes. Quantification of these changes in target genes needs stable internal controls. Real-time quantitative polymerase chain reaction (PCR) has traditionally used reference or ‘housekeeping’ genes, that are considered to maintain equal expression in different conditions, to evaluate changes in target genes between samples and experimental conditions. Recent studies showed that some housekeeping genes may vary considerably in certain biological samples. This has not been evaluated in red algae. In order to identify the optimal internal controls for real-time PCR, we studied the expression of eleven commonly used housekeeping genes; elongation factor 1-alpha, glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, β-actin, polyubiquitin, 30S ribosomal gene, 60S ribosomal gene, beta-tubulin, alpha-tubulin, translation initiation factor, ubiquitin-conjugating enzyme, and isocitrate dehydrogenase in different life-history stages of Bostrychia moritziana. Our results suggest that glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) and 30S ribosomal gene, have the most stable gene expression levels between the different life history stages (male, female, carposporophyte, and tetrasporophyte), while the other genes are not satisfactory as internal controls. These results suggest that the combinations of GAPDH and 30S would be useful as internal controls to assess expression level changes in genes that may control different physiological processes in this organism or that may change in different life history stages. These results may also be useful in other red algal systems.