Abstract
Genomic fingerprinting methods are useful in determining relatedness among bacterial strains. However, random coincidences in sizes of two DNA fragments in two different fingerprints may occur, resulting in erroneous interpretation of relatedness between two bacterial genomes. In this study, I estimated the probability of occurrence of DNA bands of identical size in fingerprints of two unrelated genomes, so that the significance of fingerprint-based estimation of genome relatedness could be analyzed. The probability could be estimated as outputs of a function formulated with the three parameters: the numbers of observed fragments, all possible sizes of fragments and observed fragments common in a given pair of fingerprints. The parameter most instrumental to significance of relatedness estimation was the number of all possible sizes of fragments. To keep the number of coincidentally-common size of fragments below 10, about 200 fragments should be distinguishable in the fingerprints.
유전체 지문 분석법은 세균 균주간의 친연성을 판정하는데 유용하다. 그러나 친연성이 낮은 두 균주의 지문 사이에서 우연히 발생하는 DNA 단편 크기의 일치성은 유전형질의 일치성의 해석에 오차를 유발한다. 본 연구는 임의의 두 유전체 지문에서 우연히 DNA 단편의 크기가 일치할 확률을 정량하여, 유전체 지문에 근거한 친연성 해석의 유의성을 고찰하였다. 유전형질 일치성 없이 단편 크기가 일치할 확률은 관찰되는 단편의 수, 관찰 가능한 전체 단편의 수와 크기가 일치하는 단편의 수로부터 계산될 수 있는 함수로 분석되었다. 유의성에 가장 큰 영향을 미치는 독립 매개변수는 전체 단편의 수였으며, 우연한 공통 단편의 수를 10개 미만으로 유지하기 위해서는 약 200개 이상의 단편이 지문에서 관찰될 수 있어야 하는 것으로 계산되었다.
