Journal of the Korean Chemical Society (대한화학회지)

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Detection of p53 Mutation in Colorectal Cancer Using PCR-SSCP and DHPLC

대장암에서 PCR-SSCP와 DHPLC를 이용한 p53 돌연변이의 검출

  • Sang-Bum Park (Department of Chemistry, College of Natrural Science, Dankook University) ;
  • Sang-Man Han (Department of Chemistry, College of Natrural Science, Dankook University) ;
  • Youn-Hyoung Nam (Department of Chemistry, College of Natrural Science, Dankook University) ;
  • Won-Cheoul Jang (Department of Chemistry, College of Natrural Science, Dankook University)
  • 박상범 (단국대학교 자연과학대학 화학과) ;
  • 한상만 (단국대학교 자연과학대학 화학과) ;
  • 남윤형 (단국대학교 자연과학대학 화학과) ;
  • 장원철 (단국대학교 자연과학대학 화학과)
  • Published : 2003.10.20
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Abstract

Structural alteration of p53 and overexpression of p53 protein are the most common genetic abnormalities in various kinds of human cancer. Mutations in the p53 tumor-suppressor gene are usually associated with an advanced development of colorectal cancer characterized by the transition from the adenoma to carcinoma stage. Mutations in exons 5-8 of the p53 gene were analyzed by the polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism(PCR-SSCP) and denaturing high performance liquid chromatography(DHPLC). SSCP analysis detected 7 mutations(C13109>T) in 50 colorectal cancer samples(14%) at exon 5, and DHPLC analysis detected 7 mutations (C13109>T) and 2 mutation(C13202>A, C13204>G) in 50 colorectal cancer samples(18%) at exon 5. All of 9 mutations were proved by sequencing analysis. We conclude that DHPLC is a highly sensitive and specific method for p53 gene mutations.

p53 유전자의 변이는 다양한 인체암 중 가장 일반적인 유전자적 변화로 알려져 있으며, 양성에서 악성 대장암으로 전이되는 과정에서 연관이 있는 것으로 알려져 있다. 본 연구에서는 PCR-SSCP와 DHPLC를 이용하여 대장암 환자의 조직에서 p53 유전자의 엑손 5-8에서 돌연변이를 분석하였다. SSCP에서는 50개의 샘플중 엑손 5에서 C13109>T 형태의 돌연변이가 7례가(14%) 발견되었고, DHPLC에서는 C13109>T 7례와 C13202>A, C13204>G 형태의 돌연변이 2례, 모두 9례의(18%) 변이가 검출되었다. DHPLC 분석법을 이용하여 SSCP에서 발견하지 못했던 2례(4%)의 변이를 더 발견하였다. 최종적으로 염기서열분석법을 통해 위의 결과를 확인하였고, p53 돌연변이 검출법으로 SSCP보다 DHPLC가 더 감도가 좋고 효과적인 검출법임을 확인하였다.

Keywords

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