Proceedings of the Korean Information Science Society Conference (한국정보과학회:학술대회논문집)

Korean Institute of Information Scientists and Engineers (한국정보과학회)
권호 표지

SMILE : Development of an Integrated LIMS for Management and Analysis of Microarray Data

SMILE : 마이크로어레이 데이터 저장.관리.분석을 위한 통합 LIMS 개발

  • Lee, Jeong-Won (Dept. of Computer Engineering, Pusan National University) ;
  • Jin, Hee-Jeong (Dept. of Computer Engineering, Pusan National University) ;
  • Cho, Hwan-Gue (Dept. of Computer Engineering, Pusan National University)
  • 이정원 (부산대학교 컴퓨터공학과) ;
  • 진희정 (부산대학교 컴퓨터공학과) ;
  • 조환규 (부산대학교 컴퓨터공학과)
  • Published : 2006.10.20
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Abstract

마이크로어레이 실험의 등장으로 한 번에 수백 개에서 수천 개의 유전자를 실험할 수 있게 되었다. 이는 기존의 실험과 비교했을 때 질적인 측면과 양적인 측면에서 가히 혁신적이라 할 수 있다. 마이크로어레이 칩을 이용한 실험에서 쏟아져 나오는 엄청난 데이터를 비교, 분석, 관리하기 위해서는 실험실의 마이크로어레이 분석 소프트웨어나 시스템간의 데이터 형식이 호환되어야 하며, 소프트웨어의 지원 또한 획기적이고 효율적이어야 한다. 본 논문에서는 다양한 종류의 마이크로어레이 입력 데이터 및 분석 데이터를 다룰 수 있고, 표준 파일 형식으로의 변환 기능을 제공하며, 마이크로어레이 이미지 분석용 소프트웨어인 ArrayMall[1,2]과 유전자 조절 네트워크 분석 시스템인 GENAW[3]를 통합하고 마이크로어레이 실험데이터의 분석, 관리 및 데이터 공유를 위한 분산 시스템인 SMILE[4]에 대해 소개한다.

Keywords