Proceedings of the Korean Information Science Society Conference (한국정보과학회:학술대회논문집)

  • 2006.10a
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  • Pages.11-16
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  • 2006
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  • 1598-5164(pISSN)
Korean Institute of Information Scientists and Engineers (한국정보과학회)
권호 표지

Inference of Gene Regulatory Program using Local Alignment

지역정렬을 이용한 유전자 발현 조절 프로그램 예측

  • Lee, Ji-Yeon (Dept. of Computer Science, Pusan National University) ;
  • Jin, Hee-Jeong (Dept. of Computer Science, Pusan National University) ;
  • Cho, Hwan-Gue (Dept. of Computer Science, Pusan National University)
  • 이지연 (정보컴퓨터공학과, 부산대학교) ;
  • 진희정 (정보컴퓨터공학과, 부산대학교) ;
  • 조환규 (정보컴퓨터공학과, 부산대학교)
  • Published : 2006.10.20
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Abstract

세포의 활동은 단순히 하나의 유전자의 발현으로 설명되기보다 여러 유전자와 그로 인해 생성된 단백질의 상호 작용에 의해 나타난다. 또한 마이크로어레이 실험을 통해 세포 내의 유전자 발현에 대한 정보를 알 수 있게 되고, Chromatin IP 마이크로어레이 실험을 통해 신뢰도가 높은 유전자 발현 조절 관계 데이터를 얻을 수 있게 되면서, 유사한 기능과 유사한 발현 패턴을 보이는 유전자들을 그룹으로 묶어 유전자 모듈로 규정하고 이를 하나의 유전자 조절 네트워크로 구성하고, 분석하는 연구들이 진행되고 있다. 본 논문에서는 ChIP 실험 데이터와 유전자 발현 데이터를 이용하여 지역 정렬을 수행해 하나의 유전자 모듈을 조절하는 조절 프로그램을 예측하는 알고리즘에 대해 기술한다. 조절 프로그램은 유전자 조절 모듈을 조절하는 조절자들의 역할 및 발현 여부에 따른 유전자 조절 모듈 내 유전자들의 발현을 설명할 수 있는 것이다.

Keywords