DNA damage by UV and environmental agents are the major cause of genomic instability that needs to be repaired, otherwise it give rise to cancer. Accordingly, mammalian cells operate several DNA repair pathways that are not only responsible for identifying various types of DNA damage but also involved in removing DNA damage. In mammals, nucleotide excision repair (NER) machinery is responsible for most, if not all, of the bulky adducts caused by UV and chemical agents. Although most of the proteins involved in NER pathway have been identified, only recently have we begun to gain some insight into the mechanism by which proteins recognize damaged DNA. Binding of Xeroderma pigmentosum group C protein (XPC)-hHR23B complex to damaged DNA is the initial damage recognition step in NER, which leads to the recruitment of XPA and RPA to form a damage recognition complex. Formation of damage recognition complex not only stabilizes low affinity binding of XPA to the damaged DNA, but also induces structural distortion, both of which are likely necessary for the recruitment of TFIIH and two structure-specific endonucleases for dual incision.
Proceedings of the Korean Society of Applied Pharmacology
/
한국응용약물학회 1993년도 제2회 신약개발 연구발표회 초록집
/
pp.137-137
/
1993
방사선, 자외선, 화학물질 등 여러 변이원에 의해 생긴 DNA 손상의 대부분은 생체내에 존재하는 효소들에 의해 수복(repair)되어 DNA는 안정하게 유지된다. T$_4$ phage 유래의 T$_4$ endonuclease V는 자외선에 의해 DNA에 pyrimidine dimer가 생겼을때 이것을 특이적으로 절제 수복하는 효소이다. 인간의 질환인 색소성 걸피증(Xeroderma pigmentosum)은 태양광선, 특히 자외선에 의해 고빈도로 피부암을 발생한다. 이 질환은 유전적으로 DNA 수복기구에 장애가 있기 때문에 일어난다. 색소성 건피증의 배양세포에 T$_4$ endonuclease V를 도입하면 세포의 DNA 수복능력이 회복되기 때문에 인간과 phage라는 서로 멀리 떨어진 생물종에 공통의 DNA 수복기구가 존재하고 있다는 것을 알 수 있다.
Aim: Individual differences in chemosensitivity and clinical outcome of non-small-cell lung cancer (NSCLC) patients may be induced by host inherited factors. We investigated the impact of XPD Arg156Arg, XPD Asp312Asn, XPD Asp711Asp and XPD Lys751Gln gene polymorphisms on the efficacy of platinum-based chemotherapy in NSCLC patients. Methods: A total of 496 were consecutively selected from the Affiliated Hospital of Nantong University between Jan. 2003 and Nov. 2006, and all patients were followed-up until Nov. 2011. The genotyping of XPD Arg156Arg, XPD Asp312Asn, XPD Asp711Asp and XPD Lys751Gln was conducted by duplex polymerase-chain-reaction with the confronting-two-pair primer methods. Results: Individuals with XPD 312 C/T+T/T and XPD 711 C/T+T/T exhibited poor responses to chemotherapy when compared with the wild-type genotype, with adjusted ORs(95% CI) of 0.67(0.38-0.97) and 0.54(0.35-0.96), respectively. Cox regression showed the median PFS and OS of patients of XPD 312 C/T+T/T genotype and XPD 711 C/T+T/T genotype to be significantly lower than those with wild-type homozygous genotype. Conclusion: We found polymorphisms in XPD to be associated with response to platinum-based chemotherapy in NSCLC, and our findings provide information for therapeutic decisions for individualized therapy.
Dogan, Mutlu;Karabulut, Halil G.;Tukun, Ajlan;Demirkazik, Ahmet;Utkan, Gungor;Yalcin, Bulent;Dincol, Dilek;Akbulut, Hakan;Icli, Fikri
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
/
제13권4호
/
pp.1553-1556
/
2012
Introduction: Antimetabolites may cause severe toxicity and even toxic death in cancer patients. Our aim was to evaluate the relationship between antimetabolite toxicity and pharmacogenetics in patients with severe clinical toxicity or alanine transaminase (ALT) elevation after fluorouracil (5FU), capecitabine or methotrexate administration. Patients and Methods: Cancer patients with severe antimetabolite toxicity were evaluated for methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR) gene C667T, thymidilate synthase (TS) gene 5´UTR variable number of tandem repeats (VNTR), dihydroprymidine dehydrogenase (DPYD) gene IVS14+1G/A, Xeroderma pigmentosum (XPD) gene Lys751Gln and X-ray repair cross-complementing group 1 (XRCC1) gene Arg399Gln polymorphisms. Results: Eighteen patients were enrolled, with a male/female ratio of 0.8. They had osteosarcoma in methotrexate group (n=7), gastrointestinal malignancies in 5FU group (n=9) and breast cancer in the capecitabine group (n=2). Mucositis and dermatitis occurred in all groups, together with ALT elevation in the methotrexate group and 2 toxic deaths were encountered. DPYD, TS, MTHFR, XPD and XRCC1 gene polymorphism rare allele frequencies were observed to be higher than in the general population. Conclusion: Pharmacogenetics might contribute to tailored therapy.
Objective: To investigate the association between xeroderma pigmentosum group D (XPD) Asp312Asn polymorphism and esophageal cancer (EC) susceptibility by meta-analysis. Methods: We searched PubMed up to April 9th, 2012, to identify relevant papers, and 8 published case-control studies including 2165 EC patients and 3141 healthy controls were yielded. Odds ratios (ORs) with relevant 95% confidence intervals (CIs) were applied to assess the association between XPD Asp312Asn polymorphism and EC susceptibility with the Comprehensive Meta-Analysis software, version 2.2. Results: Overall, the meta-analysis results suggested the XPD Asp312Asn polymorphism to be significantly associated with EC susceptibility [(Asn/Asn+Asp/Asn) vs. Asp/Asp: OR=1.20, 95%CI=1.05-1.36, p=0.01; and Asp/Asn vs. Asp/Asp: OR=1.15, 95%CI =1.01-1.31, p=0.04]. In the subgroup analysis by ethnicity and cancer type, significantly associations were found for Caucasian populations [(Asn/Asn+Asp/Asn) vs. Asp/Asp: OR=1.26, 95%CI =1.08-1.47, p<0.001; Asp/Asn vs. Asp/Asp: OR=1.19, 95%CI =1.02-1.40, p=0.03] and esophageal squamous cell carcinoma [(Asn/Asn+Asp/Asn) vs. Asp/Asp: OR=1.19, 95%CI=1.01-1.41, p=0.04]. There was no heterogeneity and no publication bias existed. Conclusions: This meta-analysis shows that the XPD Asp312Asn polymorphism may be a risk factor for developing EC, especially for Caucasian populations and esophageal squamous cell carcinoma.
Ji, Geng;Lin, Yuan;Cao, Song-Yu;Li, Luo-Zhu;Chen, Xin-Long;Sun, Bu-Mei;Chen, Chuan-Jun;Ma, Hong-Xia
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
/
제13권10호
/
pp.4983-4988
/
2012
The xeroderma pigmentosum complementation group C gene (XPC) has been identified as important for repairing UV-related DNA damage. Some subtle changes in this gene may impair repair efficiency and influence susceptibility to human cancers, including skin cancer. Two polymorphisms in XPC, 939A>C (rs2228001) and 499C>T (rs2228000), are considered to have possible associations with the risk of skin cancer, but the reported results have been inconsistent. Here we performed a meta-analysis of the available evidence regarding the relationship between these two polymorphisms and the risk of skin cancer. All relevant studies were searched using PubMed, Embase and Web of Science before February 2012. A total of 8 case-control studies were included in this analysis, and no convincing associations between the two polymorphisms and risk of skin cancer were observed in any of the genetic models. Stratified analyses by skin cancer type also did not detect significant associations in any subgroup. This meta-analysis suggested that the XPC 939A>C and 499C>T polymorphisms may have little involvement in susceptibility to skin cancer.
Zhang, Tian;Sun, Jing;Lv, Min;Zhang, Lin;Wang, Xia;Ren, Ji-Chen;Wang, Bin
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
/
제14권2호
/
pp.701-705
/
2013
Polymorphisms in XPG are considered to contribute to the clinical outcome of patients receiving platinum drug chemotherapy. We aimed to investigate the role of five potential SNPs of XPG gene on the response to platinum-based chemotherapy in advanced Chinese NSCLC patients. A total of 451 patients with newly diagnosed and histopathologically confirmed primary NSCLC were consecutively collected. XPG rs2296147, rs4150261, rs17655, rs1047768 and rs2094258 were genotyped by the Taqman real-time polymerase chain reaction (PCR). In our study, we found patients carrying rs1057768 TT genotype had a significantly lower treatment response when compared with the CC genotype (OR=0.38, 95% CI=0.18-0.78). Patients carrying rs1047768 TT genotype showed a significantly short median PFS (11.2 months) and OS (13.6 months) than CC genotype, and the hazard ratios (HR) for PFS and OS were 2.06 (1.01-4.50) and 2.29 (1.21-2.49), respectively. Moreover, we found a significant decreased risk of death from NSCLC among patients carrying the rs2296147 TT genotype when compared with the CC genotype, the HR (95% CI) for OS being 0.50 (0.27-0.95). In conclusion, our study found that polymorphisms in rs1047768 C/T and rs2296147 C/T are associated with response to platinum-based chemotherapy in advanced NSCLC, and XPG polymorphisms could be predictive of prognosis.
Background: The predictive value of the xeroderma pigmentosum group D (XPD) Lys751Gln polymorphism regarding clinical outcomes of patients with colorectal cancer (CRC) receiving oxaliplatin-based chemotherapy has been evaluated in numerous published studies, but the results remain inconclusive. Therefore, we performed a meta-analysis to determine the precise role of the XPD Lys751Gln polymorphism in this clinical situation and optimize individual chemotherapy. Materials and Methods: A multiple search strategy was used to identify eligible studies. Pooled odds ratios (ORs), generalized odds ratio (ORG) and their 95% confidence intervals (CIs) were used to estimate the objective response, while hazard ratios (HRs) with 95%CIs were used for progression-free survival (PFS) and overall survival (OS). Results: A total of 17 studies including 2,286 patients met the inclusion criteria. Overall, the XPD 751Gln allele was associated with a non-significant reduced objective response to oxaliplatin-based chemotherapy in all patients or in the Asian and Caucasian subgroups. However, poor PFS and OS of CRC patients treated with oxaliplatin-based regimens were significantly related to the XPD 751Gln allele in the dominant model (PFS: HR=2.10, 95%CI: 1.65-2.67; OS: HR=3.18, 95%CI: 1.57-6.47). On stratified analysis by ethnicity, these relationships were more pronounced in Asians (PFS: HR=2.49, 95%CI: 1.79-3.47; OS: HR=5.25, 95%CI: 3.46-7.94) than in Caucasians (PFS: HR=1.73, 95%CI: 1.22-2.46; OS: HR=1.78, 95%CI: 1.06-2.99). Conclusions: The XPD Lys751Gln polymorphism may have prognostic value in patients with CRC undergoing oxaliplatin-based chemotherapy.
Zhou, Jue-Yu;He, Li-Wen;Liu, Jie;Yu, Hai-Lang;Wei, Min;Ma, Wen-Li;Shi, Rong
Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
/
제15권21호
/
pp.9347-9353
/
2014
Background: Excision repair crossing-complementing group 2 (ERCC2), also called xeroderma pigmentosum complementary group D (XPD), plays a crucial role in the nucleotide excision repair (NER) pathway. Previous epidemiological studies have reported associations between ERCC2 polymorphisms and non-Hodgkin lymphoma (NHL) risk, but the results have remained controversial. Materials and Methods: We conducted this meta-analysis based on eligible case-control studies to investigate the role of two ERCC2 polymorphisms (Lys751Gln and Asp312Asn) in determining susceptibility to NHL. Ten case-control studies from several electronic databases were included in our study up to August 14, 2014. Pooled odds ratios (ORs) and 95% confidence intervals (CIs) were calculated using fixed- or random-effects models to estimate the association strength. Results: The combined results based on all studies did not show any association between Lys751Gln/Asp312Asn polymorphisms and NHL risk for all genetic models. Stratified analyses by histological subtype and ethnicity did not indicate any significant association between Lys751Gln polymorphism and NHL risk. However, a significant reduced risk of NHL was found among population-based studies (Lys/Gln versus Lys/Lys: OR=0.87, 95% CI=0.77-0.99, P=0.037) but not hospital-based studies. As for Asp312Asn polymorphism, there was no evidence for the association between this polymorphism and the risk of NHL in all subgroup analyses. Conclusions: This meta-analysis suggests that there may be no association between Lys751Gln/Asp312Asn polymorphism and the risk of NHL and its two subtypes, whereas ERCC2 Lys751Gln heterozygote genotype may provide protective effects against the risk of NHL in population-based studies. Therefore, large-scale and well-designed studies are needed to clarify the effects of haplotypes, gene-gene, and gene-environment interactions on these polymorphisms and the risk of NHL and its different histological subtypes in an ethnicity specific population.
Background: Published data regarding the association between xeroderma pigmentosum group D (XPD) Lys751Gln and Asp312Asn polymorphisms and gastric cancer susceptibility havew been inconclusive. This meta-analysis was therefore performed toobtain a more precise estimation of any relationship. Materials and Methods: A comprehensive literature search was conducted to identify all case-control studies of Lys751Gln and Asp312Asn polymorphisms and susceptibility to gastric cancer. Summary odds ratios (ORs) and its 95% confidence intervals (95% CIs) were calculated using a random-effects model with the software STATA (version10.0). Results: A total of 12 case-control studies including 3,147 cases and 4,736 controls were included. Overall, no significant associations were found in some models (for Lys751Gln: Lys/Gln vs Lys/Lys: OR=1.144, 95% CI=0.851-1.541, Gln/Gln vs Lys/Lys: OR=1.215, 95% CI = 0.740-1.955, dominant model: OR=1.137, 95% CI=0.818-1.582; recessive model: OR=1.123, 95% CI=0.765-1.650; for Asp312Asn: Asp/Asn vs Asp/Asp: OR=1.180, 95% CI=0.646-2.154, dominant model: OR=1.380, 95% CI = 0.812-2.346), but significantly elevated susceptibility was found for Asp312Asn polymorphism in some models (Asn/Asn vs Asp/Asp: OR=2.045, 95% CI=1.254-3.335, recessive model: OR=1.805, 95% CI =1.219-2.672), for the additive model, the XPD Lys751Gln and Asp312Asn polymorphisms were not significantly associated with gastric cancer susceptibility. In stratified analyses, significantly elevated susceptibility was found for some models in the Chinese population. Conclusion: This meta-analysis suggested the XPD Asp312Asn polymorphism might be a potential biomarker of gastric cancer susceptibility in overall population, while both XPD Lys751Gln and Asp312Asn polymorphisms might be risk factors of gastric cancer susceptibility in Chinese.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.