• 인터넷정보학회논문지
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• 제5권5호
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• pp.1-15
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• 2004

본 논문에서는 효율적인 유전자 서열 데이터의 관리와 분석을 위한 웹 기반의 통합 시스템인 GWB(Gene WorkBench)의 설계와 구현에 대해 설명한다. 유전자 서열을 다루는 기존의 시스템들은 서열 데이터의 관리 기능과 분석 기능을 동시에 지원하는 경우가 드물고, 또한 분석 기능 역시 일부 혹은 단일 분석 기능만을 제공하는 단위 프로그램들이 대부분이다. 또 이러한 분석 프로그램들마저 서로 분산되어 있고 다른 수행환경을 필요로 한다. 따라서 이러한 프로그램들을 함께 이용하기 위해서는 많은 수작업과 변환작업을 필요로 하는 등 유전자 서열 데이터를 다루는 많은 생명과학 연구자들이 불편을 겪어왔다. 본 논문에서는 기존 시스템들의 단점을 보완하고 유전자 서열 연구에 효과적으로 도움을 줄 수 있는 보다 편리한 시스템을 구현하고자, 서열 데이터베이스 관리 기능과 다양한 분석 기능들을 하나의 시스템인 GWB로 동합하였다. GWB 시스템 설계의 가상 중요한 이슈는 서로 상이한 분석 프로그램들을 어떻게 하나의 시스템으로 통합할 것이며, 또 이들 프로그램들이 요구하는 서로 다른 서열 데이터 및 서열 데이터베이스 형태를 어떻게 제공할 수 있느냐는 것이다. GWB는 이 문제들을 해결하기 위해 공통의 입출력 인터페이스인 포장기를 이용하여 서로 다른 분석 프로그램들을 시스템에 통합시켰고, 공통 서열 데이터 형식인 KSF를 제안하였으며, 로컬 서열 데이터베이스를 관계형 데이터베이스부분과 색인 순차파일부분으로 나누어 구성하였고, 서로 상이한 서열 데이터 형식간의 변환 기능과 XML 파일로의 변환 기능을 제공하도록 하였다.유의하게 높았다 (P<0.01). 고형물질별 피복지수는 red clover는 V나 V+T(1 ： 1)로 피복한 종자에서 높았으며 tall fescue는 T, V, V + T(1 : 1로 피복한 종자)에서 가장 높게 나타났다(P<0.01). 종자피복에 있어서 red clover와 tall fescue 공히 접착제는 CF나 PVA로 하고 고형물질은 V나 V+T(1:1)로 피복함으로서 가장 좋은 피복효과를 얻을 수 있었다.. 쟁점 및 과제들이 제시되었다. cells of these species contained considerable to large amount of neutral mucin, and small to considerable amount of acid mucin, Most of the medium sized and small mucous cells contained neutral mucin and sialomucin, but a few mucous cells contained neutral mucin and strongly sulfomucin or neutral combined with strongly sulfomucin and sialomucin. Most of the esophageal mucous cells pf Bryzoichthys lysimus contained small amount of neutral mucin, while on the other hand a feww mucous cells contained small amount of neutral mucin and minimal

• 동양고전연구
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• 제69호
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• pp.115-146
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• 2017

본고는 조선시대 선생안의 디지털 아카이브를 위한 온톨로지(Ontology) 설계에 관한 연구이다. 선생안(先生案)은 조선시대 각 관청에서 소속 관원(官員)의 인적사항 및 인사이동을 기록한 일종의 인명부(人名簿)이다. 일반적으로 관원의 성명(姓名), 생년(生年), 자(字), 본관(本貫) 등의 인적사항 정보와 관직(官職), 제배일(除拜日), 도임일(到任日), 체임일(遞任日), 체임사유(遞任事由) 등의 인사이동 정보가 기록되어 있다. 현전(現傳)하고 있는 선생안은 국 내외 도서관 및 박물관에 소장되어 있으며 그 수는 176종으로 알려져 있다. 이 중에서 한국학중앙연구원 장서각에 소장된 47건의 선생안을 대상으로 선생안의 내용 및 구조를 검토하고, 선생안의 소장처, 선생안 기록 주체인 관청, 기록된 관직, 관원 등 관련 있는 주변의 내용을 담아낼 수 있는 온톨로지를 설계한다. 조선시대 선생안 온톨로지는 실물자료인 선생안 소장정보와 선생안에 기록된 내용의 특징을 반영해 관원, 관청, 인사이동에 초점을 맞추어 설계하였다. 온톨로지 설계는 대상자원을 클래스(Class)로 범주화 하고, 범주에 속하는 개체들(Individuals)은 공통의 속성(Attribute)를 갖도록 하였다. 그리고 각각의 개체들은 다른 개체와의 관계(Relation)를 명시적으로 표현할 수 있는 의미적인 관계어를 정의하였다. 클래스는 '선생안', '인물', '관청', '관직', '장소', '과거(科擧)', '기록', '개념' 등 8개로 범주화하였다. 관계, 속성의 설계는 기존에 설계되어 활용되고 있는 '더블린코어(Doublin Core)', '유로피아나데이터모델(Europeana Data Mode)', 'CIDOC-CRM', '과거 합격자 데이터베이스를 위한 데이터 모델' 등의 어휘를 참조하여 설계하였다. 기존 데이터모델에서 설계한 어휘를 사용한 경우에는 해당 데이터모델의 이름 공간(Namespace)을 사용하였으며, 필요한 경우 필자가 관계를 정의하였다. 설계한 온톨로지는 명릉선생안(明陵先生案)으로 구현 예시를 보이고, 하나의 선생안에서 다수의 선생안으로 대상을 확대하여 정보를 입력하였을 때 기대되는 효과와 활용 방안에 대해 모색해 보았다. 조선시대 선생안 온톨로지는 현전하는 선생안 176종 모두를 검토하여 설계된 것이 아니기 때문에 완벽한 온톨로지로써 기능하기에는 무리가 있다. 지속적으로 선생안의 정보가 입력되는 과정에서 온톨로지 모델의 수정 및 보완이 필요하며, 그 지향점은 선생안에 기록된 정보들을 체계적으로 정리하기 위한 것도 있지만, 선생안에서 확인되는 인물, 관직 등의 정보 요소가 이미 서비스 구축 되었거나, 향후 제작될 조선시대 인물에 관한 데이터베이스 혹은 아카이브와 연계될 수 있는 것도 고려해야 할 것이다. 조선시대 선생안 온톨로지로 입력된 정보는 조선시대 관청 운영과 인사시스템을 볼 수 있는 일면으로 활용되고, 이미 구축된 여타 조선시대와 관련된 데이터베이스와 연계되어 조선시대의 정치 경제 사회 문화를 종합적으로 이해하는 자료의 하나로 기능하기를 기대한다.

• 한국지리정보학회지
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• 제17권1호
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• pp.70-79
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• 2014

광역 교통망 및 통신기술의 발전에 따라 광역경제권의 활성화를 위한 협력체계의 중요성이 날로 증대되고 있다. 이에 본 연구는 동남권 광역경제권을 대상으로 GIS 기반의 산업체 정보 공유를 목적으로 동남권 산업체 정보시스템을 구축하였다. 동남권의 경우 제조업 중심의 산업 집적지로서 행정경계를 넘어 산업체간의 근접성과 연결성을 고려한 효율적인 산업 클러스터 및 협력체계 운영이 요구된다. 정보시스템의 DB 구축을 위해 부산, 울산, 경남에서 구축되어진 산업체 DB를 활용하여 정보시스템을 구축한 바, 각 지자체간 데이터의 불일치와 GIS기반의 위치정보 미흡으로 인한 여러 가지 문제점을 발견하였다. 이의 해결을 위해서는 수집 및 배포, 활용과정을 고려한 표준화가 시급한 것으로 분석되었다. 본 연구는 산업체 정보의 공간정보화를 위해 지적도와 수치지도를 활용하여 웹상에서 관리자-사용자 쌍방향간의 정보생성 및 단계별 접근이 가능한 2-way 방식의 산업체 정보시스템을 구축하였다. 본 연구의 결과는 동남권 산업육성을 위한 협력체계 및 공동대응을 위한 산업체 정보 공유체계의 기초적 틀을 제공하였다는 데 그 의의가 있다고 하겠다.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제15권19호
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• pp.8177-8182
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• 2014

Background: Blocking angiogenesis by targeting vascular endothelial growth factor (VEGF) signaling pathway to inhibit tumor growth has proven to be successful in treating a variety of different metastatic tumor types, including kidney, colon, ovarian, and lung cancers, but its role in castration-resistant prostate cancer (CRPC) is still unknown. We here aimed to determine the efficacy and toxicities of anti-VEGF agents in patients with CRPC. Materials and Methods: The databases of PubMed, Web of Science and abstracts presented at the American Society of Clinical Oncology up to March 31, 2014 were searched for relevant articles. Pooled estimates of the objective response rate (ORR) and prostate-specific antigen (PSA) response rate (decline ${\geq}50%$) were calculated using the Comprehensive Meta-Analysis (version 2.2.064) software. Median weighted progression-free survival (PFS) and overall survival (OS) time for anti-VEGF monotherapy and anti-VEGF-based doublets were compared by two-sided Student's t test. Results: A total of 3,841 patients from 19 prospective studies (4 randomized controlled trials and 15 prospective nonrandomized cohort studies) were included for analysis. The pooled ORR was 12.4% with a higher response rate of 26.4% (95%CI, 13.6-44.9%) for anti-VEGF-based combinations vs. 6.7% (95%CI, 3.5-12.7%) for anti-VEGF alone (p=0.004). Similarly, the pooled PSA response rate was 32.4% with a higher PSA response rate of 52.8% (95%CI: 40.2-65.1%) for anti-VEGF-based combinations vs. 7.3% (95%CI, 3.6-14.2%) for anti-VEGF alone (p<0.001). Median PFS and OS were 6.9 and 22.1 months with weighted median PFS of 5.6 vs. 6.9 months (p<0.001) and weighted median OS of 13.1 vs. 22.1 months (p<0.001) for anti-VEGF monotherapy vs. anti-VEGF-based doublets. Conclusions: With available evidence, this pooled analysis indicates that anti-VEGF monotherapy has a modest effect in patients with CRPC, and clinical benefits gained from anti-VEGF-based doublets appear greater than anti-VEGF monotherapy.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제15권11호
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• pp.4617-4622
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• 2014

Background: Several studies have previously focused on associations between the (GT)n repeat polymorphism of the heme oxygenase-1 (HO-1) gene promoter region and risk of cancers, but results are complex. We conducted the present meta-analysis to integrate relevant findings and evaluate the association between HO-1(GT)n repeat polymorphism and cancer susceptibility. Materials and Methods: Published literature was retrieved from the PubMed/MEDLINE, EMBASE and ISI Web of Science databases before November 2013. For all alleles and genogypes, odds ratios were pooled to assess the strength of the associations using either fixed-effects or random-effects models according to heterogeneity. Subgroup analysis was conducted according to ethnicity and histopathology. Results: A total of 10 studies involving 2,367 cases and 2,870 controls were identified. The results showed there was no association between HO-1 (GT)n repeat polymorphism and the cancer risk both at the allelic and genotypic level. However, in the stratified analysis, we observed an increased risk of squamous cell carcinoma in persons carrying the LL genotype and the LL+LS genotype as compared with those carrying the SS genotype. When the LS and SS genotypes were combined, the odds ratio for squamous cell carcinoma in LL-genotype carriers, were also significantly increased. No publication bias was observed. Conclusions: The LL genotype and L-allele carrying genotypes (LL+LS) of HO-1 (GT)n repeat polymorphism are potential genetic factors for developing squamous cell carcinoma. More large and well-designed studies are required for further validations.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제15권11호
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• pp.4697-4703
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• 2014

Background: Interleukin-16 (IL-16) is a multifunctional cytokine which plays a key role in inflammatory and autoimmune diseases as well as in cancer. Genetic polymorphisms of IL-16 have been implicated in susceptibility to cancer. However, associations remain inconclusive. The present meta-analysis was therefore carried out to establish a more conclusive association of IL-16 polymorphisms with cancer risk. Materials and Methods: Relevant studies were searched through the PubMed, Embase, Web of Science, Google Scholar and Wan fang electronic databases updated in October 2013. Odds ratios (OR) and 95% confidence intervals (95% CI) were used to assess the association between IL-16 polymorphisms and cancer risk. Results: Eight eligible studies (rs4778889 T/C: 8, rs11556218 T/G: 7, rs4072111 C/T: 6) that met our selection criteria were included. The meta-analysis indicated that rs11556218 T/G was associated with a significant increased risk of cancer (G vs. T, OR=1.321, 95% CI=1.142-1.528, P<0.001; TG vs. TT, OR=1.665, 95% CI=1.448-1.915, P<0.001; GG+TG vs. TT, OR=1.622, 95% CI=1.416-1.858, P<0.001),as well as nasopharyngeal carcinoma and colorectal cancer. Furthermore, in the subgroup of Chinese, significant associations were found between rs11556218 polymorphism and cancer risk. There was no statistically significant association between the other two variants (rs4778889, rs4072111) and risk of cancer. Conclusions: This meta-analysis suggests that the IL-16 rs11556218 polymorphism is associated with increased cancer risk. Large well-designed studies involving various cancer types and different populations are now needed.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제15권11호
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• pp.4643-4650
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• 2014

Background: For decades, studies have been performed to evaluate the association between ABO blood groups and risk of cancer. However, whether ABO blood groups are associated with overall cancer risk remains unclear. We therefore conducted a meta-analysis of observational studies to assess this association. Materials and Methods: A search of Pubmed, Embase, ScienceDirect, Wiley, and Web of Knowledge databases (to May 2013) was supplemented by manual searches of bibliographies of key retrieved articles and relevant reviews. We included case-control studies and cohort studies with more than 100 cancer cases. Results: The search yielded 89 eligible studies that reported 100,554 cases at 30 cancer sites. For overall cancer risk, the pooled OR was 1.12 (95%CI: 1.09-1.16) for A vs. non- A groups, and 0.84 (95%CI: 0.80-0.88) for O vs. non-O groups. For individual cancer sites, blood group A was found to confer increased risk of gastric cancer (OR=1.18; 95%CI: 1.13-1.24), pancreatic cancer (OR=1.23; 95%CI: 1.15-1.32), breast cancer (OR=1.12; 95%CI: 1.01-1.24), ovarian cancer (OR=1.16; 95%CI: 1.04-1.27), and nasopharyngeal cancer (OR=1.17; 95%CI: 1.00-1.33). Blood group O was found to be linked to decreased risk of gastric cancer (OR=0.84; 95%CI: 0.80-0.88), pancreatic cancer (OR=0.75; 95%CI: 0.70-0.80), breast cancer (OR=0.90; 95%CI: 0.85-0.95), colorectal cancer (OR=0.89; 95%CI: 0.81-0.96), ovarian cancer (OR=0.76; 95%CI: 0.53-1.00), esophagus cancer (OR=0.94; 95%CI: 0.89-1.00), and nasopharyngeal cancer (OR=0.81; 95%CI: 0.70-0.91). Conclusions: Blood group A is associated with increased risk of cancer, and blood group O is associated with decreased risk of cancer.

• 한국정보과학회논문지:데이타베이스
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• 제37권5호
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• pp.258-266
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• 2010

메타 블로그에 등록된 RSS(Really Simple Syndication)의 수는 수십만 개 또는 수백만 개에 이른다. 따라서 이들에 대한 갱신 확인을 수행하는 것은 상당히 긴 시간과 네트워크 자원을 필요로 한다. 메타 블로그나 블로그 검색엔진은 제한된 자원을 가지고 있기 때문에 하루에 방문할 수 있는 블로그의 수가 제한적이다. 하지만 블로그 검색엔진의 성능향상을 위해 새로운 데이터를 최대한 수집하는 것이 필요하기 때문에, 우리는 이 논문에서 수집 효율을 높이기 위한 새로운 방법을 제안한다. 제안하는 방법은 블로그의 포스팅 성향을 분석하여 그것을 토대로 향후 갱신 가능성에 대해 예측하고 갱신 가능성이 높은 시점에만 갱신 확인을 수행한다. 이 연구는 블로그의 입장에서는 분산 서비스 거부 공격(DDoS Attack: Distributed Denial-of-Service Attack)만큼이나 빈번한 갱신확인을 줄이는데 도움이 되고, 인터넷 전체로 보아서는 트래픽을 감소시키는데 기여할 수 있다. 본 논문에서는 블로거들의 포스팅이 이루어지는 요일과 시간에 특정한 패턴이 존재할 것이라는 가정을 하고, 15119개의 실제 블로그에 작성된 포스트에 대해 요일과 시간의 선호도를 분석하였다. 그리고 과거의 포스팅 이력과 요일에 대한 선호도를 바탕으로 갱신 가능성을 예측하기 위한 방법을 제안하고, 12115개의 실제 블로그에 적용하여 그 정확도를 확인하였다. 성능평가를 통해 약 93.06%의 블로그에서 0.5 이상의 정확도를 가짐을 확인하였다.

• 한국멀티미디어학회논문지
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• 제11권3호
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• pp.315-322
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• 2008

비디오 데이터베이스에서 복사본의 위치를 검출하기 위해서는 비디오의 특징(signature)이 비디오의 재편집(reediting), 채널 잡음, 시간적인 프레임 율(frame rate) 변화에 강한 특성을 지녀야 한다. 여러 가지 시그네쳐중 하나인 오디널(ordinal) 시그네쳐는 평균 명암도 값을 구하는 고정 윈도우(fixed window) $N{\times}N$의 크기에 따라 프레임의 공간적인 특징을 나타내기 어렵다. 본 논문은 인터넷상에서 이미 배포된 비디오, 위조된 비디오의 검출을 위해 키 프레임으로 정합하지 않고 연속적인 비디오 프레임에서 공간의 변화특성인 기존의 오디널을 개선한 변형된 robust 오디널 특징을 제안하였다. Robust 오디널은 2차원 벡터 구조를 가지고 있어 비디오의 잡음과 프레임 율의 변화에 강한 특성을 가지고 있으며, 검색공간인 R-트리 공간에서 MBR 형태로 표현될 수 있다. 또한 비디오 복사 검출에 필수적인 대용량 데이터베이스 검색에 적합한 R-트리 구조를 이용하여 정확히 정합되는 프레임의 위치를 찾아내고, n차원 입력의 구조를 가지고 있는 R-트리의 입력으로 robust 오디널 특징이 적합하게 사용되었다. 실험결과 비디오 정합율이 향상되고 대용량 데이터베이스에 알맞은 특징을 가지고 있음을 확인하였다.

• 방사성폐기물학회지
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• 제4권1호
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• pp.65-75
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• 2006

방사성폐기물 처분 연구 사업이 법률적인 인허가 뿐만이 아니라 일반 국민의 동의를 얻기 위해서는 처분 사업의 안전성에 대한 신뢰성 획득이 중요하며 이를 위해 투명하게 공개될 수 있는 종합 성능 평가 (TSPA, Total System Performance Assessment)의 수행 이 필요하다. 본 연구에서는 처분 성능 평가의 투명성 증진을 위한 방안의 하나로 처분 종합 성능 평가 전 과정에 대해 품질 보증 원칙을 도입하여 평가 관련 전체 업무에 관한 신뢰성 향상을 꾀하고자 하였다. 이를 위해 처분 종합 성능 평가 수행의 다섯 단계인 (1) 기획, (2) 연구 수행 , (3) 문서화, (4) 내부 검토, (5) 독자적인 외부 검토 과정에 T2R3의 품질 보증 원칙을 적용한 인터넷 기반의 Cyber R&D Platform이 개발되었다. 인터넷을 기반으로 하는 본 시스템의 개발을 통해 안전성 평가 관련 모든 참여자들은 평가 전 과정에서 투명성이 유지된 데이터들에 쉽게 접근하여 이를 이용할 수 있다 Cyber R&D Platform은 안전성 평가를 위한 시나리오 개발 관련 데이터인 FEP 목록과 관련 시나리오 정보, 관련 시나리오 도출 과정 및 평가 체계 등을 체계적으로 구축한 FEAS (FEp to Assessment through Scenario development)프로그램과 안전성 평가에 필요한 입력 데이터들을 분류, 저장해 놓은 PAID (Performance Assessment Input Data) 프로그램, 그리고 이러한 자료들을 품질 보증 원칙과 절차에 의한 승인 과정을 통해 입력, 저장할 수 있는 품질 보증 시스템으로 구성되어 있으며 이를 통합 운영함으로써 도출된 데이터들의 신뢰성을 높이고자 하였다. 향후 연구에서는 Cyber R&D Platform과 평가 software와의 통합 운영으로 웹 기반 시스템에 대한 한 번의 접속만으로 안전성 평가 관련 모든 정보를 확인, 이용할 수 있도록 할 것이다.