• 제목/요약/키워드: virulence marker

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Genetic Diversity of Didymella bryoniae for RAPD Profiles Substantiated by SCAR Marker in Korea

  • Shim, Chang-Ki;Seo, Il-Kyo;Jee, Hyeong-Jin;Kim, Hee-Kyu
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제22권1호
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    • pp.36-45
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    • 2006
  • Twenty isolates of Didymella bryoniae were isolated from infected cucurbit plants in various growing areas of southern Korea in 2001 and 2002. Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) group [RG] I of D. bryoniae was more virulent than RG IV to watermelon. Virulence of the RG I isolate was strong to moderate to cucumber, whereas that of the RG IV varied from strong, moderate to weak. Two hundred seventy-three amplified fragments were produced with 40 primers, and were analyzed by a cluster analysis using UPGMA method with an arithmetic average program of NTSYSPC. At the distance level of 0.7, two major genomic DNA RAPD groups were differentiated among 20 isolates. The RG I included 7 isolates from watermelon and one isolate from melon, whereas the RG IV included 12 isolates from squash, cucumber, watermelon and melon. Amplification of internal transcribed spacer (ITS) region and small subunit rRNA region from the 20 isolates yielded respectively a single fragment. Restriction pattern with 12 restriction enzymes was identical for all isolates tested, suggesting that variation in the ITS and small subunit within the D. bryoniae were low. Amplification of the genomic DNAs of the tested isolates with the sequence characterized amplified regions (SCAR) primer RG IF-RG IR specific for RG I group resulted in a single band of 650bp fragment for 8 isolates out of the 20 isolates. Therefore, these 8 isolates could be assigned into RG I. The same experiments done with RG IIF-RG IIR resulted in no amplified PCR product for the 20 isolates tested. An about 1.4 kb-fragment amplified from the RG IV isolates was specifically hybridized with PCR fragments amplified from genomic DNAs of the RG IV isolates only, suggesting that this PCR product could be used for discriminating the RG IV isolates from the RG I isolates as well other fungal species.

The 14-3-3 Gene Function of Cryptococcus neoformans Is Required for its Growth and Virulence

  • Li, Jingbo;Chang, Yun C.;Wu, Chun-Hua;Liu, Jennifer;Kwon-Chung, Kyung J.;Huang, Sheng-He;Shimada, Hiro;Fante, Rob;Fu, Xiaowei;Jong, Ambrose
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제26권5호
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    • pp.918-927
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    • 2016
  • Cryptococcus neoformans is a life-threatening pathogenic yeast that causes devastating meningoencephalitis. The mechanism of cryptococcal brain invasion is largely unknown, and recent studies suggest that its extracellular microvesicles may be involved in the invasion process. The 14-3-3 protein is abundant in the extracellular microvesicles of C. neoformans, and the 14-3-3-GFP fusion has been used as the microvesicle's marker. However, the physiological role of 14-3-3 has not been explored. In this report, we have found that C. neoformans contains a single 14-3-3 gene that apparently is an essential gene. To explore the functions of 14-3-3, we substituted the promoter region of the 14-3-3 with the copper-controllable promoter CTR4. The CTR4 regulatory strain showed an enlarged cell size, drastic changes in morphology, and a decrease in the thickness of the capsule under copper-enriched conditions. Furthermore, the mutant cells produced a lower amount of total proteins in their extracellular microvesicles and reduced adhesion to human brain microvascular endothelial cells in vitro. Proteomic analyses of the protein components under 14-3-3-overexpressed and -suppressed conditions revealed that the 14-3-3 function(s) might be associated with the microvesicle biogenesis. Our results support that 14-3-3 has diverse pertinent roles in both physiology and pathogenesis in C. neoformans. Its gene functions are closely relevant to the pathogenesis of this fungus.

위암치료제로서 rebamipide의 잠재적 효능 (A Potential Efficacy of Rebamipide as Anti-gastric Cancer Drug)

  • 민도식
    • 생명과학회지
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    • 제26권10호
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    • pp.1214-1217
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    • 2016
  • Rebamipoide는 위궤양과 위염치료에 쓰이는 위보호제로 임상에서 사용되고 있지만 위암에서의 역할에 대해서는 알려지바가 거의 없다. 헬리코박토 파일로리(Helicobacter pylori)의 주요독성인자인 CagA는 위암의 발생과 관련이 있다. CagA는 위암세포에서 NFκB의 활성을 증가시켜 PLD1 단백질의 발현을 증가시킴으로써 위암세포의 증식과 침윤을 유도한다. Rebamipide는 NFκB의 활성을 억제함으로써 H. pylori의 CagA에 의해 유도되는 PLD1의 발현을 저해하는것으로 규명되었다. 게다가, rebamipide는 H. pylori의 CagA에 의해 유도되는 β-catenin과 그 표적 유전자로서 인 암줄기세포 마커 단백질의 발현을 증가시킴으로써 위암줄기세포의 자가재생능력을 감소시킨다. 또한 rebamipide는 항암제 내성을 극복하는 화학감수성을 증가시켜서 위암생성을 감소시키는 것으로 나타났다. 그래서 rebamipide는 위암치료제로서의 잠재적 효능을 가지고 있는 약물로서의 가능성이 제시되고 있다.

대장균의 이열성장독소 생산기전 (Mechanism of Heat-Libile E. coli Enterotoxin Production)

  • 최명식;이광호;장우현;이승훈
    • 대한미생물학회지
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    • 제17권1호
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    • pp.35-41
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    • 1982
  • Enterotoxigenk E. coli is one of the major causative agents of the infantile diarrhea and traveler's diarrhea. The heat-labile enterotoxin is thought to be a virulence factor in the pathogenesis of the diarrhea and to be a marker for identification of the enterotoxigenic E. coli from non pathogenic E. coli. Therefore knowledge about the heat-labile enterotoxin is essential not only for understanding the pathogenesis but also for the diagnosis of the diarrhea. However the in-vitro heat-labile enterotoxin production is reported to be greatly affected by the cultural condition. In this regards, this study was designed to know the optimal conditions for the production of the heat-labile enterotoxin by assaying the permeability factor in the 18 hours culture supernatant of E. coli 08K25(B2) H9 and of E. coli 015 H11. Results obtained were summerized as follows: 1. Amounts of heat-labile enterotoxin produced were greater at initial pH 8.5 than at 7.0 of CYES-2 broth culture. However, the bacterial growth itself was more abundant at 7.0 than at 8.5. 2. Heat-labile enterotoxin per unit volume of culture supernatant was greater at shaking culture than at standing culture condition, but ratio of the enterotoxin produced over the unit mass of E. coli calculated was greater at standing culture than shaking culture condition, indicating that the greater yields of the toxin produced at shaking culture was due to increase in E. coli cell mass compared to the standing culture condition: 3. The enterotoxin produced in the lincomycin(128 microgram/ml) supplemented media was 5 or 11 times greater on the basis of enterotoxin per unit mass of E. coli, compared to the lincomycin-non-supplemented media, indicating that lincomycin itself increases the enterotoxin production. 4. Treatment of 18 hours culture of E. coli with polymyxin B(0.2 mg/ml) for 1 hour increased the yields of enterotoxin amounting to 2 or 5 times of the non-treated control cultures.

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국내 귀리의Fusarium속 균의 다양성 및 독소 화학형 (Identification and Chemotype Profiling of Fusarium Species in Korean Oat)

  • 최정혜;나주영;진현숙;임수빈;백지선;이미정;장자영;이데레사;홍성기;김점순
    • 식물병연구
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    • 제25권4호
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    • pp.157-163
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    • 2019
  • 본 연구에서는 귀리에서 독성곰팡이 발생현황을 평가하기 위해 2017년 2018년 4월부터 6월까지 귀리 재배지 강진, 정읍을 정기적으로 모니터링 하였다. 총 745개의 곰팡이 균주를 형태학적 방법으로 분리한 후 마커 유전자 염기서열을 분석하여 동정하였다. 분리된 곰팡이의 약 92%가 Fusarium속 균주였고, Penicillium속(5.9%)과 Aspergillus속(2.1%) 순으로 분리되었다. Fusarium속 균주의 대부분이 F. asiaticum (83.1%)이었고, F. incarnatum (5.4%), F. proliferatum (3.5%), F. fujikuroi (2.8%), F. tricinctum species complex (FTSC) 11 (1.5%), F. graminearum (1.0%) 순으로 많이 분리되었다. F. asiaticum의 약 97%가 nivalenol 독소화학형이 있었고, 3-acetyl deoxynivalenol (3.2%) 독소화학형과 15-acetyl deoxynivalenol (0.4%) 독소화학형도 발견되었다. 선발된 Fusarium 균들의 병원성 실험결과 F. asiaticum이 실험에 사용된 모든 식물체에서 다양한 범위의 병원성을 나타내었다. 병증이 있는 종실에서 분리된 F. graminearum and FTSC 11 균주들은 쌀귀리에서 강한 병원성을 나타내었다. 또한 FTSC 11 균주를 제외한 모든 균주들이 쌀배지에서 nivalenol (0.2-7.6 ㎍/g), deoxynivalenol (0.03-6.1 ㎍/g), zearalenone (0.1-27.0 ㎍/g)을 생성하였다. 본 연구는 국내에서는 처음 보고되는 F. asiaticum에 의한 귀리의 붉은 곰팡이병 사례이다. 본 연구의 결과는 밀, 보리, 벼와 마찬가지로 F. asiaticum이국내귀리에서우점종임을보여준다.

Agrobacterium tumefaciens vector를 이용(利用)한 양황철의 형질전환(形質轉換) (Transformation of Populus nigra × P. maximowiczii Using Agrobacterium tumefaciens vectors)

  • 손석규;현정오
    • 한국산림과학회지
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    • 제87권2호
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    • pp.164-172
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    • 1998
  • Promoter가 없는 외래유전자를 이용하여 형질전환(形質轉換)시키고자 할 때의 최적조건(最適條件) 및 효율적인 형질전환체(形質轉換體)의 검정방법을 구명(究明)하고자 산림청(山林廳) 임목육종연구소(林木育種硏究所)에 식재된 잡종 포플러 양황철 62-9클론을 사용하여 재분화를 유도하고, 기내(器內) 형질전환실험(形質轉換實驗)을 실시하였다. 기내(器內)에서 식물체 재분화 유도를 위해서는 배지조성과 호르몬 농도의 조합이 가장 영향을 많이 끼치는 요인이었다. 여러 조합으로 엽조직 ($5{\times}5mm$ leaf strip)을 시료로 하여 MS 기본배지에 0, 0.01, 0.1, 0.5, $0.1mg/{\ell}$ NAA, 0.2, 0.5, 1.0, $2.0mg/{\ell}$ BAP를 혼합 처리하여 배양한 결과, $0.1mg/{\ell}$ NAA, $0.5mg/{\ell}$ BAP를 첨가한 호르몬 조합에서 즐기 분화율 및 explant당 분화된 부정줄기수가 상대적인 비율 94%(11.4개)로서 가장 높았다. 따라서 형질전환(形質轉換)된 엽조직(葉組織)을 재분화 시킬 때 이 조건을 줄기분화유도 배지 (SIM ; shoot-inducing medium)로 사용하였다. 선발유전자에 의한 항생제(抗生濟)의 선발농도(選拔濃度)를 알기 위해 pBI121로 형질전환(形質轉換)실험을 한 결과, cocultivation한 후 $100mg/{\ell}$ Km(kanamycin) 또는 $60mg/{\ell}$ G418(geneticin)이 첨가된 SIM 3 배지에서 2주가 경과하면서 육안으로 형질전환(形質轉換)된 부정아를 관찰할 수 있었고 이 부정아를 SIM 3로 옮긴지 6주 후에는 0.5-1cm 크기의 부정줄기로 자랐다. 그러나 대조(對照) 엽조직(葉組織)은 부정아형성이 거의 되지 않아, 선발유전자의 항생제(抗生濟) 선발농도(選拔濃度)는 이 조건이 최적임을 알 수 있었다. 또한 형질전환체(形質轉換體)의 재분화율을 높이기 위해 5-azacytidine을 처리한 결과, 항생제(抗生濟) 선발배지하에서 재분회율을 5.7%에서 26.7%까지 높일 수 있었다. Fluorometric 및 histochemical assay 방법으로 GUS 유전자의 활성(活生)을 검정한 결과 vector system간에 형질전환율(形質轉換率)이 서로 다름을 확인할 수 있었다. LBA4404/pBI121을 vector로 사용한 양황철의 기내(器內) 형질전환(形質轉換) 실험에서는 낮은 形짧훌훌換率(5.7%)을 보였다. 그러나 보다 응양성(應梁性)이 높은 super virulence 유전자를 포함하는 pEHA101을 helper plasmid로 하여 실험한 결과 형질전환율(形質轉換率)이 35.9%로 pAL4404보다 훨씬 효과적인 것으로 나타났다. 따라서 promoter가 없는 외래유전자를 이용하여 promoter tagging을 하고자 할 때 형질전환(形質轉換)실험에는 helper plasmid로써 pEHA101을 이용하는 것이 적합한 것으로 판명되었다.

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