• 제목/요약/키워드: useful fungi

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Characterization of Soil Microorganism from Humus and Indigenous Microorganism Amendments

  • Jan, Umair;Feiwen, Rui;Masood, Jan;Chun, Se Chul
    • Mycobiology
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    • 제48권5호
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    • pp.392-398
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    • 2020
  • This study was conducted to understand the dynamics of microbial communities of soil microorganisms, and their distribution and abundance in the indigenous microorganisms (IMOs) manipulated from humus collected from the forest near the crop field. The soil microorganisms originated from humus and artificially cultured microbial-based soil amendments were characterized by molecular and biochemical analyses. The bacterial population (2 × 106~13 × 106 CFU/g sample) was approximately 100-fold abundant than the fungal population (2 × 104~8 × 104 CFU/g sample). The 16S rDNA and ITS sequence analyses showed that the bacterial and fungal communities in humus and IMOs were mainly composed of Bacillus and Pseudomonas, and Trichoderma and Aspergillus species, respectively. Some of the bacterial isolates from the humus and IMOs showed strong inhibitory activity against soil-borne pathogenic fungi Fusarium oxysporum and Sclerotinia sclerotiorum. These bacteria also showed the siderophore production activity as well as phosphate solubilizing activity, which are requisite traits for biological control of plant pathogenic fungi. These results suggest that humus and IMOs could be a useful resource for sustainable agriculture.

Comparison of Soil Higher Fungal Communities between Dead and Living Abies koreana in Mt. Halla, the Republic of Korea

  • Kim, Chang Sun;Jo, Jong Won;Lee, Hyen;Kwag, Young-Nam;Cho, Sung Eun;Oh, Seung Hwan
    • Mycobiology
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    • 제48권5호
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    • pp.364-372
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    • 2020
  • To improve our understanding of the relationship between soil higher fungi (belonging to Ascomycota and Basidiomycota) and Abies koreana, we surveyed A. koreana soil fungal communities in a forest in Mt. Halla, Jeju Island, Korea by next-generation sequencing (Illumina Miseq). To confirm the soil higher fungal communities, we collected two types of soils from a defined plot: soils with dead (AKDTs) and living A. koreana (AKLTs), respectively. Soil fungi were classified into 2 phyla, 19 classes, 64 orders, 133 families, 195 genera, and 229 OTUs (895,705 sequence reads). Nonmetric multidimensional scaling (NMDS) showed significantly different soil higher fungal communities between AKDTs and AKLTs (p < .05). In addition, the saprophyte composition was significantly affected by A. koreana status (p < .05). The proportion of the mycorrhizal Clavulina spp. was different between soils with AKDTs and AKLTs, suggesting that Clavulina spp. may be a crucial soil fungal species influencing A. koreana. This study will lead to a better understanding of the ecological status of A. koreana in Mt. Halla. In addition, this study could be useful for the conservation and management of A. koreana habitats.

18S 리보좀 RNA 부분 염기서열 분석에 의한 효모성 균류의 분자계통학적 연구 (Phylogenetic Relationships of Yeast-like Fungi Deduced from Partial Sequences of 18S Ribosomal RNA)

  • 정수진;신용국;주우홍;이재동
    • 한국균학회지
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    • 제23권4호통권75호
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    • pp.310-317
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    • 1995
  • 담자성 효모와 담자균계의 yeast-like 균류의 총 43개 균류의 18S 리보좀 RNA 부분염기배열을 비교하였다. Fibulobasidium inconspicuum은 Filobasidiella neoformans와 밀접한 유연관계를 보였다. Tremella foliacea, Ustilago rabenhorstiana는 각각 다른 계통지를 형성하여 담자균효모와는 독립적으로 진화해 왔을 가능성을 시사하였다. 담자균효모는 Ustilago rabenhorstiana 보다 Tremella foliacea에 보다 가까운 유연관계를 보였다. 한편, 표현형질 즉 색소, 동포자, 사출포자등은 18S ribosomal RNA의 부분 염기서열 분석 결과 계통학적으로 의미가 없는 것으로 나타났다.

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Isolation and Characterization of an Antifungal and Plant Growth-Promoting Microbe

  • Park, Se Won;Yang, Hee-Jong;Seo, Ji Won;Kim, Jinwon;Jeong, Su-ji;Ha, Gwangsu;Ryu, Myeong Seon;Yang, Hee Gun;Jeong, Do-Youn;Lee, Hyang Burm
    • 한국균학회지
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    • 제49권4호
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    • pp.441-454
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    • 2021
  • Fungal diseases including anthracnose, stem rot, blight, wilting, and root rot of crops are caused by phytopathogens such as Colletotrichum species, Sclerotinia sclerotiorum, Phytophthora species, and Fusarium oxysporum and F. solani which threaten the production of chili pepper. In this study, to identify biological control agents (BCAs) of phytopathogenic fungi, potentially useful Bacillus species were isolated from the field soils. We screened out five Bacillus strains with antagonistic capacity that are efficiently inhibiting the growth of phytopathogenic fungi. Bacillus species were characterized by the production of extracellular enzymes, siderophores, and indole-3-acetic acid (IAA). Furthermore, the influence of bacterial strains on the plant growth promoting activity and seedling vigor index were assessed using Brassica juncea as a model plant. Inoculation with Bacillus subtilis SRCM 121379 significantly increased the length of B. juncea shoots and roots by 45.6% and 52.0%, respectively. Among the bacterial isolates, Bacillus subtilis SRCM 121379 showed the superior enzyme activities, antagonistic capacity and plant growth promoting effects. Based on the experimental results, Bacillus subtilis SRCM 121379 (GenBank accession no. NR027552) was finally selected as a BCA candidate.

Characterization of NAD-Dependent Formate Dehydrogenase from Trametes versicolor Using a Cell-Free Protein Expression System

  • LEE, Su-Yeon;JANG, Seokyoon;LEE, Soo-Min
    • Journal of the Korean Wood Science and Technology
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    • 제50권3호
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    • pp.159-166
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    • 2022
  • CO2 emissions are the primary reason for global warming; hence, biological and chemical technologies for converting CO2 into useful compounds are being actively studied. Biological methods using enzymes can convert CO2 under mild conditions. Formate dehydrogenase (FDH) is a representative CO2 conversion enzyme. Its function was revealed after isolation from bacteria, yeast, and plants. In this study, we evaluated the CO2 conversion potential of FDH isolated from wood-rotting fungi. After isolating the FDH gene (TvFDH) from Trametes versicolor, we cloned the full-length FDH from T. versicolor and expressed it in a cell-free expression system. The gene encoding TvFDH was identified as 1,200 bp open reading frame (ORF) and the expected molecular weight of the protein was approximately 42 kDa. Overexpression of the recombinant crude protein including TvFDH was confirmed by sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE). Enzyme activities and metabolite analyses confirmed the efficiency of TvFDH for CO2 reduction.

콩과식물 종실 추출물의 살균활성 (Fungicidal activities of leguminous seed extracts toward phytopathogenic fungi)

  • 이회선;김병섭;김흥태;조광연;안용준
    • 농약과학회지
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    • 제2권3호
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    • pp.21-27
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    • 1998
  • 25종 콩과식물 종자의 메탄올 추출물을 대상으로 기주식물상의 온실실험조건에서 6종의 주요 식물병원균에 대해 방제효과를 조사한 그 효과는 콩과식물의 종류에 따라 커다란 차이를 보였다. 25종의 공시종자를 5 mg/pot 농도로 처리하였을 때 결명자 (C. obtusifolia), 소리테(G. max var. solitae), 약콩(G. max var. yagkong), 흑태(G. max var. hooktae), (P. multiflorusf), (P. radiatus var. aurea)과 (V. sinensis) 추출물들은 오이잿빛곰팡이병, 밀붉은녹병 및 보리횐가루병에 대하여 80% 이상의 방제효과를 나타내었을 뿐 아니라, 잿빛곰팡이병의 살균제 저항성 균주에 대해서도 높은 활성을 보였다. 그러나, 공시종자 모두 벼도열병, 벼잎집무늬마름병 및 Phytophthora infestans병에 대해서는 거의 활성이 없거나 활성이 낮았다. 이상의 결과로부터 잿빛곰팡이병, 밀녹병 및 보리흰가루병 등에 높은 방제효과를 보인 상기 종자추출물들은 식물병 방제제로서 사용 가능성이 예상되었으며, 특히 살균제 저항성 잿곰팡이병에 높은 활성을 보여 시설원예재배에서 문제시되고 있는 잿빛곰팡이병의 방제에도 크게 이용할 수 있을 것으로 기대되었다.

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국내산 수목 추출물의 항진균 및 살충활성 (Antifungal and Insecticidal Activity of Methanol Extract from 11 Korean Wood Species)

  • 임진아;최윤아;정미화;강소영;정용재
    • 보존과학회지
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    • 제23권
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    • pp.95-102
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    • 2008
  • 유기질 문화재 보존 천연 살생물제 개발을 위한 후보물질 조사를 위해 국내 자생하는 11종 수목을 대상으로 각 수목 메탄올 추출물의 9종 목재오염균과 궐련벌레 성충에 대한 항진균 및 살충활성을 조사하였다. 항진균 활성은 목재부후균과 표면오염균에 대해 각각 paper disc soaking 방법과 feeder strip 방법으로 측정되었다. 그 결과, 수목 중 황벽(Phellodendron amurense) 메탄올 추출물은 5 mg/disc에서 Coniophora puteana, Lentinus lepideus, Tyromyces palustris 그리고 Aspergillus niger에 대해 우수한 항균활성을 나타냈다. 또한, 수목 메탄올 추출물의 살충활성은 topical application 방법에 의해 측정되었으며 특히 주목(Taxus cuspidata)과 전나무(Abies holophylla) 메탄올 추출물을 궐련벌레 성충에 25 ${\mu}g$/adult의 농도로 24시간 처리했을 때 56.7%의 치사율을 보였다. 위의 결과로부터 주목과 전나무 그리고 황벽 메탄올 추출물은 각각 충과 목재오염균에 의해 야기되는 생물학적 열화에 대한 유기질 문화재 보존을 위해 유용하게 사용가능할 것으로 사료된다.

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섬유소 분해균 Aspergillus sp. HB 1의 세포융합에 관한 연구 (Cell Fusion of Cellulolytic Fungi, Aspergillus sp. HB1)

  • 김주호;장성열;최영길
    • 한국균학회지
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    • 제15권2호
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    • pp.80-86
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    • 1987
  • 자연계에서 섬유소분해능이 우수한 균을 분리하였고 섬유소분해능을 더욱 증진시키기 위한 기초단계로서 그 분리균주의 원형질체 생성과 융합의 최적조건을 조사하였다. 토양에서 채취한 시료로부터 섬유소분해능력이 우수한 Aspergillus sp., Penicillium sp., Trichoderma sp., 3균주를 분리 동정하였고 산업적으로 유용한 균주이며 cellulase activity가 있는 Aspergillus niger를 비교균주로 선택하여 각각의 효소활성도를 비교 조사한 결과, Aspergillus sp.가 가장 좋은 효소활성도를 보였으며 그 다음 Penicillium sp., Trichoderma sp., 그리고 Aspergillus niger 순이었다. 효소활성도가 가장 좋은 Aspergillus sp.에 자외선$(12erg/sec/mm^2)$을 4 분 30초 동안 조사하여 영양요구성 변이주를 유도, 분리하였다. 세포벽분해효소로는 pH6.0에서 ${\beta}-glucuronidase$가 효과적이었고 그 효소를 농도별로 처리해본 결과 5, 000unit/ml가 최적농도이었다. 재생률은 삼투안정제로 0.6M KCI을 사응하여 pH6.0에서보았을 때 야생형은 7.0%, met. 영양요구주는 7.5%, arg. 영양요구주는 5.2%이있다. 영양요구성변이주간의 원형질체융합에 필요한 PEG는 분자량이 6,000인 것이 좋았으며 최적농도는 $30^{\circ}C$ 이었다. 이때 융합율은 1.2%까지 획득하었다.

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일개 대학병원의 임상검체에서 분리된 6년간의 효모균 분포에 관한 연구 (Study on Distribution of Yeast Isolated from Clinical Specimens for Six Years in a University-affiliated Hospital)

  • 마판곤;김선주;서충원;유영빈;김영권
    • 디지털융복합연구
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    • 제13권9호
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    • pp.369-375
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    • 2015
  • 본 연구는 한 대학병원에서 6 년간 (2006-2011) 다양한 임상 검체에서 분리된 진균의 빈도를 조사하여 임상검체에서 진균의 종류에 따른 연관성을 파악하여 이와 관련된 환자 관리에 필요한 정보를 제공하기 위함이다. 경상남도의 단일 대학병원 진단검사의학과 미생물검사실로 의뢰된 검체 163,530건을 대상으로 하였고 배양에서 양성으로 판정된 진균 5,378주(3.3%)에 대하여 환자의 일반적인 특징과 성별, 연령, 검체 종류를 분석하였다. 균주별 분리빈도는 Candida albicans가 41.9%로 가장 많았고, Candida glabrata (15.5%), Candida tropicalis (14.6%)가 그 다음 순서로 분리되었다. 분리건수는 2006년 526건에서 2011년이 1,145건으로 2배이상 증가하였다. 연령별로는 60대(27.0%)와 70대(26.5%)에서 가장 흔히 분리되었다. 검체별로는 소변이 44.8%로 가장 많았다. 성별에 따른 분리는 남성이 52.4%로 여성 47.6%보다 약간 높았다. 추후 전국적인 분포도를 연구하고, 항진균 융복합 약제 감수성을 분석한다면 더 유익한 자료를 제공할 것으로 사료된다.

다양한 잡곡 추출물의 살균.살충활성 (Fungicidal and insecticidal activities of various grain extracts against five insect pests and six phytopathogenic fungi)

  • 이회선;최경자;조광연;이상길;안용준
    • 농약과학회지
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    • 제4권3호
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    • pp.7-14
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    • 2000
  • 21종 잡곡류의 메탄올 추출물을 대상으로 기주식물상의 온실실험조건에서 6종의 주요 식물병원균의 방제효과 및 5종의 해충에 대한 살충효과를 조사한 효과는 잡곡류의 종류에 따라 커다란 차이를 보였다. 21종의 공시시료를 5 mg/pot 농도로 처리하였을 때 개보리 (E. sibiricus)와 늘보리 (H. vulgare var. nudum)는 벼도열병 및 보리흰가루병, 참깨 (S. indicum (W))와 밀 (T. aestivum)은 밀녹병과 보리흰가루병에 대하여 80% 이상의 방제효과를 나타냈다. 5종의 주요해충에 대한 살충효과는 2,500 ppm의 농도로 처리할 때 메밀 (F. esculentum)은 복숭아혹진딧물, 쇠보리 (I. crassipes), (O. sativa var. glutinosa), 기장 (P. miliaceum), 조 (S. italica), 수수 (S. bicolor) 및 밀 (T. aestivum)은 점박이응애에 대하여 80% 이상의 살충효과를 나타냈다. 그러나, 실험에 사용된 잡곡류는 토마토역병, 배추좀나방 및 담배거세미나방에 대해서는 거의 활성이 없거나 활성이 낮았다. 이상의 결과로부터 벼도열병, 밀녹병 및 보리흰가루병 등에 높은 방제효과를 보인 상기 잡곡 추출물들은 식물병 방제제로서 사용 가능성이 예상되었으며, 또한 복숭아혹진딧물 및 점박이응애에 강한 살충효과를 보인 추출물은 해충방제에 이용할 수 있을 것으로 기대되었다.

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