• 대한치과보철학회지
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• 제53권4호
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• pp.295-300
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• 2015

목적: 레진과 니켈-크롬 합금의 결합력에 미치는 금속 프라이머 및 다용도 접착제의 영향에 대하여 비교 평가하고자 한다. 재료 및 방법: 실험을 위해 120개의 니켈-크롬 합금(Vera Bond 2V) 디스크를 제작하여 아크릴 레진 실린더에 포매하였다. 시편의 표면은 220 grit, 600 grit의 실리콘 카바이드지로 연마한 뒤 $50{\mu}m$의 알루미늄옥사이드 입자를 분사하여 처리하였다. 실험군은 메탈 프라이머의 적용(Metal primer II, Alloy primer, Metal & Zirconia primer, MKZ primer)과 다용도 접착 시스템(Single Bond Universal, All Bond Universal)에 따라 6개 군으로 나뉘었다. 각 시편의 중앙에 높이 2 mm, 직경 3 mm로 복합레진을 충전하였으며, 제작된 모든 시편은 $37^{\circ}C$ 증류수에서 24시간 보관하였다. 만능시험기에 시편을 위치시킨 후 1 mm/min cross head speed로 전단결합강도를 측정하였다. 통계분석은0.05의 유의수준으로 일원분산분석을 시행하였고 Tukey's multiple coMParison test로 사후검정을 하였다. 결과: Single Bond Universal, All Bond Universal, Metal Primer II 3개 군과 Alloy Primer, MKZ Primer, Metal & Zirconia Primer 3개 군 사이에 통계학적으로 유의한 차이를 보였다(P<.001). 결론: 니켈-크롬 합금에 대한 다용도 접착 시스템의 전단결합강도는 Metal Primer II를 제외한 기존의 금속 프라이머를 적용했을 때 보다 높게 나타났다. 본 실험에서 더 나아가 다용도 접착 시스템 내 실란(Silane) 포함 여부에 따른 효과를 평가할 수 있는 연구가 필요할 것이다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제24권6호
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• pp.812-822
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• 2014

Metagenomic analysis of the human intestinal microbiota has extended our understanding of the role of these bacteria in improving human intestinal health; however, a number of reports have shown that current total fecal DNA extraction methods and 16S rRNA universal primer sets could affect the species coverage and resolution of these analyses. Here, we improved the extraction method for total DNA from human fecal samples by optimization of the lysis buffer, boiling time (10 min), and bead-beating time (0 min). In addition, we developed a new long-range 16S rRNA universal PCR primer set targeting the V6 to V9 regions with a 580 bp DNA product length. This new 16S rRNA primer set was evaluated by comparison with two previously developed 16S rRNA universal primer sets and showed high species coverage and resolution. The optimized total fecal DNA extraction method and newly designed long-range 16S rRNA universal primer set will be useful for the highly accurate metagenomic analysis of adult and infant intestinal microbiota with minimization of any bias.

• 생태와환경
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• 제53권1호
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• pp.63-72
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• 2020

본 연구에서는 멸종위기종이 서식하는 4개 하천(금강, 지천, 황지천, 섬진강)에서 환경유전자(environmental DNA, eDNA)와 보편적 어구를 이용한 조사 방법을 적용하여 지점별 종 다양성을 확인하고, 이를 통해 eDNA의 활용을 고찰하였다. eDNA 조사를 통해서 확인된 종 수는 지점 평균(±표준편차) 19종(±4.4)이며, 이는 어구를 이용한 정량 조사의 10종(±4.8)과 비교하여 높게 나타났다. 대부분의 지점에서 eDNA 조사가 어구를 이용한 조사보다 효율이 높게 나타났다. 반면 eDNA 조사 결과 고유종 및 근연종에 대해서 동정의 오류가 확인되어, universal primer (MiFish primer set)에 대한 국내 적용의 한계를 확인하였다. 또한 멸종위기종의 서식 여부도 일부 종에 대해서 eDNA 조사 결과가 현장 조사 및 문헌과의 차이를 보였다. 현재 개발된 universal primer는 국내에서 서식하는 모든 담수종의 서식을 확인하는 데 있어서 결과의 신뢰성을 담보할 수 없기 때문에 universal primer의 보완 및 개발이 필요하며, 멸종위기종과 같은 특정종의 서식 확인을 위해서는 종특이적 마커 개발을 통한 적용이 고려되어야 한다. 마지막으로 eDNA의 현장 조사 방법에 대한 매뉴얼이 개발될 경우, 수생태계 조사에 대한 활용성이 증대될 수 있을 것이다.

• 생명과학회지
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• 제24권4호
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• pp.361-369
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• 2014

16S rRNA gene PCR법은 환자 검체로부터 병원성 미생물을 검출 및 동정에 사용되어진다. 본 연구는 대량의 임상미생물 진단을 위해 bacterial 16S rRNA 부위 유전자 서열을 이용하여 광대한 범위와 높은 특이도를 가지는 primer을 포함한 PCR법을 개발하였다. 10개 표준 균주 16S rRNA 보존 부위의 유전자 서열을 기반으로 primer set를 구축하였다. 98명 환자 검체에서 임상 미생물을 분리하였다. 98개 균주는 phenotypic 방법을 이용하여 확인하고, 개발된 primer set와 universal primer set를 이용한 PCR법으로 확인하였다. 획득한 PCR 산물은 forward primer, reverse primer, 그리고 자동화 DNA 분석기를 이용하여 각 균주의 16S rRNA 유전자 서열을 분석 및 확인하였다. 본 연구에서 개발된 primer set와 universal primer set의 임상미생물 검출에 대한 효율성을 평가하였고, 또한 phenotypic 방법과 분자생물학적 방법을 비교했다. 분리된 98개 균주를 대상으로 개발된 primer set로 16S rRNA PCR을 진행하여 778 bp 크기의 단일밴드로 증폭 되었음을 확인했다. 총 98개중 94개 균주(95.9%)는 phenotypic 결과와 동일함을 확인했다. 새로 개발된 primer set를 이용한 결과는 universal primer set를 이용한 98개 균주(100%)의 결과와 동일함을 확인하였다. 개발된 16S rRNA gene PCR법은 임상미생물 검출 및 동정에서 신속성, 정확성, 그리고 검사 비용 절감의 장점을 가진다. 개발된 primer set는 병원성 미생물 동정에서 효율성을 확인했다.

• The Plant Pathology Journal
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• 제21권1호
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• pp.55-58
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• 2005

In order to diagnose and differentiate jujube witches' broom (JWB) phytoplasma rapidly, oligonucleotide primer pair, 16Sr(V) F/R, for polymerase chain reactions (PCRs) was designed on the basis of 16S rRNA sequences of JWB phytoplasma. The PCR employing phytoplasma universal primer pair P1/P7 consistently amplified DNA in all tested phytoplasma isolates. But no phytoplasma DNA was detected from healthy jujube seedlings. The nested PCR, the primer pair 16S(V) F/R, about 460 bp fragment, amplified DNA in all tested JWB and related phytoplasmas including ligustrum witches' broom phytoplasma of the 16S rRNA group V, but no DNA amplification was detected from other phytoplasma strains such as groups 16SrI (Aster yellows) and 16SrXII (Stolbur group) in which mulberry dwarf phytoplasma and chrysanthemum witches' broom phytoplasma belong to, respectively. The same results were obtained from both Korean and Chinese isolates of JWB phytoplasma. Nested-PCR using phytoplasma universal primer pair P1/P7 and 16SrV group-specific primer pair 16S(V) F/R could detect group V phytoplasmas rapidly and easily, in particular JWB phytoplasma.

• The Journal of Advanced Prosthodontics
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• 제13권5호
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• pp.292-303
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• 2021

PURPOSE. The aim of this in vitro study was to evaluate the effect of silane and universal adhesive applications on the micro-shear bond strength (µSBS) of different resin-matrix ceramics (RMCs). MATERIALS AND METHODS. A total of 120 slides (14 × 12 × 1 mm) were produced from 5 different RMC materials (GC Cerasmart [GC]; Brilliant Crios [BC]; Grandio blocs [GB]; Katana Avencia [KA]; and KZR-CAD HR 2 [KZR]) and sandblasted using 50 ㎛ Al₂O₃ particles. Each RMC material was divided into six groups according to the surface conditioning (SC) method as follows: control (G1), silane primer (G2), silane-free universal adhesive (G3), silane-containing universal adhesive (G4), silane primer and silane-free universal adhesive (G5), and silane primer and silane-containing universal adhesive (G6). Three cylindric specimens made from resin cement (Bifix QM) were polymerized over the treated surface of each slide (n = 12). After thermal cycling (10000 cycles, 5 - 55℃), µSBS test was performed and failure types were evaluated using a stereomicroscope. Data were analyzed using 2-way ANOVA and Tukey tests (α = .05). RESULTS. µSBS values of specimens were significantly affected by the RMC type and SC protocols (P < .001) except the interaction (P = .119). Except for G2, all SC protocols showed a significant increase in µSBS values (P < .05). For all RMCs, the highest µSBS values were obtained in G4 and G6 groups. CONCLUSION. Only silane application did not affect the µSBS values regardless of the RMC type. Moreover, the application of a separate silane in addition to the universal adhesives did not improve the µSBS values. Silane-containing universal adhesive was found to be the best conditioning method for RMCs.

• Restorative Dentistry and Endodontics
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• 제43권1호
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• pp.7.1-7.7
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• 2018

Objectives: The aim of this study is to compare the shear bond strengths of ceramic brackets bonded to zirconia surfaces using different zirconia primers and universal adhesive. Materials and Methods: Fifty zirconia blocks ($15{\times}15{\times}10mm$, Zpex, Tosoh Corporation) were polished with 1,000 grit sand paper and air-abraded with $50{\mu}m$ $Al_2O_3$ for 10 seconds (40 psi). They were divided into 5 groups: control (CO), Metal/Zirconia primer (MZ, Ivoclar Vivadent), Z-PRIME Plus (ZP, Bisco), Zirconia Liner (ZL, Sun Medical), and Scotchbond Universal adhesive (SU, 3M ESPE). Transbond XT Primer (used for CO, MZ, ZP, and ZL) and Transbond XT Paste was used for bracket bonding (Gemini clear ceramic brackets, 3M Unitek). After 24 hours at $37^{\circ}C$ storage, specimens underwent 2,000 thermocycles, and then, shear bond strengths were measured (1 mm/min). An adhesive remnant index (ARI) score was calculated. The data were analyzed using one-way analysis of variance and the Bonferroni test (p = 0.05). Results: Surface treatment with primers resulted in increased shear bond strength. The SU group showed the highest shear bond strength followed by the ZP, ZL, MZ, and CO groups, in that order. The median ARI scores were as follows: CO = 0, MZ = 0, ZP = 0, ZL = 0, and SU = 3 (p < 0.05). Conclusions: Within this experiment, zirconia primer can increase the shear bond strength of bracket bonding. The highest shear bond strength is observed in SU group, even when no primer is used.

• 한국식물병리학회:학술대회논문집
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• 한국식물병리학회 2003년도 정기총회 및 추계학술발표회
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• pp.136.2-137
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• 2003

In order to diagnose and differentiate jujube witches' broom (JWB) phytoplasma rapidly, oligonucleotide primer pair, 16Sr(V) F/R, for polymerase chain reactions (PCRs) was designed on the basis of 165 rRNA sequences of JWB phytoplasma. The PCR employing phytoplasma universal primer pair P1/P7 consistently amplified DNA in all tested phytoplasma isolates. But no phytoplasma DNA was detected in healthy jujube seedlings. The nested PCR, the primer pair 16S(V) F/R, about 460 bp fragment, amplified DNA in all tested JWB and related phytoplasmas including LiWB phytoplasma of the 165 rRNA group V, but no DNA amplification was detected from other phytoplasma strains such as group 16SrI (Aster yellows) and group 16SrⅩII (Stolbur group) phytoplasmas in which mulberry dwarf phytoplasma and chrysanthemum witches broom phytoplasma are belonged to, respectively The same results were obtained from both Korean- and Chinese-isolates of JWB. Nested-PCR using phytoplasma universal primer pair P1/P7 and 16S rRNA group V specific primer pair 16S(V) F/R could detect group V phytoplasma rapidly and easily, in particular JWB phytoplasma.

• Mycobiology
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• 제30권4호
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• pp.202-207
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• 2002

This study was carried out to develop specific primers for PCR detection of Phellinus linteus. Diverse genomes of 15 Phellinus spp. including five Phellinus linteus isolates were fingerprinted by Primer Universal rice primer(URP)1F. The URP-PCR pattern differentiated P. linteus isolates from other phellinus spp. A polymorphic band(2.8 kb), which is unique for P. linteus isolates, was isolated and sequenced. Twenty four-oligonucleotide primer pairs were designed based on information of DNA sequence. The primer set(PLSPF2/PLSPR1) amplified single band(2.2 kb) of expected size with genomic DNA from seven Phellinus linteus, but not with that of other Phellinus species tested. The primers could be used identically in both DNA samples from mycelium and fruit bodies. This specific primers could offer a useful tool for detecting and identifying P. linteus rapidly.

• 한국균학회지
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• 제27권5호
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• pp.337-340
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• 1999

rDNA내의 ITS region의 염기서열 분석 결과를 토대로 19종의 Phellinus 속균중 Phellinus linteus를 특이적으로 동정할 수 있는 primer를 제작하였다. 이 특이 primer는 ITS1과 ITS2내에 위치하며 이들 spacer region에 인접해 있는 universal Primer내에 위치해 있다. 총 4개의 Primer(universal primer인 ITS-1F와 ITS-4 그리고 특이 primer인 PL-F와 PL-R)가 한국에서 채집된 Phellinus 속균중 Phellinus linteus를 동정하는데 사용되었다. Phellinus linteus의 증폭된 DNA크기는 800bp(ITS-1F/ITS-4)와 720 bp(ITS-1F/PL-R과 PL-F/ITS-4)에 해당하는 2개의 band, 그리고 610 bp(PL-F/PL-R)인 것으로 나타났다. 한국에서 채집된 23종의 Phellinus속균중 13종이 Phellinus linteus인 것으로 확인되었다.