• 제목/요약/키워드: undulata

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Rhizina undulata rDNA ITS 영역의 PCR 검정 및 염기배열 분석 (PCR Detection and Sequence Analysis of the rDNA ITS Regions of Rhizina undulata)

  • 이선근;이종규;김경희;이승규;이상용
    • 한국산림과학회지
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    • 제96권4호
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    • pp.425-431
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    • 2007
  • Rhizina undulata의 PCR 검정 및 유전적 특성 분석을 목적으로, rDNA ITS 영역의 염기배열 해석 및 PCR 방법에 의한 토양으로부터 R. undulata의 진단법을 개발하였다. 18S rDNA 부분의 염기서열 분석 결과, 공시한 4종의 균주 모두 1,375 nt의 크기로 동일하였으며, 염기배열도 100% 일치하였다. 한편, rDNA ITS 영역의 염기배열은 585 nt이었고, PDK-1, PTT-1 및 PDJ-9 균주는 염기배열이 100% 동일하였으나, PDS-5균주에서는 두 곳에서 염기의 치환이 발견되었다. 이와 같은 염기배열을 분석하여 제작한 R. undulata rDNA ITS 영역 특이적 primer를 이용한 PCR 검정 결과, R. undulata 균주들에서만 약 525 bp 크기의 ITS 영역 특이적인 증폭산물이 검출되었다. PCR 방법에 의하여 검출할 수 있는 토양 중의 R. undulata 최소 균사량의 한계를 확인하기 위해서, 순수 배양한 R. undulata 균사현탁액을 순차 희석하여 100g의 사양토에 혼합한 다음, 농도별로 균사 혼합한 각각의 토양 시료로부터 추출한 total DNA의 PCR 증폭산물을 분석한 결과, PCR 방법에 의하여 100g의 토양 중에 1 ng의 R. undulata 균사가 함유되어 있는 경우까지 검출이 가능하였다.

Detection of Rhizina undulata in Soil by Nested-PCR Using rDNA ITS-specific Primer

  • Lee, Sun Keun;Lee, Jong Kyu;Lee, Seung Kyu;Kim, Kyung Hee;Lee, Sang Yong
    • 한국산림과학회지
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    • 제96권5호
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    • pp.585-590
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    • 2007
  • Rhizina undulata is the fungus, which causes Rhizina root rot on coniferous trees. Nested-PCR using ITS-specific primer was applied to detect R. undulata from the soils of Japanese black pine (Pinus thunbergil) forests infested with the disease in Seocheon, Chungnam Province, South Korea. Soil samples were collected from four different sites, both dead trees and fruit bodies of R. undulata were present, dead trees only present, fruit bodies only present, and both were absent. Nested-PCR products specific to R. undulata ITS-region were amplified. Positive reactions were found in some samples from the sites, where dead trees and fruit bodies of R. undulata were absent as well as where both of those were present. R. undulata was mainly detected in the soil samples from the depth of 5~20 cm under the soil surface. These results show that the nested-PCR could be used to diagnose the presence or potential infestation of R. undulata in the soils of pine forests.

Effect of Sodium Chloride (NaCl) on the Mycelial Growth and Ascospore Germination of Rhizina undulata, the Root Rot Fungus of Coniferous Trees

  • Lee, Sun Keun;Lee, Dong Hyeon;Lee, Kyoung-Tae;Park, Yong Bae;Seo, Sang-Tae;Lee, Jong Kyu
    • Journal of Forest and Environmental Science
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    • 제31권4호
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    • pp.312-316
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    • 2015
  • Rhizina undulata, the causal agent of Rhizina root rot, is a soil-borne fungus occurring on coniferous trees. The destruction of coastal forests caused by R. undulata infection has been mainly associated with bonfires at camping sites. However, Rhizina root rot was observed in the western coastal forests without fire. It was hypothesized that Rhizina root rot in this area might be closely related to the soil salinity, which can facilitate the growth and survival of R. undulata. So, the variation in sodium chloride (NaCl) resistance among isolates of Rhizina undulata was compared using liquid media containing different concentrations of NaCl ranging from 0 mM to 300 mM. Our results showed that, albeit of no growth at a higher concentration of NaCl (300 mM), most of R. undulata isolates were capable of germinating and grew at up to 100 mM, indicating that NaCl resistance varies among R. undulata isolates. It was further found that isolates from coastal areas seemed to be more tolerant to NaCl than those further away the coast. We demonstrated that R. undulata could be possible to survive in coastal areas, but was lower NaCl tolerance than other fungi.

리지나뿌리썩음병균 분리주들의 배양 특성 및 RAPD에 의한 유전적 다양성 분석 (Cultural Characteristics and Genetic Diversity of Rhizina undulata Isolates by Random Amplified Polymorphic DNA(RAPD))

  • 이상용;이선근;이종규;김경희;이승규
    • 한국산림과학회지
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    • 제95권4호
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    • pp.388-392
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    • 2006
  • 국내에 분포하는 리지나뿌리썩음병균(Rhizina undulata)의 생리적 특성 및 유전적 다양성을 밝히기 위하여, 소나무(Pinus densiflora) 및 곰솔(P. thunbergii) 림으로부터 분리한 13종의 리지나뿌리썩음병균 분리주를 공시하여 각 분리주들의 배양 특성 및 RAPD에 의한 유전적 다양성을 분석하였다. P. densiflora 및 P. thunbergii로부터 제조한 수용성 추출물 첨가배지에서의 각 분리주들의 균사생장 특성을 조사한 결과, 각 분리주들의 기주와 분리주들의 기주로 부터 추출한 수용성 추출물 배지에서의 균사생장량 간에는 상관관계를 발견할 수 없었다. 한편, 12종의 random primer를 사용하여 R. undulata 분리주들의 genomic DNA의 random amplified polymorphic DNA(RAPD)에 의한 유전적 다양성을 분석한 결과, 국내 분리주들의 RAPD profile은 모두 동일하였다. 그러나, 국내 분리주들의 RAPD profile과 일본 분리주와는 다소 차이를 나타내었는데 즉, RAPD profile의 phylogenetic tree 분석 결과, 국내 분리주들과 일본분리주와는 88%의 상동성을 나타내었다.

In Vitro Antioxidant Activity of 5-HMF Isolated from Marine Red Alga Laurencia undulata in Free Radical Mediated Oxidative Systems

  • Li, Yong-Xin;Li, Yong;Qian, Zhong-Ji;Kim, Moon-Moo;Kim, Se-Kwon
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제19권11호
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    • pp.1319-1327
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    • 2009
  • Marine red algae of genus Laurencia are becoming the most important resources to produce unique natural metabolites with wide bioactivities. However, reports related to Laurencia undulata, an edible species used as folk herb, are rarely found to date. In this research, 5-hydroxymethyl-2-furfural (5-HMF) was isolated and characterized by nuclear magnetic resonance (NMR) from Laurencia undulata as well as other marine algae. The following characteristics of 5-HMF were systematically evaluated: its antioxidant activities, such as typical free-radicals scavenging in vitro by electron spin resonance spectrometry (ESR) and intracellular reactive oxygen species (ROS) scavenging; membrane protein oxidation; oxidative enzyme myeloperoxidase (MPO) inhibition; as well as expressions of antioxidative enzymes glutathione (GSH) and superoxide dismutase (SOD) on the gene level using the polymerase chain reaction (PCR) method. The results demonstrated that 5-HMF could be developed as a novel marine natural antioxidant or potential precursor for practical applications in the food, cosmetic, and pharmaceutical fields.

소나무 리지나뿌리썩음병(病)에 관(關)한 연구(硏究) : Rhizina undulata의 생리적(生理的) 특성(特性) 및 병원성(病原性) (Studies on Rhizina Root Rot Disease of Pinus densiflora : Physiological Characteristics and Pathogenicity of Rhizina undulata)

  • 이상용;김완규
    • 한국산림과학회지
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    • 제79권3호
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    • pp.322-329
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    • 1990
  • 리지나뿌리썩음병(病)에 의한 소나무림(林)의 군상고사(群狀枯死) 현상(現象)이 강릉지방(江陵地方)에서 발견되었는데 흑갈색(黑褐色)의 부후반점(腐朽斑點), 방사상(放射狀) 부후(腐朽)흔적 및 모래덩이 형성등(等)이 이병목(罹病木)의 뿌리에서 관찰되었다. 년간(年間) 피해(被害) 확산거리(擴散距離)는 약(約)6m였으며, 포착목(捕捉木)에 의하여 이병목(罹病木) 토양중(土壤中) 병원균(病原菌)이 검출(檢出)되었다. Rhizina undulata의 자양포자(子襄胞子)는 $37^{\circ}C$ 24시간(時間) 또는 $40^{\circ}C$ 17시간(時間) 열처리(處理)에 의하여 발아(發芽)되었으며, PDA배지(培地)에서 균사(菌絲)의 생장이 양호하였고, 최적생장온도(最適生長溫度)는 $25-30^{\circ}C$ 배지(培地)의 최적(最適)pH는 5.6-6.3이었다. 試驗管내(試驗管內)에서의 접종실험결과(接種實驗結果), 침엽수가 활엽수보다 감수성(感受性)을 나타내었다.

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광양만에 분포하는 농조개, Raphia undulata의 자원생태학적 특성에 관한 연구

  • 김영혜;장대수;박영철;고태승;김종빈
    • 한국어업기술학회:학술대회논문집
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    • 한국어업기술학회 2001년도 춘계 수산관련학회 공동학술대회발표요지집
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    • pp.618-619
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    • 2001
  • 농조개(Raphia undulata)는 일본 인도양, 태평양 및 우리나라 남서해안에 분포하며, 수심 1m 근방의 진흙에 서식한다. 패각은 가늘고 길며 성장맥이 있지만 매우 약하다. 각장은 40∼60mm, 각고 35mm 이며, 패각전면에 보라색을 띤 산 무늬가 있고, 바탕은 열은 황색이다(유, 1976; 권 등, 1993). 본 종은 일본, 대만, 홍콩, 태국 및 필리핀 등에서는 많은 연구가 이루어져 있으며, 특히 동남아시아에서는 Perna viridis, 피조개 다음으로 식용조개로서 상업적으로 중요한 위치에 있으므로, 본 종에 대한 생태, 분류학적 위치 및 종묘생산 등 많은 연구가 이루어져 있는 실정이다. (중략)

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두과식물에서 발견된 내생균근 포자들 (Arbuscular mycorrhizal spores found from the soils of the leguminous plants in Korea)

  • 안태근;이민웅;가강현;이상선
    • 한국균학회지
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    • 제20권2호
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    • pp.95-108
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    • 1992
  • 1991년도 8월부터 11월까지 4개 도(道)의 9지역에서 19종의 콩과식물뿌리 주변토양에서 65 토양시료를 채취하여, 내생균근균에 대한 기본 연구를 하였다. 여기서 분리된 내생균근균은 4속 21종이였으며, 이중에 6종이 미기록종으로 나타나서 여기서 새로이 서술하였다 : Acaulospora elegans, A. undulata, Glomus laminated spores cf. marcrocarpus var. macrocarpus, Gl. WUM1+3, Gl. scintillans, Scutetlospora verrucosa. 또한 미동정된 3종은 아직 종동정에 어려웠으며, Acaulospora sp., Glomus sp. 및 Scutellospora sp.의 각각 한종씩 분리하여 속기재를 하였다.

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현삼과에서 재분류된 식물들의 계통분류학적 고찰 (Phylogenetic Analysis of the Former Members of Scrophulariaceae)

  • 배영민
    • 생명과학회지
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    • 제21권2호
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    • pp.273-278
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    • 2011
  • 꿀풀목 현삼과에 속하는 식물들의 재분류가 최근에 이루어졌는데, 엽록체 DNA의 염기서열에 따라 많은 수의 식물들이 꿀풀목의 다른 과로 옮겨졌다. 이들 중에서 국내의 산야에서 쉽게 발견할 수 있는 꽃며느리밥풀, 나도송이풀, 물칭개나물, 외풀, 주름잎의 계통분류를 시도해 보았다. 우선, 이 식물들의 18S rRNA 및 ITS1의 염기서열을 결정하여 GenBank에 등록하였다(각각, accession numbers GU359046, GU359047, GU359048, GU359049, GU359050). 꽃며느리밥풀, 나도송이풀 및 물칭개나물의 경우에는 엽록체 DNA의 염기서열에 기초를 둔 현재의 분류체계와 본 연구에서 분석한 결과가 잘 일치하였다. 그러나 주름잎과 외풀의 경우에는 분석 결과에 있어서의 차이가 커서 결론에 도달할 수가 없었다.

한국미기록 히드라충류 (자포동물문: 히드라충강) 4종 (New Records of Four Hydroids (Cnidaria, Hydrozoa) in Korea)

  • 박정희
    • Animal Systematics, Evolution and Diversity
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    • 제15권2호
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    • pp.197-204
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    • 1999
  • 1989년 6월부터 1997년 7월까지 우리 나라의 동해에서 채집한 히드라충류 가운데 4종, 고리마디히드라 [Bimeria annulata(Nutting, 1901)], 분지보우갠빌히드라 [Bougainvilla ramosa(van Beneden, 1844)], 북방산꽃히드라 [Eudendrium boreale Yamada, 1954] 그리고 파도깃히드라 [Plumularia undulata Yamada, 1950]가 한국미기록종으로 판명되어 재기재하고 보도한다. 이로서 지금까지 밝혀진 한국 해산 히드라충류는 2목, 18과의 134종 및 7아종이 된다.

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