• 제목/요약/키워드: two-stepwise screening method

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제초제 저항성 유전자와 기존 병 저항성 유전자가 연관된 형질전환 토마토 개체 선발 및 후대분석 (Progeny Analysis and Selection of Tomato Transformants with patII Gene linked to Inherent Disease Resistance Gene)

  • 안순영;강권규;윤해근;박효근
    • 원예과학기술지
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    • 제29권4호
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    • pp.345-351
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    • 2011
  • 원예작물의 내병성 육종에 있어 $F_2$와 그 이후 분리 세대에서 유용하게 사용할 수 있는 선발방법의 모델 시스템을 개발하고자 하였다. 상용 토마토 품종인 '모모따로 요크'에 제초제 저항성 유전자를 도입한 후 획득된 형질전환체의 도입 유전자 수와 후대 분리비를 분석하고, 제초제 저항성 유전자와 기존 병 저항성 유전자가 연관된 개체를 선발하였다. 총 60개의 형질전환체 중에서 42개체에 Southern blot을 실시하여 도입 유전자 수를 확인하고, 제초제 저항성 유전자에 대한 분리비를 비교 분석하여 Southern 결과와 도입된 유전자의 표현형의 분리비가 일치하지 않으며 여러 개의 copy가 삽입된 대부분의 경우, 실제 도입된 copy 수보다 더 적은 copy 수를 가지는 것처럼 분리비를 나타내는 것을 알 수 있었다. 삽입된 제초제 저항성 유전자와 기존 병 저항성 유전자가 가깝게 연관된 개체를 찾기 위해 $T_1(F_2)$세대 개체에 대하여 two-stepwise screening 방법을 실시하여 위조병 저항성 I2 유전자(11번 염색체)와 제초제 저항성 patII 유전자가 대략 12-13cM으로 가깝게 연관된 개체(T-20)를 선발하였다.

Nutritional Assessment of the Older Population: Practical Application and Limitation

  • Yoon, Jin-Sook
    • Journal of Community Nutrition
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    • 제2권1호
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    • pp.36-49
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    • 2000
  • Evaluation of nutritional status is an essential element in providing appropriate intervention strategies to achieve the highest level of health, Nutritional assessment of the older population is complicated by many factors which do not significantly affect the nutritional status in young adults, therefore, it should be considered in two ways; community-dwelling elders group and hospitalized or institutionalized elderly group. To sort out the individuals with nutritional problems in a community efficiently, nutrition screening tools must be simple, relatively inexpensive, and applicable to a large number of subjects. Combination of tools and indicators such as 24-hour food recall, body weight and height, and questionnaires on eating practices, and the presence of chronic diseases is practically applicable as basic tools of nutritional screening of older age group. However, the lack of validated screening techniques remains a barrier in improving nutrition. Validation is only limited to energy, BMI, protein intake of the older populations living in western countries. Further refinement of nutritional assessment tools is demanded to figure out whether those are practically applicable to community-living older adults in Asian Society. A careful and systematic evaluation of nutritional assessment tools should be carried out prior to implementation of stepwise nutrition service to the heterogeneous older population. For an in-depth nutritional assessment at the individual level, we need to extend research efforts to clarify the requirements of nutrients due to aging and diseases. More cost-effective method that will allow rapid analysis of survey results are needed so that information can be readily available to policymakers.

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Construction of a Large Synthetic Human Fab Antibody Library on Yeast Cell Surface by Optimized Yeast Mating

  • Baek, Du-San;Kim, Yong-Sung
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제24권3호
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    • pp.408-420
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    • 2014
  • Yeast surface-displayed antibody libraries provide an efficient and quantitative screening resource for given antigens, but suffer from typically modest library sizes owing to low yeast transformation efficiency. Yeast mating is an attractive method for overcoming the limit of yeast transformation to construct a large, combinatorial antibody library, but the optimal conditions have not been reported. Here, we report a large synthetic human Fab (antigen binding fragment) yeast surface-displayed library generated by stepwise optimization of yeast mating conditions. We first constructed HC (heavy chain) and LC (light chain) libraries, where all of the six CDRs (complementarity-determining regions) of the variable domains were diversified mimicking the human germline antibody repertoires by degenerate codons, onto single frameworks of VH3-23 and $V{\kappa}1$-16 germline sequences, in two haploid cells of opposite mating types. Yeast mating conditions were optimized in the order of cell density, media pH, and cell growth phase, yielding a mating efficiency of ~58% between the two haploid cells carrying HC and LC libraries. We constructed two combinatorial Fab libraries with CDR-H3 of 9 or 11 residues in length with colony diversities of more than $10^9$ by one round of yeast mating between the two haploid HC and LC libraries, with modest diversity sizes of ${\sim}10^7$. The synthetic human Fab yeast-displayed libraries exhibited relative amino acid compositions in each position of the six CDRs that were very similar to those of the designed repertoires, suggesting that they are a promising source for human Fab antibody screening.

전기뱀장어 및 집파리 AChE를 이용한 살충제의 In Vitro AChE 저해 시험 (In Vitro AChE Inhibition Tests of Insecticides Using Electric eel and Housefly AChE)

  • 이시혁;이준호;조광연
    • 한국응용곤충학회지
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    • 제31권2호
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    • pp.122-132
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    • 1992
  • 신규화합물의 in Vitro AChE 저해력을 평가하기 위한 저해시험법의 확립을 목적으로 실험을여 다음과 같은 결과를 얻었다. {TEX}$I_{50}${/TEX} 산출이 가능한 고정시간 저해시험(fixed time inhibition test)의 경우, DFP, DDVP 및 paraoxon과 같은 대표적 AChE 저해제의 저해력 평가에 적당한 저해시간은 10분 정도로 조사되었으며, 10분간의 저해조건하에서 ester group을 보유한 신규화합물의 저해여부 및 정도의 평가에 효과적인 시험농도는 10$\mu$M 수준으로 판정되었으나 다른 화합물의 경우에는 보다 높은 농도로부터 단계적 저해시험이 필요한 것으로 보였다. {TEX}$K_{d}${/TEX}, {TEX}$k_{3}${/TEX} 및 {TEX}$k_{i}${/TEX}와 같은 저해상수의 산출을 위한 경시적 저해시험(Progressive inhibition test)에 있어서, 본 실험의 장시간 저해(0.8~13.3분)와 낮은 저해제농도(1$\times${TEX}$10^{-9}${/TEX}~2$\times${TEX}$10^{-6}${/TEX}M)의 조건하에서는 극히 낮은 {TEX}$K_{d}${/TEX}(1.3$\times${TEX}$10^-{8}${/TEX}~5.6$\times${TEX}$10^{-7}${/TEX}M) 및 {TEX}$K_{3}${/TEX}(0.21~{TEX}$0.27min^{-1}${/TEX})가 관찰되었으나 저해제간의 저해독성 조사에는 충분한 타당성을 가지는 것으로 조사되었다. 또한 DFP, paraoxon 및 신규화합물인 KH501간의 현격한 저해력 차이는 {TEX}$K_{d}${/TEX}의 차이 즉, 저해제와 AChE간의 친화력 차이에 기인된 것으로 판명되었다. 따라서 AntiChE 스크리닝에 있어서 1차단계에서는 고정시간 저해법을 통하여 산출된 {TEX}$I_{50}${/TEX}를 바탕으로 하여 저해력 유무 및 정도를 파악하고, 1차단계에서 고도의 AChE 저해력이 인정된 신규 화합물을 대상으로 2차단계인 경시적 저해법을 이용하여 저해양상 및 특성을 조사하는 것이 합리적인 체계일 것으로 생각되어진다.

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