A livetin solution(LS) containing yolk immunoglobulins(IgY) was separated by treating the egg yolk with natural gum, carrageenan. Carrageenan has been used as a food ingredient. Relative absorbance of IgY LS after proteolysis was investigated. IgY LS was fairly stable to pepsin digestion at pH 3.0. However, IgY LS appeared to be susceptible to pepsin digestion at pH 2.0, showing 18% of relative absorbance and complete breakdown H chain after 30 min exposure. Relative absorbance of IgY LS was considerably high after exposure to trypsin and chymotrypsin for 8 hr. IgY LS showed especially good stability to chymotrypsin digestion.
The number of sites at which a protein can be readily cleaved by a proteolytic enzyme is greatly influenced by its three-dimensional structure. For native, properly-folded proteins both the rate of cleavage and number of sites at which cleavage takes place are usually much less than for the denatured protein. In order to compare the tertiary structure of recombinant HepG2 type glucose transporter with that of its native counterpart in the erythrocyte, the pattern of tryptic cleavage of the protein expressed in insect cell membranes was therefore examined. After 30 minutes digestion, a fragment of approximate Mr 19,000-21,000 was generated. In addition to this, there were two less intensely stained fragments of apparent Mr 28,000 and 17,000. The pattern of labelling was similar up to 2 hours of digestion. However, the fragments of Mr 19,000-21,000 and Mr 17,000 were no longer detectable after 4 hours digestion. The observation of a very similar pattern of fragments yielded by tryptic digestion of the HepG2 type transporter expressed in insect cells suggests that the recombinant protein exhibits a tertiary structure similar if not identical to that of its human counterpart. Also, the endogenous sugar transporter(s) present in Sf21 cells did not bind cytochalasin B, the potent transporter inhibitor. Therefore, the baculovirus/Spodoptera frugiperda (Sf) cell expression system could be very useful for production of large amounts of human glucose transporters, heterologously.
탄수화물을 갖고 있지 않은 caseinomacropeptide (CMP)를 감성유청분말로부터 12% TCA법에 의해 분리한 결과 100 g의 감성유청분말로 부터 2.7 g을 얻을 수 있었다. 분리된 CMP는 전기영동과 아미노산 조성을 분석한 결과 매우 순도가 높은 CMP로 나타나 12% TCA침전법은 감성유청분말로 부터 CMP를 분리하는 효과적인 방법임을 알 수 있었다. 트립신을 pore glass beads에 carbodiimide (EDC) 방법으로 amide결합에 의해 고정화시켰으며 고정화된 트립신의 양은 1 g glass beads당 20 mg이었다. 수용성 트립신에 의한 CMP 가수분해는 24시간이 지나면 거의 완료되었으며 고정화 트립신은 24시간이 지난 후에도 가수분해가 진행되고 있었다. 가수분해물을 Bio-Gel P4 column에 의해 분획한 후 혈소판 응집 저해작용을 측정한 결과 고정화 트립신에 의해 24시간 가수분해시킨 CMP 분해물이 가장 높은 혈소판 응집 억제능을 보였다.
Lysozyme was treated with digestive enzymes and the production of interleukin 8 (IL-8) was measured in Caco-2 cell with the peptides from lysozyme upon stimulating with lipopolysaccharide (LPS) to investigate the overall anti-inflammatory activity of lysozyme when it is in digestive tracts. Lysozyme reduced IL-8 production, and the peptides from pepsin hydrolysis of lysozyme had the similar effect. The products of trypsin digestion of lysozyme had no effect on the reduction of IL-8 production while those of pepsin-trypsin hydrolysis did. The effectiveness of lowering IL-8 production was not different by time of the peptide addition. When Caco-2 cells were pre-incubated with peptides for 24 hr, the reduction effects were observed from the peptides from pepsin hydrolysis, indicating that some of the peptides are still remaining in the cells. Therefore, it can be concluded that the IL-8 reduction effect of lysozyme against LPS still remained even after the pepsin and trypsin hydrolysis.
A general procedure to quantitate the reaction of carbodiimides with carboxy groups of proteins is described. Pyridoxamine reacts with the o-acylisourea intermediate generated during the reaction of carboxyl residues with carbodiimides. The extent of the reaction is determined by measuring the spectroscopic properties, absorption and emission, of pyridoxyl residues covalently attached to the proteins. Resolved pig brain aspartate aminotransferase (apoenzyme), inactivated by 1-ethyl-3-(3-dimethylamino propyl) carbodiimide, reacts with $[^{3}H]pyridoxamine$. After trypsin digestion, one peptide labeled with radioactive pyridoxyl was separated by reverse phase HPLC.
Kim, Won-Tae;Bae, Sung-Woo;Kim, A-Young;Park, Kwan-Ho;Lee, Sang-Beom;Choi, Young-Cheol;Han, Sang-Mi;Park, Young-Han;Koh, Young-Ho
BMB Reports
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제44권6호
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pp.387-392
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2011
To investigate the molecular scavenging capabilities of the larvae of Hermetia illucens, two serine proteases (SPs) were cloned and characterized. Multiple sequence alignments and phylogenetic tree analysis of the deduced amino acid sequences of Hi-SP1 and Hi-SP2 were suggested that Hi-SP1 may be a chymotrypsin- and Hi-SP2 may be a trypsin-like protease. Hi-SP1 and Hi-SP2 3-D homology models revealed that a catalytic triad, three disulfide bonds, and a substrate-binding pocket were highly conserved, as would be expected of a SP. E. coli expressed Hi-SP1 and Hi-SP2 showed chymotrypsin or trypsin activities, respectively. Hi-SP2 mRNAs were consistently expressed during larval development. In contrast, the expression of Hi-SP1 mRNA fluctuated between feeding and molting stages and disappeared at the pupal stages. These expression pattern differences suggest that Hi-SP1 may be a larval specific chymotrypsin-like protease involved with food digestion, while Hi-SP2 may be a trypsin-like protease with diverse functions at different stages.
Serratia marcescens ATCC 21074 의 세포배양액으로 부터 순수분리한 metalloprotease 의 자가분해성 및 안정성과 관련된 몇가지 효소적 특성을 조사하였다. 최적 반응온도와 pH 는 각각 37.deg.C, pH 8.0 였으며 안정성은 pH 5.0-11.0 범위에서, 온도의 경우 10-37.deg.C 에서 비교적 안정한 것으로 나타냈다. Differential scanning calorimeter 로 이효소의 열적 성질을 분석한 결과 변셩 시작 온도는 37.6 .deg.C, endothermic peak 온도는 43.2 .deg.C, enthaply 변화량은 -8.4 mJ/mg 이었다. 이 효소는 30.deg.C 에서 24 시간 동안 거의 자가분해가 일어나지 않았으나 변성된 단백질의 셩우 쉽게 자가분해되는 것으로 나타났다. 또한 이효소는 trypsin, .alpha.-chymotrypsin, elastase 에 의해서 분해되지 않았으나 분해되지 않았으나 thermolysin 에 의해서는 쉽게 분해되었다.
This paper describes a micro total analysis system ($\mu$ TAS) for detecting and digesting the target protein which includes a bead based temperature controllable microchip and computer based controllers for temperature and valve actuation. We firstly combined the temperature control function with a bead based microchip and realized the on-chip sequential reactions using two kinds of beads. The PEG-grafted bead, on which RNA aptamer was immobilized, was used for capturing and releasing the target protein. The target protein can be chosen by the type of RNA aptamer. In this paper, we used the RNA aptamer of HCV replicase. The trypsin coated bead was used for digesting the released protein prior to the matrix assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometer (MALDI TOF MS). Heat is applied for release of the captured protein binding on the bead, thermal denaturation and trypsin digestion. PDMS microchannel and PDMS micro pneumatic valves were also combined for the small volume liquid handling. The entire procedures for the detection and the digestion of the target protein were successfully carried out on a microchip without any other chemical treatment or off-chip handling using $20\;{\mu}l$ protein mixture within 20 min. We could acquire six matched peaks (7% sequence coverage) of HCV replicase.
Earthworm extracts are known for anti-inflammatory, analgesic. antipyretic, and anticancer effects but can also influence blood circulation. It was previously shown that an earthworm, Lumbricus rubelius. contained a water-extractable anticoagulant which was a heat- and acid-stable molecule with hydrophilic property. In order to uncover the biochemical nature of this molecule, the anticoagulant was processed with various hydrolases such as trypsin, DNase, RNase. and lysozome. When the digested samples were analyzed with an in vitro coagulation test measuring activated partial thromboplastin time (APTT) and agarose gel electrophoresis, the anticoagulant proved to be a relatively homogeneous DNA fragment with relative molecular size around 72 base pairs. Interestingly, the activity was further stimulated with a trypsin digestion. RNA. on the other hand, did not prolong the APTT. It was also demonstrated that the DNA accelerated the antithrombin III (AT-III) inhibition of thrombin from $IC_{50}$ of 0.34 to 0.16 unit determined with S-2238 as a substrate, whereas heparin, a popular anticoagulant. shifted the value to 0.05. Therefore, it is suggested that the DNA could be considered as an alternative antithrombotic agent to heparin, which would exhibits bleeding side effects.
To facilitate their spread, plant viruses have developed several methods for dispersal including insect and seed transmission. While insect transmission requires virus stability against insect digestion, seed-transmitted viruses have to overcome barriers to entry into embryos. Bean pod mottle virus (BPMV) is transmitted through seed at levels typically below 0.1%, but co-infection with Soybean mosaic virus (SMV) enhanced the seed transmission rate of BPMV in one experiment. In contrast, the rate of SMV seed transmission was not affected by BPMV co-infection. In a second preliminary study, the rate of SMV transmission was lower in an isoline of Williams 82 that contained a null mutation for the Kunitz trypsin inhibitor gene than in Williams 82. In this preliminary study, we observed that factors such as protease inhibitor expression and dual infection may affect the frequency of seed transmission of BPMV and SMV.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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