• 제목/요약/키워드: triglycerides

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Identification of Causal and/or Rare Genetic Variants for Complex Traits by Targeted Resequencing in Population-based Cohorts

  • Kim, Yun-Kyoung;Hong, Chang-Bum;Cho, Yoon-Shin
    • Genomics & Informatics
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    • 제8권3호
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    • pp.131-137
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    • 2010
  • Genome-wide association studies (GWASs) have greatly contributed to the identification of common variants responsible for numerous complex traits. There are, however, unavoidable limitations in detecting causal and/or rare variants for traits in this approach, which depends on an LD-based tagging SNP microarray chip. In an effort to detect potential casual and/or rare variants for complex traits, such as type 2 diabetes (T2D) and triglycerides (TGs), we conducted a targeted resequencing of loci identified by the Korea Association REsource (KARE) GWAS. The target regions for resequencing comprised whole exons, exon-intron boundaries, and regulatory regions of genes that appeared within 1 Mb of the GWA signal boundary. From 124 individuals selected in population-based cohorts, a total of 0.7 Mb target regions were captured by the NimbleGen sequence capture 385K array. Subsequent sequencing, carried out by the Roche 454 Genome Sequencer FLX, generated about 110,000 sequence reads per individual. Mapping of sequence reads to the human reference genome was performed using the SSAHA2 program. An average of 62.2% of total reads was mapped to targets with an average 22X-fold coverage. A total of 5,983 SNPs (average 846 SNPs per individual) were called and annotated by GATK software, with 96.5% accuracy that was estimated by comparison with Affymetrix 5.0 genotyped data in identical individuals. About 51% of total SNPs were singletons that can be considered possible rare variants in the population. Among SNPs that appeared in exons, which occupies about 20% of total SNPs, 304 nonsynonymous singletons were tested with Polyphen to predict the protein damage caused by mutation. In total, we were able to detect 9 and 6 potentially functional rare SNPs for T2D and triglycerides, respectively, evoking a further step of replication genotyping in independent populations to prove their bona fide relevance to traits.

Effects of three different formulae of Gamisoyosan on lipid accumulation induced by oleic acid in HepG2 cells

  • Go, Hiroe;Ryuk, Jin Ah;Hwang, Joo Tae;Ko, Byoung Seob
    • Integrative Medicine Research
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    • 제6권4호
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    • pp.395-403
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    • 2017
  • Background: Gamisoyosan (GSS) is an herbal formula which has been used to treat women's diseases for several hundred years in Korea. GSS is one of the three most common prescriptions among women and is used to treat menopausal symptoms. Fatty liver disease is also common in postmenopausal women and can precede more severe diseases, such as steatohepatitis. The present study compared the effects of GSS on fatty liver using three different formulae, Dongui-Bogam (KIOM A), Korean Pharmacopeia (KIOM B) and Korean National Health Insurance (KIOM C). Methods: In oleic acid-induced HepG2 fatty liver cells, cellular lipid accumulation, triglycerides and total cholesterol were measured after treatment with three GSS formulae and simvastatin as a positive control. To investigate the phytoestrogen activity of GSS, MCF-7 cells were treated with GSS, and hormone levels were quantified. Also, qualitative analysis was performed with UPLC. Results: All types of GSS decreased cellular lipid accumulation. KIOM A was slightly less effective than the other two GSS formulae. KIOM B and KIOM C decreased cellular triglycerides more effective than simvastatin, but KIOM A did not affect cellular triglycerides. Cellular total cholesterol was decreased by all GSS and simvastatin. GSS showed phytoestrogen activity in MCF-7 cells. From the UPLC analysis data, geniposide, paeoniflorin and glycyrrhizin were detected form three GSS formulae. Conclusion: These results suggest that all GSS formulae have a beneficial effect on fatty liver disease during menopause and that differences of formula have no effect on the efficacy of the prescription.

Perilipin 5 is a novel target of nuclear receptor LRH-1 to regulate hepatic triglycerides metabolism

  • Pantha, Rubee;Lee, Jae-Ho;Bae, Jae-Hoon;Koh, Eun Hee;Shin, Minsang;Song, Dae-Kyu;Im, Seung-Soon
    • BMB Reports
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    • 제54권9호
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    • pp.476-481
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    • 2021
  • Liver receptor homolog-1 (LRH-1) has emerged as a regulator of hepatic glucose, bile acid, and mitochondrial metabolism. However, the functional mechanism underlying the effect of LRH-1 on lipid mobilization has not been addressed. This study investigated the regulatory function of LRH-1 in lipid metabolism in maintaining a normal liver physiological state during fasting. The Lrh-1f/f and LRH-1 liver-specific knockout (Lrh-1LKO) mice were either fed or fasted for 24 h, and the liver and serum were isolated. The livers were used for qPCR, western blot, and histological analysis. Primary hepatocytes were isolated for immunocytochemistry assessments of lipids. During fasting, the Lrh-1LKO mice showed increased accumulation of triglycerides in the liver compared to that in Lrh-1f/f mice. Interestingly, in the Lrh-1LKO liver, decreases in perilipin 5 (PLIN5) expression and genes involved in β-oxidation were observed. In addition, the LRH-1 agonist dialauroylphosphatidylcholine also enhanced PLIN5 expression in human cultured HepG2 cells. To identify new target genes of LRH-1, these findings directed us to analyze the Plin5 promoter sequence, which revealed -1620/-1614 to be a putative binding site for LRH-1. This was confirmed by promoter activity and chromatin immunoprecipitation assays. Additionally, fasted Lrh-1f/f primary hepatocytes showed increased co-localization of PLIN5 in lipid droplets (LDs) compared to that in fasted Lrh-1LKO primary hepatocytes. Overall, these findings suggest that PLIN5 might be a novel target of LRH-1 to mobilize LDs, protect the liver from lipid overload, and manage the cellular needs during fasting.

중년 남성의 공복혈당장애 관련 요인 (Factors Associated with Impaired Fasting Glucose in Middle-aged Men)

  • 이영숙
    • 문화기술의 융합
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    • 제8권4호
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    • pp.107-114
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    • 2022
  • 본 연구의 목적은 우리나라 중년 남성의 공복혈당장애 유병률을 파악하고, 공복혈당장애 관련 요인을 규명하기 위함이다. 연구방법은 제8기 2차년도(2020) 국민건강영양조사에 참여한 대상자 중 당뇨병 유병자를 제외한 40-64세의 남성 545명의 자료를 이용한 서술적 조사연구이다. 자료분석을 위해 SPSS/WIN 23.0 프로그램의 복합표본분석방법을 사용하여 빈도와 백분율, 평균과 표준편차, Rao-Scott 𝛘2, t-test, 로지스틱회귀분석을 시행하였다. 연구결과, 공복혈당장애 유병률은 44.77%였으며, 음주빈도(OR=1.531, 95% CI: 1.01-2.33), 중성지방(OR=1.002, 95% CI: 1.00-1.01)이 공복혈당장애의 유의한 관련 요인이었다. 따라서, 중년 남성의 공복혈당장애의 예방과 관리를 위한 프로그램의 개발이 필요하며, 이에 음주습관과 중성지방 관리 전략을 포함해야 할 것이다.

한국국민건강영양조사 병합자료(1998년, 2001년, 2005년)를 이용한 소아청소년에서의 대사증후군 진단 요인의 기초 분석 (Preliminary analysis of metabolic syndrome components in Korean adolescents by using Korean national health and nutrition examination Survey pooling data (1998, 2001, and 2005))

  • 허경;박미정
    • Clinical and Experimental Pediatrics
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    • 제51권12호
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    • pp.1300-1309
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    • 2008
  • 목 적: 본 연구는 국내 소아청소년의 대사증후군의 기준치 설정의 참고자료가 되고자 BMI, 혈압, 허리둘레, 중성지방, 중성지방, HDL-콜레스테롤, 공복혈당의 연령별, 성별 백분위수 분포를 분석하였다. 방 법: 1998년, 2001년 및 2005년 국민건강영양조사에서 조사된 10-19세 연령 총 4,164명(남아 2,139명, 여아 2,025명)을 대상으로 하였다. 신장, 체중, 허리둘레를 측정하였고 BMI, 혈압, 지질 농도와 혈당의 분포를 분석하였다. 결 과: BMI 는 여아 17세 90 백분위수에서, 남아 17세의 85 백분위수에서 성인 비만 위험군으로 정의하는 25 이상으로 측정되고 있었다. 허리둘레는 17세 이상 90 백분위수 남아 여아 모두에서 아시아 성인 복부비만의 기준치 이상이 측정되었다. 수축기 혈압은 남아 15세 이상 90 백분위수 이상, 13세 이상 95 백분위수 이상에서 성인 대사증후군의 진단 기준인 수축기 혈압 130 mmHg 이상이 측정되었고 이완기 혈압은 남아 17세 이상의 90 백분위수 이상, 15세 이상 95 백분위수 이상에서 80 mmHg 이상이었다. 혈장 중성지방은 NCEP-ATP III의 기준인 110 mg/dL 이상은 남아 여아 모두 75 백분위수에 해당하였고 IDF의 기준인 150 mg/dL 이상은 남아 여아 모두 90 백분위수에 해당하였다. HDL-콜레스테롤의 대사증후군 진단 기준인 40 mg/dL 이하는 남아에서 25 백분위수 이하가 여아에서 10 백분위수 이하가 해당되었다. 공복 혈당은 NCEP-ATP III 기준인 110 mg/dL 이상은 남아 여아에서 95 백분위수에 해당하였고 IDF 기준인 100 mg/dL 는 남아 여아 모두 90 백분위수에 해당하였다. 결 론: 한국 청소년 후기 남아에서 혈압, 허리둘레, 중성지방의 90 백분위수와 여아에서 허리둘레, 중성지방의 90 백분위 수치가 한국 성인 대사증후군의 기준치에 근접하여 매우 높았다.

식물유(植物油)의 Triglyceride조성(組成)에 관한 연구(硏究) -제(第) 4 보(報) : 쌀겨기름의 Triglyceride조성(組成)- (Studies on the Triglyceride Composition of Some Vegetable Oils -IV. Triglyceride Composition of Rice Bran Oil-)

  • 최수안;박영호
    • 한국식품과학회지
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    • 제15권2호
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    • pp.108-111
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    • 1983
  • 쌀겨기름의 트리-글리세리드를 ${\mu}-Bondapack$ $C_18$를 column로, 메타놀과 크로로포름의 혼합용액을 용매로 한 HPLC에 걸면, 5개의 피이크로 분획(分劃)되었다. 이 5개의 분획분(分劃分)을 분취(分取)하여 5개군의 트리-글리세리드를 각각 얻었다. 이 트리-글리세리드들을 GLC로서 총탄소수별(總炭素數別)로 분석(分析)하였는데 $3{\sim}4$개의 피이크로 각각 분획(分劃)하였다. 쌀겨기름의 트리-글리세리드를 구성(構成)하는 주요(主要) 지방산(脂肪酸)은 $C_{16:0}$, $C_{18:1}$$C_{18:2}$였으며, 산정(算定)된 주요(主要) 트리-글리세리드의 조성(組成)은 $(1{\times}C_{16:0},\;1{\times}C_{18:1},\;1{\times}C_{18:2};16.64%)$, $(2{\times}C_{18:1},\;1{\times}C_{18:2},\;16.68%)$, $(3{\times}C_{18:1},\;13.7%)$, $(1{\times}C_{16:0},\;2{\times}C_{18:1},\;12.77%)$, $(1{\times}C_{18:1},\;2{\times}C_{18:2},\;9.16%)$$(1{\times}C_{16:0},\;2{\times}C_{18:2},\;6{\times}C_{18:2};6.42%)$이였다.

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식물유(植物油)의 Triglyceride조성(組成)에 관한 연구(硏究) -제3보(第3報) : 올리브기름의 Triglyceride조성(組成)- (Studies on the Triglyceride Composition of some Vegetable Oils -III. Triglyceride Composition of Olive Oil-)

  • 최수안;박영호
    • 한국식품과학회지
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    • 제15권1호
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    • pp.66-69
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    • 1983
  • 올리브기름의 트리-글리세리드조성(組成)을 구명(究明)하기 위하여, 시료유(試料油)를 TLC에 의하여, 트리-글리세리드를 분리(分離)하고, 분리(分離)한 트리-글리세리드 HPLC에 의하여 PN별(別)로 4군(群)으로 분획(分劃)하였으며, 각 획분(劃分)을 분취(分取)하여 GLC에 의하여 acyl탄소수별(炭素數別)로 분획(分劃)하였다. 또 PN별(別) 획분(劃分)은 GLC로 지방산조성(脂肪酸組成)을 분석(分析)하였다. 올리브기름에 있어서 주(主)로 PN48에 acyl탄소(炭素) C-52 및 C-54가 높은 비율(比率)로 함유되어 있으며, 지방산(脂肪酸)은 C18 : 1 및 C18 : 2가 주요성분(主要成分)으로 구성(構成)되여 있었다. 시료유(試料油)의 주요(主要) 트리-글리세리드를 들면 다음과 같다. $(3{\times}C18:1;50.46%),\;(1{\times}C16:0,\;2{\times}C18:1;23.51%)$ $(2{\times}C18:1,\;1{\times}C18:2;5.48%),\;(1{\times}C18:0,\;2{\times}C18:1;4.55%)$ $(1{\times}C16:0,\;1{\times}C18:1,\;1{\times}C18:2;2.94%)\;(2{\times}C16:0,\;1{\times}C18:1;2.35%)$ $(1{\times}C16:1,\;2{\times}C18:1;2.21%),\;(1{\times}C18:1,\;2{\times}C18:2;1.06%)$, 및 $(1{\times}C14:0,\;2{\times}C18:1;1.03%)$이였다.

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녹두의 유리 및 결합지질의 조성에 관한 연구 (Composition of Lipid Glass and Fatty Acid in Free and Bound Lipids From Mungbean)

  • 엄수현;최홍식
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제17권2호
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    • pp.164-171
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    • 1988
  • 녹두(Phasealus radiatus, L)로 부터 유리지질과 결합지질(저온 및 고온)을 얻은 다음, 이들을 다시 중성지질, 당지질, 인지질로 분획 정량하고 다시 이 분획된 성분을 정량하였으며 아울러 각 분획별 지방산 조성을 분석하였다. 녹두 유리지질의 중성지질, 당지질, 인지질의 함량비율은 각각 89.1, 7.1, 3.7%였으며 결합지질(저온)은 56.4%, 28.6, 15.0%였으며 결합지질(고온)의 경우는 49.2, 29.0, 21.8%였다. 유리지질 획분의 중성지질조성 중 주된 성분은 triglycerides (82.8%), 1,2-diglycerides(6.6%), esterified sterols(4.6%)이었고, 저온에게 추출한 결합지질은 triglycerides (32.5%), free fatty acid(28.2%), 1,3-diglycerides(26.3%)들이고 고온에서 추출한 결합지질은 triglycerides(57.8%), free fatty acid(21.6%)이었다. 한편 유리지질 획분의 주된 당지질 성분은 esteryl steryl glycosides(89.9%), monogalactosyl diglycerides(8.2%)였고 저온 또는 고온에서 추출된 결합지질의 당지질성분은 esteryl steryl glycosides가 주성분$(76{\sim}93%)$였고 monogalactosyl diglycerides도 함유되어 있었다. 유리지질 및 결합지질의 인지질조성을 보면 phosphatidyl ethanolamine, diphosphatidyl glycerides, phosphatidyl choline, phosphatidyl inositol+phosphatidyl serine 등이 주요성분으로 함유되어 있었다. 또한 각 분획된 지질의 지방산 조성은 유리지질에서는 linoleic acid(39.6%), palmitic acid(24.9%), linolenic acid(19.7%), 저온 또는 고온 결합지질에서는 linolenic acid, palmitic acid, linolenic acid이었고 유리지질에서는 결합지질에서 나타나지 않는 arachidic acid와 behenic acid가 함유되어 있었다.

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복숭아씨 및 살구씨기름의 triglyceride조성(組成) (Triglyceride Compositions of Peach Kernel and Apricot Kernel Oil)

  • 박영호;박진우;김태수;최수안;천석조
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제27권4호
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    • pp.278-284
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    • 1984
  • 복숭아씨기름 및 살구씨기름의 triglyceride 조성(組成)을 밝히기 위하여 시료유(試料油)로부터 TLC에 의하여 triglyceride를 분리하고, 이것을 HPLC에 의하여 PN 별(別)로 triglyceride를 분획(分劃)하여 분취(分取)하였다. 분취(分取)한 각분획(各劃分)을 GLC에 의하여 acyl 탄소수별(炭素數別)로 재분획(再分劃)하는 한편, 각획분(各劃分)의 지방산조성(脂肪酸組成)을 분석(分析)하였다. 이들 결과로부터 시료유(試料油)의 triglyceride조성(組成)을 산정(算定)하였는데, 산정(算定)할 수 있었던 복숭아씨기름의 triglyceride는 15종류였으며, 이중(中) 주요(主要) triglyceride는 다음과 같다. $(3{\times}C_{18:1},\;30.9%)$, $(2{\times}C_{18:1},\;C_{18:2},\;21.2%)$, $(C_{18:1},\;2{\times}C_{18:2},\;10.6%)$, $(3{\times}C_{18:2},\;3.8%)$, $(C_{18:0},\;2{\times}C_{18:1},\;1.8%)$, $(C_{16:0},\;C_{18:1},\;C_{18:2},\;1.5%)$, $(C_{18:0},\;C_{18:1},\;C_{18:2},\;1.1%)$ 등이다. 또한 살구씨기름의 정우는 산정(算定)할 수 있었던 triglyceride 는 13종류였고, 주요(主要) triglyceride는 다음과 같다. $(3{\times}C_{18:1},\;39.5%)$, $(2{\times}C_{18:1},\;C_{18:2},\;24.5%)$, $(C_{18:1},\;2{\times}C_{18:2},\;14.2%)$, $(3{\times}C_{18:2},\;2.0%)$ 등이다.

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Effect of Temperature Shock on Cultured Olive Flounder (Paralichthys olivaceus) and Black Rockfish (Sebastes schlegeli)

  • Lee Sang Jun;Lee Jong Hee;Kang Jeong Ha;Lee Jeong Ho;Min Kwang Sik;Myung Jeong In;Kim Yoon;Kong In Soo
    • Fisheries and Aquatic Sciences
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    • 제4권3호
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    • pp.112-119
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    • 2001
  • Aim of this research is to investigate the effect of temperature shocks on the physiological responses of cultured olive flounder (Paralichthys olivaceus) and black rockfish (Sebastes schlegeli). Olive flounder and black rockfish were suffered with high and low temperature shocks for 4 and 8h, respectively, in laboratory conditions and then the changes in glucose, lactate, total protein, uric acid, and triglycerides-glycerol in blood plasma were analyzed. We observed that lactate and uric acid increased for up to 4h and then decreased for up to 8h by the high and low temperature shocks, and total protein decreased for up to 4h and then recovered for up to 8h by the high temperature shock in both fishes. Glucose by the high and low temperature shocks and triglycerides-glycerol by the low temperature shock increased for up to 4h, and then decreased in olive flounder, but increased for up to 8h in black rockfish. From the result, we speculated that the two fishes have an interspecific variation in the regulatory systems of glucose and triglycerides-glycero1. Glucose would play important role as an energy source during the temperature shocks and for an intermediate substance for low temperature tolerance, and glycerol of triglycerides-glycerol would play an important role for low temperature tolerance. In olive flounder, the turnover of chemical change by temperature shock took more than 4h, all chemicals returned almost to the initial level for up to 8h, but fish death followed only in 8h with the high temperature shocked group within two days. Therefore, we suggested that fish would be damaged severely by the longer time exposure of high temperature and mortality would occur after a certain time later than the shocked time as a post-effect.

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