• 제목/요약/키워드: translocation population

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Study for grain-filling of rice using 13C labeling flow-metabolome analysis

  • Okamura, Masaki;Hirai, Masami Yokota;Sawada, Yuji;Okamoto, Mami;Arai-Sanoh, Yumiko;Yoshida, Hiroe;Mukouyama, Takehiro;Adachi, Shunsuke;Fushimi, Erina;Yabe, Shiori;Nakagawa, Hiroshi;Kobayashi, Nobuya;Kondo, Motohiko
    • 한국작물학회:학술대회논문집
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    • 한국작물학회 2017년도 9th Asian Crop Science Association conference
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    • pp.59-59
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    • 2017
  • Rice (Oryza sativa L.) is the most important crop and its yield must be improved to feed the increasing global population. Recently developed high-yielding varieties with extra-large sink capacity often have a problem in unstable grain-filling. Therefore, understanding limiting factors for improving grain-filling and controlling them are essential for further improvement of rice grain yield. However, since grain-filling rate was determined by complex sink-source balance, the ability of grain-filling was very difficult to evaluate. Source ability for 'grain' was not only determined by the ability of carbon assimilation in leaves, but also that of carbon translocation from leaves to panicles. Sink strength was determined by the complex carbon metabolism from sucrose degradation to starch synthesis. Hence, to evaluate the grain-filling ability and determine its regulatory steps, the whole picture of carbon flow from photosynthesis at leaves to starch synthesis at grains must be revealed in a metabolite level. In this study, the yield and grain growth rate of three high-yielding varieties, which show high sink capacity commonly, were compared. Momiroman showed lower grain filling rate and slower grain growth rate than the other varieties, Hokuriku 193 and Tequing. To clarify the limiting point in the carbon flow of Momiroman, $CO_2$ labeled by stable isotope ($^{13}C$) was fed to three varieties during ripening period. The ratio of $^{13}C$ left in the stem was higher in Momiroman 24 hours after feeding, suggesting inefficient carbon translocation of Momiroman. More interestingly, $^{13}C$ translocation from soluble fraction to insoluble one in the grain seemed to be slower in Momiroman. To get the further insight in a metabolite level, we are now trying the $^{13}C$ labeling metabolome analysis in the developing grains.

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한국산 중고기속(Sarcocheilichthys) 어류의 유전적 다양성과 분자계통학적 유연관계 (Genetic Diversity and Molecular Phylogenetic Relationships of the Genus Sarcocheilichthys Fish in Korea)

  • 장지왕;김재구;고재근;윤봉한;배양섭
    • 한국어류학회지
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    • 제36권2호
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    • pp.139-155
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    • 2024
  • 한국산 중고기속(genus Sarcocheilichthys)에 속하는 중고기(S. nigripinnis morii) 8개 집단과 참중고기(S. variegatus wakiyae) 5개 집단의 미토콘드리아 DNA의 cytb 유전자를 이용하여 각 집단의 유전적 다양성 및 분자계통학적 유연관계를 검토하였다. 참중고기 집단이 중고기 집단보다 유전적 다양성이 높은 것으로 확인되었다. cytb 유전자를 기반으로 한 한국산 중 고기속 어류의 분자계통도상에서 참중고기의 영산강(YSR) 집단은 중고기의 탐진강(TJR), 영산강(YSR), 섬진강(SJR) 집단과 clade를 이루며 현재의 분류체계와 일치하지 않는 유전적 유역관계가 나타났다. 한편, 핵 DNA 분자계통도상에서는 참중고기와 중고기로 뚜렷하게 구분이 가능하여 미토콘드리아 및 핵 DNA가 분자계통도상에서 상충하는 mitonuclear 불일치 현상이 나타냈다. 중고기의 섬진강(SJR) 집단이 동진강(DJR) 집단에 이입되어 교배가 일어난 것으로 추정되는 유전자형이 확인되었다. 동해로 유입되는 하천 중 유일하게 형산강(HSR)에만 이입되어 서식하는 것으로 알려진 중고기 집단은 한강(HR) 집단으로부터 이입되어 형성된 집단으로 추정되었지만, 고유한 유전적 그룹을 나타내는 유전자형도 확인되었다. 중고기의 한강(HR), 금강(GR), 만경강(MGR) 집단은 압록강 이북에 분포하는 북방중고기(S. czerskii), S. soldatovi와 유전적으로 동일 집단을 형성하였으며, 이에 다양한 표본을 확보하여 형태학적 및 분자계통학적 연구를 통한 분류학적 재검토가 요구되었다.

The frequency of chromosomal abnormalities and the prenatal cytogenetic analyses for couples with recurrent abortions

  • Choi, Soo-Kyung;Park, So-Yeon;Han, Jung-Yeol;Ryu, Hyun-Mee;Jun, Jong-Young
    • Journal of Genetic Medicine
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    • 제2권2호
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    • pp.59-63
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    • 1998
  • Between 1988-1998, cytogenetic analyses were performed for 1,476 couples and 162 women with recurrent abortions. We applied GTG-banding, high resolution-banding and FISH (fluorescent in situ hybridization) techniques in this study. The frequency of balanced translocations was 3.6% (112/3114). Of them, 74 cases (2.38%) were reciprocal translocations and 38 (1.22%) were robertsonian translocations. Chromosome aberrations were more frequent in women (80 cases) than in men (32 cases). No phenotypical abnormalities were found in all carriers who had experienced recurrent spontaneous abortions or experienced giving birth to malformed offsprings. Prenatal cytogenetic analyses were carried out on 40 subsequent pregnancies for carrier couples with balanced translocation. The fetal karyotypes showed that 13 cases (32.5%) were normal, 25 (62.5%) were balanced translocations, and two (6%) were unbalanced translocations. It is believed that the frequency of chromosomal abnormalities in patients with recurrent spontaneous abortion is higher than that of the normal population. Most of the fetal samples showed normal karyotypes or balanced translocations matching that of one of their parents. Although the incidence of chromosomal imbalance in the fetuses was relatively low in prenatal cytogenetic analysis, individuals with balanced translocations are predisposed to giving birth to malformed offsprings with partial trisomy or monosomy. Therefore, we recommend the cytogenetic and the prenatal cytogenetic analysis for those who experiences recurrent abortion as well as in case they become pregnant, to prevent the birth of offsprings with chromosomal abnormalities.

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팔당산 호밀(Secale cereale) B 염색체의 출현빈도에 대하여 (Frequency of B-chromosomes in Rye (Secale cereale) Cultivated in Paldang)

  • 이웅직
    • Journal of Plant Biology
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    • 제24권4호
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    • pp.181-190
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    • 1981
  • 1963년부터 1977년까지 팔당산 호밀의 B 염색체의 출현빈도를 조사한 결과는 다음과 같다. 2%(1963), 8%(1964), 8%(1965), 15%(1966), 11.5%(1968), 11.7%(1969), 20%(1975), 19.6%(1976), 12.8%(1977). $x^2$검정의 결과는 각 년도에 있어서의 B'의 출현빈도 사이에 유의차가 없음을 나타내고 있다. 1976년과 1977년에는 호밀 밭을 10개 구로 나누어 재료를 수집하여 B'의 분포와 표본채취의 결과를 분석하였다. 호밀의 B'는 집단내에서 비교적 균일하게 분포되고 있으며 최소 50개체를 관찰하면 호밀 집단의 B'의 출현빈도를 대략 알 수가 있었다. 팔당산 호밀 집단에서 1966년부터 1977년까지 계속하여 전좌이형접합체(T.H)에 의한 사가염색체를 가진 개체가 1~7%의 빈도로 관찰되었다.

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Ten-eleven translocation 1 mediating DNA demethylation regulates the proliferation of chicken primordial germ cells through the activation of Wnt4/β-catenin signaling pathway

  • Yinglin Lu;Ming Li;Heng Cao;Jing Zhou;Fan Li;Debing Yu;Minli Yu
    • Animal Bioscience
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    • 제37권3호
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    • pp.471-480
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    • 2024
  • Objective: The objective of this study was to investigate the regulation relationship of Ten-eleven translocation 1 (Tet1) in DNA demethylation and the proliferation of primordial germ cells (PGCs) in chickens. Methods: siRNA targeting Tet1 was used to transiently knockdown the expression of Tet1 in chicken PGCs, and the genomic DNA methylation status was measured. The proliferation of chicken PGCs was detected by flow cytometry analysis and cell counting kit-8 assay when activation or inhibition of Wnt4/β-catenin signaling pathway. And the level of DNA methylation and hisotne methylation was also tested. Results: Results revealed that knockdown of Tet1 inhibited the proliferation of chicken PGCs and downregulated the mRNA expression of Cyclin D1 and cyclin-dependent kinase 6 (CDK6), as well as pluripotency-associated genes (Nanog, PouV, and Sox2). Flow cytometry analysis confirmed that the population of PGCs in Tet1 knockdown group displayed a significant decrease in the proportion of S and G2 phase cells, which meant that there were less PGCs entered the mitosis process than that of control. Furthermore, Tet1 knockdown delayed the entrance to G1/S phase and this inhibition was rescued by treated with BIO. Consistent with these findings, Wnt/β-catenin signaling was inactivated in Tet1 knockdown PGCs, leading to aberrant proliferation. Further analysis showed that the methylation of the whole genome increased significantly after Tet1 downregulation, while hydroxyl-methylation obviously declined. Meanwhile, the level of H3K27me3 was upregulated and H3K9me2 was downregulated in Tet1 knockdown PGCs, which was achieved by regulating Wnt/β-catenin signaling pathway. Conclusion: These results suggested that the self-renewal of chicken PGCs and the maintenance of their characteristics were regulated by Tet1 mediating DNA demethylation through the activation of Wnt4/β-catenin signaling pathway.

산전 진단을 위한 임신 중기 양수 천자 (Midtrimester Amniocentesis for Prenatal Diagnosis)

  • 김숙령;최은정;김태윤;권경훈;송남희;오선경;지희준
    • Journal of Genetic Medicine
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    • 제5권2호
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    • pp.125-130
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    • 2008
  • 목 적: 양수 천자를 이용한 세포 유전학적 결과와 산전 유전 진단의 적응증의 변화를 알아보고자 하였다. 대상 및 방법: 지난 2000년부터 2007년까지 8년간 미즈메디 병원 산부인과에 내원한 산모 중 산전 유전 진단의 적응증에 해당되어 양수 천자를 시행한 2,523예에 대하여 세포 유전학적 검사 결과를 종합 분석하였다. 결 과: 양수 천자를 시행한 2,523예의 적응증은 고령의 산모가 1159예(45.9%)로 가장 많았으며, 다음으로 양성 산모혈청 표지자가 755예(29.9%)로 많았다. 염색체 핵형 분석 결과로는 정상 핵형이 2,413예(95.6%)였으며, 염색체 이상을 보인 경우가 110예(4.4%)였다. 염색체 이상을 보인 110예에서는 수적 이상이 38예(34.5%), 구조적 이상이 65예(59.1%), 모자이시즘이 7예(6.4%)로 나타났다. 위의 110예의 염색체 이상을 적응증에 따라 분석한 결과에는 고령의 산모로 의뢰된 경우가 40예(36.4%)로 가장 많았으며, 양성 산모 혈청 표지자가 36예(32.7%)로 많았다. 결 론: 양수 천자는 산전 진단에 있어서 효과적인 방법이다. 이에 고령 산모, 산모 혈청 표지자 검사 그리고 초음파 소견과 같은 적응증은 태아의 염색체 이상 등을 예측하기 위한 산전 세포 유전학적 진단에 효과적인 요인이 된다. 이에 지난 8년간의 미즈메디에서 시행한 산전 세포 유전학 분석 결과는 산전 진찰 및 유전 상담의 중요한 자료로 활용될 수 있을 것이라 사료된다.

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한국 담수어류의 보존 및 복원 전략 (Strategies for Conservation and Restoration of Freshwater Fish Species in Korea)

  • 강언종;;양현
    • 한국어류학회지
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    • 제21권sup1호
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    • pp.29-37
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    • 2009
  • The tiny fragment of freshwater body is providing home for huge biodiversity and resources for the existence of human. The competing demand for freshwater have been increased rapidly and it caused the declination of biodiversity in recent decades. Unlike the natural process of extinction in gradual progress, the current species extinction is accelerated by human activity. As a result many fish species are already extinct or alive only in captivity in the world and about fifty eight animal species are in endangered in Korea including eighteen freshwater species. Conservation of biodiversity is the process by which the prevention of loss or damage is attained, and is often associated with management of the natural environment. The practical action is classified into in-situ, or ex-situ depending on the location of the conservation effort. Recovery means the process by which the status of endangerment is improved to persist in the wild by re-introduction of species from ex-situ conservation population into nature or translocation of some population. However there are a lot of restrictions to complete it and successful results are known very rare in case. In this article the authors explore some strategies for conservation and restoration of freshwater fish species conducted in Korea for few years. The major causes are discussed in relation with the decline of freshwater fish diversity during few decades and some strategies are evaluated to advance the process of conservation. A study on the Korean bullhead, Pseudobagrus brevicorpus, is introduced as a case for ex-situ conservation and restoration in freshwater ecosystem.

이식신장에 생긴 유두모양 신세포암종과 고유신장에 생긴 Xp11.2전위/전사인자E3-재배열 신세포암종: 증례 보고 (Papillary Renal Cell Carcinoma in Transplanted Kidney and Xp11.2 Translocation/Transcription Factor E3-Rearranged Renal Cell Carcinoma in the Native Kidney: A Case Report)

  • 김민혜;김경아;김정우;이석영;최재웅
    • 대한영상의학회지
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    • 제85권2호
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    • pp.437-444
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    • 2024
  • 고유신장과 이식신장 모두에 신세포암종이 발생하는 경우는 매우 드물며, 소수의 증례만이 영문 문헌에서 보고되었다. Xp11.2전위/전사인자E3 (이하 TFE3)-재배열 신세포암종은 성인인구에서 드문 아형이다. 신장이식을 받은 어린이에서 TFE3-재배열 신세포암종이 소수의 증례로 보고되었으나, 어른에서 신장이식 후 TFE3-재배열 신세포암종이 보고된 증례는 없다. 저자들은 이식신장에 유두모양 신세포암종이, 고유신장에 TFE3-재배열 신세포암종이 있던 드문 증례를 영상 소견과 함께 보고하고자 한다. 고유신장에 생긴 TFE3-재배열 신세포암종은 5년에 걸쳐 천천히 자랐다. CT에서 약한 조영증강을 보이는 소엽 모양 종괴였으며, MRI에서는 T1 강조영상에서 높은 신호 강도를, T2 강조영상에서 낮은 신호 강도를 보였다.

Local ablative radiotherapy for oligometastatic non-small cell lung cancer

  • Suh, Yang-Gun;Cho, Jaeho
    • Radiation Oncology Journal
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    • 제37권3호
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    • pp.149-155
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    • 2019
  • In metastatic non-small cell lung cancer (NSCLC), the role of radiotherapy (RT) has been limited to palliation to alleviate the symptoms. However, with the development of advanced RT techniques, recent advances in immuno-oncology therapy targeting programmed death 1 (PD-1) and programmed death ligand 1 (PD-L1) and targeted agents for epidermal growth factor receptor (EGFR) mutation or anaplastic lymphoma kinase (ALK) translocation allowed new roles of RT in these patients. Within this metastatic population, there is a subset of patients with a limited number of sites of metastatic disease, termed as oligometastasis that can achieve long-term survival from aggressive local management. There is no consensus on the definition of oligometastasis; however, most clinical trials define oligometastasis as having 3 to 5 metastatic lesions. Recent phase II randomized clinical trials have shown that ablative RT, including stereotactic ablative body radiotherapy (SABR) and hypofractionated RT, to primary and metastatic sites improved progression-free survival (PFS) and overall survival (OS) in patients with oligometastatic NSCLC. The PEMBRO-RT study, a randomized phase II study comparing SABR prior to pembrolizumab therapy and pembrolizumab therapy alone, revealed that the addition of SABR improved the overall response, PFS, and OS in patients with advanced NSCLC. The efficacy of RT in oligometastatic lung cancer has only been studied in phase II studies; therefore, large-scale phase III studies are needed to confirm the benefit of local ablative RT in patients with oligometastatic NSCLC. Local intensified RT to primary and metastatic lesions is expected to become an important treatment paradigm in the near future in patients with metastatic lung cancer.

변산반도국립공원 내 미선나무 아개체군의 생태적 특성과 관리제언 (Ecological Characteristics and Management Proposal of Abeliophyllum distichum Subpopulations in the Byeonsanbando National Park)

  • 임동옥;황인천;최현우;김용식
    • 한국환경생태학회지
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    • 제23권2호
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    • pp.116-126
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    • 2009
  • 본 연구는 전라북도 부안군 변산반도국립공원 내 3개 지역에 분포하는 우리나라의 희귀 및 멸종위기식물인 미선나무아개체군을 대상으로 생태적 특성 분석과 관리방안을 강구하기 위한 것이다. 변산반도국립공원에 위치한 미선나무아개체군 중 부안댐 제방하부 지역과 상서면 청림리 산록에 자생군락을 천연기념물 제370호로 지정한 반면, 가마소지역의 미선나무아개체군은 이식한 집단이다. 미선나무 아개체군 중 가마소 아개체군의 식생은 감나무, 오동나무 및 산뽕나무가 교목상이나, 부안댐 하부의 아개체군은 굴참나무가 우점하고 있다. 미선나무 자생지인 청림리 아개체군은 미선나무를 제외한 관목이상의 목본수종을 모두 제거한 상태였다. 미선나무 아개체군에서 확인한 식물종은 65과 143속 164종 17변종 1품종 등 총 182분류군이며, 가마소 지역, 부안댐 제방하부지역 및 청림리 지역은 각각 75종, 102종 및 89종이다. 미선나무 아개체군 동향은 가마소지역과 부안댐 하부 자생지에서 맹아의 수가 $1{\sim}2$개인 개체가 87%이상이고, 나머지는 3개였으며, 총 개체 수는 각 766개체와 59개체였다. 반면, 청림리의 경우 맹아의 수가 $1{\sim}2$개인 개체가 74.8%, 3개는 16% 그리고 $4{\sim}11$개가 9.2%로 총 838개체를 확인하였다. 교목을 인위적으로 제거한 미선나무 자생지에는 흰명아주, 돌소루쟁이, 미국자리공, 나팔꽃, 배풍등, 망초 및 개망초 등 귀화식물이 침입하였으며, 미선나무 어린 개체보다 성장이 빨라 미선나무를 피압한 상태이다. 미선나무의 자생지 보전을 위한 우선순위로 미선나무 단일종이나 수림 하에 분포하는 원 자생지의 모습 그대로를 유지하는 것이 서식지 관리에 바람직한지는 더 많은 연구가 필요하다.