• 한국동물번식학회:학술대회논문집
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• 한국동물번식학회 2003년도 학술발표대회 발표논문초록집
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• pp.47-47
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• 2003

The present study was conducted to determine the expression of the antioxidant enzyme(CuZn-SOD, Mn-SOD and GPX and apoptosis gene(caspase-3) for in vitro culture in in vitro maturation and in vitro fertilization(IVM/IVF) embryos in porcine. Porcine embryos derived from IVM/IVF were cultured in NCSU23 medium under 5% $CO_2$ in air at 38.5$^{\circ}C$. The patterns of gene expression for several antioxidant enzyme and apoptosis genes during preimplantion porcine embryo development were examined by the modified semi-quantitative single cell reverse transcriptase- polymerase chain reaction (RT-PCR). Preimplantation porcine embryos produced by IVM/IVF have expressed mRNAs for CuZn-SOD and GPX, whereas transcripts for Mn-SOD have not detected at any developmental stages. Expression of caspase-3 mRNA was detected at 2 cell, 8 cell, 16 cell and morula stages. The fas ligand transcripts were detected in porcine blastocyst. These results suggest that various antioxidant enzymes and apoptosis genes play crucial roles in in vitro culture of porcine IVM/IVF embryos.

• 한국동물학회지
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• 제22권2호
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• pp.43-53
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• 1979

管棲 갯지렁이(Schizobranchia insignis)의 卵子形成 및 初期發生 期間에 일어나는 단일유전자 발현의 변이에 대하여 DNA-RNA 分子結合法을 이용하여 연구하였다. 卵子形成 初期에 活性化되었던 유전자의 일부는, 卵子形成 과정이 진행됨에 EK라 점차 억제되는 경향을 보였으며, 初期에 생성된 전사물질의 일부는 생성된 후, 卵子形成 과정에서 점차 소모되어, 末期에 잔존한 전사물질의 양은 사실상 初期에서 보다 적었다. 즉, 初期의 卵子는 末期에서는 존재하지 않는 단일유전자의 전사물질을 함유하고 있음이 확실하였다. 수정 후 발생단계를 통하여, 卵子形成 期間 중 발현된 유전자와는 다른 새로운 유전자의 발현이, Trochophore stage까지 계속 증가됨을 보여 주었다.

• 한국작물학회:학술대회논문집
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• 한국작물학회 2022년도 추계학술대회
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• pp.254-254
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• 2022

Astragalus membranaceus (A. membranaceus) has traditionally been used as a medicinal plant in East Asia for the treatment ofvarious diseases. A. membranaceus belongs to the legume family and is known to be rich in substances such as flavonoids and saponins. Recent pharmacological studies of A. membranaceus have shown that the plant has immunomodulatory, anti-oxidant, anti-cancer, and anti-inflammatory effects. However, knowledge of major biosynthetic pathways in A. membranaceu is still lacking. Recently developed sequencing techniques enable high-quality transcriptome analysis in plants, which is recognized as an important part in elucidating the regulatory mechanisms of many plant secondary metabolic pathways. However, it is difficult to predict the number of transcripts because plant transcripts contain a large number of isoforms due to alternative splicing events, which can vary depending on the assembly platform used. In this study, we constructed three unigene sets using Pac-Bio isoform sequencing, Trinity and rnaSPAdes assembly for detailed transcriptome analysis mA. membranaceus. Furthermore, all genes involved in the flavonoid biosynthetic pathway were searched from three unigene sets, and structural comparisons and expression profiles between these genes were analyzed. The isoflavone synthesis was active in most tissues. Flavonol synthesis was mainly active in leaves and flowers, and anthocyanin synthesis was specific in flowers. Gene structural analysis revealed structural differences in the flavonoid-related genes derived from the three unigene sets. This study suggests the need for the application of multiple unigene sets for the analysis of key biosynthetic pathways in plants.

• IMMUNE NETWORK
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• 제4권4호
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• pp.216-223
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• 2004

Background: It is well known that IgA isotype switching is induced by $TGF-{\beta}1$. LPS-activated mouse normal B cells well differentiate into IgA secreting plasma cells under the influence of $TGF-{\beta}1$. Nevertheless, there are lots of difficulties in studying normal B cells in detail because it is not simple to obtain highly purified B cells, showing low reproducibility and transfection efficacy, moreover impossible to keep continuous culture. To overcome these obstacles, it is desperately needed to develop B cell line which acts like normal B cells. In the present study, we investigated whether CH12F3-2A lymphoma cells are appropriate for studying IgA isotype switching event. Methods: CH12F3-2A B cell line was treated with LPS and $TGF-{\beta}1$, then levels of germ-line (GL) transcripts were measured by RT-PCR, and $GL{\alpha}$ promoter activity was measured by luciferase assay. In addition, membrane IgA (mIgA) expression and IgA secretion were determined by FACS and ELISA, respectively. Results: $TGF-{\beta}1$, regardless of the presence of LPS, increased level of $GL{\alpha}$ transcripts but not $GL{\gamma}2b$ transcripts. However, IgA secretion was increased dramatically by co-stimulation of LPS and $TGF-{\beta}1$. Both mIgA and IgA secretion in the presence of $TGF-{\beta}1$ were further increased by over-expression of Smad3/4. Finally, $GL{\alpha}$ promoter activity was increased by $TGF-{\beta}1$. Conclusion: CH12F3-2A cell line acts quite similarly to the normal B cells which have been previously reported regarding IgA expression. Thus, CH12F3-2A lymphoma cell line appears to be adequate for the investigation of the mechanism(s) of IgA isotype switching at the cellular and molecular levels.

• 한국발생생물학회지:발생과생식
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• 제4권2호
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• pp.231-236
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• 2000

Gonadotropin-releasing hormone (GnRH)과 그 수용체가 흰쥐의 난소, 정소, 자궁, 태 반 그리고 유선 등의 생식기관에서 발현됨이 알려져 있다. 더욱이, 뇌하수체 전엽에 작용하는 GnRH의 표적 산물로 알려진 luteinizing hormone (LH)이 흰쥐 생식소에서도 발현됨이 알려졌는데, 이는 생식소 내에 GnRH-LH로 이루어진 국부 회로 (local circuit)가 존재함을 시사하는 것이다 본 연구는 LH와 그 수용체 유전자가 흰쥐 유선에서도 발현되는가를 규명한 것이다. 이를 위해 reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR)과 LH 방사면역측정법 (radioimmunoassay, RIA)을 사용하였다. RT-PCR을 시행한 결과 생식 주기중인 임신하지 않은 흰쥐 유선에서 뇌하수체 유형의 LH${\beta}$ 전사체 (exon 1-3)가 증폭되었으나 정소특이적 LH${\beta}$ exon 부분은 검출되지 않았다. 뇌하수체 glycoprotein hormone에서 공통적으로 존재하는 ${\alpha}$-subunit과 LH 수용체에 대한 전사체 역시 흰쥐 유선에 존재함이 확인되었다. 또한 기존의 보고에서 수유중인 흰쥐 유선에서만 발현된다고 알려진 GnRH가 임신하지 않은 흰쥐 유선에서도 발현됨을 확인하였다. LH 방사면역측정법을 시행한 결과 흰쥐 유선조직 추출물에서 immunoreactive LH분자들이 검출되었으며, LH standard curve와 parallelism을 보이므로 흰쥐 유선의 LH가 뇌하수체 형과 동일할 가능성을 확인하였다. 본 연구는 흰쥐 유선에서 LH subunit들과 수용체 유전자가 발현됨을 최초로 보고한 것으로서, 흰쥐 유선이 LH의 생성처이면서 동시에 작용처이며 유선에서 합성된 GnRH의 조절하에 국부적인 인자로 작용할 가능성을 시사한다.

• 생명과학회지
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• 제14권6호
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• pp.1023-1027
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• 2004

본 연구는 출아형 효모 Saccharomyces cerevisiae에서 자외선의 상해 시 이를 정상으로 회복시키는 절제회복(excision repair) 유전자로 알려진 RADS의 특성 규명을 위하여 균류 Coprinus cinereus에서 이와 유사한 유전자를 분리하였다. RADS 유사 유전자를 분리하기 위하여 균류 C. cinereus의 염색체 DNA를 전기영동하여 분리한 다음 효모 RADS DNA를 probe로 하여 이와 hybridization하였다. 이 결과 RADS유사 유전자는 3.4kb의 insert DNA를 갖고 있었다. 또한 Southern hybridization으로 이 유사 유전자는 fungus C. cinereus의 염색체에 존재함을 확인하였다. 분리한 RADS 유사 유전자의 전사체 크기는 2.8kb 였으며, 자외선의 상해시 전혀 자외선에 대한 유도성이 없음을 Northern hybridization으로 확인하였다. 또한 유사유전자 부분을 삭제하였을 때 이 부분이 없는 세포는 전혀 생존을 못하였다. 이 결과 분리한 RADS 유사유전자는 세포의 생존에 필수적인 유전자임을 알 수 있었다.

• Journal of the Korean Wood Science and Technology
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• 제34권3호
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• pp.56-63
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• 2006

셀룰로오스의 가수분해 기작을 구명하기 위하여 Phanerochaete chrysosporium으로부터 74A (PcGHF74A) 유전자를 클로닝한 결과 2162 bp의 염기서열에 해당하는 721개의 아미노산을 가지고 있으며, 다른 사상균에서 유래한 GHF74와 70~77%의 상동성을 나타냈다. Phanerochaete chrysosporium GHF74B (PcGHF74B)는 family 1에 속하는 Cellulose Binding Module (CBM)을 가지고 있으며 셀룰로오스 배양계에서 다양한 전사산물이 존재하였다. PcGHF74B 전사산물에서 나타난 splice variants를 조사하기 위해서 annotation data와 sequence data로부터 primer를 설계하여 RT-PCR분석을 수행하였으며 그 결과 다양한 배양조건에서 splice variants가 존재함을 확인하였다. 첫 번째는 annotation data와 다르게 11번째 intron을 포함하고 있어 full length로 추정되어지는 것으로 2562 bp에 stop codon이 존재했으며, 두 번째는 7번째 exon 1187 bp에 stop codon을 가지고 있으며 12개의 exon으로 구성되어 있다. 세 번째는 10개의 exon과 9개의 intron을 포함하고 있으며 7번째 exon에 stop codon이 존재했다. Splice variants로서 intron에 나타난 stop codon으로 인해 활성단백질의 합성이 일어나지 않을 것이며 비활성 단백질을 생성하거나 원래의 GHF74의 기능이 아닌 다른 새로운 기능을 갖는 단백질을 생성할 수 있을 것으로 사료된다.

• 한국수정란이식학회지
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• 제31권4호
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• pp.335-347
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• 2016

Multiple interferon tau (IFNT) genes exist in bovine. An antiluteolytic substance secreted by the bovine conceptus and primarily responsible for maternal recognition of pregnancy is bovine trophoblast protein 1 (bIFNT1), a new type I interferon tau (IFNT) genes. The objectives of this research were to investigate whether multiple, distinct gene encode bIFNT1 and other type I bIFNT gene in the bovine genome and to examine expression of bIFNT1 and other bIFNTc1 mRNAs during conceptus development. These transcrips could be regulated through caudal-related homeobox-2 (CDX2) and ETS2 and/or AP1 (JUN) expression, a transcription factor implicated in the control of cell differentiation in the trophectoderm. The presence of mRNAs encoded by bIFNT1 and type I bIFNTc1 genes were examined quantitatively via reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) analysis of total cellular RNA (tcRNA) extracted from on day 17, 20 and 22 bovine conceptuses. The expression level of bIFNT1 was higher on day 17 transcripts were gradually weakly detectable on day 20 and 22. However, the other bIFNTc1 gene examined transcripts was highly expressed on day 20 and transcripts were weakly detectable on day 17 and 22 bovine conceptuses. Furthermore, human choriocarcinoma JEG3 was co-transfected with an -1kb-bIFNT1/c1-Luc constructs and several transcription factor expression plasmids. Compared to each -1kb-bIFNT1/c1-Luc increased when this constructs were co-transfected with, ETS2, AP1(JUN), CREBBP and/or CDX2. Also, bIFNTc1 gene was had very effect on activity by alone ETS2, and AP1 (JUN) expression factors in choriocarcinoma JEG3 cell. However, bIFNT1 gene expression of the upstream region was not identified. We demonstrated that the activities of bIFN genes are regulated by differential, tissue-specific and developmental competence during pregnancy.

• Journal of Plant Biotechnology
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• 제41권3호
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• pp.159-167
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• 2014

진핵생물의 유전자 발현 과정에서 생성된 단백질은 전사후 변형 과정을 통해 소포체와 골지체에서 당질화가 일어난다. 당질화된 당단백질은 접힘의 오류가 있는 경우를 비롯하여 식물의 분화 조절 등의 경우 당단백질이 분해되며, 이 때 PNGase에 의해 N-당사슬이 단백질의 아스파라긴산 잔기로부터 절단된다. 그러나 식물의 발달과 분화 과정에서 PNGase의 발현 조절에 대해서는 거의 알려진 바가 없다. 기존에 보고된 유전적 정보를 활용하여 토마토의 잎에서 제조된 cDNA library에서 nested RT-PCR을 통하여 PNGase T의 유전자(GenBank Accession number KM401550)를 분리하였는데 이의 ORF는 1,767 bp, 588개의 이미노산으로 이루어졌으며, 분자량은 65.8 KDa이었다. PNGase T의 유전자는 토마토 과육에서 높은 수준으로 항시적으로 발현되었으며, 특히 녹색과보다는 오렌지색으로 숙성되는 과정에서 PNGase T의 전사체량이 크게 증가하였다. 이러한 발현 패턴은 토마토 과육에서 세포죽음의 과정에서 증가하는 단백질 가수분해 효소인 metacaspase의 전사체 증가 페턴과 유사하였으며, 이 시기에는 에틸렌의 생합성 효소 중 노화관련 ACC synthase의 유전자 members (LeACS2, LeACS4, LeACS6)의 발현 패턴과도 유사하였다. 따라서 토마토 과육에서 PNGase T의 유전자 발현은 거대분자가 분해되는 시기에서 과육의 숙성과 노화 과정에서 특이적인 생리적 기능을 나타내는 것으로 판단된다. 향 후 고가의 의약용 재조합단백질의 면역부작용을 완화하기 위하여 식물체 유래의 당단백질의 탈당질화과정에서 PNGase T를 활용함으로써 식물생명공학 분야에서 활용가치가 높을 것으로 사료된다.

• 대한한의학회지
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• 제24권2호
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• pp.166-178
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• 2003

Objectives : Nitric oxide (NO) plays an important role in normal and pathophysiological cells as a messenger molecule, neurotransmitter, microbiological agent, or dilator of blood vessels and arteriosclerosis, respectively. This study was undertaken to understand the mechanism of NO production and effect of Hyeolbuchukeo-tang (Xiefuzhuyu-tang) on NO production in cultured vascular smooth muscle cell (VSMC). Methods and Results : VSMC was isolated from aorta and cultured. Cultured primary cells were identified as VSMC with anti--smooth muscle actin antibody. A large amount of NO was produced in cultured VSMC treated with $IFN-{\gamma}$ plus TNF in a time- and dose-dependent manner. $TNF-{\alpha}$ was a more efficient stimulator than $IFN-{\gamma}$ in NO production of cultured VSMC. iNOS protein wasdetected within 3 hrs and it increased up to 12 hrs in a time-dependent manner. However, accumulated NO in cytokine-treated VSMC was not detected within 3 hrs. NO production in cytokine-treated VSMC showed the dose- and time-dependent manner, and increased up to 48 hrs. The activated VSMC produced a large amount of NO (about 60 uM). Hyeolbuchukeo-tang (Xiefuzhuyu-tang) alone did not induceNO production, but it potentiated the effect of $TNF-{\alpha}$ on NO production and increased NO production by about 20%. Hyeolbuchukeo-tang (Xiefuzhuyu-tang) did not affect the transcriptional activity of iNOS gene, but increased the accumulation of iNOS. These results indicate that Hyeolbuchukeo-tang (Xiefuzhuyu-tang) could modulate the translational level of iNOS. PKC did not modulate NO production, but calcium ionophore A23187 decreased NO production. However, Hyeolbuchukeo-tang (Xiefuzhuyu-tang) elevated the decreased NO production in A23187-treated VSMC by modulating the stability of iNOS transcripts. Half-life of the synthesized transcripts appeared to have about 6 hrs. PDTC, an $NF-{\kappa}B$ inhibitor, blocked the accumulation of iNOS mRNA, indicating that $NF-{\kappa}B$ served as an important modulator in the transcriptional regulation of iNOS. As Hyeolbuchukeo-tang (Xiefuzhuyu-tang) potentiated the effect of the $TNF-{\alpha}$ on NO production but had no additional effect on PDTC-modulated NO production, it is suggested that Hyeolbuchukeo-tang (Xiefuzhuyu-tang) enhances the $TNF-{\alpha}-mediated$ NO production of VSMC by modulating the iNOS activity and the stability of iNOS transcripts in activated VSMC having the elevated intracellular calcium ion. Conclusions : This study suggests that Hyeolbuchukeo-tang (Xiefuzhuyu-tang) has a potential capacity for preventing and treating diseases of the circulation system, including arteriosclerosis.