The quality control of pathological specimens is important for accurate molecular pathology testing. This study evaluated that specimen factors affecting the DNA quality during tissue processing and sample types for BRAF, EGFR, and KRAS mutations tests. One thousand seven hundred and seventy-two molecular pathology tests were investigated for the factors influencing the DNA quality, such as sample type, formalin fixation time, and reexamination status. Cytology samples stored in a saline solution had better DNA quality than commercial cytology preservation. Tissue samples fixed in formalin within 24 hours had better DNA quality than the samples fixed over 24 hours. Between the types of samples, fresh tissue samples and tissue samples with a high tumor cell density had relatively better DNA quality than the formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissues and cytology specimens. Of real-time PCR, the non-PNA Ct value increased proportionally with samples held for longer than 24 hours in formalin, and that the formalin-fixed time affects the sample DNA quality. In conclusion, the appropriate tumor cellularity and 10% neutral formalin fixation time are the most important factors for maintaining the DNA quality. These factors should be managed properly for an accurate pathological molecular test to ensure optimal DNA quality.
Journal of the Korean Society of Food Science and Nutrition
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v.24
no.2
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pp.313-322
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1995
This study was conducted to investigate the effect of ginseng on the preservability and quality of Chinese cabbage Kimchi. The effect of ginseng on the growth of Lactobacilli, pH, titratable acidity, amount of juice, sensory quality and fracitonation of cell wall ploysaccharides, and enzyme activities related to softening were examined during fermentation. Ginseng promoted the growth of L. brevis and it didn't influence L. plantarum and L. fermentum. But Leuc. mesenteroides and P. cerevisiae was inhibited a little by adding of ginseng. The quality of ginseng added Kimchi evaluated by nalysis of the pH, acidity, sensory quality, the amount of juice, and overall eating quality during fermentation was better than those of control Kimchi, and 2% ginseng added Kimchi was the best ont the preservability and quality. The activity of β -galactosidase in ginseng added Kimchi was higher than that of control Kimchi. But the activity of polygalacturonase in ginseng added Kimchi was the same as that of control Kimchi. Ginseng added Kimchi showed more desirable softness of tissue. This was the same result as the analysis of pectic substance and hemicellulosic polysaccharides composed of cell wall polysaccharides. The value of L(lightness) of ginseng added Kimchi was highly maintained during the edible period and the yellow color from the ginseng was moved to Kimchi tissue in the ginseng added Kimchi.
Objective: The objective of this study was to investigate the effects of various dietary unsaturated to saturated fatty acids ratios (UFA to SFA ratios) on growth performance, carcass traits, blood lipid parameters, tissue fatty acid (FA) composition, and meat quality of finishing pigs. Methods: A total of 45 crossbred pigs ([Duroc×Landrace]×Yorkshire), with an average initial body weight of 60.3±2.4 kg, were randomly allocated to three treatment groups of 1:1, 2:1, and 3:1 dietary UFA to SFA ratios. Results: Both average daily gain and average daily feed intake of pigs were decreased linearly (p<0.05), whereas backfat thickness was decreased linearly (p<0.05) with increasing of dietary UFA to SFA ratio. Serum triglyceride and low density lipoprotein cholesterol were decreased quadratically or linearly (p<0.05) respectively, whereas high density lipoprotein cholesterol was increased quadratically (p<0.05) with increasing dietary UFA to SFA ratio. In M. longissimus thoracis, the proportion of C18:1 and monounsaturated FA was decreased linearly (p<0.05), whereas the proportion of C18:2n-6, C20:4n-6 and polyunsaturated FA (PUFA) were increased linearly (p<0.05) as dietary UFA to SFA ratio increased. In the subcutaneous adipose tissue, the proportion of SFA was decreased linearly (p<0.05), whereas the proportion of n-6 PUFA, n-3 PUFA, and the UFA to SFA ratios were increased linearly (p<0.05) with increasing of dietary UFA to SFA ratio. Meat color scores and shear force of pigs were decreased linearly (p<0.05), whereas drip loss and cooking loss were increased linearly (p<0.05) with increasing of dietary UFA to SFA ratio. Conclusion: Appropriately boosted dietary UFA to SFA ratio could be conductive to optimize blood lipid parameters and tissue FA composition. However, when the ratio is too high or too low it tends to have negative effects on growth performance and meat quality.
Biological samples can be fixed either by chemical method by using chemical solution or physical methods by using heat treatment. The problem in traditional heat fixation is unsatisfactory quality due to uneven heat conduction in specimen and loss of inner cell contents. Chemical fixation method also bears several intrinsic problems like the limit in specimen size, time consumption in fixative impregnation, and loss of low molecular weight cell components. These factors deteriorate the quality of fixed specimen, thus limit the magnification and contrast of tissue pictures. Microwave heat has been reported to be a good alternative to current chemical methods to overcome these problem. In this study, we tried to introduce the microwave energy method to routine fixation work in hospital. We replaced chemical fixative with saline to provide moderate reaction condition, and used frozen section to reduce time for sample preparation. Temperature was measured at each experiment. The fixation of rat kidney tissue with 2.45 GHz electromagnetic wave and saline showed similar result to the control group fixed with traditional chemical method. Human tumor tissue fixed with 2.45 GHz electromagnetic in frozen section was improved in terms of histochemistry of PAS and immunohistochemistry of tumor marker like cytokeratin. Total turnaround time was reduced from $24\sim38$ h to to $2\sim4$ h. In conclusion, the quality of samples prepared by microwave heating method was at least as good as that of traditional method. If the condition for the fixation of different specimens is standardized, this new method could be applied to routine work in hospital, and could save working time as well.
With the development of sequencing technology, numerous, long noncoding RNAs (lncRNAs) have been discovered and annotated. Increasing evidence has shown that lncRNAs play an essential role in regulating many biological and pathological processes, especially in cancer. However, there have been few studies on the roles of lncRNAs in livestock production. In animal products, meat quality and lean percentage are vital economic traits closely related to adipose tissue deposition. However, adipose tissue accumulation is also a pivotal contributor to obesity, diabetes, atherosclerosis, and many other diseases, as demonstrated by human studies. In livestock production, the mechanism by which lncRNAs regulate adipose tissue deposition is still unclear. In addition, the phenomenon that different animal species have different adipose tissue accumulation abilities is not well understood. In this review, we summarize the characteristics of lncRNAs and their four functional archetypes and review the current knowledge about lncRNA functions in adipose tissue deposition in livestock species. This review could provide theoretical significance to explore the functional mechanisms of lncRNAs in adipose tissue accumulation in animals.
Six muscles were seamed out randomly from Hanwoo carcasses (n = 12) of each quality grade (quality grades 1, 2 and 3). Samples were analysed for their total and soluble collagen contents, IMCT (intramuscular connective tissue) and Warner-Bratzler shear force (WBSF). Simple correlation (n = 21) was determined for WBSF among major muscles. For LT (longissimus thoracis), total collagen content was significantly higher (p<0.05) for quality grade 3 than those for quality grades 1 and 2. For semitendinosus (ST), semimembranosus (SM), psoas major (PM) and serratus ventralis (SV), total collagen content of quality grade 1 was lowest (p<0.05) of all quality grades. IMCT shear force for gluteus medius (GM) decreased (p<0.05) with better quality grade, and those for other muscles, with the exception of GM, were higher (p<0.05) for quality grade 3 than for quality grades 1 and 2. WBSF values showed GM and LT to be decreased (p<0.05) with better quality grade, and PM to be higher (p<0.05) for quality grade 3 than those for quality grades 1 and 2. SM, ST and SV from quality grade 1 had lower (p<0.05) WBSF value than those from quality grades 2 and 3. Total collagen content of ST was highest (p<0.05) of all muscles, whereas that of PM was lowest (p<0.05). Soluble collagen contents of LT and SV from quality grades 1 and 2 were, in general, higher (p<0.05) than other muscles, but that of SM was lowest (p<0.05). ST and SM had higher (p<0.05) WBSF values for three quality grades when compared to other muscles, whereas PM was lowest (p<0.05). LT had the strongest simple correlation with SV (r = 0.78) and GM (r = 0.77), and SM had the strongest correlation with ST (r = 0.73) and LT (r = 0.73). Also, PM had the strongest correlation with SV (r = 0.62).
Beef producers are trying to produce not only better quality but also greater quantity of beef in order to meet the preferences of some consumers at a lower cost. This can be accomplished if we understand the factors regulating lipid deposition in intramuscular adipose tissue and the tenderness of meat. Propylene glycol (PG) might be used as a precursor of intramuscular fat synthesis especially in the late period of fattening because adipose tissue in ruminants is thought to mature sequentially in abdominal, intermuscular, subcutaneous and intramuscular depots. The action of cholecalciferol supplementation has been verified in producing more tender meat through the enhancement of calpain activity over the postmortem ageing period. A synergistic effect can be expected if the dietary cation and anion difference (DCAD) technique is used in combination with dietary supplementation of cholecalciferol. In another approach, the optimization of hormonal implant use also may provide similarly marbled beef at a much lower cost.
The study was conducted to evaluate the effect of chromium nanoparticle (CrNano) on growth, carcass characteristics, pork quality, and tissue chromium in finishing pigs. A total of 100 Duroc$\times$Landrace$\times$Yorkshire barrows (average initial BW of 64.78$\pm$0.83 kg) were divided into 10 pens, 10 pigs per pen. 5 pens of pigs were fed with control diet (corn-soybean meal, 1.05% Lys) and others were fed with control diet addition with 200 $\mu$g/kg Chrome (Cr) from CrNano. During the trial, all pigs were given free access to feed and water. After 35 days trial, 10 pigs from each each treatment (weight similar to average group weight, 91.34$\pm$1.31 kg for control group, and 92.26$\times$0.56 kg for CrNano treated group) were sacrificed to measure carcass characteristics, pork quality, and to collect the samples of longissimus muscle, liver, kidney and heart. The results indicated that the addition of 200 $\mu$g/kg CrNano decreased feed: gain ratio by 3.56% (p<0.05) compared to the control group. Pigs fed CrNano had 14.06% higher (p<0.05) carcass lean percentage, 19.96% (p<0.05) larger longissimus muscle area and 25.53% lower (p<0.05) carcass fat percentage, 18.22% lower (p<0.05) backfat thickness. Drip loss in chops from pigs fed CrNano was decreased by 21.48% (p<0.05) and weights of longissimus muscle and semimembranosus were increased by 16.33% (p<0.05) and 14.87% (p<0.05) respectively. In addition, supplemental CrNano resulted in 184.11% (p<0.05), 144.99% (p<0.05), 88.13% (p<0.05) and 52.60% (p<0.05) increment of Cr concentration in longissimus muscle, liver, kidney and heart, respectively. These results suggest that supplemental CrNano has beneficial effects on carcass characteristics, pork quality and individual skeletal muscle weight, increase tissue chromium concentration in selected muscle and organs.
The functional non-woven fabrics have been applied in various industry fields, such as clothing, hygiene, environment, medical and so forth. The functional non-woven fabrics for wet tissue were manufactured by meltblown and wet tissue finishing processes. The wet tissue was contained the various composition substances such as Benzalkonium Chloride(0.2292g), lodo-2-propynyl Butyl carbamate(0.0069g) and 5-Chloro-2-Methyl-Isothiazolin -3-one, 2-Methyl-Isothiazolin-3-one (0.0034g) with purified water (999.76g). In this study, the functional wet tissue based on meltblown nonwovens has been applied in dairy cattle for prevention on cow mastitis. Mastitis is the most costly disease results in lost milk production, decreased milk quality, milk discard, early culling of cows, drug costs and labor costs in dairy cattle. Therefore, this study was investigated to evaluate clinical effect of the functional wet tissue in mastitis control. The results, after experiment the functional wet tissue used group, demonstrated that the infection rate, cure rate and mean somatic cell count(SCC) were significantly decreased as compared to the control group.
Ginseng has been used as a medicinal herb in the world for more than two thousand years. Inspection of the quality of ginseng was made since many hundred years ago. Ginseng quality has been graded by several methodes, based on saponin contents, number of ginsenosides, shape of root and tissue elaborateness. In present. ginseng products are usually evaluated by saponin contents and number of ginsenosides. On the other hand, fresh and manufactured ginseng roots such as red. white and semi-red ginseng, Taegeuk Sam, are mostly graded by root shape such as root development and skin (epidermis) color, and tissue elaborateness. which is a conventional grading method. However, the root shape grading method has a risk of overlooking real medicinal properties of ginseng. So. both the medicinal ingredients and the conventional grading method should be considered for the proper evaluation of ginseng quality. Therefore, for the establishment of better method in evaluating ginseng quality, the relationships of root shape and useful components are required to be studied.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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